{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006333674734050343],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.279958962646887, 0.000633578843040974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006333924808340572],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006331843690054398],
[424.5529909962642, 1091.304606269057, 0, 1, 0.2800744553856365, 0, 0.0009163344443480284, 0.01139345838491049, 0.7199255446143635, 1, 0.000632970349178092],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331377053069734],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334597161531953],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332823568511444],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329662184258407],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799589626468871, 0.0006331287535464221],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006336370676987152],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006332767865715442],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331287556856695],
[424.3466623490862, 1090.660909890736, 1, 0, 0.2800954068643513, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800954068643513, 0.0006341605864207662],
[424.4903587274064, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800955062558726, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2800955062558725, 0.0006332767942943837],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006330200344183189],
[424.3654297078748, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800396255442054, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199603744557945, 1, 0.0006329703483073905],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331332740927001],
[424.4739464959403, 1090.902418128169, 1, 0, 0.2801112359972907, 0.00235585719277959, 0, -0.02929210077421452, 1, 0.2801112359972907, 0.0006332508685124504],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.0006331836265941056],
[424.4572885816856, 1090.919076042424, 1, 0, 0.2801002434051905, 0.002355949648883348, 0, -0.02929325034877988, 1, 0.2801002434051905, 0.0006334807775372205],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006332508696726364],
[424.1403337019082, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2799592170188623, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7200407829811377, 1, 0.0006335006259658749],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.000633039650024986],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334597123003827],
[424.3466623490862, 1091.064881865278, 0, 1, 0.2800207402201628, 0, 0.0009165357776802477, 0.01139596170993148, 0.7199792597798371, 1, 0.0006331836211046267],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332714274578207],
[424.219378202232, 1091.156986421877, 0, 1, 0.2799432458532901, 0, 0.000916458412899138, 0.01139499977685185, 0.7200567541467099, 1, 0.0006331286044300885],
[424.1841986119773, 1091.156986421877, 0, 1, 0.2799265292868685, 0, 0.000916458412899138, 0.01139499977685185, 0.7200734707131315, 1, 0.0006331836208614925],
[424.4903587274064, 1090.886005896703, 1, 0, 0.2801220664628102, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2801220664628101, 0.0006332716529093651],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287488199998],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006336370748352657],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331427606630769],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331286798516753],
[424.1048285007736, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006331432239316663],
[424.215454733373, 1091.196089480991, 0, 1, 0.2799341580529528, 0, 0.0009164255715722306, 0.01139459143654146, 0.7200658419470471, 1, 0.00063296622326862],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331286742194992],
[424.3818419393409, 1090.994522684769, 0, 1, 0.2800504560097248, 0, 0.0009165948858653799, 0.01139669664535999, 0.7199495439902752, 1, 0.0006331836261552829],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331332734986801],
[423.834173586479, 1091.507011447376, 1, 0, 0.2796955416855578, 0.002359413332667381, 0, -0.02933631687028335, 1, 0.2796955416855578, 0.0006331286060229575],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332822030988317],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.000632966217323419],
[424.2672922378824, 1091.252768764547, 0, 1, 0.279948318174854, 0, 0.000916377972751576, 0.01139399960548497, 0.7200516818251459, 1, 0.0006332508691227148],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380160247811],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329662225485895],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331287472097379],
[424.5529909962642, 1091.011243200816, 0, 1, 0.2801286685293052, 0, 0.0009165808384029054, 0.01139652198295359, 0.7198713314706948, 1, 0.0006329703506122779],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877707, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380129638854],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331336514300556],
[424.7965188428355, 1090.579845781274, 1, 1, 0.2803241021567647, 0.002354068255370934, 0.0009169434075536358, -0.01786882753182675, 0.9214183977500039, 0.482066602063533, 0.001268714755607769],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.4903587274064, 1090.886005896703, 1, 0, 0.2801220664628102, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2801220664628101, 0.0006333480806990481],
[424.2509599345076, 1090.64417204839, 0, 1, 0.2800530221383648, 0, 0.0009168893261693709, 0.01140035763766586, 0.7199469778616352, 1, 0.0006336272738790956],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332508698808707],
[424.4778699647994, 1090.710625086339, 0, 1, 0.2801485566655342, 0, 0.0009168334634320092, 0.0113996630552704, 0.7198514433344658, 1, 0.0006336415343237928],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331331310982285],
[424.5884961973988, 1090.78786842671, 0, 1, 0.2801868275824128, 0, 0.0009167685385448431, 0.01139885579651828, 0.7198131724175872, 1, 0.0006332508690672457],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006329703489422553],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006331380153093406],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287538364225],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329703492943142],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331381136638628],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287482463962],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006329703413777223],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332768628491414],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006331285001180418],
[424.5529909962642, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2800952317302455, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7199047682697545, 1, 0.0006329662227600501],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331380152016556],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287489078787],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329703486816811],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877707, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380153309011],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331286794909059],
[424.3466623490862, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800237729375754, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199762270624246, 1, 0.0006329662219416535],
[424.3466623490862, 1091.010934916235, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991546, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331431590489892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.6904772081588, 1091.169475184484, 0, 2, 0.279689536012198, 0, 0.001832895847514301, 0.02278973871530901, 0.5188471645303225, 1, 0.001267849949126052],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006332483651649673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329097207964104],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006331386011961549],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331201755210027],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.279958962646887, 0.0006331039805845435],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 2, 0, 0.2799324153877706, 0.004714724225048984, 0, -0.05862162509087454, 1, 0.07836215718483142, 0.001267494572225364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006330817996723762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.2757582148692, 1088.961790275665, 1, 0.75, 0.2799003097346506, 0.00236252603791301, 0.0006887293995964188, -0.02081154152950312, 0.9458080408418225, 0.4370924259795543, 0.0006339635988869776],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331285022140908],
[424.3466623490862, 1091.048469633812, 1, 0, 0.2800237729375754, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800237729375754, 0.0006334157414634107],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.279867654268168, 0, 0.0009163622131595483, 0.01139380365491578, 0.720132345731832, 1, 0.0006331332722857067],
[424.4260324602899, 1090.806635785499, 0, 1, 0.2801061786449306, 0, 0.0009167527655164029, 0.01139865967888432, 0.7198938213550694, 1, 0.0006331286741685997],
[424.4260324602899, 1090.78786842671, 0, 1, 0.2801096480251617, 0, 0.0009167685385448431, 0.01139885579651828, 0.7198903519748383, 1, 0.0006329662251068791],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006331380151793159],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329703512199686],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.000633138015213552],
[424.3135922033654, 1091.062772420744, 2, 0, 0.2800054178676706, 0.004713495011117716, 0, -0.05860634137229511, 1, 0.07840303403524884, 0.001267850502361034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287492915898],
[424.3278949902976, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800148563063755, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199851436936245, 1, 0.0006329703487412127],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331377062888379],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006331287558930515],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.0006329703492254906],
[424.3466623490862, 1091.010934916235, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991546, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331332737690488],
[424.1048285007735, 1091.433999860445, 0, 1, 0.2798376528296319, 0, 0.0009162258094652212, 0.01139210764771617, 0.7201623471703682, 1, 0.0006332949102214055],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332380027433531],
[424.8278949902976, 1090.548469633812, 1, 1, 0.2803448073414267, 0.002353894392981982, 0.0009169697889134479, -0.01786633775439619, 0.9214067889966984, 0.4820964036795518, 0.001267771523358259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.9447998190785, 1091.269101067922, 1, 0, 0.2797920475590296, 0.002358797655795654, 0, -0.02932866170806627, 1, 0.2797920475590296, 0.0006335343632653299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331992530723788],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 1, 0, 0.2795568037517182, 0.002361035710807978, 0, -0.02935648908790922, 1, 0.2795568037517182, 0.0006333663861368383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 1, 0, 0.2795568037517182, 0.002361035710807978, 0, -0.02935648908790922, 1, 0.2795568037517182, 0.0006334125899893613],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 0, 1, 0.2795568037517182, 0, 0.0009161632732383768, 0.01139133008893019, 0.7204431962482818, 1, 0.0006332716112071984],
[423.9447998190785, 1091.269101067922, 1, 0, 0.2797920475590296, 0.002358797655795654, 0, -0.02932866170806627, 1, 0.2797920475590296, 0.0006332371607641933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.000633368519417165],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006339964979351573],
[424.2360361164867, 1091.267612654477, 1, 0, 0.2799307256439348, 0.002357178350887241, 0, -0.02930852770219071, 1, 0.2799307256439347, 0.0006333944453782826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3818419393409, 1090.994522684768, 0, 1, 0.2800504560097249, 0, 0.00091659488586538, 0.01139669664535999, 0.7199495439902751, 1, 0.0006333327434880798],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334026025443027],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006331785181226754],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334125582550991],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006332711991020735],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006332717271266853],
