{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221495265025244],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.2733023798712491, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001220752125439564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.0182526312239, 576.0220349104529, 1, 0, 0.2736535029058267, 0.004607907343624621, 0, -0.02599856546208068, 1, 0.2736535029058267, 0.001222010373647947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001221894960637979],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.2733023798712491, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001220752126007068],
[216.7748936555622, 575.7949730564244, 1, 0, 0.2735088763276644, 0.004613080339409228, 0, -0.02602775234877605, 1, 0.2735088763276643, 0.001221037877728024],
[215.9970867510815, 576.9055522089168, 0, 1, 0.2724131263258142, 0, 0.001733385986962848, 0.009780046709371973, 0.7275868736741857, 1, 0.001221587371762762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221769352146497],
[216.0194861781148, 576.8831527818834, 0, 1, 0.2724413762343563, 0, 0.001733453291498868, 0.009780426452551495, 0.7275586237656437, 1, 0.001220902852572242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221847904452606],
[216.500663584023, 576.458399077861, 1, 0, 0.2730288028454483, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730288028454483, 0.00122116580365882],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001221869571044314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221440179490678],
[216.504725479949, 576.6005001659455, 1, 0, 0.2729836073184745, 0.004618836830388778, 0, -0.02606023141061543, 1, 0.2729836073184745, 0.00122017986696625],
[216.6369373517688, 576.6672981470805, 0, 2, 0.273081785849211, 0, 0.003468204294618931, 0.01956817480591795, 0.5284100900641724, 1, 0.002442782142401193],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221198201554995],
[216.6899823210126, 576.2126566389857, 1, 0, 0.273286998521321, 0.004614888003999017, 0, -0.02603795148748837, 1, 0.2732869985213211, 0.001225318028464497],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001222249803514485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.504725479949, 576.3979134800493, 1, 0, 0.2730533546513667, 0.004618836830388778, 0, -0.02606023141061543, 1, 0.2730533546513667, 0.001220994681059155],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863644, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136356, 1, 0.001221869824835933],
[216.5584219449643, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730294124851215, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269705875148784, 1, 0.001222250165174767],
[216.6272462358037, 576.0728060382984, 0, 1, 0.2732776989409074, 0, 0.001735891695490862, 0.009794184325937677, 0.7267223010590926, 1, 0.001222249803537732],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221870435680982],
[216.6272462358037, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2731380896644392, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7268619103355608, 1, 0.001220102429385725],
[216.4304393135056, 576.3933765175734, 0, 2, 0.2729868036149141, 0, 0.003469852502614632, 0.01957747426449553, 0.5285481877180594, 1, 0.002443570780934527],
[217.0288427746546, 575.8737961853436, 0, 1, 0.2737143655610959, 0, 0.001736491583093585, 0.009797568989722396, 0.7262856344389041, 1, 0.001228648003940253],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165803140712],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 1, 0, 0.2730924871946331, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2730924871946331, 0.001221037878801725],
[216.5288427746546, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2730837711155334, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7269162288844666, 1, 0.001221165803568349],
[216.6468265680334, 576.2558123919648, 0, 1, 0.2732325709650756, 0, 0.001735340413919864, 0.009791073905318774, 0.7267674290349244, 1, 0.001220257330136557],
[216.2256496969527, 576.6769892630456, 1, 0, 0.2727013873740697, 0.004624798220754719, 0, -0.02609386654824214, 1, 0.2727013873740698, 0.001221869571017619],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.273302379871249, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001221470047886466],
[216.402260122874, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729318367807259, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270681632192741, 1, 0.001221870435959706],
[216.5584219449643, 576.6104164371112, 0, 1, 0.2730294124851214, 0, 0.001734273213756738, 0.009785052587780656, 0.7269705875148786, 1, 0.001222250165144412],
[216.2612335284707, 576.6414054315275, 0, 1, 0.2727462653070841, 0, 0.001734180013056214, 0.00978452673421352, 0.727253734692916, 1, 0.001220475329890822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4442398821372, 576.458399077861, 1, 0, 0.2729770708873334, 0.004620127569782135, 0, -0.02606751397298273, 1, 0.2729770708873334, 0.001221761447933992],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001220918265158673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221178838771953],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018176, 0.001220561496161806],
[216.6272462358037, 576.2529932971612, 0, 1, 0.2732155947831477, 0, 0.001735348903401395, 0.009791121804359454, 0.7267844052168523, 1, 0.001221178838722957],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.00122116582217902],
[216.8522323487333, 576.050406611265, 0, 1, 0.2734916264538671, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7265083735461328, 1, 0.00122025733010977],
[216.6272462358037, 576.050406611265, 0, 1, 0.2732854212021006, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7267145787978994, 1, 0.001221869571044314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.0091933021174, 0, 1, 0.2732996307387655, 0, 0.001736083402188859, 0.009795265966423416, 0.7267003692612345, 1, 0.001220179866992214],
[216.3925690069089, 576.4412456622501, 0, 1, 0.2729355950808016, 0, 0.001734782178626271, 0.009787924250661805, 0.7270644049191983, 1, 0.001222520222596256],
[216.4425967810496, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2731299998939422, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7268700001060578, 1, 0.001220656644152745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863643, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136357, 1, 0.001221940462759364],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.001221847879413624],
[216.6272462358037, 576.1769892630456, 0, 1, 0.2732417872357824, 0, 0.00173557781486387, 0.009792413360199962, 0.7267582127642176, 1, 0.001221869942426639],
[216.5288427746546, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2730837711155334, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7269162288844666, 1, 0.001221165822735251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.00122116582217902],
[216.7635200035494, 576.2079432472881, 0, 1, 0.2733560160095969, 0, 0.001735484579341933, 0.009791887310164726, 0.7266439839904031, 1, 0.001221037877804453],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018177, 0.001220483711796351],
[217.0828476817021, 576.1548149912126, 0, 2, 0.2736668439950443, 0, 0.003471289222898369, 0.01958558047487737, 0.5275598535121194, 1, 0.002458671476148107],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221198201659803],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221870494089173],
[216.500663584023, 576.458399077861, 1, 0, 0.2730288028454483, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730288028454483, 0.001221165822735251],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001229210593466542],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221165822171329],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.0814484309111, 574.5141725352106, 0.5, 1, 0.2733147549778429, 0.00231394228255494, 0.001740601098815734, -0.003234884555171051, 0.7942109923076895, 0.3805310922726209, 0.001222376726908898],
[216.6272462358037, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2731739741153545, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7268260258846455, 1, 0.001220561480381608],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221178839357397],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.00122209352024944],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730924871946331, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269075128053669, 1, 0.001221869571044314],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165803123065],
[216.9246595499074, 575.9779794100909, 0, 1, 0.2735829708354031, 0, 0.00173617748550767, 0.009795796799867014, 0.7264170291645968, 1, 0.001221869942315778],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221165822735251],
[216.4909724680579, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2731743693442503, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7268256306557497, 1, 0.001221605081063361],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165822129887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863643, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136357, 1, 0.001221870435680982],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018177, 0.001220561495643497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.4721996464926, 0, 0, 0.2731400801759648, 0, 0, 0, 1, 1, 1.376412186733691e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2731739741153545, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7268260258846455, 1, 0.001208024718437926],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.001220948874199203],
[215.6272462358037, 577.2753927241946, 1, 0, 0.2719466875764579, 0.004637632847689523, 0, -0.02616628160862905, 1, 0.2719466875764579, 0.001288820012839884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.1272462358037, 576.7753927241946, 0, 1, 0.2725772820220204, 0, 0.001733777155916541, 0.009782253748466061, 0.7274227179779796, 1, 0.001221649008517014],
[216.7594581076235, 576.5447773912258, 0, 1, 0.2732362294414321, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.7267637705585679, 1, 0.00122114877078374],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221605080923409],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221165822686556],
[216.1772740099444, 576.5003788371242, 0, 1, 0.272717760155718, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.727282239844282, 1, 0.001236549719629536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001222156735871883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.1110268723337, 575.8140115146979, 1, 0, 0.2738102801167448, 0.004605938327526878, 0, -0.02598745595182026, 1, 0.2738102801167448, 0.001220405916341899],
[216.4844442205531, 576.4405941664785, 0, 1, 0.2730200633604986, 0, 0.001734784139284951, 0.009787935313018147, 0.7269799366395014, 1, 0.001221869570323874],
[216.5869095776281, 576.4423120341507, 0, 1, 0.273113403233023, 0, 0.00173477896941881, 0.009787906143789412, 0.7268865967669771, 1, 0.00122056148042477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.00122173508689762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.9454401500277, 0, 1, 0.2729771953497911, 0, 0.001733266146864705, 0.009779370551974656, 0.7270228046502089, 1, 0.001221203017892807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730924871946331, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269075128053669, 1, 0.001221787976746156],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221215560167876],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.5062928040622, 576.5447773912258, 0, 1, 0.273004224999971, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.726995775000029, 1, 0.001221305989951221],
[216.500663584023, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2730918294785776, 0.004618923487095476, 0, -0.02606072034190111, 1, 0.2730918294785776, 0.001221044426140777],
[216.3094858817642, 576.9499507630183, 0, 1, 0.2726844155761698, 0, 0.001733252596135066, 0.009779294096545909, 0.7273155844238302, 1, 0.001221192410082586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729318367807259, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270681632192741, 1, 0.001221862654839706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221908999669051],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.00122099163865741],
[216.8916699794433, 576.5891759453273, 0, 1, 0.2733420360344863, 0, 0.001734337101213327, 0.009785413051240199, 0.7266579639655137, 1, 0.001221748958971009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.689083293547, 577.0167487441531, 0, 1, 0.2730093121997553, 0, 0.00173305194723801, 0.009778162002713286, 0.7269906878002447, 1, 0.00122165072482073],
[216.8916699794433, 576.7157585971079, 0, 1, 0.2732984371989431, 0, 0.001733956433638217, 0.009783265262638398, 0.7267015628010569, 1, 0.001221650793452293],
[216.9900734405923, 576.7157585971079, 0, 1, 0.2733885334866551, 0, 0.001733956433638217, 0.009783265262638398, 0.7266114665133449, 1, 0.001221537934814724],
[217.0182526312239, 576.6875794064763, 1, 0, 0.2734240368047538, 0.004607907343624621, 0, -0.02599856546208068, 1, 0.2734240368047538, 0.001221304474164642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6666838665136, 577.0391481711865, 0, 1, 0.2729810908787958, 0, 0.001732984673863646, 0.009777782435352917, 0.7270189091212043, 1, 0.001221889727349702],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221132673585105],
[216.7932665182943, 576.8337423904868, 0, 1, 0.2731677023144412, 0, 0.001733601775540813, 0.009781264223755798, 0.7268322976855588, 1, 0.001221132672962618],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221760706216945],
[216.8916699794433, 577.1491857711735, 0, 1, 0.2731492572563068, 0, 0.001732654268001475, 0.009775918231540616, 0.7268507427436932, 1, 0.001221132672917051],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221619404622314],
[217.1666838665136, 576.8023527746543, 0, 1, 0.273520343797313, 0, 0.001733696118244998, 0.009781796520694018, 0.726479656202687, 1, 0.001221132673070382],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221619404649343],
[216.7650873276627, 576.9407447100375, 1, 0, 0.2731050706420494, 0.004613289032511022, 0, -0.026028929829325, 1, 0.2731050706420494, 0.001221889997788543],
[217.2932665182943, 576.4125655194059, 1, 0, 0.2737705302737061, 0.004602075416431776, 0, -0.02596566077681111, 1, 0.2737705302737061, 0.001221459077616153],
[216.7488679641928, 576.9793635005408, 0, 1, 0.2730769290695479, 0, 0.001733164239935702, 0.009778795576445167, 0.7269230709304521, 1, 0.001221132673073066],
[217.1569927505485, 576.5488392871516, 0, 1, 0.2735988372329785, 0, 0.001734458439351653, 0.009786097660824783, 0.7264011627670215, 1, 0.001221166671090322],
[216.6666838665136, 577.0391481711865, 0, 1, 0.2729810908787958, 0, 0.001732984673863646, 0.009777782435352917, 0.7270189091212043, 1, 0.001222896864385163],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221324063911979],
[216.7594581076235, 576.5447773912258, 0, 1, 0.2732362294414321, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.7267637705585679, 1, 0.00122187066319139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.5062928040622, 576.797942694787, 0, 1, 0.2729171018076283, 0, 0.001733709373733239, 0.009781871310322602, 0.7270828981923716, 1, 0.001221296516171457],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221701850887636],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221751050474769],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221038787020075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221871072996988],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221864012447082],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221670760586144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221584970851848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.0450621381245, 575.9239745030434, 0, 1, 0.2737119006026728, 0, 0.001736340288425891, 0.009796715360508789, 0.7262880993973273, 1, 0.001221821328239298],
