{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524009416375916],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005240091993035499],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240096717619209],
[587.1884327492339, 1271.098120235296, 0, 1, 0.3159837925997855, 0, 0.0007867213270796811, 0.007810035363291697, 0.6840162074002145, 1, 0.0005238123483797843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005238666651424648],
[587.3486355387399, 1271.791703689148, 0, 1, 0.3159248514733801, 0, 0.0007862922812747178, 0.007805776087746601, 0.6840751485266199, 1, 0.0005244741330738605],
[586.7974471862091, 1271.517198918197, 1, 0, 0.3157686177721923, 0.00170416555967509, 0, -0.016917799006888, 1, 0.3157686177721923, 0.0005240451537312124],
[586.9972205791208, 1271.378857127407, 0, 1, 0.3158656784387527, 0, 0.0007865476088374091, 0.007808310806490332, 0.6841343215612472, 1, 0.0005239062194633846],
[587.4734016914852, 1270.871004234341, 0, 1, 0.3161273011709614, 0, 0.0007868619212084925, 0.007811431086376978, 0.6838726988290386, 1, 0.0005241903538906901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.1885564868066, 1271.14096952831, 0, 1, 0.315976552202739, 0, 0.0007866948072416204, 0.00780977209233926, 0.684023447797261, 1, 0.0005239092276585341],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240249047663563],
[586.7717253500715, 1271.542920754335, 0, 1, 0.3157547762862031, 0, 0.0007864461227991866, 0.007807303321984554, 0.6842452237137968, 1, 0.0005240450986309658],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235583117654496],
[586.9472664605281, 1271.454533082137, 0, 1, 0.3158344264437163, 0, 0.0007865007941541539, 0.007807846062089539, 0.6841655735562837, 1, 0.0005238848079896041],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005236013481185212],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005240091990048812],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.000524009562146642],
[586.9100671408618, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437463, 1, 0.315829221047794, 0.000523558991661967],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240095590991551],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524030833482854],
[587.3760765724921, 1270.973643739797, 1, 4, 0.3160740253313492, 0.001702486771056947, 0.00314719350767191, 0.0143420679142283, 0.4954155235927696, 0.8503607612799255, 0.002630060404328484],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.3107841329488, 1271.003861971458, 0, 1, 0.3160448556783057, 0, 0.0007867796707154746, 0.007810614559308235, 0.6839551443216942, 1, 0.0005239079841106684],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005239508123006366],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095621367328],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240092506438619],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005235582566453485],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005243852587268676],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0005241271931093644],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990048812],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005238845899019168],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241271928123775],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240457989449013],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240091990152466],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235582566453485],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240094193359343],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005241272442633066],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005236435526104673],
[587.1322465094804, 1271.154306475049, 0, 1, 0.3159535570908091, 0, 0.0007866865532423293, 0.00780969015223654, 0.6840464429091909, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235468904484852],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 2, 0.3157720379996263, 0, 0.001572931926547847, 0.01561500056950281, 0.4681679039831849, 1, 0.001048787987104475],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0005240094193359343],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005240450989276506],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240095059272798],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990048812],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240450989276506],
[586.7602478665426, 1271.492966635742, 0, 1, 0.3157590382663219, 0, 0.0007864770205107084, 0.007807610053493316, 0.6842409617336781, 1, 0.000524176558916512],
[586.7974471862091, 1271.517198918197, 1, 0, 0.3157686177721923, 0.00170416555967509, 0, -0.016917799006888, 1, 0.3157686177721923, 0.0005238879800979891],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524009505934321],
[586.7975709237819, 1271.517075180624, 0, 0, 0.3157686843581028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001833582077066536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0003404708463760047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005241056740660272],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7545978931953, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157551064968281, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842448935031719, 1, 0.000524313527902877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005239678126070371],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005239662917528574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.9535416631481, 1269.318131410672, 1, 0, 0.315831665069482, 0.001706619943215358, 0, -0.01694216446081021, 1, 0.315831665069482, 0.0005246071848955992],
[586.052824671061, 1269.261821433345, 1, 0, 0.3158778624971203, 0.001706330825316436, 0, -0.01693929429454291, 1, 0.3158778624971204, 0.0005246146614082886],
[586.0098516404744, 1269.304794463932, 0, 1, 0.3158547003716679, 0, 0.0007878328391742441, 0.007821069700949082, 0.6841452996283321, 1, 0.0005254722264761566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.5970050787337, 1269.752715233556, 0, 1, 0.3156262124965675, 0, 0.000787554921523489, 0.007818310723143641, 0.6843737875034326, 1, 0.0005245795608828151],