[424.2029659707659, 1091.156986421877, 1, 0, 0.2799354472189794, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799354472189794, 0.0006332717271266853],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006333964361972621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3091276315089, 1091.0672369926, 1, 0, 0.2800024716874605, 0.00235677230320732, 0, -0.02930347901350286, 1, 0.2800024716874605, 0.0006335733450014063],
[424.3278949902976, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800148563063755, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199851436936245, 1, 0.0006333189303740162],
[424.219378202232, 1091.156986421877, 1, 0, 0.2799432458532901, 0.002357270910720359, 0, -0.02930967856649931, 1, 0.2799432458532901, 0.0006331285016589411],
[424.5529909962642, 1091.011243200816, 0, 1, 0.2801286685293052, 0, 0.0009165808384029054, 0.01139652198295359, 0.7198713314706948, 1, 0.0006329662220772017],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380147299371]
],
"NAMES": [
["epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1"],
["epi_isl_421422_New_York_20200317_null_3"],
["epi_isl_421434_New_York_20200317_null_27"],
["Node2"],
["epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1"],
["epi_isl_419397_Minnesota_20200314_null_1"],
["epi_isl_420055_Grand_Est_20200317_null_1"],
["epi_isl_417939_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_421426_New_York_20200317_null_30"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_2"],
["epi_isl_421311_Wisconsin_20200318_null_2"],
["epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1"],
["epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1"],
["epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2"],
["epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1"],
["epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1"],
["epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_421359_New_York_20200317_null_5"],
["epi_isl_417694_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_1"],
["epi_isl_418222_Centre_Val_de_Loire_20200304_null_10"],
["epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_8"],
["epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1"],
["epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_6"],
["epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1"],
["epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_5"],
["epi_isl_414648_California_20200311_null_1"],
["epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1"],
["epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1"],
["epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1"],
["epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_419248_Hong_Kong_20200224_null_1"],
["epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1"],
["epi_isl_417954_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1"],
["epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node172"],
["epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1"],
["epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2"],
["epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_4"],
["epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_420717_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_4"],
["epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1"],
["epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_5"],
["epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2"],
["epi_isl_420259_South_Yorkshire_20200324_null_2"],
["epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1"],
["epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1"],
["epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_417765_Reykjavik_20200227_null_1"],
["epi_isl_413809_China_20200201_null_2"],
["epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1"],
["Node37"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1"],
["epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2"],
["Node33"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_419926_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["Node76"],
["epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1"],
["epi_isl_420730_England_20200327_null_1"],
["Node73"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1"],
["epi_isl_420592_Abruzzo_20200323_null_2"],
["epi_isl_420718_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_418737_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_418677_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_418261_Abruzzo_20200317_null_2"],
["epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["Node59"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418662_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_420275_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1"],
["epi_isl_421005_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421184_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1"],
["epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14"],
["epi_isl_418723_England_20200316_null_5"],
["epi_isl_421432_New_York_20200317_null_3231"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2"],
["epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_418688_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420301_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_1"],
["epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2"],
["epi_isl_421205_Li_ge_20200331_null_2"],
["Node143"],
["epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_421401_New_York_20200317_null_57"],
["epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3"],
["Node136"],
["epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2"],
["epi_isl_417818_Reykjavik_20200316_null_8"],
["epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_421364_New_York_20200317_null_432"],
["epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1"],
["epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1"],
["epi_isl_418065_Idaho_20200313_null_2"],
["epi_isl_417163_Washington_20200305_null_2"],
["epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1"],
["Node111"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4"],
["epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1"],
["Node132"],
["epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1"],
["epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1"],
["epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006333674734050343],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.279958962646887, 0.000633578843040974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006333924808340572],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006331843690054398],
[424.5529909962642, 1091.304606269057, 0, 1, 0.2800744553856365, 0, 0.0009163344443480284, 0.01139345838491049, 0.7199255446143635, 1, 0.000632970349178092],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331377053069734],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334597161531953],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332823568511444],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329662184258407],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799589626468871, 0.0006331287535464221],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006336370676987152],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006332767865715442],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331287556856695],
[424.3466623490862, 1090.660909890736, 1, 0, 0.2800954068643513, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800954068643513, 0.0006341605864207662],
[424.4903587274064, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800955062558726, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2800955062558725, 0.0006332767942943837],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006330200344183189],
[424.3654297078748, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800396255442054, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199603744557945, 1, 0.0006329703483073905],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331332740927001],
[424.4739464959403, 1090.902418128169, 1, 0, 0.2801112359972907, 0.00235585719277959, 0, -0.02929210077421452, 1, 0.2801112359972907, 0.0006332508685124504],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.0006331836265941056],
[424.4572885816856, 1090.919076042424, 1, 0, 0.2801002434051905, 0.002355949648883348, 0, -0.02929325034877988, 1, 0.2801002434051905, 0.0006334807775372205],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006332508696726364],
[424.1403337019082, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2799592170188623, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7200407829811377, 1, 0.0006335006259658749],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.000633039650024986],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334597123003827],
[424.3466623490862, 1091.064881865278, 0, 1, 0.2800207402201628, 0, 0.0009165357776802477, 0.01139596170993148, 0.7199792597798371, 1, 0.0006331836211046267],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332714274578207],
[424.219378202232, 1091.156986421877, 0, 1, 0.2799432458532901, 0, 0.000916458412899138, 0.01139499977685185, 0.7200567541467099, 1, 0.0006331286044300885],
[424.1841986119773, 1091.156986421877, 0, 1, 0.2799265292868685, 0, 0.000916458412899138, 0.01139499977685185, 0.7200734707131315, 1, 0.0006331836208614925],
[424.4903587274064, 1090.886005896703, 1, 0, 0.2801220664628102, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2801220664628101, 0.0006332716529093651],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287488199998],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006336370748352657],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331427606630769],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331286798516753],
[424.1048285007736, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006331432239316663],
[424.215454733373, 1091.196089480991, 0, 1, 0.2799341580529528, 0, 0.0009164255715722306, 0.01139459143654146, 0.7200658419470471, 1, 0.00063296622326862],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331286742194992],
[424.3818419393409, 1090.994522684769, 0, 1, 0.2800504560097248, 0, 0.0009165948858653799, 0.01139669664535999, 0.7199495439902752, 1, 0.0006331836261552829],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331332734986801],
[423.834173586479, 1091.507011447376, 1, 0, 0.2796955416855578, 0.002359413332667381, 0, -0.02933631687028335, 1, 0.2796955416855578, 0.0006331286060229575],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332822030988317],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.000632966217323419],
[424.2672922378824, 1091.252768764547, 0, 1, 0.279948318174854, 0, 0.000916377972751576, 0.01139399960548497, 0.7200516818251459, 1, 0.0006332508691227148],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380160247811],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329662225485895],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331287472097379],
[424.5529909962642, 1091.011243200816, 0, 1, 0.2801286685293052, 0, 0.0009165808384029054, 0.01139652198295359, 0.7198713314706948, 1, 0.0006329703506122779],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877707, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380129638854],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331336514300556],
[424.7965188428355, 1090.579845781274, 1, 1, 0.2803241021567647, 0.002354068255370934, 0.0009169434075536358, -0.01786882753182675, 0.9214183977500039, 0.482066602063533, 0.001268714755607769],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.4903587274064, 1090.886005896703, 1, 0, 0.2801220664628102, 0.002355766107380937, 0, -0.02929096824263129, 1, 0.2801220664628101, 0.0006333480806990481],
[424.2509599345076, 1090.64417204839, 0, 1, 0.2800530221383648, 0, 0.0009168893261693709, 0.01140035763766586, 0.7199469778616352, 1, 0.0006336272738790956],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332508698808707],
[424.4778699647994, 1090.710625086339, 0, 1, 0.2801485566655342, 0, 0.0009168334634320092, 0.0113996630552704, 0.7198514433344658, 1, 0.0006336415343237928],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331331310982285],