[216.6272462358037, 576.0785858018966, 0, 0, 0.2732757064230872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002005195456257255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.1769892630456, 0, 1, 0.2732417872357824, 0, 0.00173557781486387, 0.009792413360199962, 0.7267582127642176, 1, 0.0005318820714400561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 0, 0.2732078764675828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004887129845705127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221679283104373],
[216.500663584023, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2730918294785776, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730918294785776, 0.001220819029094952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001220580353778094],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221406289481334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.1272462358036, 576.7753927241946, 0, 1, 0.2725772820220204, 0, 0.001733777155916541, 0.009782253748466061, 0.7274227179779796, 1, 0.001221650751978817],
[216.8619234646984, 576.0407154952998, 0, 1, 0.2735038487816649, 0, 0.00173598839995219, 0.009794729948295252, 0.726496151218335, 1, 0.001220253275747951],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221304473708274],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221889997797597],
[216.4844442205531, 576.4405941664785, 0, 1, 0.2730200633604986, 0, 0.001734784139284951, 0.009787935313018147, 0.7269799366395014, 1, 0.001221132673585105],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001225247918203356],
[216.8102525894701, 576.0923863705282, 1, 0, 0.2734386820478323, 0.004612328005970725, 0, -0.02602350756069947, 1, 0.2734386820478323, 0.001221619404697753],
[216.8522323487333, 576.050406611265, 0, 1, 0.2734916264538671, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7265083735461328, 1, 0.001228556659623535],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221889997780227],
[217.0450621381246, 576.1207814253414, 0, 1, 0.2736439849237626, 0, 0.001735747142337007, 0.00979336873344569, 0.7263560150762374, 1, 0.001221132672917051],
[216.6272462358037, 576.0728060382984, 0, 1, 0.2732776989409074, 0, 0.001735891695490862, 0.009794184325937677, 0.7267223010590926, 1, 0.001221760705466267],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 0, 0.2732078764675828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004866694277676419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.0007344965117075773],
[216.6272462358037, 576.9409372202178, 0, 1, 0.272978744299429, 0, 0.001733279674723967, 0.009779446878365001, 0.7270212557005711, 1, 0.001222430894035386],
[216.500663584023, 577.0675198719985, 1, 0, 0.2728192335548962, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2728192335548962, 0.001223079514085385],
[216.6272462358037, 576.6081649722062, 0, 1, 0.2730932623215904, 0, 0.001734279985522235, 0.009785090795187062, 0.7269067376784096, 1, 0.001223800169421018]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420134_Norway_20200228_null_1"],
["epi_isl_421004_Wales_20200323_null_3"],
["Node226"],
["epi_isl_416343_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_418328_Ontario_20200320_null_2"],
["epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5"],
["Node231"],
["epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418670_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_420847_Congo_20200326_null_8"],
["Node239"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["Node242"],
["epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5"],
["epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_1"],
["epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2"],
["Node73"],
["epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_418888_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_420669_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_418738_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420910_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2"],
["Node70"],
["epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1"],
["epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_418935_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_420290_South_Yorkshire_20200316_null_1"],
["epi_isl_417876_Reykjavik_20200310_null_11"],
["epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1"],
["epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_2"],
["epi_isl_420280_South_Yorkshire_20200321_null_1"],
["epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1"],
["Node66"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_14"],
["Node288"],
["epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1"],
["epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1"],
["epi_isl_419875_Victoria_20200318_null_3"],
["epi_isl_419713_Virginia_20200311_null_1"],
["epi_isl_419977_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2"],
["epi_isl_420749_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_420713_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_420777_England_20200327_null_24"],
["Node303"],
["epi_isl_419966_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_415482_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_420671_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418736_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_421408_New_York_20200318_null_5"],
["epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_418938_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_420775_England_20200330_null_7"],
["epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2"],
["epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1"],
["epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1"],
["epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2"],
["epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2"],
["epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_418625_Li_ge_20200314_null_1"],
["epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1"],
["epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2"],
["epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1"],
["epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node50"],
["epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2"],
["Node45"],
["epi_isl_421007_Wales_20200323_null_3"],
["epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2"],
["epi_isl_420689_England_20200328_null_4"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1"],
["Node57"],
["epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2993"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_420525_England_20200326_null_5"],
["Node222"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2"],
["epi_isl_420524_England_20200326_null_51"],
["Node217"],
["epi_isl_418728_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1"],
["Node207"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_420745_England_20200328_null_1"],
["Node203"],
["epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5"],
["Node200"],
["epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1"],
["epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2"],
["epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_689"],
["epi_isl_421190_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1"],
["epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_418915_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_418954_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_420635_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1"],
["epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_420704_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_421501_Ile_de_France_20200312_null_32"],
["Node150"],
["epi_isl_419564_Luxembourg_20200315_null_1"],
["epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2"],
["Node197"],
["epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_5"],
["epi_isl_421309_Wisconsin_20200320_null_3"],
["epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7"],
["Node211"],
["epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2"],
["epi_isl_418311_Derbyshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_421010_Wales_20200323_null_76"],
["epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1"],
["Node130"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["Node129"],
["epi_isl_419415_Wales_20200318_null_12"],
["Node128"],
["epi_isl_419421_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_418698_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420252_Derbyshire_20200324_null_1"],
["epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["Node117"],
["epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_490"],
["epi_isl_420518_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420685_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1"],
["epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_2"],
["epi_isl_420104_Singapore_20200305_null_5"],
["epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1"],
["epi_isl_418713_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_419898_Victoria_20200319_null_2"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1"],
["Node86"],
["epi_isl_420975_Wales_20200322_null_5"],
["Node85"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1"],
["Node124"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221495265025244],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.2733023798712491, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001220752125439564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.0182526312239, 576.0220349104529, 1, 0, 0.2736535029058267, 0.004607907343624621, 0, -0.02599856546208068, 1, 0.2736535029058267, 0.001222010373647947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001221894960637979],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.2733023798712491, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001220752126007068],
[216.7748936555622, 575.7949730564244, 1, 0, 0.2735088763276644, 0.004613080339409228, 0, -0.02602775234877605, 1, 0.2735088763276643, 0.001221037877728024],
[215.9970867510815, 576.9055522089168, 0, 1, 0.2724131263258142, 0, 0.001733385986962848, 0.009780046709371973, 0.7275868736741857, 1, 0.001221587371762762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221769352146497],
[216.0194861781148, 576.8831527818834, 0, 1, 0.2724413762343563, 0, 0.001733453291498868, 0.009780426452551495, 0.7275586237656437, 1, 0.001220902852572242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221847904452606],
[216.500663584023, 576.458399077861, 1, 0, 0.2730288028454483, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730288028454483, 0.00122116580365882],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001221869571044314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221440179490678],
[216.504725479949, 576.6005001659455, 1, 0, 0.2729836073184745, 0.004618836830388778, 0, -0.02606023141061543, 1, 0.2729836073184745, 0.00122017986696625],
[216.6369373517688, 576.6672981470805, 0, 2, 0.273081785849211, 0, 0.003468204294618931, 0.01956817480591795, 0.5284100900641724, 1, 0.002442782142401193],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221198201554995],
[216.6899823210126, 576.2126566389857, 1, 0, 0.273286998521321, 0.004614888003999017, 0, -0.02603795148748837, 1, 0.2732869985213211, 0.001225318028464497],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001222249803514485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.504725479949, 576.3979134800493, 1, 0, 0.2730533546513667, 0.004618836830388778, 0, -0.02606023141061543, 1, 0.2730533546513667, 0.001220994681059155],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863644, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136356, 1, 0.001221869824835933],
[216.5584219449643, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730294124851215, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269705875148784, 1, 0.001222250165174767],
[216.6272462358037, 576.0728060382984, 0, 1, 0.2732776989409074, 0, 0.001735891695490862, 0.009794184325937677, 0.7267223010590926, 1, 0.001222249803537732],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221870435680982],
[216.6272462358037, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2731380896644392, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7268619103355608, 1, 0.001220102429385725],
[216.4304393135056, 576.3933765175734, 0, 2, 0.2729868036149141, 0, 0.003469852502614632, 0.01957747426449553, 0.5285481877180594, 1, 0.002443570780934527],
[217.0288427746546, 575.8737961853436, 0, 1, 0.2737143655610959, 0, 0.001736491583093585, 0.009797568989722396, 0.7262856344389041, 1, 0.001228648003940253],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165803140712],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 1, 0, 0.2730924871946331, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2730924871946331, 0.001221037878801725],
[216.5288427746546, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2730837711155334, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7269162288844666, 1, 0.001221165803568349],
[216.6468265680334, 576.2558123919648, 0, 1, 0.2732325709650756, 0, 0.001735340413919864, 0.009791073905318774, 0.7267674290349244, 1, 0.001220257330136557],
[216.2256496969527, 576.6769892630456, 1, 0, 0.2727013873740697, 0.004624798220754719, 0, -0.02609386654824214, 1, 0.2727013873740698, 0.001221869571017619],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.1084734142385, 0, 1, 0.273302379871249, 0, 0.001735784224928369, 0.009793577959479795, 0.7266976201287509, 1, 0.001221470047886466],
[216.402260122874, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729318367807259, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270681632192741, 1, 0.001221870435959706],
[216.5584219449643, 576.6104164371112, 0, 1, 0.2730294124851214, 0, 0.001734273213756738, 0.009785052587780656, 0.7269705875148786, 1, 0.001222250165144412],
[216.2612335284707, 576.6414054315275, 0, 1, 0.2727462653070841, 0, 0.001734180013056214, 0.00978452673421352, 0.727253734692916, 1, 0.001220475329890822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4442398821372, 576.458399077861, 1, 0, 0.2729770708873334, 0.004620127569782135, 0, -0.02606751397298273, 1, 0.2729770708873334, 0.001221761447933992],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001220918265158673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221178838771953],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018176, 0.001220561496161806],
[216.6272462358037, 576.2529932971612, 0, 1, 0.2732155947831477, 0, 0.001735348903401395, 0.009791121804359454, 0.7267844052168523, 1, 0.001221178838722957],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.00122116582217902],
[216.8522323487333, 576.050406611265, 0, 1, 0.2734916264538671, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7265083735461328, 1, 0.00122025733010977],
[216.6272462358037, 576.050406611265, 0, 1, 0.2732854212021006, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7267145787978994, 1, 0.001221869571044314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.0091933021174, 0, 1, 0.2732996307387655, 0, 0.001736083402188859, 0.009795265966423416, 0.7267003692612345, 1, 0.001220179866992214],
[216.3925690069089, 576.4412456622501, 0, 1, 0.2729355950808016, 0, 0.001734782178626271, 0.009787924250661805, 0.7270644049191983, 1, 0.001222520222596256],
[216.4425967810496, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2731299998939422, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7268700001060578, 1, 0.001220656644152745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863643, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136357, 1, 0.001221940462759364],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.001221847879413624],