[586.0098516404744, 1269.304794463932, 0, 1, 0.3158547003716679, 0, 0.0007878328391742441, 0.007821069700949082, 0.6841452996283321, 1, 0.0005246839114002732],
[586.052824671061, 1269.261821433345, 0, 1, 0.3158778624971202, 0, 0.0007878595126029436, 0.007821334496645134, 0.6841221375028798, 1, 0.0005246839192010983],
[585.9318044020049, 1269.382841702401, 0, 1, 0.315812633524067, 0, 0.0007877843997472619, 0.007820588827195331, 0.684187366475933, 1, 0.0005248092407450837],
[585.9278198270106, 1269.325394675274, 0, 1, 0.3158209430642057, 0, 0.0007878200532305789, 0.007820942770778586, 0.6841790569357944, 1, 0.0005248094041169225],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005247173128420806],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005248758440315043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005238481336220079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7975709237819, 1271.517075180624, 0, 1, 0.3157686843581028, 0, 0.0007864621085469463, 0.007807462017638294, 0.6842313156418971, 1, 0.0005241279843988894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.000523993526735631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9007147691162, 1271.439653171427, 0, 4, 0.3158198169152045, 0, 0.003146039994916442, 0.03123174975544912, 0.2191199719696343, 1, 0.002117980372991488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7038948077571, 1271.610751296649, 0, 1, 0.3157182751788924, 0, 0.000786404172015933, 0.007806886863081699, 0.6842817248211075, 1, 0.0005240871373711231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7538489263499, 1271.560797178057, 1, 0, 0.3157451565892593, 0.001704292186288703, 0, -0.01691905606996257, 1, 0.3157451565892593, 0.0005241319508702994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240429395258503],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.00052422603598438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005239835854659951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157812733579121, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157812733579122, 0.0005238258124072264],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005235911216221629],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091993035499],
[586.8888313714183, 1271.425814732988, 1, 1, 0.3158177936130009, 0.001703900204853516, 0.0007865185592523225, -0.009107142322397448, 0.900259121237416, 0.5318947084634178, 0.001048539077747344],
[586.8628633633251, 1271.901828622488, 0, 1, 0.3157273569342172, 0, 0.0007862242018183376, 0.007805100241111279, 0.6842726430657828, 1, 0.0005238590900155784],
[586.8818502834122, 1271.417915910284, 1, 0, 0.3158165657446677, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158165657446677, 0.0005240097276663039],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524009505934321],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240093617552994],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240450989276506],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005238880908771223],
[586.4409106017946, 1271.908809710495, 0, 1, 0.3155708014437913, 0, 0.0007862198864929748, 0.007805057401490022, 0.6844291985562087, 1, 0.0005236220361376933],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240094163862175],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095059272798],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095059272798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005242510290740338],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240108819179513],
[586.9409106017946, 1271.435167104733, 0, 1, 0.3158353778026212, 0, 0.0007865127738106884, 0.007807964987988653, 0.6841646221973788, 1, 0.0005235195434719665],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235582566453485],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240092506362414],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005235583117554304],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005242601355951085],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524030833493239],
[586.8038030449427, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157805266255484, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842194733744515, 1, 0.0005240092506362414],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235582566381513],
[586.9972205791209, 1271.317425525285, 0, 1, 0.3158761202305788, 0, 0.0007865856157731953, 0.007808688113552341, 0.6841238797694211, 1, 0.0005235583117554304],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524030833493239],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.000523623057986441],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241393191561543],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005240154546602313],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000523836194740147],
[586.8038030449426, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157805266255483, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842194733744517, 1, 0.0005240387844759482],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005239490722748172],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005239539006045378],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005235439871828074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7678111023622, 1271.546835002044, 0, 1, 0.3157526699433846, 0, 0.0007864437018542006, 0.007807279288485903, 0.6842473300566154, 1, 0.0005241075344378398],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157757946766889, 0.001704126827658025, 0, -0.01691741450171119, 1, 0.3157757946766888, 0.0005240851602045857],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005242126921002084],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7538489263499, 1271.560797178057, 0, 1, 0.3157451565892593, 0, 0.0007864350664311728, 0.00780719356186721, 0.6842548434107407, 1, 0.0005243017095636647],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240949176020556],