[424.5884961973988, 1090.78786842671, 0, 1, 0.2801868275824128, 0, 0.0009167685385448431, 0.01139885579651828, 0.7198131724175872, 1, 0.0006332508690672457],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006329703489422553],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006331380153093406],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287538364225],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329703492943142],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331381136638628],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287482463962],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006329703413777223],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332768628491414],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006331285001180418],
[424.5529909962642, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2800952317302455, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7199047682697545, 1, 0.0006329662227600501],
[424.3466623490862, 1091.010934916234, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991548, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331380152016556],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287489078787],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006329703486816811],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877707, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380153309011],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331286794909059],
[424.3466623490862, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800237729375754, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199762270624246, 1, 0.0006329662219416535],
[424.3466623490862, 1091.010934916235, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991546, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331431590489892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.6904772081588, 1091.169475184484, 0, 2, 0.279689536012198, 0, 0.001832895847514301, 0.02278973871530901, 0.5188471645303225, 1, 0.001267849949126052],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006332483651649673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329097207964104],
[424.3466623490862, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2800572659085792, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7199427340914208, 1, 0.0006331386011961549],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331201755210027],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.2029659707659, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2799589626468871, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.279958962646887, 0.0006331039805845435],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 2, 0, 0.2799324153877706, 0.004714724225048984, 0, -0.05862162509087454, 1, 0.07836215718483142, 0.001267494572225364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006330817996723762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.2750485757783, 1088.962499914756, 1, 0, 0.279899840470353, 0.002362529998791014, 0, -0.02937506866663706, 1, 0.279899840470353, 0.0006339635988869776],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331285022140908],
[424.3466623490862, 1091.048469633812, 1, 0, 0.2800237729375754, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800237729375754, 0.0006334157414634107],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.279867654268168, 0, 0.0009163622131595483, 0.01139380365491578, 0.720132345731832, 1, 0.0006331332722857067],
[424.4260324602899, 1090.806635785499, 0, 1, 0.2801061786449306, 0, 0.0009167527655164029, 0.01139865967888432, 0.7198938213550694, 1, 0.0006331286741685997],
[424.4260324602899, 1090.78786842671, 0, 1, 0.2801096480251617, 0, 0.0009167685385448431, 0.01139885579651828, 0.7198903519748383, 1, 0.0006329662251068791],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006331380151793159],
[424.1841986119773, 1091.192166012132, 0, 1, 0.2799200307688556, 0, 0.000916428866653797, 0.0113946324067079, 0.7200799692311444, 1, 0.0006329703512199686],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.000633138015213552],
[424.3135922033654, 1091.062772420744, 2, 0, 0.2800054178676706, 0.004713495011117716, 0, -0.05860634137229511, 1, 0.07840303403524884, 0.001267850502361034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006331287492915898],
[424.3278949902976, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800148563063755, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199851436936245, 1, 0.0006329703487412127],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331377062888379],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877706, 0.0006331287558930515],
[424.719378202232, 1090.656986421877, 0, 1, 0.2802731968883414, 0, 0.0009168785534310874, 0.01140022369230772, 0.7197268031116586, 1, 0.0006329703492254906],
[424.3466623490862, 1091.010934916235, 0, 1, 0.2800307089989058, 0, 0.0009165810973991546, 0.01139652520324396, 0.7199692910010942, 1, 0.0006331332737690488],
[424.1048285007735, 1091.433999860445, 0, 1, 0.2798376528296319, 0, 0.0009162258094652212, 0.01139210764771617, 0.7201623471703682, 1, 0.0006332949102214055],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006332380027433531],
[424.8278949902976, 1090.548469633812, 1, 1, 0.2803448073414267, 0.002353894392981982, 0.0009169697889134479, -0.01786633775439619, 0.9214067889966984, 0.4820964036795518, 0.001267771523358259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.9447998190785, 1091.269101067922, 1, 0, 0.2797920475590296, 0.002358797655795654, 0, -0.02932866170806627, 1, 0.2797920475590296, 0.0006335343632653299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006331992530723788],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 1, 0, 0.2795568037517182, 0.002361035710807978, 0, -0.02935648908790922, 1, 0.2795568037517182, 0.0006333663861368383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 1, 0, 0.2795568037517182, 0.002361035710807978, 0, -0.02935648908790922, 1, 0.2795568037517182, 0.0006334125899893613],
[423.5429372890708, 1091.508499860821, 0, 1, 0.2795568037517182, 0, 0.0009161632732383768, 0.01139133008893019, 0.7204431962482818, 1, 0.0006332716112071984],
[423.9447998190785, 1091.269101067922, 1, 0, 0.2797920475590296, 0.002358797655795654, 0, -0.02932866170806627, 1, 0.2797920475590296, 0.0006332371607641933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.000633368519417165],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006339964979351573],
[424.2360361164867, 1091.267612654477, 1, 0, 0.2799307256439348, 0.002357178350887241, 0, -0.02930852770219071, 1, 0.2799307256439347, 0.0006333944453782826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3818419393409, 1090.994522684768, 0, 1, 0.2800504560097249, 0, 0.00091659488586538, 0.01139669664535999, 0.7199495439902751, 1, 0.0006333327434880798],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334026025443027],
[424.509126086195, 1090.867238537914, 0, 1, 0.2801344510817251, 0, 0.0009167018356333596, 0.01139802643028543, 0.7198655489182748, 1, 0.0006331785181226754],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006334125582550991],
[424.1048285007735, 1091.271536123336, 0, 1, 0.2798676542681681, 0, 0.0009163622131595485, 0.01139380365491579, 0.7201323457318319, 1, 0.0006332711991020735],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 0, 1, 0.2800272409252904, 0, 0.0009165653308198602, 0.01139632916579697, 0.7199727590747096, 1, 0.0006332717271266853],
[424.2029659707659, 1091.156986421877, 1, 0, 0.2799354472189794, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799354472189794, 0.0006332717271266853],
[424.3466623490862, 1091.029702275023, 1, 0, 0.2800272409252904, 0.002356563839725352, 0, -0.02930088703409924, 1, 0.2800272409252904, 0.0006333964361972621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[424.3091276315089, 1091.0672369926, 1, 0, 0.2800024716874605, 0.00235677230320732, 0, -0.02930347901350286, 1, 0.2800024716874605, 0.0006335733450014063],
[424.3278949902976, 1091.048469633812, 0, 1, 0.2800148563063755, 0, 0.0009165495647829741, 0.01139613313509413, 0.7199851436936245, 1, 0.0006333189303740162],
[424.219378202232, 1091.156986421877, 1, 0, 0.2799432458532901, 0.002357270910720359, 0, -0.02930967856649931, 1, 0.2799432458532901, 0.0006331285016589411],
[424.5529909962642, 1091.011243200816, 0, 1, 0.2801286685293052, 0, 0.0009165808384029054, 0.01139652198295359, 0.7198713314706948, 1, 0.0006329662220772017],
[424.2029659707659, 1091.173398653343, 1, 0, 0.2799324153877706, 0.002357362112524492, 0, -0.02931081254543727, 1, 0.2799324153877707, 0.0006331380147299371]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 3, 0, 0.3333333333333333, 3, 0, -37.30120085036287, 1, 0.03703703703703698, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9989979997962497, 2.00100200020375, 0, 1, 0.3329993332654166, 0, 0.4997496253867692, 6.213753717148495, 0.6670006667345834, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -24.86746723357525, 1, 0.1111111111111109, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386974765099, 0, 1, 0.3208375612887768, 0, 0.4908247732933971, 6.102784483650277, 0.6791624387112232, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763515659095403, 2.323648434090458, 0, 1, 0.2254505219698469, 0, 0.4303577018489151, 5.350953024722322, 0.7745494780301532, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.997092078023663, 1, 0, 0.3336567492645799, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3336567492645799, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.263286582403263, 2.360974271655112, 1, 0, 0.1003279007100589, 3.798142658361335, 0, -47.22509405262245, 1, 0.1003279007100589, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.001033723142701406, 2.99748614078186, 0, 1, 0.000344744470476322, 0, 0.3336128852756469, 4.148053746645324, 0.9996552555295237, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987209495650624, 2.001002087273699, 0, 1, 0.3329377203495286, 0, 0.4997496036410776, 6.213753446768358, 0.6670622796504714, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340828178868, 2.03866591718211, 1, 0, 0.3204446942726293, 1.040221103020476, 0, -12.9338320975176, 1, 0.3204446942726293, 0.08042636514665492],
[0.00293334260845221, 2.997066657391548, 0, 1, 0.0009777808694840697, 0, 0.3336595792868801, 4.148634327542498, 0.9990222191305159, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9989979999588973, 2.001002000041102, 1, 0, 0.3329993333196325, 1.001003005052206, 0, -12.44620471442305, 1, 0.3329993333196325, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962330517809, 2.001903766948219, 0, 1, 0.3326987443505936, 0, 0.4995245108731872, 6.210954703253344, 0.6673012556494065, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6762039903418111, 2, 1, 0, 0.2526728129777001, 1.478843683685621, 0, -18.38754842381595, 1, 0.2526728129777001, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 1, 0.2250241752607642, 0, 0.4301209440249232, 5.348009241007116, 0.7749758247392358, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763517120619016, 2.323648287938097, 0, 1, 0.2254505706873006, 0, 0.4303577289174671, 5.350953361285486, 0.7745494293126993, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.675349488945846, 2.324650511054152, 0, 1, 0.2251164963152821, 0, 0.4301721894301148, 5.348646412724353, 0.7748835036847179, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852259401651, 0, 1, 0.3333497497638299, 0, 0.5000369378781994, 6.217326084131713, 0.6666502502361702, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386975872445, 0, 1, 0.320837561170345, 0, 0.4908247730266276, 6.102784480333336, 0.679162438829655, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5182364239244887, 2.481763576075509, 0, 1, 0.1727454746414963, 0, 0.4029392685266707, 5.010039528603881, 0.8272545253585036, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.961334126626508, 2, 1, 0, 0.3246287266211464, 1.040221055616924, 0, -12.93383150811446, 1, 0.3246287266211464, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9995565295025087, 2.000443470497491, 1, 1, 0.3331855098341696, 1.000443667250828, 0.4998891569534377, -6.223761441719327, 0.8889874160365444, 0.5553584357048837, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1.000624653365639, 