[216.6272462358037, 576.1769892630456, 0, 1, 0.2732417872357824, 0, 0.00173557781486387, 0.009792413360199962, 0.7267582127642176, 1, 0.001221869942426639],
[216.5288427746546, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2730837711155334, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7269162288844666, 1, 0.001221165822735251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.00122116582217902],
[216.7635200035494, 576.2079432472881, 0, 1, 0.2733560160095969, 0, 0.001735484579341933, 0.009791887310164726, 0.7266439839904031, 1, 0.001221037877804453],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018177, 0.001220483711796351],
[217.0828476817021, 576.1548149912126, 0, 2, 0.2736668439950443, 0, 0.003471289222898369, 0.01958558047487737, 0.5275598535121194, 1, 0.002458671476148107],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221198201659803],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221870494089173],
[216.500663584023, 576.458399077861, 1, 0, 0.2730288028454483, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730288028454483, 0.001221165822735251],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001229210593466542],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221165822171329],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.0810119201907, 574.5141725352106, 0, 1, 0.273314353753669, 0, 0.001740601098815734, 0.009820755548294926, 0.726685646246331, 1, 0.001222376726908898],
[216.6272462358037, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2731739741153545, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7268260258846455, 1, 0.001220561480381608],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221178839357397],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.00122209352024944],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730924871946331, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269075128053669, 1, 0.001221869571044314],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165803123065],
[216.9246595499074, 575.9779794100909, 0, 1, 0.2735829708354031, 0, 0.00173617748550767, 0.009795796799867014, 0.7264170291645968, 1, 0.001221869942315778],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221165822735251],
[216.4909724680579, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2731743693442503, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7268256306557497, 1, 0.001221605081063361],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221165822129887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6675828939792, 576.0100699530894, 0, 1, 0.2733363077863643, 0, 0.001736080759979492, 0.009795251058646835, 0.7266636922136357, 1, 0.001221870435680982],
[216.7538288875843, 576.148810072414, 1, 0, 0.2733675211018177, 0.004613528651983505, 0, -0.02603028180150603, 1, 0.2733675211018177, 0.001220561495643497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.4721996464926, 0, 0, 0.2731400801759648, 0, 0, 0, 1, 1, 1.376412186733691e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.3737961853436, 0, 1, 0.2731739741153545, 0, 0.001734985189504402, 0.009789069671177236, 0.7268260258846455, 1, 0.001208024718437926],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.001220948874199203],
[215.6272462358037, 577.2753927241946, 1, 0, 0.2719466875764579, 0.004637632847689523, 0, -0.02616628160862905, 1, 0.2719466875764579, 0.001288820012839884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.1272462358037, 576.7753927241946, 0, 1, 0.2725772820220204, 0, 0.001733777155916541, 0.009782253748466061, 0.7274227179779796, 1, 0.001221649008517014],
[216.7594581076235, 576.5447773912258, 0, 1, 0.2732362294414321, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.7267637705585679, 1, 0.00122114877078374],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221605080923409],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001221165822686556],
[216.1772740099444, 576.5003788371242, 0, 1, 0.272717760155718, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.727282239844282, 1, 0.001236549719629536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.5003788371242, 0, 1, 0.2729241264812986, 0, 0.001734604237411134, 0.009786920277277544, 0.7270758735187014, 1, 0.001222156735871883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.1110268723337, 575.8140115146979, 1, 0, 0.2738102801167448, 0.004605938327526878, 0, -0.02598745595182026, 1, 0.2738102801167448, 0.001220405916341899],
[216.4844442205531, 576.4405941664785, 0, 1, 0.2730200633604986, 0, 0.001734784139284951, 0.009787935313018147, 0.7269799366395014, 1, 0.001221869570323874],
[216.5869095776281, 576.4423120341507, 0, 1, 0.273113403233023, 0, 0.00173477896941881, 0.009787906143789412, 0.7268865967669771, 1, 0.00122056148042477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.3619234646984, 576.5407154952998, 0, 1, 0.2728732543361025, 0, 0.00173448287887337, 0.009786235552595998, 0.7271267456638975, 1, 0.00122173508689762],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.9454401500277, 0, 1, 0.2729771953497911, 0, 0.001733266146864705, 0.009779370551974656, 0.7270228046502089, 1, 0.001221203017892807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.6104164371111, 0, 1, 0.2730924871946331, 0, 0.001734273213756739, 0.00978505258778066, 0.7269075128053669, 1, 0.001221787976746156],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221215560167876],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.5062928040622, 576.5447773912258, 0, 1, 0.273004224999971, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.726995775000029, 1, 0.001221305989951221],
[216.500663584023, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2730918294785776, 0.004618923487095476, 0, -0.02606072034190111, 1, 0.2730918294785776, 0.001221044426140777],
[216.3094858817642, 576.9499507630183, 0, 1, 0.2726844155761698, 0, 0.001733252596135066, 0.009779294096545909, 0.7273155844238302, 1, 0.001221192410082586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.402260122874, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729318367807259, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270681632192741, 1, 0.001221862654839706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221908999669051],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.00122099163865741],
[216.8916699794433, 576.5891759453273, 0, 1, 0.2733420360344863, 0, 0.001734337101213327, 0.009785413051240199, 0.7266579639655137, 1, 0.001221748958971009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.689083293547, 577.0167487441531, 0, 1, 0.2730093121997553, 0, 0.00173305194723801, 0.009778162002713286, 0.7269906878002447, 1, 0.00122165072482073],
[216.8916699794433, 576.7157585971079, 0, 1, 0.2732984371989431, 0, 0.001733956433638217, 0.009783265262638398, 0.7267015628010569, 1, 0.001221650793452293],
[216.9900734405923, 576.7157585971079, 0, 1, 0.2733885334866551, 0, 0.001733956433638217, 0.009783265262638398, 0.7266114665133449, 1, 0.001221537934814724],
[217.0182526312239, 576.6875794064763, 1, 0, 0.2734240368047538, 0.004607907343624621, 0, -0.02599856546208068, 1, 0.2734240368047538, 0.001221304474164642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6666838665136, 577.0391481711865, 0, 1, 0.2729810908787958, 0, 0.001732984673863646, 0.009777782435352917, 0.7270189091212043, 1, 0.001221889727349702],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221132673585105],
[216.7932665182943, 576.8337423904868, 0, 1, 0.2731677023144412, 0, 0.001733601775540813, 0.009781264223755798, 0.7268322976855588, 1, 0.001221132672962618],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221760706216945],
[216.8916699794433, 577.1491857711735, 0, 1, 0.2731492572563068, 0, 0.001732654268001475, 0.009775918231540616, 0.7268507427436932, 1, 0.001221132672917051],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221619404622314],
[217.1666838665136, 576.8023527746543, 0, 1, 0.273520343797313, 0, 0.001733696118244998, 0.009781796520694018, 0.726479656202687, 1, 0.001221132673070382],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 1, 0, 0.2732645537234016, 0.004610596617633027, 0, -0.02601373878505336, 1, 0.2732645537234015, 0.001221619404649343],
[216.7650873276627, 576.9407447100375, 1, 0, 0.2731050706420494, 0.004613289032511022, 0, -0.026028929829325, 1, 0.2731050706420494, 0.001221889997788543],
[217.2932665182943, 576.4125655194059, 1, 0, 0.2737705302737061, 0.004602075416431776, 0, -0.02596566077681111, 1, 0.2737705302737061, 0.001221459077616153],
[216.7488679641928, 576.9793635005408, 0, 1, 0.2730769290695479, 0, 0.001733164239935702, 0.009778795576445167, 0.7269230709304521, 1, 0.001221132673073066],
[217.1569927505485, 576.5488392871516, 0, 1, 0.2735988372329785, 0, 0.001734458439351653, 0.009786097660824783, 0.7264011627670215, 1, 0.001221166671090322],
[216.6666838665136, 577.0391481711865, 0, 1, 0.2729810908787958, 0, 0.001732984673863646, 0.009777782435352917, 0.7270189091212043, 1, 0.001222896864385163],
[216.8916699794433, 576.8141620582569, 0, 1, 0.2732645537234016, 0, 0.001733660623781637, 0.009781596255137356, 0.7267354462765985, 1, 0.001221324063911979],
[216.7594581076235, 576.5447773912258, 0, 1, 0.2732362294414321, 0, 0.00173447065902642, 0.009786166606224648, 0.7267637705585679, 1, 0.00122187066319139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.5062928040622, 576.797942694787, 0, 1, 0.2729171018076283, 0, 0.001733709373733239, 0.009781871310322602, 0.7270828981923716, 1, 0.001221296516171457],
[216.500663584023, 576.4019753759752, 1, 0, 0.273048231833348, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.273048231833348, 0.001221701850887636],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221751050474769],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221038787020075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221871072996988],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221864012447082],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221670760586144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.4246595499074, 576.4779794100909, 0, 1, 0.2729523763898407, 0, 0.001734671636587574, 0.009787300554433762, 0.7270476236101593, 1, 0.001221584970851848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[217.0450621381245, 575.9239745030434, 0, 1, 0.2737119006026728, 0, 0.001736340288425891, 0.009796715360508789, 0.7262880993973273, 1, 0.001221821328239298],
[216.6272462358037, 576.0785858018966, 0, 0, 0.2732757064230872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002005195456257255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.1769892630456, 0, 1, 0.2732417872357824, 0, 0.00173557781486387, 0.009792413360199962, 0.7267582127642176, 1, 0.0005318820714400561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 0, 0.2732078764675828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004887129845705127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221679283104373],
[216.500663584023, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2730918294785776, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2730918294785776, 0.001220819029094952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.7594581076235, 576.2120051432141, 0, 1, 0.2733508936362024, 0, 0.001735472345376518, 0.009791818284134692, 0.7266491063637976, 1, 0.001220580353778094],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221406289481334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.1272462358036, 576.7753927241946, 0, 1, 0.2725772820220204, 0, 0.001733777155916541, 0.009782253748466061, 0.7274227179779796, 1, 0.001221650751978817],
[216.8619234646984, 576.0407154952998, 0, 1, 0.2735038487816649, 0, 0.00173598839995219, 0.009794729948295252, 0.726496151218335, 1, 0.001220253275747951],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221304473708274],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001221889997797597],
[216.4844442205531, 576.4405941664785, 0, 1, 0.2730200633604986, 0, 0.001734784139284951, 0.009787935313018147, 0.7269799366395014, 1, 0.001221132673585105],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 1, 0, 0.2732078764675828, 0.004616224493346868, 0, -0.02604549217856749, 1, 0.2732078764675828, 0.001225247918203356],
[216.8102525894701, 576.0923863705282, 1, 0, 0.2734386820478323, 0.004612328005970725, 0, -0.02602350756069947, 1, 0.2734386820478323, 0.001221619404697753],
[216.8522323487333, 576.050406611265, 0, 1, 0.2734916264538671, 0, 0.00173595919475642, 0.009794565167813045, 0.7265083735461328, 1, 0.001228556659623535],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.001221889997780227],
[217.0450621381246, 576.1207814253414, 0, 1, 0.2736439849237626, 0, 0.001735747142337007, 0.00979336873344569, 0.7263560150762374, 1, 0.001221132672917051],
[216.6272462358037, 576.0728060382984, 0, 1, 0.2732776989409074, 0, 0.001735891695490862, 0.009794184325937677, 0.7267223010590926, 1, 0.001221760705466267],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 0, 0.2732078764675828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004866694277676419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[216.6272462358037, 576.2753927241946, 0, 1, 0.2732078764675828, 0, 0.001735281451586464, 0.009790741230208275, 0.7267921235324172, 1, 0.0007344965117075773],
[216.6272462358037, 576.9409372202178, 0, 1, 0.272978744299429, 0, 0.001733279674723967, 0.009779446878365001, 0.7270212557005711, 1, 0.001222430894035386],
[216.500663584023, 577.0675198719985, 1, 0, 0.2728192335548962, 0.004618923487095475, 0, -0.0260607203419011, 1, 0.2728192335548962, 0.001223079514085385],
[216.6272462358037, 576.6081649722062, 0, 1, 0.2730932623215904, 0, 0.001734279985522235, 0.009785090795187062, 0.7269067376784096, 1, 0.001223800169421018]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8623514183213468, 2.000000000000001, 0, 0, 0.301273775400744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8029991292013475, 2.197000870798656, 1, 1, 0.2676663764004489, 1.245331362930103, 0.4551659552308138, -4.458242222766181, 0.9283547109446532, 0.463687463745551, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.332262223485132, 0, 1, 0.428768253385199, 0, 0.7506029836859367, 4.235024568016062, 0.571231746614801, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000833705305868, 1.99451612969337, 0, 1, 0.3341291536673286, 0, 0.5013747370164093, 2.82883811441858, 0.6658708463326714, 1, 0.1772369844922916],
[0.9944153442698404, 2.005584655730162, 0, 2, 0.3314717814232799, 0, 0.9972154475184054, 5.626452347826851, 0.4469299790333628, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346479230486052, 2.120707551126564, 0, 1, 0.2824187920343332, 0, 0.4715407362362524, 2.660509811690915, 0.7175812079656668, 1, 0.1772369844922916],
[0.2874260028016845, 2.575873862507, 0, 2, 0.1003827808201632, 0, 0.7764355347949672, 4.380776038472579, 0.8093111410448626, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5298014904362129, 1.800151083730729, 1, 0, 0.2273872422599159, 1.887499408838296, 0, -10.64957979422397, 1, 0.2273872422599159, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 2.576747387820263, 0, 0, 0.09977951298117654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277989494882, 1.802720380293172, 0, 2, 0.3568599968791695, 0, 1.109434398070512, 6.259609986304883, 0.4136290636142619, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994991437625, 2.449100500856241, 1, 0, 0.183633166381254, 1.815213122455645, 0, -10.24172876589757, 1, 0.1836331663812539, 0.1772369844922916],