[587.3038030449426, 1271.010843059464, 0, 1, 0.3160410990012431, 0, 0.0007867753492904036, 0.007810571659133215, 0.683958900998757, 1, 0.0005241834287126242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005242908989786305],
[586.8628633633251, 1271.513214343203, 0, 1, 0.3157933802546513, 0, 0.0007864644965695835, 0.007807485724306212, 0.6842066197453487, 1, 0.0005240933293374294],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005241312354055302],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241310190313335],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241752094997928],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240091990048812],
[586.8537571635354, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157904305178404, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842095694821595, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241527885564045],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005241744550629877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005242657731207384],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241404474789127],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241312354055302],
[587.3537571635354, 1270.960888940871, 0, 1, 0.3160679804116099, 0, 0.0007868062728769958, 0.007810878647512112, 0.68393201958839, 1, 0.0005240327655622489],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241752063591096],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241310157556172],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241596258660735],
[586.9472664605281, 1271.428811246, 0, 1, 0.315838797916994, 0, 0.0007865167055794497, 0.007808004019920303, 0.6841612020830059, 1, 0.0006074228903326382],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0004840998615362108],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 0, 0.3157989194099932, 0, 0, 0, 1, 1, 3.978847614081553e-05],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005239210704363576],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005237053940018165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.360980703686, 0, 1, 0.3158158985635325, 0, 0.0007865586683701038, 0.007808420598024481, 0.6841841014364675, 1, 0.0005242746633061043],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.000523976714430793],
[585.9564963978908, 1272.28800129075, 1, 0, 0.3153279867782345, 0.001706611337441261, 0, -0.01694207902852598, 1, 0.3153279867782345, 0.0005241292958461817],
[585.0752616622545, 1270.184863573611, 1, 0.75, 0.3153602310015, 0.001709181819034537, 0.0005904652318796391, -0.011105858969927, 0.9306744644066808, 0.4847016942320533, 0.0005247319258702046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.0780988147602, 1272.25355231214, 0, 1, 0.3153786346260422, 0, 0.00078600684445537, 0.007802942464738862, 0.6846213653739579, 1, 0.0005242258642842941],
[585.9845895177675, 1272.259908170873, 1, 0, 0.3153431048748637, 0.001706529519527031, 0, -0.01694126679580583, 1, 0.3153431048748637, 0.0005241283110036283],
[585.9845895177675, 1272.259908170873, 1, 0, 0.3153431048748637, 0.001706529519527031, 0, -0.01694126679580583, 1, 0.3153431048748637, 0.0005241284764429384],
[586.341126102182, 1271.903371586459, 0, 1, 0.3155349722985843, 0, 0.0007862232480386378, 0.007805090772633779, 0.6844650277014157, 1, 0.0005241256896230962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005239404613310476],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005241164601022798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005238982384365814],
[586.0792523925847, 1272.261115547959, 0, 1, 0.3153777760540667, 0, 0.0007860021718649342, 0.007802896078432446, 0.6846222239459333, 1, 0.0005239876699643361],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005240071444641716],
[586.1406839947065, 1272.124007991107, 0, 1, 0.3154236780812608, 0, 0.000786086885962607, 0.007803737062496078, 0.6845763219187393, 1, 0.0005240073094369702],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005235210278601389],
[586.4112745179477, 1271.903371586459, 0, 1, 0.3155608097623535, 0, 0.0007862232480386378, 0.007805090772633779, 0.6844391902376465, 1, 0.0005240812501792626],
[586.7769173021519, 1271.599160404376, 0, 1, 0.3157471323168931, 0, 0.0007864113402544195, 0.007806958024488089, 0.684252867683107, 1, 0.000523673530993973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157757946766889, 0.001704126827658025, 0, -0.01691741450171119, 1, 0.3157757946766888, 0.0005238878645244062],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235584741855739],
[586.8628633633251, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157890094099921, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842109905900079, 1, 0.000523919703635543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9318044020049, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158409183463052, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841590816536948, 1, 0.0005238668328015059],
[586.9037112821281, 1271.425814732988, 1, 1, 0.3158232719579326, 0.001703857005462509, 0.0007865185592523225, -0.009106713468164293, 0.9002556608897858, 0.531902204805651, 0.001048413045778271],
[586.9318044020049, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158409183463052, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841590816536948, 1, 0.0005240189188934773],
[586.8616559862392, 1271.318007673099, 0, 1, 0.3158261106089842, 0, 0.0007865852555886517, 0.007808684537884662, 0.6841738893910159, 1, 0.0005241589718796915],
[586.8616559862392, 1271.353081880982, 0, 1, 0.3158201493223618, 0, 0.0007865635552009582, 0.007808469111164361, 0.6841798506776382, 1, 0.0005241899982938974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.5332125217013, 1271.131571226927, 0, 1, 0.3161049898071138, 0, 0.0007867006237873361, 0.007809829835057257, 0.6838950101928862, 1, 0.0005240188059860251],