1.99809673534555, 0, 1, 0.3336837683996025, 0, 0.5004762693969671, 6.22278861520553, 0.6663162316003974, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9998522974199355, 2.000147702580064, 0, 1, 0.3332840991399785, 0, 0.499963077081789, 6.216407718664423, 0.6667159008600214, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6799837212048858, 2.316224958299696, 1, 1, 0.2269480513344351, 1.47062344114366, 0.4317369936010379, -12.91723734683577, 0.9484945819955026, 0.4023906846643728, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254845256869603, 0, 1, 0.2304066447800723, 0, 0.44348941327721, 5.514229226554266, 0.7695933552199277, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763512853917015, 2.323648714608297, 0, 1, 0.2254504284639006, 0, 0.4303576498948433, 5.350952378739232, 0.7745495715360994, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.998095818319961, 2.001904181680039, 0, 2, 0.3326986061066536, 0, 0.9990488147747206, 12.42190683307628, 0.4452911502920029, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.000147701617083, 0, 1, 0.3248704058234295, 0, 0.4999630773224989, 6.216407721657346, 0.6751295941765705, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.962613088934515, 1, 0, 0.3375398575450309, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3375398575450309, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6762039811557887, 2.32379601884421, 1, 0, 0.2254013270519297, 1.478843703775256, 0, -18.38754867360512, 1, 0.2254013270519297, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763517644148365, 2.323648235585162, 0, 1, 0.225450588138279, 0, 0.4303577386136379, 5.350953481845091, 0.7745494118617211, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613332781980718, 2, 1, 0, 0.3246285331258051, 1.040221973668076, 0, -12.93384292291793, 1, 0.3246285331258051, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -24.86746723357525, 1, 0.1111111111111109, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7464338999927285, 2.253566100007272, 1, 0, 0.2488112999975761, 1.339703354858001, 0, -16.65751463982109, 1, 0.2488112999975761, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962187899942, 2.001903781210006, 1, 1, 0.3326987395966647, 1.001907412506095, 0.4995245073145186, -6.246495216779929, 0.8893115486707907, 0.5547090278641201, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.958430892763633, 1.04129216813937, 1, 0, 0.6528705660495503, 0.5106128603745896, 0, -6.348824287203621, 1, 0.6528705660495503, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852297421654, 0, 1, 0.3333497455389691, 0, 0.5000369283717945, 6.217325965931607, 0.6666502544610309, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.403008388859472, 2.596991611140529, 0, 0, 0.134336129619824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.937147884599188, 1.05261687633979, 2, 0, 0.6479265224835948, 1.032445698080411, 0, -12.83715478373017, 1, 0.4198087785376844, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823608981, 2.038665917639099, 1, 0, 0.3204446941202996, 1.040221103514965, 0, -12.93383210366595, 1, 0.3204446941202996, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613338269166983, 2.001002226712188, 1, 0, 0.3245188288948704, 1.040221379920975, 0, -12.93383554042465, 1, 0.3245188288948704, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987213803763133, 2.001278619623687, 0, 1, 0.3329071267921044, 0, 0.4996805493220312, 6.212894843760246, 0.6670928732078956, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9974389040154594, 2.002006521105601, 0, 1, 0.3325411076533262, 0, 0.4994988724850674, 6.210635922365099, 0.6674588923466738, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987215028516381, 2.001278497148362, 0, 1, 0.3329071676172127, 0, 0.499680579901752, 6.212895223980349, 0.6670928323827874, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390654025517, 2.361700347255727, 0, 1, 0.100557985354396, 0, 0.4234237426276328, 5.264738022855229, 0.8994420146456039, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9535507908620039, 2.038863005552078, 1, 1, 0.3186560602028631, 1.048711835366427, 0.4904694416823864, -6.941037216665245, 0.8984583152959891, 0.5357704357017157, 0.08042636514665492],
[0.002933323460186552, 2.997066676539813, 0, 1, 0.0009777744867288508, 0, 0.3336595771551284, 4.148634301036864, 0.9990222255132711, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987213803802031, 2.001278619619796, 0, 1, 0.3329071267934011, 0, 0.4996805493230025, 6.212894843772323, 0.6670928732065989, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1.158115288136135, 1.518088655885625, 0, 1, 0.4327455277551592, 0, 0.6587230568669378, 8.190387016319551, 0.5672544722448408, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340736141277, 2.038665926385869, 1, 0, 0.3204446912047096, 1.040221112979495, 0, -12.93383222134539, 1, 0.3204446912047096, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386974672137, 0, 1, 0.3208375612987193, 0, 0.4908247733157926, 6.102784483928736, 0.6791624387012807, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340656415327, 2.038665934358464, 1, 0, 0.3204446885471779, 1.040221121606321, 0, -12.93383232860905, 1, 0.3204446885471779, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823764124, 2.038665917623585, 1, 0, 0.3204446941254711, 1.040221103498178, 0, -12.93383210345722, 1, 0.3204446941254711, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390759940419, 2.361700346308166, 0, 1, 0.1005579890187795, 0, 0.4234237427975189, 5.264738024967548, 0.8994420109812205, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390759903626, 1.777283031361176, 0, 1, 0.1293470908091685, 0, 0.5626565844350213, 6.99592208859663, 0.8706529091908315, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6753495541718033, 2.324650445828195, 0, 1, 0.2251165180572679, 0, 0.4301722015000555, 5.34864656279878, 0.7748834819427322, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.155964737203245, 1.521389484750123, 1, 1, 0.4317563689274801, 0.8650782915916726, 0.657293881694103, -2.583536002387791, 0.8135864378905575, 0.677099175745518, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9602000361306321, 2.039799963869365, 1, 0, 0.320066678710211, 1.041449658791674, 0, -12.94910763271004, 1, 0.320066678710211, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.676010163747675, 2.32108494050239, 0, 2, 0.225555125958149, 0, 0.8616660101922456, 10.71372563737059, 0.5997648629296984, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.959297587161214, 1.039421786824191, 1, 0, 0.6533781067206825, 0.510386991007772, 0, -6.346015887664418, 1, 0.6533781067206825, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.323647507791762, 0, 1, 0.2251202240369536, 0, 0.4303578734066824, 5.3509551578259, 0.7748797759630464, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658182963, 2.038665934181701, 1, 0, 0.320444688606099, 1.040221121415053, 0, -12.93383232623086, 1, 0.320444688606099, 0.08042636514665492],
[0.9987210416899464, 2.001278958310054, 0, 1, 0.3329070138966488, 0, 0.4996804647586128, 6.212893792321228, 0.6670929861033512, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658159827, 2.038665934184015, 1, 0, 0.3204446886053278, 1.040221121417556, 0, -12.93383232626199, 1, 0.3204446886053278, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852259401575, 0, 1, 0.3333497497638383, 0, 0.5000369378782183, 6.217326084131949, 0.6666502502361618, 1, 0.08042636514665492],
[0.6757821648731592, 2.324217835126839, 0, 0.75, 0.2252607216243865, 0, 0.3226892026491442, 4.012231586753059, 0.8257844128492056, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.960200672064773, 2.039799327935224, 1, 0, 0.3200668906882579, 1.041448969046902, 0, -12.94909905660728, 1, 0.320066890688258, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.007585734323885, 1.992414265676115, 0, 1, 0.335861911441295, 0, 0.5019036538872881, 6.240536333726915, 0.6641380885587049, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390654043035, 2.00127861128407, 0, 1, 0.1165571911266314, 0, 0.499680551404272, 6.212894869650275, 0.8834428088733686, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.32364851472388, 0, 1, 0.2251201484444657, 0, 0.4303576869149809, 5.350952839037762, 0.7748798515555343, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.962465282422798, 0, 0, 0.3375566984475066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2641591561246347, 1.998256075301678, 1, 0, 0.1167598027343985, 3.785596587567017, 0, -47.06909955042855, 1, 0.1167598027343985, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9364551357687256, 1.993462551790388, 0, 1, 0.3196182403843834, 0, 0.5016397218507417, 6.237254673091561, 0.6803817596156165, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.323648422271495, 0, 2, 0.2251201553850564, 0, 0.8607154080757575, 10.70190610387863, 0.6004387735904791, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658172226, 2.038665934182775, 1, 0, 0.3204446886057412, 1.040221121416214, 0, -12.93383232624531, 1, 0.3204446886057412, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.002934330989019392, 2.99706566901098, 0, 1, 0.0009781103296731307, 0, 0.3336596893220548, 4.148635695690547, 0.9990218896703269, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.000624813681228, 1.960709268825687, 0, 1, 0.3378966323293554, 0, 0.5100195199255231, 6.341446850115863, 0.6621033676706447, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9626129850027606, 2.037387014997237, 0, 1, 0.3208709950009205, 0, 0.490824763601115, 6.102784363139023, 0.6791290049990795, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823650905, 2, 1, 0, 0.3246287165267467, 1.040221103510429, 0, -12.93383210360954, 1, 0.3246287165267467, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658214516, 2.038665934178546, 1, 0, 0.3204446886071508, 1.040221121411638, 0, -12.93383232618841, 1, 0.3204446886071508, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962031281999, 2.0019037968718, 0, 1, 0.3326987343760666, 0, 0.4995245034065136, 6.210954610414714, 0.6673012656239334, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 3, 0, 0.3333333333333333, 3, 0, -37.30120085036287, 1, 0.03703703703703698, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9989979997962497, 2.00100200020375, 0, 1, 0.3329993332654166, 0, 0.4997496253867692, 6.213753717148495, 0.6670006667345834, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -24.86746723357525, 1, 0.1111111111111109, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386974765099, 0, 1, 0.3208375612887768, 0, 0.4908247732933971, 6.102784483650277, 0.6791624387112232, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763515659095403, 2.323648434090458, 0, 1, 0.2254505219698469, 0, 0.4303577018489151, 5.350953024722322, 0.7745494780301532, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.997092078023663, 1, 0, 0.3336567492645799, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3336567492645799, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.263286582403263, 2.360974271655112, 1, 0, 0.1003279007100589, 3.798142658361335, 0, -47.22509405262245, 1, 0.1003279007100589, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.001033723142701406, 2.99748614078186, 0, 1, 0.000344744470476322, 0, 0.3336128852756469, 4.148053746645324, 0.9996552555295237, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987209495650624, 2.001002087273699, 0, 1, 0.3329377203495286, 0, 0.4997496036410776, 6.213753446768358, 0.6670622796504714, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340828178868, 2.03866591718211, 1, 0, 0.3204446942726293, 1.040221103020476, 0, -12.9338320975176, 1, 0.3204446942726293, 0.08042636514665492],