[0.5509000297786415, 2.449099970221361, 1, 0, 0.183633343259547, 1.815211374016103, 0, -10.24171890091625, 1, 0.1836333432595469, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -2.821081623749617, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9965536235129533, 2.003446376487048, 1, 1, 0.3321845411709842, 1.003458295073875, 0.4991398880131018, -2.845446781355652, 0.8896534306070225, 0.5540225129489913, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -11.28432649499847, 1, 0.111111111111111, 0.1772369844922916],
[0.4711825374428261, 2.528817462557175, 0, 1, 0.1570608458142753, 0, 0.3954417488832057, 2.231146902075646, 0.8429391541857247, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.802320403883075, 2.197679596116929, 1, 0, 0.2674401346276913, 1.246384854679246, 0, -7.032306819310917, 1, 0.2674401346276913, 0.1772369844922916],
[0.9995253784017636, 1.334571199296672, 0, 2, 0.4282279439299628, 0, 1.498608692480412, 8.455394887095865, 0.3269232841025578, 1, 0.1772369844922916],
[0.002880303917354386, 2.427726092706966, 0, 1, 0.001185014538493199, 0, 0.4119080826309275, 2.324052645168099, 0.9988149854615068, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498418742808, 2.001550158125721, 0, 1, 0.3328166139580934, 0, 0.4996127606097135, 2.81889675589376, 0.6671833860419066, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986433089961709, 2.000269954534913, 1, 1, 0.3330017313739558, 1.001358534114841, 0.4999325204744738, -2.829127425501731, 0.8891098469019479, 0.5551133096498593, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 2.821081623749617, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449817891782954, 0, 1, 0.1833520238686559, 0, 0.4081936062897352, 2.303094963272117, 0.8166479761313441, 1, 0.1772369844922916],
[0.3275194511499283, 1.996606505553735, 0, 4, 0.1409215581475856, 0, 2.003399262134853, 11.30350568688436, 0.544667275669894, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984492842761951, 2.001550715723807, 0, 1, 0.3328164280920648, 0, 0.4996126214260711, 2.818895970596929, 0.6671835719079352, 1, 0.1772369844922916],
[0.99932199848729, 2.000678001512712, 1, 1, 0.3331073328290964, 1.000678461510641, 0.4998305570631058, -2.82586563906089, 0.8890395048154855, 0.5552541704736784, 0.1772369844922916],
[0.5315843724023657, 2.331241196764352, 0, 1, 0.1856852118856455, 0, 0.4289560434106735, 2.42024002292439, 0.8143147881143545, 1, 0.1772369844922916],
[0.9609741439947153, 2.039025856005287, 0, 1, 0.3203247146649048, 0, 0.4904302694616772, 2.767087641817823, 0.6796752853350951, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2892114203080753, 2.574563538645031, 1, 1, 0.1009895765042239, 3.457678119815513, 0.3884153507923486, -17.31728159230024, 0.9898011054374974, 0.1917802584459454, 0.1772369844922916],
[0.863368604957592, 1.996690247166904, 1, 0, 0.30187092280156, 1.158253837651555, 0, -6.535057234072549, 1, 0.3018709228015599, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.803193077701958, 1.196806922298043, 0, 0, 0.6010643592339859, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 2.574914750143911, 0, 1, 0.09984343834186797, 0, 0.3883623719752705, 2.191203901870499, 0.9001565616581321, 1, 0.1772369844922916],
[1.00230208747513, 2.018775412496279, 0, 1, 0.3317697369513413, 0, 0.4953498015727607, 2.814480556327028, 0.6682302630486587, 1, 0.1760004347726621],
[1.007025833323803, 2.014051666647607, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1760004347726621],
[0.8031930777019585, 2.196128651525522, 0, 1, 0.2677915709658906, 0, 0.4553467299401419, 2.569140584537229, 0.7322084290341094, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.039160664459619, 0, 0, 0.2825802664136869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.800424476148205, 1.199575523851796, 1, 0, 0.6001414920494014, 0.5554245752864801, 0, -3.133796125439252, 1, 0.6001414920494014, 0.1772369844922916],
[0.8389629871978853, 2.116392395128815, 1, 0, 0.2838788838103742, 1.191947696453182, 0, -6.725163485869523, 1, 0.2838788838103742, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.448402539285902, 0, 1, 0.1834385717346043, 0, 0.408429571508147, 2.304426317555128, 0.8165614282653957, 1, 0.1772369844922916],
[1.000278080617543, 1.998170866815101, 0, 2, 0.3335985031441034, 0, 1.000915403790174, 5.647328105120781, 0.4440909550117795, 1, 0.1772369844922916],
[0.9981710694314697, 2.001828930568532, 0, 1, 0.3327236898104898, 0, 0.4995431850992352, 2.818504199505613, 0.6672763101895103, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8022538113994384, 2.193103489779256, 0, 2, 0.2678324255619675, 0, 0.9119496682763965, 5.145368901918205, 0.5360693570584718, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498007721411, 2.001550199227861, 0, 1, 0.3328166002573801, 0, 0.499612750350089, 2.818896698007284, 0.6671833997426199, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346479230490178, 2.120707551126087, 0, 1, 0.2824187920344789, 0, 0.4715407362363584, 2.660509811691513, 0.7175812079655211, 1, 0.1772369844922916],
[1.002767671427744, 1.997232328572258, 1, 0, 0.3342558904759145, 0.9972399674355241, 0, -5.626590693202051, 1, 0.3342558904759145, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984476444754468, 2.001552355524555, 0, 4, 0.3328158814918154, 0, 1.998448848444788, 11.27557464470236, 0.1981448548407747, 1, 0.1772369844922916],
[0.9993220168923219, 2.000134905158209, 0, 2, 0.3331676509656792, 0, 0.9999325519704388, 5.641782694705731, 0.4446653817186303, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984493067563519, 2.00155069324365, 0, 1, 0.3328164355854504, 0, 0.4996126270374054, 2.818896002256993, 0.6671835644145496, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9993219984979315, 2.00067800150207, 1, 1, 0.3331073328326436, 1.000678461499985, 0.4998305570657644, -2.825865638985768, 0.8890395048131223, 0.5552541704784096, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.001551695257685, 0, 1, 0.2155636462580581, 0, 0.4996123769220246, 2.818894591065183, 0.7844363537419419, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.079552045125699, 1.472742152727039, 1, 1, 0.4229732003598696, 0.9263101343887169, 0.6790054852088845, -1.395333202538143, 0.8210936717773294, 0.6670400724970689, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.8005764943493446, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2858613203262428, 1.249099876224487, 0, -7.047625414089646, 1, 0.2858613203262428, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 1.91120289179696, 0, 0, 0.1300087083676513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8623514183213468, 2.000000000000001, 0, 0, 0.301273775400744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4697881802231909, 2.53021181977681, 1, 0, 0.1565960600743969, 2.128618901235258, 0, -12.01001533248178, 1, 0.156596060074397, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.00205036431864864, 2.997949635681353, 0, 1, 0.0006834547728828797, 0, 0.3335613074009254, 1.882007349405296, 0.9993165452271171, 1, 0.1772369844922916],
[0.6173099066119991, 2.382690093388004, 0, 0, 0.2057699688706661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986036952078914, 2.00139630479211, 0, 1, 0.3328678984026303, 0, 0.4996511673403295, 2.819113452937699, 0.6671321015973697, 1, 0.1772369844922916],
[0.002878680491263735, 2.427726693450057, 0, 1, 0.001184347126903551, 0, 0.4119079807039128, 2.324052070079242, 0.9988156528730965, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984489229436367, 2.001551077056365, 0, 1, 0.3328163076478787, 0, 0.4996125312328661, 2.818895461712142, 0.6671836923521213, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023209210888876, 2.040421581333606, 1, 0, 0.2822348209185938, 1.246384051213357, 0, -7.03230228602521, 1, 0.2822348209185938, 0.1772369844922916],
[0.001894798898839941, 2.428710575042708, 0, 1, 0.0007795584257132097, 0, 0.4117411149257318, 2.323110586118324, 0.9992204415742868, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.802320921102512, 2.040421581313909, 1, 0, 0.2822348209239894, 1.246384051192192, 0, -7.032302285905795, 1, 0.2822348209239893, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.080673316351153, 1.469354457789569, 0, 0, 0.423788841560875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 1, 0.2677310259006525, 0, 0.4552061402619379, 2.568347354621889, 0.7322689740993475, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.039160664459619, 0, 0, 0.2825802664136869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986035971478956, 2.001396402852106, 0, 1, 0.332867865715965, 0, 0.4996511428595264, 2.819113314813011, 0.6671321342840351, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.403776307078607, 0, 1, 0.1862099716219739, 0, 0.4160120877534295, 2.347208112037828, 0.8137900283780262, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196128529852173, 0, 1, 0.2677915818293796, 0, 0.455346755167974, 2.569140726876777, 0.7322084181706203, 1, 0.1772369844922916],
[0.5504642848611289, 2.000000000000001, 0.5, 0, 0.2158290504707464, 0.9083241433658862, 0, -5.124913098515231, 1, 0.1144657265078591, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1861219412755146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498418749251, 2.001550158125077, 0, 1, 0.3328166139583082, 0, 0.4996127606098744, 2.818896755894668, 0.6671833860416918, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277826105906, 1.80204339044518, 0, 1, 0.3569461702670126, 0, 0.5549255946345212, 3.130980795143556, 0.6430538297329873, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277826105777, 1.802043390445714, 0, 1, 0.3569461702669149, 0, 0.5549255946343566, 3.130980795142627, 0.643053829733085, 1, 0.1772369844922916],
[0.995348573557742, 2.004188334361429, 0, 1, 0.3318340810976158, 0, 0.4989551045953065, 2.815186153299776, 0.6681659189023843, 1, 0.1772369844922916],
[0.5515767790183534, 2.446872322617845, 0, 2, 0.1839540243379046, 0, 0.8173699876012541, 4.611734903652703, 0.6659310343943013, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9947248610135492, 2.004800412520089, 1, 3, 0.3316274311106897, 1.005303113648005, 1.496408311403387, 2.77089569743126, 0.5956252877722634, 0.8004395522410331, 0.1772369844922916],
[1.005483856435867, 2.016491138585871, 0, 1, 0.3327240821291555, 0, 0.4959109320466848, 2.818505856618926, 0.6672759178708445, 1, 0.1759481644794517],
[0.5540567266735749, 2.467918268348165, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5991837322720257, 2.422791262749713, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5345325199265586, 1.812486952979783, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5540567266735749, 2.467918268348165, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.8090764656632896, 2.21289852935845, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.8090764656632896, 2.015341010925441, 0, 1, 0.2864578173622103, 0, 0.4961939416599286, 2.820114339515472, 0.7135421826377897, 1, 0.1759481644794517],
[0.2886136814206032, 1.927072084287936, 0, 1, 0.130259302057803, 0, 0.5189219480440481, 2.949288783883, 0.869740697942197, 1, 0.1759481644794517],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.001394610206958, 0, 1, 0.2155769180026799, 0, 0.4996515903960554, 2.819115839887167, 0.7844230819973201, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5322612639974087, 1.797691310169533, 0, 1, 0.2284429605558453, 0, 0.5562690292504636, 3.138560672559044, 0.7715570394441547, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.339186925176584, 1, 1, 0.4274989695081811, 0.9999999999999993, 0.7467217467555103, -1.429037251846861, 0.8172446310694433, 0.6722425700858053, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.403776866130983, 0, 1, 0.1862099363789095, 0, 0.4160119910004615, 2.347207566141787, 0.8137900636210905, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986029352861053, 2.001397064713896, 0, 1, 0.3328676450953683, 0, 0.4996509776249482, 2.819112382532547, 0.6671323549046317, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.080673316351153, 1.469354457789569, 0, 0, 0.423788841560875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5515873142567664, 2.448412685743237, 0, 1, 0.1838624380855886, 0, 0.4084278789367738, 2.304416767791133, 0.8161375619144113, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8005760383489466, 2.199423961651057, 1, 0, 0.2668586794496486, 1.249100587699741, 0, -7.047629428349179, 1, 0.2668586794496486, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023209210892903, 2.197679078910713, 1, 0, 0.2674403070297631, 1.246384051212732, 0, -7.032302286021682, 1, 0.2674403070297631, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023211687689005, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2863059301376834, 1.246383666449213, 0, -7.032300115123098, 1, 0.2863059301376834, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 1.922683806637712, 0, 1, 0.1293327915400428, 0, 0.5201063204192411, 2.934524765861504, 0.8706672084599572, 1, 0.1772369844922916],
[1.803193077701958, 1.196806922298043, 0, 0, 0.6010643592339859, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986036200493195, 2.001396379950682, 0, 1, 0.332867873349773, 0, 0.499651148576896, 2.819113347071343, 0.667132126650227, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023195543305528, 2.197680445669451, 1, 0, 0.2674398514435173, 1.246386174439422, 0, -7.032314265613283, 1, 0.2674398514435172, 0.1772369844922916],
[0.9958123444428589, 2.004187655557143, 0, 1, 0.3319374481476194, 0, 0.498955273587897, 2.815187106783559, 0.6680625518523806, 1, 0.1772369844922916],
[0.998448947432289, 2.00139663108648, 0, 2, 0.3328334480221119, 0, 0.9993021717610657, 5.638225986656455, 0.445111208078064, 1, 0.1772369844922916],
[0.9968991118838596, 2.003100888116142, 0, 1, 0.3322997039612863, 0, 0.4992259780486996, 2.816714465543234, 0.6677002960387137, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9570573958437496, 2.042942604156253, 1, 0, 0.3190191319479163, 1.044869413624239, 0, -5.895323803986761, 1, 0.3190191319479163, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994991433924, 2.449100500856611, 1, 0, 0.1836331663811306, 1.815213122456864, 0, -10.24172876590445, 1, 0.1836331663811306, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2905591616152632, 2.044040937159144, 0, 1, 0.124457786910828, 0, 0.4892269923858881, 2.760298556124247, 0.875542213089172, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5338799988652577, 1.668461958100439, 0, 1, 0.2424146700636886, 0, 0.5993543905181453, 3.381655314408785, 0.7575853299363113, 1, 0.1772369844922916],
[0.5960880134282975, 2.403911986571705, 1, 0, 0.198696004476099, 1.677604611185976, 0, -9.465319081068763, 1, 0.198696004476099, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8045581527384945, 2.195441847261509, 0, 1, 0.2681860509128312, 0, 0.4554891769268919, 2.569944293690587, 0.7318139490871688, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 5.642163247499234, 0.4444444444444444, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986433089961709, 2.001356691003831, 0, 1, 0.3328811029987234, 0, 0.4996610571693868, 2.819169252967729, 0.6671188970012766, 1, 0.1772369844922916],
[0.9995253784017756, 1.332262942906357, 0, 1, 0.4286518502850389, 0, 0.7506025783607561, 4.235022281105224, 0.5713481497149611, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[1.000278080478523, 1.998170867729533, 0, 1, 0.3335985030114696, 0, 0.5004577016660606, 2.823664051268185, 0.6664014969885304, 1, 0.1772369844922916],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994435901698, 2.447549504940052, 1, 1, 0.1837281384631242, 1.815213305504678, 0.4085719197841078, -7.936500328923998, 0.9662439711368751, 0.3337002480631235, 0.1772369844922916],