[586.6261396708808, 1271.58859819634, 1, 0, 0.3156934059968683, 0.001704663212861666, 0, -0.01692273936995181, 1, 0.3156934059968683, 0.0005246707003553779],
[586.9397032247086, 1271.362188080772, 1, 0, 0.3158473367383683, 0.001703752522628635, 0, -0.01691369865543174, 1, 0.3158473367383683, 0.000524005275656172],
[586.896730194122, 1271.318007673099, 1, 0, 0.3158390245401546, 0.001703877272700497, 0, -0.01691493708947348, 1, 0.3158390245401546, 0.0005240378097191685],
[586.1003920680496, 1269.104188987006, 0, 1.75, 0.3159222427829141, 0, 0.001378925398864882, 0.01368903544086213, 0.514558280854714, 1, 0.0005241646143896614],
[586.896730194122, 1271.318007673099, 0, 1, 0.3158390245401546, 0, 0.0007865852555886517, 0.007808684537884662, 0.6841609754598454, 1, 0.0005241757871989212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005240764590147409],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005241600894678584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005236274835562581],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005239054243196032],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240099279720744],
[586.8537571635354, 1271.373735502612, 1, 0, 0.3158137308158806, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3158137308158806, 0.000524176558916512],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005236013481185212]
],
"NAMES": [
["epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1"],
["epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1"],
["epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4"],
["Node23"],
["epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1"],
["epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2"],
["epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1"],
["epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2"],
["epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2"],
["Node35"],
["epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2"],
["epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1"],
["epi_isl_419698_New_York_20200318_null_4"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3"],
["epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9"],
["epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1"],
["epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1"],
["epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_417363_Connecticut_20200314_null_1"],
["Node390"],
["epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["epi_isl_418722_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1"],
["epi_isl_418710_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_418751_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4"],
["epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1"],
["epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_417839_Reykjavik_20200316_null_5"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1"],
["epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1"],
["epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12"],
["epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5"],
["epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1"],
["epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1"],
["epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4"],
["epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2"],
["epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1"],
["epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1"],
["epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1"],
["epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_418746_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1"],
["epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node346"],
["epi_isl_414525_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_420477_England_20200318_null_6"],
["epi_isl_420526_England_20200327_null_1"],
["Node261"],
["epi_isl_418687_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1"],
["epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1"],
["epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1"],
["epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420479_England_20200319_null_56"],
["Node271"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_420458_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1"],
["epi_isl_417285_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1"],
["epi_isl_420463_England_20200312_null_103"],
["epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1"],
["epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1"],
["epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5"],
["epi_isl_418741_England_20200318_null_2"],
["Node276"],
["epi_isl_419937_Victoria_20200321_null_4"],
["epi_isl_420386_Watermaal_Bosvoorde_20200323_null_5"],
["Node295"],
["epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5"],
["epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_416453_Connecticut_20200307_null_1"],
["Node303"],
["epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1"],
["epi_isl_414483_USA_20200217_null_1"],
["epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1"],
["epi_isl_420530_England_20200327_null_2507"],
["epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_414482_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_418691_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_420523_England_20200326_null_76"],
["epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_420488_England_20200320_null_1"],
["Node324"],
["epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1"],
["epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1"],
["Node333"],
["epi_isl_420527_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1"],
["epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2"],
["Node341"],
["epi_isl_417232_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_420511_England_20200323_null_7"],
["epi_isl_420306_Fairbanks_20200301_null_1"],
["epi_isl_420531_Australia_20200314_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1"],