[0.00293334260845221, 2.997066657391548, 0, 1, 0.0009777808694840697, 0, 0.3336595792868801, 4.148634327542498, 0.9990222191305159, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9989979999588973, 2.001002000041102, 1, 0, 0.3329993333196325, 1.001003005052206, 0, -12.44620471442305, 1, 0.3329993333196325, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962330517809, 2.001903766948219, 0, 1, 0.3326987443505936, 0, 0.4995245108731872, 6.210954703253344, 0.6673012556494065, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6762039903418111, 2, 1, 0, 0.2526728129777001, 1.478843683685621, 0, -18.38754842381595, 1, 0.2526728129777001, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 1, 0.2250241752607642, 0, 0.4301209440249232, 5.348009241007116, 0.7749758247392358, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763517120619016, 2.323648287938097, 0, 1, 0.2254505706873006, 0, 0.4303577289174671, 5.350953361285486, 0.7745494293126993, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.675349488945846, 2.324650511054152, 0, 1, 0.2251164963152821, 0, 0.4301721894301148, 5.348646412724353, 0.7748835036847179, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852259401651, 0, 1, 0.3333497497638299, 0, 0.5000369378781994, 6.217326084131713, 0.6666502502361702, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386975872445, 0, 1, 0.320837561170345, 0, 0.4908247730266276, 6.102784480333336, 0.679162438829655, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5182364239244887, 2.481763576075509, 0, 1, 0.1727454746414963, 0, 0.4029392685266707, 5.010039528603881, 0.8272545253585036, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.961334126626508, 2, 1, 0, 0.3246287266211464, 1.040221055616924, 0, -12.93383150811446, 1, 0.3246287266211464, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9995565295025087, 2.000443470497491, 1, 1, 0.3331855098341696, 1.000443667250828, 0.4998891569534377, -6.223761441719327, 0.8889874160365444, 0.5553584357048837, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1.000624653365639, 1.99809673534555, 0, 1, 0.3336837683996025, 0, 0.5004762693969671, 6.22278861520553, 0.6663162316003974, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9998522974199355, 2.000147702580064, 0, 1, 0.3332840991399785, 0, 0.499963077081789, 6.216407718664423, 0.6667159008600214, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6799837212048858, 2.316224958299696, 1, 1, 0.2269480513344351, 1.47062344114366, 0.4317369936010379, -12.91723734683577, 0.9484945819955026, 0.4023906846643728, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254845256869603, 0, 1, 0.2304066447800723, 0, 0.44348941327721, 5.514229226554266, 0.7695933552199277, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763512853917015, 2.323648714608297, 0, 1, 0.2254504284639006, 0, 0.4303576498948433, 5.350952378739232, 0.7745495715360994, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.998095818319961, 2.001904181680039, 0, 2, 0.3326986061066536, 0, 0.9990488147747206, 12.42190683307628, 0.4452911502920029, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.000147701617083, 0, 1, 0.3248704058234295, 0, 0.4999630773224989, 6.216407721657346, 0.6751295941765705, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.962613088934515, 1, 0, 0.3375398575450309, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3375398575450309, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6762039811557887, 2.32379601884421, 1, 0, 0.2254013270519297, 1.478843703775256, 0, -18.38754867360512, 1, 0.2254013270519297, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6763517644148365, 2.323648235585162, 0, 1, 0.225450588138279, 0, 0.4303577386136379, 5.350953481845091, 0.7745494118617211, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613332781980718, 2, 1, 0, 0.3246285331258051, 1.040221973668076, 0, -12.93384292291793, 1, 0.3246285331258051, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -24.86746723357525, 1, 0.1111111111111109, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7464338999927285, 2.253566100007272, 1, 0, 0.2488112999975761, 1.339703354858001, 0, -16.65751463982109, 1, 0.2488112999975761, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962187899942, 2.001903781210006, 1, 1, 0.3326987395966647, 1.001907412506095, 0.4995245073145186, -6.246495216779929, 0.8893115486707907, 0.5547090278641201, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.958430892763633, 1.04129216813937, 1, 0, 0.6528705660495503, 0.5106128603745896, 0, -6.348824287203621, 1, 0.6528705660495503, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852297421654, 0, 1, 0.3333497455389691, 0, 0.5000369283717945, 6.217325965931607, 0.6666502544610309, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.403008388859472, 2.596991611140529, 0, 0, 0.134336129619824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.937147884599188, 1.05261687633979, 2, 0, 0.6479265224835948, 1.032445698080411, 0, -12.83715478373017, 1, 0.4198087785376844, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823608981, 2.038665917639099, 1, 0, 0.3204446941202996, 1.040221103514965, 0, -12.93383210366595, 1, 0.3204446941202996, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2, 0, 0, 0.1159889784073262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613338269166983, 2.001002226712188, 1, 0, 0.3245188288948704, 1.040221379920975, 0, -12.93383554042465, 1, 0.3245188288948704, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987213803763133, 2.001278619623687, 0, 1, 0.3329071267921044, 0, 0.4996805493220312, 6.212894843760246, 0.6670928732078956, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9974389040154594, 2.002006521105601, 0, 1, 0.3325411076533262, 0, 0.4994988724850674, 6.210635922365099, 0.6674588923466738, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987215028516381, 2.001278497148362, 0, 1, 0.3329071676172127, 0, 0.499680579901752, 6.212895223980349, 0.6670928323827874, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390654025517, 2.361700347255727, 0, 1, 0.100557985354396, 0, 0.4234237426276328, 5.264738022855229, 0.8994420146456039, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9535507908620039, 2.038863005552078, 1, 1, 0.3186560602028631, 1.048711835366427, 0.4904694416823864, -6.941037216665245, 0.8984583152959891, 0.5357704357017157, 0.08042636514665492],
[0.002933323460186552, 2.997066676539813, 0, 1, 0.0009777744867288508, 0, 0.3336595771551284, 4.148634301036864, 0.9990222255132711, 1, 0.08042636514665492],
[0.9987213803802031, 2.001278619619796, 0, 1, 0.3329071267934011, 0, 0.4996805493230025, 6.212894843772323, 0.6670928732065989, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1.158115288136135, 1.518088655885625, 0, 1, 0.4327455277551592, 0, 0.6587230568669378, 8.190387016319551, 0.5672544722448408, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340736141277, 2.038665926385869, 1, 0, 0.3204446912047096, 1.040221112979495, 0, -12.93383222134539, 1, 0.3204446912047096, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.037386974672137, 0, 1, 0.3208375612987193, 0, 0.4908247733157926, 6.102784483928736, 0.6791624387012807, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340656415327, 2.038665934358464, 1, 0, 0.3204446885471779, 1.040221121606321, 0, -12.93383232860905, 1, 0.3204446885471779, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823764124, 2.038665917623585, 1, 0, 0.3204446941254711, 1.040221103498178, 0, -12.93383210345722, 1, 0.3204446941254711, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390759940419, 2.361700346308166, 0, 1, 0.1005579890187795, 0, 0.4234237427975189, 5.264738024967548, 0.8994420109812205, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390759903626, 1.777283031361176, 0, 1, 0.1293470908091685, 0, 0.5626565844350213, 6.99592208859663, 0.8706529091908315, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6753495541718033, 2.324650445828195, 0, 1, 0.2251165180572679, 0, 0.4301722015000555, 5.34864656279878, 0.7748834819427322, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.778747534801097, 0, 0, 0.2137837873025163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.155964737203245, 1.521389484750123, 1, 1, 0.4317563689274801, 0.8650782915916726, 0.657293881694103, -2.583536002387791, 0.8135864378905575, 0.677099175745518, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9602000361306321, 2.039799963869365, 1, 0, 0.320066678710211, 1.041449658791674, 0, -12.94910763271004, 1, 0.320066678710211, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.676010163747675, 2.32108494050239, 0, 2, 0.225555125958149, 0, 0.8616660101922456, 10.71372563737059, 0.5997648629296984, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.959297587161214, 1.039421786824191, 1, 0, 0.6533781067206825, 0.510386991007772, 0, -6.346015887664418, 1, 0.6533781067206825, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.323647507791762, 0, 1, 0.2251202240369536, 0, 0.4303578734066824, 5.3509551578259, 0.7748797759630464, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.7454317062917417, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2484772354305806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658182963, 2.038665934181701, 1, 0, 0.320444688606099, 1.040221121415053, 0, -12.93383232623086, 1, 0.320444688606099, 0.08042636514665492],
[0.9987210416899464, 2.001278958310054, 0, 1, 0.3329070138966488, 0, 0.4996804647586128, 6.212893792321228, 0.6670929861033512, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658159827, 2.038665934184015, 1, 0, 0.3204446886053278, 1.040221121417556, 0, -12.93383232626199, 1, 0.3204446886053278, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.999852259401575, 0, 1, 0.3333497497638383, 0, 0.5000369378782183, 6.217326084131949, 0.6666502502361618, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.960200672064773, 2.039799327935224, 1, 0, 0.3200668906882579, 1.041448969046902, 0, -12.94909905660728, 1, 0.320066890688258, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.007585734323885, 1.992414265676115, 0, 1, 0.335861911441295, 0, 0.5019036538872881, 6.240536333726915, 0.6641380885587049, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2640390654043035, 2.00127861128407, 0, 1, 0.1165571911266314, 0, 0.499680551404272, 6.212894869650275, 0.8834428088733686, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.32364851472388, 0, 1, 0.2251201484444657, 0, 0.4303576869149809, 5.350952839037762, 0.7748798515555343, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.262415231426312, 0, 0, 0.4420055107963369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 1.962465282422798, 0, 0, 0.3375566984475066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.962465282422798, 1.037534717577202, 0, 0, 0.6541550941409326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 2.361845622632063, 0, 0, 0.09999586398604081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.5163323033747834, 2.483667696625214, 0, 0, 0.1721107677915946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.158740222407509, 1.516332303374784, 0, 0, 0.433162170834471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 6.216866808393813, 0.6666666666666667, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.254568293708259, 0, 0, 0.2304284270246084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2641591561246347, 1.998256075301678, 1, 0, 0.1167598027343985, 3.785596587567017, 0, -47.06909955042855, 1, 0.1167598027343985, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2, 0, 0, 0.3248866031049866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9364551357687256, 1.993462551790388, 0, 1, 0.3196182403843834, 0, 0.5016397218507417, 6.237254673091561, 0.6803817596156165, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -12.43373361678763, 1, 0.3333333333333333, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.323648422271495, 0, 2, 0.2251201553850564, 0, 0.8607154080757575, 10.70190610387863, 0.6004387735904791, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658172226, 2.038665934182775, 1, 0, 0.3204446886057412, 1.040221121416214, 0, -12.93383232624531, 1, 0.3204446886057412, 0.08042636514665492],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.002934330989019392, 2.99706566901098, 0, 1, 0.0009781103296731307, 0, 0.3336596893220548, 4.148635695690547, 0.9990218896703269, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1.000624813681228, 1.960709268825687, 0, 1, 0.3378966323293554, 0, 0.5100195199255231, 6.341446850115863, 0.6621033676706447, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9626129850027606, 2.037387014997237, 0, 1, 0.3208709950009205, 0, 0.490824763601115, 6.102784363139023, 0.6791290049990795, 1, 0.08042636514665492],