[0.5345325199265586, 1.812486952979783, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.99652838376538, 2.025446611256358, 1, 1, 0.3297606318407713, 1.003483710339993, 0.4937182715370182, -2.897247836094977, 0.8912579256879752, 0.550779189369518, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.002783960623468, 1.997216039376534, 2, 1, 0.3342613202078223, 1.994447536592554, 0.5006969603108973, -8.427984602427172, 0.9626527720460157, 0.2604974346532609, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346473293218521, 2.120708237983229, 0, 1, 0.2824185822360953, 0, 0.4715405835132651, 2.660508950002889, 0.7175814177639047, 1, 0.1772369844922916]
],
"RESOLVED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8623514183213468, 2.000000000000001, 0, 0, 0.301273775400744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8029991292013475, 2.197000870798656, 1, 1, 0.2676663764004489, 1.245331362930103, 0.4551659552308138, -4.458242222766181, 0.9283547109446532, 0.463687463745551, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.332262223485132, 0, 1, 0.428768253385199, 0, 0.7506029836859367, 4.235024568016062, 0.571231746614801, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000833705305868, 1.99451612969337, 0, 1, 0.3341291536673286, 0, 0.5013747370164093, 2.82883811441858, 0.6658708463326714, 1, 0.1772369844922916],
[0.9944153442698404, 2.005584655730162, 0, 2, 0.3314717814232799, 0, 0.9972154475184054, 5.626452347826851, 0.4469299790333628, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346479230486052, 2.120707551126564, 0, 1, 0.2824187920343332, 0, 0.4715407362362524, 2.660509811690915, 0.7175812079656668, 1, 0.1772369844922916],
[0.2874260028016845, 2.575873862507, 0, 2, 0.1003827808201632, 0, 0.7764355347949672, 4.380776038472579, 0.8093111410448626, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5298014904362129, 1.800151083730729, 1, 0, 0.2273872422599159, 1.887499408838296, 0, -10.64957979422397, 1, 0.2273872422599159, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 2.576747387820263, 0, 0, 0.09977951298117654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277989494882, 1.802720380293172, 0, 2, 0.3568599968791695, 0, 1.109434398070512, 6.259609986304883, 0.4136290636142619, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994991437625, 2.449100500856241, 1, 0, 0.183633166381254, 1.815213122455645, 0, -10.24172876589757, 1, 0.1836331663812539, 0.1772369844922916],
[0.5509000297786415, 2.449099970221361, 1, 0, 0.183633343259547, 1.815211374016103, 0, -10.24171890091625, 1, 0.1836333432595469, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -2.821081623749617, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9965536235129533, 2.003446376487048, 1, 1, 0.3321845411709842, 1.003458295073875, 0.4991398880131018, -2.845446781355652, 0.8896534306070225, 0.5540225129489913, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -11.28432649499847, 1, 0.111111111111111, 0.1772369844922916],
[0.4711825374428261, 2.528817462557175, 0, 1, 0.1570608458142753, 0, 0.3954417488832057, 2.231146902075646, 0.8429391541857247, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.802320403883075, 2.197679596116929, 1, 0, 0.2674401346276913, 1.246384854679246, 0, -7.032306819310917, 1, 0.2674401346276913, 0.1772369844922916],
[0.9995253784017636, 1.334571199296672, 0, 2, 0.4282279439299628, 0, 1.498608692480412, 8.455394887095865, 0.3269232841025578, 1, 0.1772369844922916],
[0.002880303917354386, 2.427726092706966, 0, 1, 0.001185014538493199, 0, 0.4119080826309275, 2.324052645168099, 0.9988149854615068, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498418742808, 2.001550158125721, 0, 1, 0.3328166139580934, 0, 0.4996127606097135, 2.81889675589376, 0.6671833860419066, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986433089961709, 2.000269954534913, 1, 1, 0.3330017313739558, 1.001358534114841, 0.4999325204744738, -2.829127425501731, 0.8891098469019479, 0.5551133096498593, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 2.821081623749617, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449817891782954, 0, 1, 0.1833520238686559, 0, 0.4081936062897352, 2.303094963272117, 0.8166479761313441, 1, 0.1772369844922916],
[0.3275194511499283, 1.996606505553735, 0, 4, 0.1409215581475856, 0, 2.003399262134853, 11.30350568688436, 0.544667275669894, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984492842761951, 2.001550715723807, 0, 1, 0.3328164280920648, 0, 0.4996126214260711, 2.818895970596929, 0.6671835719079352, 1, 0.1772369844922916],
[0.99932199848729, 2.000678001512712, 1, 1, 0.3331073328290964, 1.000678461510641, 0.4998305570631058, -2.82586563906089, 0.8890395048154855, 0.5552541704736784, 0.1772369844922916],
[0.5315843724023657, 2.331241196764352, 0, 1, 0.1856852118856455, 0, 0.4289560434106735, 2.42024002292439, 0.8143147881143545, 1, 0.1772369844922916],
[0.9609741439947153, 2.039025856005287, 0, 1, 0.3203247146649048, 0, 0.4904302694616772, 2.767087641817823, 0.6796752853350951, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2892114203080753, 2.574563538645031, 1, 1, 0.1009895765042239, 3.457678119815513, 0.3884153507923486, -17.31728159230024, 0.9898011054374974, 0.1917802584459454, 0.1772369844922916],
[0.863368604957592, 1.996690247166904, 1, 0, 0.30187092280156, 1.158253837651555, 0, -6.535057234072549, 1, 0.3018709228015599, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.803193077701958, 1.196806922298043, 0, 0, 0.6010643592339859, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 2.574914750143911, 0, 1, 0.09984343834186797, 0, 0.3883623719752705, 2.191203901870499, 0.9001565616581321, 1, 0.1772369844922916],
[1.00230208747513, 2.018775412496279, 0, 1, 0.3317697369513413, 0, 0.4953498015727607, 2.814480556327028, 0.6682302630486587, 1, 0.1760004347726621],
[1.007025833323803, 2.014051666647607, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1760004347726621],
[0.8031930777019585, 2.196128651525522, 0, 1, 0.2677915709658906, 0, 0.4553467299401419, 2.569140584537229, 0.7322084290341094, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.039160664459619, 0, 0, 0.2825802664136869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.800424476148205, 1.199575523851796, 1, 0, 0.6001414920494014, 0.5554245752864801, 0, -3.133796125439252, 1, 0.6001414920494014, 0.1772369844922916],
[0.8389629871978853, 2.116392395128815, 1, 0, 0.2838788838103742, 1.191947696453182, 0, -6.725163485869523, 1, 0.2838788838103742, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.448402539285902, 0, 1, 0.1834385717346043, 0, 0.408429571508147, 2.304426317555128, 0.8165614282653957, 1, 0.1772369844922916],
[1.000278080617543, 1.998170866815101, 0, 2, 0.3335985031441034, 0, 1.000915403790174, 5.647328105120781, 0.4440909550117795, 1, 0.1772369844922916],
[0.9981710694314697, 2.001828930568532, 0, 1, 0.3327236898104898, 0, 0.4995431850992352, 2.818504199505613, 0.6672763101895103, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8022538113994384, 2.193103489779256, 0, 2, 0.2678324255619675, 0, 0.9119496682763965, 5.145368901918205, 0.5360693570584718, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498007721411, 2.001550199227861, 0, 1, 0.3328166002573801, 0, 0.499612750350089, 2.818896698007284, 0.6671833997426199, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346479230490178, 2.120707551126087, 0, 1, 0.2824187920344789, 0, 0.4715407362363584, 2.660509811691513, 0.7175812079655211, 1, 0.1772369844922916],
[1.002767671427744, 1.997232328572258, 1, 0, 0.3342558904759145, 0.9972399674355241, 0, -5.626590693202051, 1, 0.3342558904759145, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984476444754468, 2.001552355524555, 0, 4, 0.3328158814918154, 0, 1.998448848444788, 11.27557464470236, 0.1981448548407747, 1, 0.1772369844922916],
[0.9993220168923219, 2.000134905158209, 0, 2, 0.3331676509656792, 0, 0.9999325519704388, 5.641782694705731, 0.4446653817186303, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984493067563519, 2.00155069324365, 0, 1, 0.3328164355854504, 0, 0.4996126270374054, 2.818896002256993, 0.6671835644145496, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9993219984979315, 2.00067800150207, 1, 1, 0.3331073328326436, 1.000678461499985, 0.4998305570657644, -2.825865638985768, 0.8890395048131223, 0.5552541704784096, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.001551695257685, 0, 1, 0.2155636462580581, 0, 0.4996123769220246, 2.818894591065183, 0.7844363537419419, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.079552045125699, 1.472742152727039, 1, 1, 0.4229732003598696, 0.9263101343887169, 0.6790054852088845, -1.395333202538143, 0.8210936717773294, 0.6670400724970689, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.8005764943493446, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2858613203262428, 1.249099876224487, 0, -7.047625414089646, 1, 0.2858613203262428, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 1.91120289179696, 0, 0, 0.1300087083676513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8623514183213468, 2.000000000000001, 0, 0, 0.301273775400744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4697881802231909, 2.53021181977681, 1, 0, 0.1565960600743969, 2.128618901235258, 0, -12.01001533248178, 1, 0.156596060074397, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.00205036431864864, 2.997949635681353, 0, 1, 0.0006834547728828797, 0, 0.3335613074009254, 1.882007349405296, 0.9993165452271171, 1, 0.1772369844922916],
[0.6173099066119991, 2.382690093388004, 0, 0, 0.2057699688706661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986036952078914, 2.00139630479211, 0, 1, 0.3328678984026303, 0, 0.4996511673403295, 2.819113452937699, 0.6671321015973697, 1, 0.1772369844922916],
[0.002878680491263735, 2.427726693450057, 0, 1, 0.001184347126903551, 0, 0.4119079807039128, 2.324052070079242, 0.9988156528730965, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984489229436367, 2.001551077056365, 0, 1, 0.3328163076478787, 0, 0.4996125312328661, 2.818895461712142, 0.6671836923521213, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023209210888876, 2.040421581333606, 1, 0, 0.2822348209185938, 1.246384051213357, 0, -7.03230228602521, 1, 0.2822348209185938, 0.1772369844922916],
[0.001894798898839941, 2.428710575042708, 0, 1, 0.0007795584257132097, 0, 0.4117411149257318, 2.323110586118324, 0.9992204415742868, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.802320921102512, 2.040421581313909, 1, 0, 0.2822348209239894, 1.246384051192192, 0, -7.032302285905795, 1, 0.2822348209239893, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.080673316351153, 1.469354457789569, 0, 0, 0.423788841560875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 2.821081623749617, 0.6666666666666666, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 1, 0.2677310259006525, 0, 0.4552061402619379, 2.568347354621889, 0.7322689740993475, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.039160664459619, 0, 0, 0.2825802664136869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986035971478956, 2.001396402852106, 0, 1, 0.332867865715965, 0, 0.4996511428595264, 2.819113314813011, 0.6671321342840351, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.403776307078607, 0, 1, 0.1862099716219739, 0, 0.4160120877534295, 2.347208112037828, 0.8137900283780262, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196128529852173, 0, 1, 0.2677915818293796, 0, 0.455346755167974, 2.569140726876777, 0.7322084181706203, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1861219412755146, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.4693544577895689, 2.530645542210432, 0, 0, 0.1564514859298562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9984498418749251, 2.001550158125077, 0, 1, 0.3328166139583082, 0, 0.4996127606098744, 2.818896755894668, 0.6671833860416918, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277826105906, 1.80204339044518, 0, 1, 0.3569461702670126, 0, 0.5549255946345212, 3.130980795143556, 0.6430538297329873, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000277826105777, 1.802043390445714, 0, 1, 0.3569461702669149, 0, 0.5549255946343566, 3.130980795142627, 0.643053829733085, 1, 0.1772369844922916],
[0.995348573557742, 2.004188334361429, 0, 1, 0.3318340810976158, 0, 0.4989551045953065, 2.815186153299776, 0.6681659189023843, 1, 0.1772369844922916],
[0.5515767790183534, 2.446872322617845, 0, 2, 0.1839540243379046, 0, 0.8173699876012541, 4.611734903652703, 0.6659310343943013, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9947248610135492, 2.004800412520089, 1, 3, 0.3316274311106897, 1.005303113648005, 1.496408311403387, 2.77089569743126, 0.5956252877722634, 0.8004395522410331, 0.1772369844922916],
[1.005483856435867, 2.016491138585871, 0, 1, 0.3327240821291555, 0, 0.4959109320466848, 2.818505856618926, 0.6672759178708445, 1, 0.1759481644794517],
[0.5540567266735749, 2.467918268348165, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5991837322720257, 2.422791262749713, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5345325199265586, 1.812486952979783, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.5540567266735749, 2.467918268348165, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.8090764656632896, 2.21289852935845, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.8090764656632896, 2.015341010925441, 0, 1, 0.2864578173622103, 0, 0.4961939416599286, 2.820114339515472, 0.7135421826377897, 1, 0.1759481644794517],
[0.2886136814206032, 1.927072084287936, 0, 1, 0.130259302057803, 0, 0.5189219480440481, 2.949288783883, 0.869740697942197, 1, 0.1759481644794517],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.001394610206958, 0, 1, 0.2155769180026799, 0, 0.4996515903960554, 2.819115839887167, 0.7844230819973201, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5322612639974087, 1.797691310169533, 0, 1, 0.2284429605558453, 0, 0.5562690292504636, 3.138560672559044, 0.7715570394441547, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0, 2.428791938997834, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.339186925176584, 1, 1, 0.4274989695081811, 0.9999999999999993, 0.7467217467555103, -1.429037251846861, 0.8172446310694433, 0.6722425700858053, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.403776866130983, 0, 1, 0.1862099363789095, 0, 0.4160119910004615, 2.347207566141787, 0.8137900636210905, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986029352861053, 2.001397064713896, 0, 1, 0.3328676450953683, 0, 0.4996509776249482, 2.819112382532547, 0.6671323549046317, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.080673316351153, 1.469354457789569, 0, 0, 0.423788841560875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5515873142567664, 2.448412685743237, 0, 1, 0.1838624380855886, 0, 0.4084278789367738, 2.304416767791133, 0.8161375619144113, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8005760383489466, 2.199423961651057, 1, 0, 0.2668586794496486, 1.249100587699741, 0, -7.047629428349179, 1, 0.2668586794496486, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023209210892903, 2.197679078910713, 1, 0, 0.2674403070297631, 1.246384051212732, 0, -7.032302286021682, 1, 0.2674403070297631, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023211687689005, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2863059301376834, 1.246383666449213, 0, -7.032300115123098, 1, 0.2863059301376834, 0.1772369844922916],
[0.2856040305010839, 1.922683806637712, 0, 1, 0.1293327915400428, 0, 0.5201063204192411, 2.934524765861504, 0.8706672084599572, 1, 0.1772369844922916],
[1.803193077701958, 1.196806922298043, 0, 0, 0.6010643592339859, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986036200493195, 2.001396379950682, 0, 1, 0.332867873349773, 0, 0.499651148576896, 2.819113347071343, 0.667132126650227, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.666161380087611, 0, 0, 0.2415531091168141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8356318046418052, 2.119569341291444, 0, 0, 0.282766472864883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8023195543305528, 2.197680445669451, 1, 0, 0.2674398514435173, 1.246386174439422, 0, -7.032314265613283, 1, 0.2674398514435172, 0.1772369844922916],