["epi_isl_420489_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_420500_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_420509_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_1"],
["Node245"],
["epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1"],
["epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2"],
["epi_isl_418315_Derbyshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2"],
["epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1"],
["epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2"],
["epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_6"],
["epi_isl_420485_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3"],
["epi_isl_418729_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1"],
["epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1"],
["Node217"],
["epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_2"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1"],
["Node181"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1"],
["epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1"],
["epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1"],
["Node166"],
["epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1"],
["epi_isl_420501_England_20200322_null_400"],
["epi_isl_417939_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1"],
["epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1"],
["epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4"],
["epi_isl_420529_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420027_Virginia_20200328_null_3"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6"],
["Node142"],
["epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3"],
["epi_isl_418204_New_York_20200317_null_3"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1"],
["epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2"],
["epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_418037_Connecticut_20200316_null_6"],
["Node173"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["Node121"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1"],
["Node178"],
["epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2"],
["epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_416458_Hawali_20200302_null_12"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1"],
["epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1"],
["Node204"],
["epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1"],
["Node203"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_43"],
["epi_isl_419753_Victoria_20200310_null_2"],
["epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8"],
["Node187"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7"],
["epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_420295_Slovenia_20200324_null_6"],
["Node198"],
["epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3"],
["epi_isl_420237_South_Yorkshire_20200323_null_27"],
["epi_isl_416675_USA_20200311_null_1"],
["epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1"],
["Node101"],
["epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5"],
["epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3"],
["epi_isl_420528_England_20200327_null_121"],
["epi_isl_418320_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_418698_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1"],
["epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_418765_England_20200318_null_1"],
["Node85"],
["epi_isl_420492_England_20200320_null_17"],
["Node84"],
["epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1"],
["epi_isl_415473_Netherlands_20200309_null_3"],
["Node80"],
["epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_413693_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1"],
["epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524009416375916],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005240091993035499],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240096717619209],
[587.1884327492339, 1271.098120235296, 0, 1, 0.3159837925997855, 0, 0.0007867213270796811, 0.007810035363291697, 0.6840162074002145, 1, 0.0005238123483797843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005238666651424648],
[587.3486355387399, 1271.791703689148, 0, 1, 0.3159248514733801, 0, 0.0007862922812747178, 0.007805776087746601, 0.6840751485266199, 1, 0.0005244741330738605],
[586.7974471862091, 1271.517198918197, 1, 0, 0.3157686177721923, 0.00170416555967509, 0, -0.016917799006888, 1, 0.3157686177721923, 0.0005240451537312124],
[586.9972205791208, 1271.378857127407, 0, 1, 0.3158656784387527, 0, 0.0007865476088374091, 0.007808310806490332, 0.6841343215612472, 1, 0.0005239062194633846],
[587.4734016914852, 1270.871004234341, 0, 1, 0.3161273011709614, 0, 0.0007868619212084925, 0.007811431086376978, 0.6838726988290386, 1, 0.0005241903538906901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.1885564868066, 1271.14096952831, 0, 1, 0.315976552202739, 0, 0.0007866948072416204, 0.00780977209233926, 0.684023447797261, 1, 0.0005239092276585341],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240249047663563],
[586.7717253500715, 1271.542920754335, 0, 1, 0.3157547762862031, 0, 0.0007864461227991866, 0.007807303321984554, 0.6842452237137968, 1, 0.0005240450986309658],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235583117654496],
[586.9472664605281, 1271.454533082137, 0, 1, 0.3158344264437163, 0, 0.0007865007941541539, 0.007807846062089539, 0.6841655735562837, 1, 0.0005238848079896041],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005236013481185212],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005240091990048812],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.000524009562146642],
[586.9100671408618, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437463, 1, 0.315829221047794, 0.000523558991661967],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240095590991551],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524030833482854],