[0.9374877572086054, 1.992153062281945, 0, 0, 0.3200009198983067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340823650905, 2, 1, 0, 0.3246287165267467, 1.040221103510429, 0, -12.93383210360954, 1, 0.3246287165267467, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 2.140593157433159, 0, 0, 0.1843062574656907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.4836676966252164, 1.553867020951985, 0, 0, 0.2373788738188164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2, 0, 0, 0.2523567190332066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9624652824227974, 2.0375347175772, 0, 0, 0.3208217608075994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0, 2.475169537147373, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9613340658214516, 2.038665934178546, 1, 0, 0.3204446886071508, 1.040221121411638, 0, -12.93383232618841, 1, 0.3204446886071508, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.6750725257822923, 2.324927474217706, 0, 0, 0.2250241752607642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.9980962031281999, 2.0019037968718, 0, 1, 0.3326987343760666, 0, 0.4995245034065136, 6.210954610414714, 0.6673012656239334, 1, 0.08042636514665492],
[0.6242608540583757, 2, 0, 0, 0.2378806409785699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492],
[0.2624152314263126, 1.775119486150889, 0, 0, 0.128790557119118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08042636514665492]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.0006333964361972621,
"Nucleotide GTR":0.0006329260067461959,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node132":{
"Global MG94xREV":0.0006333189303740162,
"Nucleotide GTR":0.0006328485584872493,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node136":{
"Global MG94xREV":0.0006332371607641933,
"Nucleotide GTR":0.0006327668496084796,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node143":{
"Global MG94xREV":0.0006331992530723788,
"Nucleotide GTR":0.0006327289700710619,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node172":{
"Global MG94xREV":0.0006333480806990481,
"Nucleotide GTR":0.0006328776871620624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node2":{
"Global MG94xREV":0.0006333924808340572,
"Nucleotide GTR":0.0006329220543206767,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node33":{
"Global MG94xREV":0.0006329097207964104,
"Nucleotide GTR":0.0006324396528334191,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node37":{
"Global MG94xREV":0.0006332483651649673,
"Nucleotide GTR":0.0006327780456876405,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node59":{
"Global MG94xREV":0.0006330817996723762,
"Nucleotide GTR":0.0006326116039047969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.0006331039805845435,
"Nucleotide GTR":0.0006326337683429935,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node76":{
"Global MG94xREV":0.0006331201755210027,
"Nucleotide GTR":0.0006326499512513215,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380160247811,
"Nucleotide GTR":0.0006326677785047911,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332822030988317,
"Nucleotide GTR":0.0006328118584897549,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCC", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006336272738790956,
"Nucleotide GTR":0.0006331566729827268,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "Q", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAA", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006336370748352657,
"Nucleotide GTR":0.0006331664666596344,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "Y", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TAT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001268714755607769,
"Nucleotide GTR":0.001267772469305018,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "A", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTA", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GCT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331432239316663,
"Nucleotide GTR":0.0006326729825437155,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332823568511444,
"Nucleotide GTR":0.0006328120121278737,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAY", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413809_China_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006329662219416535,
"Nucleotide GTR":0.0006324961120147345,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "F", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TTC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413809_China_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "AS", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "KCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "VF", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "KTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414648_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331286060229575,
"Nucleotide GTR":0.0006326583754918634,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "TTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414648_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331836211046267,
"Nucleotide GTR":0.0006327133497133184,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "F", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TTT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006331287482463962,
"Nucleotide GTR":0.0006326585176096721,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006339964979351573,
"Nucleotide GTR":0.0006335256228126313,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCA", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000632966217323419,
"Nucleotide GTR":0.0006324961073999298,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001267494572225364,
"Nucleotide GTR":0.001266553192164211,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACC", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006335006259658749,
"Nucleotide GTR":0.0006330301191320934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "E", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAG", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332508691227148,
"Nucleotide GTR":0.0006327805477856748,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "S", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TCA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334597123003827,
"Nucleotide GTR":0.0006329892358535639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "T", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "ACT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331785181226754,
"Nucleotide GTR":0.0006327082505213987,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006330200344183189,
"Nucleotide GTR":0.00063254988452437,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "A", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "GCA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331285001180418,
"Nucleotide GTR":0.0006326582696656057,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006333663861368383,
"Nucleotide GTR":0.0006328959790042325,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006333944453782826,
"Nucleotide GTR":0.0006329240174058157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTG", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329662225485895,
"Nucleotide GTR":0.0006324961126212196,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "L", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CTC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331286742194992,
"Nucleotide GTR":0.0006326584436377549,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTT", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417163_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006332717271266853,
"Nucleotide GTR":0.000632801390298211,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417163_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332717271266853,
"Nucleotide GTR":0.000632801390298211,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "LF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTK", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334026025443027,
"Nucleotide GTR":0.0006329321685134324,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006331286798516753,
"Nucleotide GTR":0.0006326584492657487,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006333674734050343,
"Nucleotide GTR":0.0006328970654649045,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "N", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "AAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTY", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331286741685997,
"Nucleotide GTR":0.0006326584435868939,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "L", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TTA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331287556856695,
"Nucleotide GTR":0.0006326585250434203,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTT", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331287472097379,
"Nucleotide GTR":0.0006326585165737841,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAT", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417694_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331836208614925,
"Nucleotide GTR":0.0006327133494703648,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "C", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "TGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417694_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331285016589411,
"Nucleotide GTR":0.0006326582712053601,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATT", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417765_Reykjavik_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331286794909059,
"Nucleotide GTR":0.0006326584489052466,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417765_Reykjavik_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417818_Reykjavik_20200316_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000633368519417165,
"Nucleotide GTR":0.0006328981107001528,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417818_Reykjavik_20200316_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001267771523358259,
"Nucleotide GTR":0.001266829937602912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "L", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCA", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CTA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331836261552829,
"Nucleotide GTR":0.0006327133547602227,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "I", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334597161531953,
"Nucleotide GTR":0.0006329892397035149,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417954_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331336514300556,
"Nucleotide GTR":0.0006326634171516912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417954_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332380027433531,
"Nucleotide GTR":0.0006327676909622934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCC", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331836265941056,
"Nucleotide GTR":0.00063271335519872,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418065_Idaho_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006332711991020735,
"Nucleotide GTR":0.0006328008626657684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418065_Idaho_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332949102214055,
"Nucleotide GTR":0.0006328245561746302,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "F", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTT", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418222_Centre_Val_de_Loire_20200304_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006331287488199998,
"Nucleotide GTR":0.0006326585181828497,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "I", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ATC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418222_Centre_Val_de_Loire_20200304_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331427606630769,
"Nucleotide GTR":0.0006326725196191999,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418261_Abruzzo_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "IV", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "RTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418261_Abruzzo_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332714274578207,
"Nucleotide GTR":0.0006328010908519129,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTC", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000633039650024986,