[0.9958123444428589, 2.004187655557143, 0, 1, 0.3319374481476194, 0, 0.498955273587897, 2.815187106783559, 0.6680625518523806, 1, 0.1772369844922916],
[0.998448947432289, 2.00139663108648, 0, 2, 0.3328334480221119, 0, 0.9993021717610657, 5.638225986656455, 0.445111208078064, 1, 0.1772369844922916],
[0.9968991118838596, 2.003100888116142, 0, 1, 0.3322997039612863, 0, 0.4992259780486996, 2.816714465543234, 0.6677002960387137, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9570573958437496, 2.042942604156253, 1, 0, 0.3190191319479163, 1.044869413624239, 0, -5.895323803986761, 1, 0.3190191319479163, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2865279184980049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994991433924, 2.449100500856611, 1, 0, 0.1836331663811306, 1.815213122456864, 0, -10.24172876590445, 1, 0.1836331663811306, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 2.331705876110916, 0, 0, 0.18538797815456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.2905591616152632, 2.044040937159144, 0, 1, 0.124457786910828, 0, 0.4892269923858881, 2.760298556124247, 0.875542213089172, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[0.5338799988652577, 1.668461958100439, 0, 1, 0.2424146700636886, 0, 0.5993543905181453, 3.381655314408785, 0.7575853299363113, 1, 0.1772369844922916],
[0.5960880134282975, 2.403911986571705, 1, 0, 0.198696004476099, 1.677604611185976, 0, -9.465319081068763, 1, 0.198696004476099, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.960839335540383, 2.039160664459619, 0, 0, 0.3202797785134608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8045581527384945, 2.195441847261509, 0, 1, 0.2681860509128312, 0, 0.4554891769268919, 2.569944293690587, 0.7318139490871688, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 5.642163247499234, 0.4444444444444444, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 1.803193077701958, 0, 0, 0.3567360407509977, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.9986433089961709, 2.001356691003831, 0, 1, 0.3328811029987234, 0, 0.4996610571693868, 2.819169252967729, 0.6671188970012766, 1, 0.1772369844922916],
[0.9995253784017756, 1.332262942906357, 0, 1, 0.4286518502850389, 0, 0.7506025783607561, 4.235022281105224, 0.5713481497149611, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.449972225859281, 0, 0, 0.1833425913802404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -5.642163247499234, 1, 0.3333333333333334, 0.1772369844922916],
[1.000278080478523, 1.998170867729533, 0, 1, 0.3335985030114696, 0, 0.5004577016660606, 2.823664051268185, 0.6664014969885304, 1, 0.1772369844922916],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5306455422104317, 1.79930703195651, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5948266282074739, 2.405173371792528, 0, 0, 0.1982755427358245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5500277741407218, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2156948170205963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.5508994435901698, 2.447549504940052, 1, 1, 0.1837281384631242, 1.815213305504678, 0.4085719197841078, -7.936500328923998, 0.9662439711368751, 0.3337002480631235, 0.1772369844922916],
[0.5345325199265586, 1.812486952979783, 0, 0, 0.2277495036138924, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[0.99652838376538, 2.025446611256358, 1, 1, 0.3297606318407713, 1.003483710339993, 0.4937182715370182, -2.897247836094977, 0.8912579256879752, 0.550779189369518, 0.1759481644794517],
[1.007324998340579, 2.014649996681159, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1759481644794517],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8031930777019585, 2.196806922298045, 0, 0, 0.2677310259006525, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[1.002783960623468, 1.997216039376534, 2, 1, 0.3342613202078223, 1.994447536592554, 0.5006969603108973, -8.427984602427172, 0.9626527720460157, 0.2604974346532609, 0.1772369844922916],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1772369844922916],
[0.8346473293218521, 2.120708237983229, 0, 1, 0.2824185822360953, 0, 0.4715405835132651, 2.660508950002889, 0.7175814177639047, 1, 0.1772369844922916]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.001221406289481334,
"Nucleotide GTR":0.001212778243391024,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"Global MG94xREV":0.001223800169421018,
"Nucleotide GTR":0.001215155212899976,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node128":{
"Global MG94xREV":0.0004887129845705127,
"Nucleotide GTR":0.000485260703218992,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node129":{
"Global MG94xREV":0.0005318820714400561,
"Nucleotide GTR":0.0005281248425257181,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0002005195456257255,
"Nucleotide GTR":0.0001991030702918694,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.00122187066319139,
"Nucleotide GTR":0.001213239336753002,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.001221701850887636,
"Nucleotide GTR":0.001213071716943793,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node199":{
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node200":{
"Global MG94xREV":0.001221862654839706,
"Nucleotide GTR":0.001213231384972525,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node203":{
"Global MG94xREV":0.001221044426140777,
"Nucleotide GTR":0.001212418936262603,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node207":{
"Global MG94xREV":0.001221215560167876,
"Nucleotide GTR":0.001212588861394442,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node211":{
"Global MG94xREV":0.001221871072996988,
"Nucleotide GTR":0.001213239743663723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node217":{
"Global MG94xREV":0.001221787976746156,
"Nucleotide GTR":0.001213157234406989,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node222":{
"Global MG94xREV":0.00122173508689762,
"Nucleotide GTR":0.001213104718173732,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node226":{
"Global MG94xREV":0.001221495265025244,
"Nucleotide GTR":0.001212866590409356,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.001221894960637979,
"Nucleotide GTR":0.001213263462561792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001221769352146497,
"Nucleotide GTR":0.001213138741371992,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001221847904452606,
"Nucleotide GTR":0.001213216738782548,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.001221761447933992,
"Nucleotide GTR":0.00121313089299505,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.001221940462759364,
"Nucleotide GTR":0.001213308643254997,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node45":{
"Global MG94xREV":0.001221649008517014,
"Nucleotide GTR":0.001213019247853063,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.001208024718437926,
"Nucleotide GTR":0.001199491200116728,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node57":{
"Global MG94xREV":0.001222156735871883,
"Nucleotide GTR":0.001213523388608573,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node66":{
"Global MG94xREV":0.001221470047886466,
"Nucleotide GTR":0.001212841551405109,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node70":{
"Global MG94xREV":0.001220994681059155,
"Nucleotide GTR":0.001212369542581544,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.001221440179490678,
"Nucleotide GTR":0.001212811894000452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0007344965117075773,
"Nucleotide GTR":0.0007293080090686422,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node86":{
"Global MG94xREV":0.0004866694277676419,
"Nucleotide GTR":0.0004832315821550183,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220253275747951,
"Nucleotide GTR":0.00121163337457692,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "G", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GGA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002458671476148107,
"Nucleotide GTR":0.002441303356301483,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "V", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "V", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GTG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GTC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220405916341899,
"Nucleotide GTR":0.001211784936913706,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "CTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001236549719629536,
"Nucleotide GTR":0.00122781469995115,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "-", "-", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "Y", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "NNN", "NNN", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TAT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221605081063361,
"Nucleotide GTR":0.001212975630704097,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Q", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAA", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221870435680982,
"Nucleotide GTR":0.001213239110849735,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132672917051,
"Nucleotide GTR":0.001212506559661334,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220948874199203,
"Nucleotide GTR":0.001212324059302454,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869824835933,
"Nucleotide GTR":0.00121323850431971,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "L", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "TTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220483711796351,
"Nucleotide GTR":0.001211862182819026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122017986696625,
"Nucleotide GTR":0.001211560484356781,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTG", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTN", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "HPRL", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CNT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0]
],
"original name":"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001288820012839884,
"Nucleotide GTR":0.001279715754438188,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222520222596256,
"Nucleotide GTR":0.001213884307653183,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "K", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AAA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220752126007068,
"Nucleotide GTR":0.001212128700944712,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001229210593466542,
"Nucleotide GTR":0.001220527417568022,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "V", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "GTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221178838771953,
"Nucleotide GTR":0.001212552399399424,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221203017892807,
"Nucleotide GTR":0.001212576407718336,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415482_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869942426639,
"Nucleotide GTR":0.001213238621079752,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415482_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221537934814724,
"Nucleotide GTR":0.001212908958778324,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869942315778,
"Nucleotide GTR":0.001213238620969673,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416343_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220752125439564,
"Nucleotide GTR":0.001212128700381217,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416343_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":1.376412186733691e-05,
"Nucleotide GTR":1.366689174916351e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220918265158673,
"Nucleotide GTR":0.001212293666484989,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "V", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GTT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221037878801725,
"Nucleotide GTR":0.001212412435174128,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGC", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221870435959706,
"Nucleotide GTR":0.001213239111126489,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221864012447082,
"Nucleotide GTR":0.001213232732989727,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221165822735251,
"Nucleotide GTR":0.001212539475308349,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220179866992214,
"Nucleotide GTR":0.001211560484382561,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "E", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "GAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122209352024944,
"Nucleotide GTR":0.001213460619542944,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221304474164642,
"Nucleotide GTR":0.001212677147300402,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTC", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228648003940253,
"Nucleotide GTR":0.001219968802188914,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "CTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869571044314,
"Nucleotide GTR":0.001213238252320883,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869570323874,
"Nucleotide GTR":0.001213238251605532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417876_Reykjavik_20200310_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001220102429385725,
"Nucleotide GTR":0.001211483593797357,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "C", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417876_Reykjavik_20200310_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "ILVF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "NTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCN", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002443570780934527,
"Nucleotide GTR":0.002426309332795274,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "C", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "F", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "TGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TTC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00122116580365882,
"Nucleotide GTR":0.001212539456366672,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221304473708274,
"Nucleotide GTR":0.001212677146847258,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "A", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GCA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220257330136557,
"Nucleotide GTR":0.001211637400325219,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "V", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "GTC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221650751978817,
"Nucleotide GTR":0.001213020978999007,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "M", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ATG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132673070382,
"Nucleotide GTR":0.001212506559813581,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221908999669051,
"Nucleotide GTR":0.001213277402420778,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACT", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221889727349702,
"Nucleotide GTR":0.001213258266241602,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "NHDY", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "NAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221584970851848,
"Nucleotide GTR":0.001212955662551647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "I", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "ATT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220819029094952,
"Nucleotide GTR":0.001212195131427427,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418311_Derbyshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221670760586144,