[587.3760765724921, 1270.973643739797, 1, 4, 0.3160740253313492, 0.001702486771056947, 0.00314719350767191, 0.0143420679142283, 0.4954155235927696, 0.8503607612799255, 0.002630060404328484],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.3107841329488, 1271.003861971458, 0, 1, 0.3160448556783057, 0, 0.0007867796707154746, 0.007810614559308235, 0.6839551443216942, 1, 0.0005239079841106684],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005239508123006366],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095621367328],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240092506438619],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005235582566453485],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005243852587268676],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0005241271931093644],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091990048812],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005238845899019168],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241271928123775],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240457989449013],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240091990152466],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235582566453485],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091960232516],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240094193359343],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005241272442633066],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005236435526104673],
[587.1322465094804, 1271.154306475049, 0, 1, 0.3159535570908091, 0, 0.0007866865532423293, 0.00780969015223654, 0.6840464429091909, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235468904484852],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 2, 0.3157720379996263, 0, 0.001572931926547847, 0.01561500056950281, 0.4681679039831849, 1, 0.001048787987104475],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0005240094193359343],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005240450989276506],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240095059272798],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990048812],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240450989276506],
[586.7602478665426, 1271.492966635742, 0, 1, 0.3157590382663219, 0, 0.0007864770205107084, 0.007807610053493316, 0.6842409617336781, 1, 0.000524176558916512],
[586.7974471862091, 1271.517198918197, 1, 0, 0.3157686177721923, 0.00170416555967509, 0, -0.016917799006888, 1, 0.3157686177721923, 0.0005238879800979891],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000524009505934321],
[586.7975709237819, 1271.517075180624, 0, 0, 0.3157686843581028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001833582077066536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.0003404708463760047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005241056740660272],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7545978931953, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157551064968281, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842448935031719, 1, 0.000524313527902877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157885758260363, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157885758260363, 0.0005239678126070371],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005239662917528574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.9535416631481, 1269.318131410672, 1, 0, 0.315831665069482, 0.001706619943215358, 0, -0.01694216446081021, 1, 0.315831665069482, 0.0005246071848955992],
[586.052824671061, 1269.261821433345, 1, 0, 0.3158778624971203, 0.001706330825316436, 0, -0.01693929429454291, 1, 0.3158778624971204, 0.0005246146614082886],
[586.0098516404744, 1269.304794463932, 0, 1, 0.3158547003716679, 0, 0.0007878328391742441, 0.007821069700949082, 0.6841452996283321, 1, 0.0005254722264761566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.5970050787337, 1269.752715233556, 0, 1, 0.3156262124965675, 0, 0.000787554921523489, 0.007818310723143641, 0.6843737875034326, 1, 0.0005245795608828151],
[586.0098516404744, 1269.304794463932, 0, 1, 0.3158547003716679, 0, 0.0007878328391742441, 0.007821069700949082, 0.6841452996283321, 1, 0.0005246839114002732],
[586.052824671061, 1269.261821433345, 0, 1, 0.3158778624971202, 0, 0.0007878595126029436, 0.007821334496645134, 0.6841221375028798, 1, 0.0005246839192010983],
[585.9318044020049, 1269.382841702401, 0, 1, 0.315812633524067, 0, 0.0007877843997472619, 0.007820588827195331, 0.684187366475933, 1, 0.0005248092407450837],
[585.9278198270106, 1269.325394675274, 0, 1, 0.3158209430642057, 0, 0.0007878200532305789, 0.007820942770778586, 0.6841790569357944, 1, 0.0005248094041169225],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005247173128420806],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005248758440315043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005238481336220079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7975709237819, 1271.517075180624, 0, 1, 0.3157686843581028, 0, 0.0007864621085469463, 0.007807462017638294, 0.6842313156418971, 1, 0.0005241279843988894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.488982060748, 1, 0, 0.315783801884048, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.315783801884048, 0.000523993526735631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9007147691162, 1271.439653171427, 0, 4, 0.3158198169152045, 0, 0.003146039994916442, 0.03123174975544912, 0.2191199719696343, 1, 0.002117980372991488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7038948077571, 1271.610751296649, 0, 1, 0.3157182751788924, 0, 0.000786404172015933, 0.007806886863081699, 0.6842817248211075, 1, 0.0005240871373711231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7538489263499, 1271.560797178057, 1, 0, 0.3157451565892593, 0.001704292186288703, 0, -0.01691905606996257, 1, 0.3157451565892593, 0.0005241319508702994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240429395258503],