"Nucleotide GTR":0.0006325694855623435,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "G", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GGT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334125582550991,
"Nucleotide GTR":0.0006329421168300301,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006335733450014063,
"Nucleotide GTR":0.0006331027841585175,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334157414634107,
"Nucleotide GTR":0.0006329452976741423,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCT", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006336415343237928,
"Nucleotide GTR":0.0006331709228360577,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "K", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "AAG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703483073905,
"Nucleotide GTR":0.0006325002353157814,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "I", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "ATC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331332740927001,
"Nucleotide GTR":0.0006326630400945873,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "S", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "TCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006331287538364225,
"Nucleotide GTR":0.0006326585231955465,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "L", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CTT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331386011961549,
"Nucleotide GTR":0.0006326683632415532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00063296622326862,
"Nucleotide GTR":0.0006324961133407153,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418662_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331285022140908,
"Nucleotide GTR":0.0006326582717600967,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418662_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTR", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418677_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418688_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703492254906,
"Nucleotide GTR":0.0006325002362331986,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418688_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418723_England_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001267850502361034,
"Nucleotide GTR":0.001266908857947244,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418723_England_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACY", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418737_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006335343632653299,
"Nucleotide GTR":0.0006330638313745414,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006333327434880798,
"Nucleotide GTR":0.0006328623613421842,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "I", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "ATT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331431590489892,
"Nucleotide GTR":0.0006326729177092272,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "Y", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "TAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331287492915898,
"Nucleotide GTR":0.0006326585186540899,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "S", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "TCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419248_Hong_Kong_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703506122779,
"Nucleotide GTR":0.0006325002376189568,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419248_Hong_Kong_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332716529093651,
"Nucleotide GTR":0.0006328013161360126,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAC", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419397_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000632970349178092,
"Nucleotide GTR":0.0006325002361858367,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419397_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KR", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "ARG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703512199686,
"Nucleotide GTR":0.0006325002382261964,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "F", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "TTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "EV", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GWG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332508698808707,
"Nucleotide GTR":0.0006327805485432674,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGC", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334807775372205,
"Nucleotide GTR":0.0006330102854450532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAA", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006334125899893613,
"Nucleotide GTR":0.0006329421485407216,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGC", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703492943142,
"Nucleotide GTR":0.0006325002363019713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "F", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419926_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419926_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACY", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703487412127,
"Nucleotide GTR":0.0006325002357492812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "F", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "TTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703489422553,
"Nucleotide GTR":0.0006325002359501744,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006332508690672457,
"Nucleotide GTR":0.0006327805477302473,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420055_Grand_Est_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331377053069734,
"Nucleotide GTR":0.0006326674680177572,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTT", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420055_Grand_Est_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380129638854,
"Nucleotide GTR":0.0006326677754461686,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331287558930515,
"Nucleotide GTR":0.0006326585252506491,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAT", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "AV", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GYC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329703486816811,
"Nucleotide GTR":0.0006325002356897944,
"amino-acid": [
["S", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAR", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380153309011,
"Nucleotide GTR":0.0006326677778114268,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAT", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14":{
"Global MG94xREV":0.000633138015213552,
"Nucleotide GTR":0.0006326677776941641,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006329703413777223,
"Nucleotide GTR":0.0006325002283912596,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420259_South_Yorkshire_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006332768628491414,
"Nucleotide GTR":0.0006328065222063178,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420259_South_Yorkshire_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006331332734986801,
"Nucleotide GTR":0.0006326630395010087,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420275_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331332722857067,
"Nucleotide GTR":0.0006326630382889361,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "I", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ATA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420275_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331331310982285,
"Nucleotide GTR":0.0006326628972063199,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331332737690488,
"Nucleotide GTR":0.0006326630397711766,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "S", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "TCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331843690054398,
"Nucleotide GTR":0.0006327140970586581,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "Y", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "TAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001267849949126052,
"Nucleotide GTR":0.001266908305123154,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Q", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAG", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331381136638628,
"Nucleotide GTR":0.0006326678760713556,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "HP", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CMT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420592_Abruzzo_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "HY", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "YAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420592_Abruzzo_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331377062888379,
"Nucleotide GTR":0.0006326674689988914,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTT", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006339635988869776,
"Nucleotide GTR":0.0006334927481988827,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420717_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006331380153093406,
"Nucleotide GTR":0.0006326677777898819,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420717_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAY", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420718_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329662227600501,
"Nucleotide GTR":0.0006324961128325234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "D", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAT", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAY", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420730_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421005_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329662251068791,
"Nucleotide GTR":0.0006324961151776086,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "L", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "TTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421005_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421184_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380151793159,
"Nucleotide GTR":0.0006326677776599543,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "F", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "TTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421184_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006332716112071984,
"Nucleotide GTR":0.0006328012744648188,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331287489078787,
"Nucleotide GTR":0.0006326585182706633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "V", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421205_Li_ge_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421205_Li_ge_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329662220772017,
"Nucleotide GTR":0.0006324961121501822,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332508685124504,
"Nucleotide GTR":0.0006327805471758638,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATC", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421311_Wisconsin_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006341605864207662,
"Nucleotide GTR":0.000633689589428189,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGA", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421311_Wisconsin_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006336370676987152,
"Nucleotide GTR":0.0006331664595283845,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCA", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380152016556,
"Nucleotide GTR":0.0006326677776822781,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "Y", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "TAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006331286044300885,
"Nucleotide GTR":0.000632658373900178,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421364_New_York_20200317_null_432":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421364_New_York_20200317_null_432",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421401_New_York_20200317_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421401_New_York_20200317_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421422_New_York_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000633578843040974,