"Nucleotide GTR":0.001213040846265008,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418311_Derbyshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418328_Ontario_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001222010373647947,
"Nucleotide GTR":0.001213378060291227,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418328_Ontario_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869571044314,
"Nucleotide GTR":0.001213238252320883,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220902852572242,
"Nucleotide GTR":0.001212278362773474,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418625_Li_ge_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221165822129887,
"Nucleotide GTR":0.00121253947470726,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418625_Li_ge_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221587371762762,
"Nucleotide GTR":0.001212958046502463,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "H", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CAT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418670_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221037877728024,
"Nucleotide GTR":0.00121241243410801,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "CGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418670_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "KTRI", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "NTSI", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "ANA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ANT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225247918203356,
"Nucleotide GTR":0.001216592734746913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCT", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418713_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "DAGV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GNT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418728_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222430894035386,
"Nucleotide GTR":0.001213795610111611,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418736_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122116582217902,
"Nucleotide GTR":0.001212539474756046,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418736_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225318028464497,
"Nucleotide GTR":0.001216662349747329,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATT", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220561480381608,
"Nucleotide GTR":0.001211939402044954,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "P", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "CCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418888_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002442782142401193,
"Nucleotide GTR":0.002425526265225242,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "P", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CCA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418888_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418915_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132673585105,
"Nucleotide GTR":0.001212506560324669,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "V", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GTC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418915_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222249803537732,
"Nucleotide GTR":0.001213615798841986,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "Y", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TAT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221870494089173,
"Nucleotide GTR":0.001213239168845329,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418954_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132672917051,
"Nucleotide GTR":0.001212506559661334,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418954_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221605080923409,
"Nucleotide GTR":0.001212975630565134,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "D", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GAT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221748958971009,
"Nucleotide GTR":0.001213118492254429,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "Y", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "TAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132672962618,
"Nucleotide GTR":0.00121250655970658,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221679283104373,
"Nucleotide GTR":0.001213049308579944,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCA", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419415_Wales_20200318_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419415_Wales_20200318_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "NHDY", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "NAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "ILVF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "NTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419421_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419421_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCN", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "EAGV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GNA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAN", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTN", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TNA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222250165174767,
"Nucleotide GTR":0.001213616157924407,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228556659623535,
"Nucleotide GTR":0.001219878103130847,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "T", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419564_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419564_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222376726908898,
"Nucleotide GTR":0.001213741825623127,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "D", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "GAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAN", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "TPAS", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "NCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419713_Virginia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221178838722957,
"Nucleotide GTR":0.001212552399350775,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "C", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TGT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419713_Virginia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221619404649343,
"Nucleotide GTR":0.001212989853107892,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGC", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "KN", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAN", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221165822735251,
"Nucleotide GTR":0.001212539475308349,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "QH", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAN", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419875_Victoria_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220561496161806,
"Nucleotide GTR":0.00121193941771368,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAC", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419875_Victoria_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419898_Victoria_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221619404697753,
"Nucleotide GTR":0.001212989853155961,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419898_Victoria_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "KN", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAN", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221889997788543,
"Nucleotide GTR":0.001213258534770054,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419966_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221847879413624,
"Nucleotide GTR":0.001213216713920442,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419966_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220561495643497,
"Nucleotide GTR":0.001211939417199034,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419977_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122116582217902,
"Nucleotide GTR":0.001212539474756046,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419977_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221459077616153,
"Nucleotide GTR":0.001212830658629074,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTA", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132673073066,
"Nucleotide GTR":0.001212506559816246,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420104_Singapore_20200305_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001221889997797597,
"Nucleotide GTR":0.001213258534779043,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420104_Singapore_20200305_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420134_Norway_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TPAS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "NCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420134_Norway_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223079514085385,
"Nucleotide GTR":0.001214439648292551,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221192410082586,
"Nucleotide GTR":0.001212565874841963,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420252_Derbyshire_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420252_Derbyshire_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420280_South_Yorkshire_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221165803568349,
"Nucleotide GTR":0.001212539456276842,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420280_South_Yorkshire_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420290_South_Yorkshire_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221870435680982,
"Nucleotide GTR":0.001213239110849735,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "L", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CTT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420290_South_Yorkshire_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220580353778094,
"Nucleotide GTR":0.001211958142119273,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122025733010977,
"Nucleotide GTR":0.00121163740029862,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "G", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GGT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221132673585105,
"Nucleotide GTR":0.001212506560324669,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221165822171329,
"Nucleotide GTR":0.001212539474748409,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "NTSI", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ANT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420524_England_20200326_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420524_England_20200326_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420525_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "KTRI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ANA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420525_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "HPRL", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "NTSI", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CNT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ANT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "ED", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAN", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221296516171457,
"Nucleotide GTR":0.001212669245522691,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122099163865741,
"Nucleotide GTR":0.001212366521671406,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420635_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221619404622314,
"Nucleotide GTR":0.001212989853081054,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420635_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221198201554995,
"Nucleotide GTR":0.001212571625403259,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420669_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "SWL"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TNG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_420671_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "YSCF", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TNC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420685_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420689_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001221165822686556,
"Nucleotide GTR":0.001212539475259997,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420689_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221166671090322,
"Nucleotide GTR":0.001212540317670617,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "V", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "GTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420704_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "ILV", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "NTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420713_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220656644152745,
"Nucleotide GTR":0.001212033893576714,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420713_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221305989951221,
"Nucleotide GTR":0.001212678652379427,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420745_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420749_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869571044314,
"Nucleotide GTR":0.001213238252320883,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "Y", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "TAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420749_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420775_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001221165822735251,
"Nucleotide GTR":0.001212539475308349,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420775_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420777_England_20200327_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420777_England_20200327_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221178839357397,
"Nucleotide GTR":0.001212552399980734,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCG", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420847_Congo_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420847_Congo_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420910_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001222249803514485,
"Nucleotide GTR":0.001213615798818903,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420910_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221889997780227,
"Nucleotide GTR":0.001213258534761799,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "V", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GTC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "HPRL", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CNT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221821328239298,
"Nucleotide GTR":0.001213190350304307,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421004_Wales_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421004_Wales_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421007_Wales_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00122114877078374,
"Nucleotide GTR":0.001212522543812269,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421007_Wales_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_76":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222250165144412,
"Nucleotide GTR":0.001213616157894268,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421190_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122165072482073,