[586.8038030449427, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842279620003737, 1, 0.00052422603598438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005239835854659951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8256640436587, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157812733579121, 0.001704083616775155, 0, -0.01691698553339461, 1, 0.3157812733579122, 0.0005238258124072264],
[586.8537571635354, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158121831857614, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841878168142386, 1, 0.0005235911216221629],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005240091993035499],
[586.8888313714183, 1271.425814732988, 1, 1, 0.3158177936130009, 0.001703900204853516, 0.0007865185592523225, -0.009107142322397448, 0.900259121237416, 0.5318947084634178, 0.001048539077747344],
[586.8628633633251, 1271.901828622488, 0, 1, 0.3157273569342172, 0, 0.0007862242018183376, 0.007805100241111279, 0.6842726430657828, 1, 0.0005238590900155784],
[586.8818502834122, 1271.417915910284, 1, 0, 0.3158165657446677, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158165657446677, 0.0005240097276663039],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005240091990152466],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524009505934321],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240093617552994],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240450989276506],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005238880908771223],
[586.4409106017946, 1271.908809710495, 0, 1, 0.3155708014437913, 0, 0.0007862198864929748, 0.007805057401490022, 0.6844291985562087, 1, 0.0005236220361376933],
[586.7757099250659, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263188, 1, 0.0005240094163862175],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095059272798],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240095059272798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005242510290740338],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240108819179513],
[586.9409106017946, 1271.435167104733, 0, 1, 0.3158353778026212, 0, 0.0007865127738106884, 0.007807964987988653, 0.6841646221973788, 1, 0.0005235195434719665],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005235582566453485],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005240092506362414],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005235583117554304],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005242601355951085],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524030833493239],
[586.8038030449427, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157805266255484, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842194733744515, 1, 0.0005240092506362414],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235582566381513],
[586.9972205791209, 1271.317425525285, 0, 1, 0.3158761202305788, 0, 0.0007865856157731953, 0.007808688113552341, 0.6841238797694211, 1, 0.0005235583117554304],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.000524030833493239],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.000523623057986441],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241393191561543],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005240154546602313],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.000523836194740147],
[586.8038030449426, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157805266255483, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842194733744517, 1, 0.0005240387844759482],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005239490722748172],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005239539006045378],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005235439871828074],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7678111023622, 1271.546835002044, 0, 1, 0.3157526699433846, 0, 0.0007864437018542006, 0.007807279288485903, 0.6842473300566154, 1, 0.0005241075344378398],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157757946766889, 0.001704126827658025, 0, -0.01691741450171119, 1, 0.3157757946766888, 0.0005240851602045857],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0005242126921002084],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7538489263499, 1271.560797178057, 0, 1, 0.3157451565892593, 0, 0.0007864350664311728, 0.00780719356186721, 0.6842548434107407, 1, 0.0005243017095636647],
[586.8038030449426, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157720379996263, 0, 0.0007864659632739237, 0.007807500284751404, 0.6842279620003737, 1, 0.0005240949176020556],
[587.3038030449426, 1271.010843059464, 0, 1, 0.3160410990012431, 0, 0.0007867753492904036, 0.007810571659133215, 0.683958900998757, 1, 0.0005241834287126242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005242908989786305],
[586.8628633633251, 1271.513214343203, 0, 1, 0.3157933802546513, 0, 0.0007864644965695835, 0.007807485724306212, 0.6842066197453487, 1, 0.0005240933293374294],
[586.7757099250658, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157569204736811, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842430795263189, 1, 0.0005241312354055302],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241310190313335],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241752094997928],
[586.8818502834122, 1271.432795820994, 1, 0, 0.3158140369359383, 0.001703920473119229, 0, -0.01691536595390919, 1, 0.3158140369359383, 0.0005240091990048812],
[586.8537571635354, 1271.510843059464, 0, 1, 0.3157904305178404, 0, 0.0007864659632739236, 0.007807500284751403, 0.6842095694821595, 1, 0.0005240091990152466],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241527885564045],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005241744550629877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005242657731207384],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241404474789127],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241312354055302],