"Nucleotide GTR":0.0006331082781146408,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421422_New_York_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_30":{
"Global MG94xREV":0.0006332767865715442,
"Nucleotide GTR":0.0006328064459853727,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_3231":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_3231",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332508696726364,
"Nucleotide GTR":0.0006327805483351886,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "L", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "CTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331380147299371,
"Nucleotide GTR":0.0006326677772109089,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAT", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006331287535464221,
"Nucleotide GTR":0.0006326585229057618,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAT", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006329662184258407,
"Nucleotide GTR":0.0006324961085015329,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "S", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "TCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006332767942943837,
"Nucleotide GTR":0.0006328064537024766,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6637.601367503645,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02962009926537624],
[0.01558929476758025],
[0.01208848461964169],
[0.04280247171251388],
[0.01704728447322559],
[0.008972121945268302],
[0.006957297283676966],
[0.0246341480797582],
[0.01620268377610957],
[0.008527601854019443],
[0.006612600851522859],
[0.02341365934598357],
[0.0236178148356476],
[0.01243024454240847],
[0.009638846542422108],
[0.03412888128284793],
[0.01765987403562915],
[0.009294532723648616],
[0.007207305882126354],
[0.02551936953635235],
[0.01016380444067619],
[0.005349291437755403],
[0.004148027748231769],
[0.01468718751297675],
[0.009660242930370629],
[0.00508426299381168],
[0.003942515419666147],
[0.01395951684897059],
[0.01408123690800373],
[0.007411067427029167],
[0.005746800990194854],
[0.02034806632591412],
[0.03055604360873971],
[0.01608188974925196],
[0.01247046000393135],
[0.04415495641968466],
[0.01758594942939182],
[0.009255625613078662],
[0.007177135947261969],
[0.02541254491571272],
[0.01671466079859319],
[0.008797059449222537],
[0.006821547698947431],
[0.02415349083088099],
[0.02436409728392653],
[0.01282301895419754],
[0.009943417564183465],
[0.03520729540617072],
[0.01542712433402439],
[0.04235721132720666],
[0.0168699470403789],
[0.008878787838275469],
[0.006884922751429539],
[0.02437788693812648],
[0.008438891946966173],
[0.006543812085705601],
[0.02317009455720534],
[0.02337212628278862],
[0.01230093669515166],
[0.009538576713281816],
[0.03377384947692392]
],
"Log Likelihood":-3151.422259440731,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.69445708491378, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":167
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":7043.150025955082,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2935053225133568],
[0.1825086017019482],
[0.1997568645394557],
[0.3242292112452393]
],
"Log Likelihood":-3234.203747262216,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3181525999584187,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4786178968967811,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":7.385012564077736,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.544407939022661
},
"display order":0,
"estimated parameters":287
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-08/sequences.exonuclease.compressed.fas",
"number of sequences":141,
"number of sites":527,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1,epi_isl_421422_New_York_20200317_null_3,epi_isl_421434_New_York_20200317_null_27)Node2,epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1,epi_isl_419397_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_420055_Grand_Est_20200317_null_1,epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1,epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,epi_isl_421426_New_York_20200317_null_30,epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_2,epi_isl_421311_Wisconsin_20200318_null_2,epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1,epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1,epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1,epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1,epi_isl_421359_New_York_20200317_null_5,epi_isl_417694_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_1,epi_isl_418222_Centre_Val_de_Loire_20200304_null_10,epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_8,epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1,epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_6,epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_5,epi_isl_414648_California_20200311_null_1,epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1,epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1,epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1,epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_419248_Hong_Kong_20200224_null_1,epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1,epi_isl_417954_Madrid_20200312_null_1,(epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1,epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2)Node172,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2,epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_4,epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_420717_England_20200326_null_2,epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_4,epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1,epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_5,epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2,epi_isl_420259_South_Yorkshire_20200324_null_2,epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1,epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_417765_Reykjavik_20200227_null_1,epi_isl_413809_China_20200201_null_2,epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1,(epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1,epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1)Node37,(epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1,epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2)Node33,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,(epi_isl_419926_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1)Node76,(epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_420730_England_20200327_null_1)Node73,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1,epi_isl_420592_Abruzzo_20200323_null_2,epi_isl_420718_England_20200327_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1,epi_isl_418737_England_20200317_null_1,epi_isl_418677_England_20200315_null_1,epi_isl_418261_Abruzzo_20200317_null_2,(epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1,epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1)Node59,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_418662_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_420275_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1,epi_isl_421005_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421184_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1,epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14,epi_isl_418723_England_20200316_null_5,epi_isl_421432_New_York_20200317_null_3231,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2,epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_418688_England_20200317_null_1,epi_isl_420301_New_York_20200318_null_2,epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_1,epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2,(epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2,epi_isl_421205_Li_ge_20200331_null_2)Node143,(epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1,epi_isl_421401_New_York_20200317_null_57,epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3)Node136,epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2,(epi_isl_417818_Reykjavik_20200316_null_8,epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1,epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1,epi_isl_421364_New_York_20200317_null_432,epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_418065_Idaho_20200313_null_2,epi_isl_417163_Washington_20200305_null_2,epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1)Node111,(epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1)Node132,epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node111":"test",
"Node132":"test",
"Node136":"test",
"Node143":"test",
"Node172":"test",
"Node2":"test",
"Node33":"test",
"Node37":"test",
"Node59":"test",
"Node73":"test",
"Node76":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":"test",
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_412967_Guangzhou_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413809_China_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414648_California_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_5":"test",
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"test",
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416526_Auckland_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417163_Washington_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417165_Washington_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_8":"test",
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417694_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417760_Reykjavik_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417765_Reykjavik_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_417818_Reykjavik_20200316_null_8":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417954_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418065_Idaho_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418222_Centre_Val_de_Loire_20200304_null_10":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418261_Abruzzo_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418263_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418309_Derbyshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_4":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_418662_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418688_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418723_England_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419248_Hong_Kong_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_419397_Minnesota_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419557_Georgia_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419926_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_420050_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420055_Grand_Est_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_420070_Dakar_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420107_Singapore_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420191_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420224_South_Yorkshire_20200326_null_14":"test",
"epi_isl_420257_Derbyshire_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_420259_South_Yorkshire_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_420275_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420287_South_Yorkshire_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420592_Abruzzo_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420717_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421005_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421184_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421205_Li_ge_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421311_Wisconsin_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_421364_New_York_20200317_null_432":"test",
"epi_isl_421401_New_York_20200317_null_57":"test",
"epi_isl_421422_New_York_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_30":"test",
"epi_isl_421432_New_York_20200317_null_3231":"test",
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_27":"test",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":7
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":8
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":16
}
}
}