"Nucleotide GTR":0.001213020952032767,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "I", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ATT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421190_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221760705466267,
"Nucleotide GTR":0.001213130155772138,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "Y", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221165803140712,
"Nucleotide GTR":0.001212539455852225,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122056148042477,
"Nucleotide GTR":0.001211939402087812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221165803123065,
"Nucleotide GTR":0.001212539455834703,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGT", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421309_Wisconsin_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001221038787020075,
"Nucleotide GTR":0.0012124133369768,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421309_Wisconsin_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221650793452293,
"Nucleotide GTR":0.001213021020179515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001221751050474769,
"Nucleotide GTR":0.001213120568983753,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221760706216945,
"Nucleotide GTR":0.001213130156517513,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "T", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "ACT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001222896864385163,
"Nucleotide GTR":0.001214258288834606,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "D", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GAT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220475329890822,
"Nucleotide GTR":0.001211853860123498,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421408_New_York_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001221037877804453,
"Nucleotide GTR":0.0012124124341839,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421408_New_York_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221869571017619,
"Nucleotide GTR":0.001213238252294376,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_490":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_490",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221198201659803,
"Nucleotide GTR":0.001212571625507326,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421501_Ile_de_France_20200312_null_32":{
"Global MG94xREV":0.001221324063911979,
"Nucleotide GTR":0.001212696598665249,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421501_Ile_de_France_20200312_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_689":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_689",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2993":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2993",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5000.567478119783,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02328745176799809],
[0.01834955793371464],
[0.01215515343334017],
[0.03324256602422043],
[0.01697421811967242],
[0.01337498846458001],
[0.008859888480333198],
[0.02423049856095253],
[0.01151073865990954],
[0.009069990482604715],
[0.006008162504690772],
[0.01643144529945639],
[0.02509993782573721],
[0.01977772269179428],
[0.01310120138856919],
[0.03582986875028212],
[0.01442420181415535],
[0.01136568008699685],
[0.007528878125062205],
[0.02059038000081533],
[0.01051379731173976],
[0.008284441543759628],
[0.005487797495596158],
[0.01500832314255505],
[0.007129728882088347],
[0.00561793426249167],
[0.003721444036182358],
[0.01017760489463755],
[0.0155468521128067],
[0.01225028252867378],
[0.0081148583674709],
[0.02219295021961073],
[0.02238463547619346],
[0.01763817568309261],
[0.01168391808057028],
[0.03195380628841713],
[0.01631615553679485],
[0.01285646210932136],
[0.008516405142469282],
[0.02329112189246542],
[0.01106448621046152],
[0.008718361834876875],
[0.005775235903399917],
[0.01579442512816261],
[0.02412685442364942],
[0.01901097283702985],
[0.01259328930898014],
[0.03444080353339013],
[0.01974104727143335],
[0.03576342654566782],
[0.01826141226434654],
[0.01438924471575534],
[0.009531754276680737],
[0.02606795320247416],
[0.009757788798800975],
[0.006463775337150226],
[0.0176774797281928],
[0.02700332405379145],
[0.02127751306000932],
[0.01409469573373836],
[0.03854693041018586]
],
"Log Likelihood":-2283.29971537883,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.915344604957515, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":216
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5349.507351115614,
"Equilibrium frequencies": [
[0.27032681788091],
[0.2105379603498136],
[0.1848733493606494],
[0.3342618724086268]
],
"Log Likelihood":-2320.881011516912,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.5488991307208149,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1434678825013292,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1993764008408607,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.261679827180991,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.897332743432493
},
"display order":0,
"estimated parameters":353
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-08/sequences.ORF3a.compressed.fas",
"number of sequences":174,
"number of sites":275,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_420134_Norway_20200228_null_1,epi_isl_421004_Wales_20200323_null_3)Node226,epi_isl_416343_Shanghai_20200204_null_1,(epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_418328_Ontario_20200320_null_2,epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5)Node231,epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418670_England_20200311_null_1,(epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_420847_Congo_20200326_null_8)Node239,(epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1)Node242,epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5,epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_1,(epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1,epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2)Node73,epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_418888_Washington_20200323_null_1,epi_isl_420669_England_20200327_null_1,epi_isl_418738_England_20200317_null_1,epi_isl_420910_England_20200325_null_2,(epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2)Node70,epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1,epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1,epi_isl_418935_Washington_20200324_null_1,epi_isl_420290_South_Yorkshire_20200316_null_1,epi_isl_417876_Reykjavik_20200310_null_11,epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1,epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_2,epi_isl_420280_South_Yorkshire_20200321_null_1,epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1,epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1,(epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1,epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1)Node66,epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,(epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_14)Node288,epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1,epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1,epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1,epi_isl_419875_Victoria_20200318_null_3,epi_isl_419713_Virginia_20200311_null_1,epi_isl_419977_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_420749_England_20200325_null_1,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,(epi_isl_420713_England_20200327_null_3,epi_isl_420777_England_20200327_null_24)Node303,epi_isl_419966_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_415482_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_420671_England_20200328_null_1,epi_isl_418736_England_20200318_null_1,epi_isl_421408_New_York_20200318_null_5,epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_418938_Washington_20200324_null_1,epi_isl_420775_England_20200330_null_7,epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2,epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1,epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1,epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2,epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2,epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_418625_Li_ge_20200314_null_1,epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1,epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,(epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node50,epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2)Node45,epi_isl_421007_Wales_20200323_null_3,epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2,epi_isl_420689_England_20200328_null_4,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1)Node57,epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2993,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,(epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1,epi_isl_420525_England_20200326_null_5)Node222,(epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2,epi_isl_420524_England_20200326_null_51)Node217,(epi_isl_418728_England_20200318_null_1,epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1)Node207,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1,epi_isl_420745_England_20200328_null_1)Node203,(epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5)Node200,(epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1,epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2,epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1,epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_689,epi_isl_421190_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_418915_Washington_20200324_null_1,epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_418954_Washington_20200323_null_1,epi_isl_420635_England_20200322_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_420704_England_20200328_null_1,epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2,epi_isl_421501_Ile_de_France_20200312_null_32)Node150,(epi_isl_419564_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2)Node197,(epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_5,epi_isl_421309_Wisconsin_20200320_null_3,epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7)Node211,epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2,epi_isl_418311_Derbyshire_20200325_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1,(((epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_421010_Wales_20200323_null_76,epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1,epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1)Node130,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1)Node129,epi_isl_419415_Wales_20200318_null_12)Node128,epi_isl_419421_Wales_20200318_null_1,((epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2,epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,(epi_isl_420252_Derbyshire_20200324_null_1,epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1)Node117,epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_490,epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_420685_England_20200329_null_1,epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1,epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1,epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_2,epi_isl_420104_Singapore_20200305_null_5,epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1,epi_isl_418713_England_20200317_null_1,epi_isl_419898_Victoria_20200319_null_2,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1,epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1,epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1)Node86,epi_isl_420975_Wales_20200322_null_5)Node85,(epi_isl_418730_England_20200318_null_1,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1)Node124)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node117":"test",
"Node124":"test",
"Node128":"test",
"Node129":"test",
"Node130":"test",
"Node150":"test",
"Node197":"test",
"Node200":"test",
"Node203":"test",
"Node207":"test",
"Node211":"test",
"Node217":"test",
"Node222":"test",
"Node226":"test",
"Node231":"test",
"Node239":"test",
"Node242":"test",
"Node288":"test",
"Node303":"test",
"Node45":"test",
"Node50":"test",
"Node57":"test",
"Node66":"test",
"Node70":"test",
"Node73":"test",
"Node85":"test",
"Node86":"test",
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_415482_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416343_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":"test",
"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417876_Reykjavik_20200310_null_11":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":"test",
"epi_isl_418080_Idaho_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418311_Derbyshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_418328_Ontario_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_418411_Helsinki_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418625_Li_ge_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418670_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418736_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418888_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418915_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418935_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418954_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":"test",
"epi_isl_419415_Wales_20200318_null_12":"test",
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419421_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419564_Luxembourg_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419713_Virginia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419875_Victoria_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_419898_Victoria_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419966_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419977_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420104_Singapore_20200305_null_5":"test",
"epi_isl_420134_Norway_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420252_Derbyshire_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420280_South_Yorkshire_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420290_South_Yorkshire_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420524_England_20200326_null_51":"test",
"epi_isl_420525_England_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420635_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420689_England_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420713_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420749_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420775_England_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_420777_England_20200327_null_24":"test",
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_420847_Congo_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_420910_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421004_Wales_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_421007_Wales_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_76":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421190_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":"test",
"epi_isl_421309_Wisconsin_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421408_New_York_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_490":"test",
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421467_Portugal_20200320_null_14":"test",
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_421501_Ile_de_France_20200312_null_32":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_689":"test",
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2993":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":3
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":6
}
}
}