[587.3537571635354, 1270.960888940871, 0, 1, 0.3160679804116099, 0, 0.0007868062728769958, 0.007810878647512112, 0.68393201958839, 1, 0.0005240327655622489],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005241752063591096],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005241310157556172],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157757946766889, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842242053233112, 1, 0.0005241596258660735],
[586.9472664605281, 1271.428811246, 0, 1, 0.315838797916994, 0, 0.0007865167055794497, 0.007808004019920303, 0.6841612020830059, 1, 0.0006074228903326382],
[586.9037112821281, 1271.410934822278, 0, 1, 0.31582580082036, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.68417419917964, 1, 0.0004840998615362108],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 0, 0.3157989194099932, 0, 0, 0, 1, 1, 3.978847614081553e-05],
[586.8537571635354, 1271.486610777009, 0, 1, 0.3157945483441768, 0, 0.0007864809519220164, 0.007807649081876412, 0.6842054516558231, 1, 0.0005239210704363576],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005237053940018165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.360980703686, 0, 1, 0.3158158985635325, 0, 0.0007865586683701038, 0.007808420598024481, 0.6841841014364675, 1, 0.0005242746633061043],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.000523976714430793],
[585.9564963978908, 1272.28800129075, 1, 0, 0.3153279867782345, 0.001706611337441261, 0, -0.01694207902852598, 1, 0.3153279867782345, 0.0005241292958461817],
[585.0752970526391, 1270.184828183227, 1, 0, 0.3153602500771995, 0.001709181715648525, 0, -0.01696759599877296, 1, 0.3153602500771995, 0.0005247319258702046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.0780988147602, 1272.25355231214, 0, 1, 0.3153786346260422, 0, 0.00078600684445537, 0.007802942464738862, 0.6846213653739579, 1, 0.0005242258642842941],
[585.9845895177675, 1272.259908170873, 1, 0, 0.3153431048748637, 0.001706529519527031, 0, -0.01694126679580583, 1, 0.3153431048748637, 0.0005241283110036283],
[585.9845895177675, 1272.259908170873, 1, 0, 0.3153431048748637, 0.001706529519527031, 0, -0.01694126679580583, 1, 0.3153431048748637, 0.0005241284764429384],
[586.341126102182, 1271.903371586459, 0, 1, 0.3155349722985843, 0, 0.0007862232480386378, 0.007805090772633779, 0.6844650277014157, 1, 0.0005241256896230962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005239404613310476],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005241164601022798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005238982384365814],
[586.0792523925847, 1272.261115547959, 0, 1, 0.3153777760540667, 0, 0.0007860021718649342, 0.007802896078432446, 0.6846222239459333, 1, 0.0005239876699643361],
[586.1406839947065, 1272.1739621097, 0, 1, 0.3154151990479308, 0, 0.0007860560188967062, 0.007803430635216243, 0.6845848009520692, 1, 0.0005240071444641716],
[586.1406839947065, 1272.124007991107, 0, 1, 0.3154236780812608, 0, 0.000786086885962607, 0.007803737062496078, 0.6845763219187393, 1, 0.0005240073094369702],
[586.4972205791209, 1271.817425525285, 0, 1, 0.315607059228962, 0, 0.0007862763789283516, 0.00780561822004529, 0.6843929407710381, 1, 0.0005235210278601389],
[586.4112745179477, 1271.903371586459, 0, 1, 0.3155608097623535, 0, 0.0007862232480386378, 0.007805090772633779, 0.6844391902376465, 1, 0.0005240812501792626],
[586.7769173021519, 1271.599160404376, 0, 1, 0.3157471323168931, 0, 0.0007864113402544195, 0.007806958024488089, 0.684252867683107, 1, 0.000523673530993973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8107841329488, 1271.503861971458, 1, 0, 0.3157757946766889, 0.001704126827658025, 0, -0.01691741450171119, 1, 0.3157757946766888, 0.0005238878645244062],
[586.9100671408617, 1271.404578963545, 1, 0, 0.315829221047794, 0.00170383855378646, 0, -0.01691455271437464, 1, 0.315829221047794, 0.0005235584741855739],
[586.8628633633251, 1271.53893617934, 0, 1, 0.3157890094099921, 0, 0.0007864485872565981, 0.007807327787445033, 0.6842109905900079, 1, 0.000523919703635543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.9318044020049, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158409183463052, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841590816536948, 1, 0.0005238668328015059],
[586.9037112821281, 1271.425814732988, 1, 1, 0.3158232719579326, 0.001703857005462509, 0.0007865185592523225, -0.009106713468164293, 0.9002556608897858, 0.531902204805651, 0.001048413045778271],
[586.9318044020049, 1271.382841702401, 0, 1, 0.3158409183463052, 0, 0.0007865451437593608, 0.007808286334868593, 0.6841590816536948, 1, 0.0005240189188934773],
[586.8616559862392, 1271.318007673099, 0, 1, 0.3158261106089842, 0, 0.0007865852555886517, 0.007808684537884662, 0.6841738893910159, 1, 0.0005241589718796915],
[586.8616559862392, 1271.353081880982, 0, 1, 0.3158201493223618, 0, 0.0007865635552009582, 0.007808469111164361, 0.6841798506776382, 1, 0.0005241899982938974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[587.5332125217013, 1271.131571226927, 0, 1, 0.3161049898071138, 0, 0.0007867006237873361, 0.007809829835057257, 0.6838950101928862, 1, 0.0005240188059860251],
[586.6261396708808, 1271.58859819634, 1, 0, 0.3156934059968683, 0.001704663212861666, 0, -0.01692273936995181, 1, 0.3156934059968683, 0.0005246707003553779],
[586.9397032247086, 1271.362188080772, 1, 0, 0.3158473367383683, 0.001703752522628635, 0, -0.01691369865543174, 1, 0.3158473367383683, 0.000524005275656172],
[586.896730194122, 1271.318007673099, 1, 0, 0.3158390245401546, 0.001703877272700497, 0, -0.01691493708947348, 1, 0.3158390245401546, 0.0005240378097191685],
[586.1001890066752, 1269.104437675983, 0, 1, 0.3159221255580291, 0, 0.000787957216374742, 0.007822304433376994, 0.6840778744419709, 1, 0.0005241646143896614],
[586.896730194122, 1271.318007673099, 0, 1, 0.3158390245401546, 0, 0.0007865852555886517, 0.007808684537884662, 0.6841609754598454, 1, 0.0005241757871989212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.410934822278, 0, 1, 0.3158074087585449, 0, 0.0007865277642431029, 0.007808113802827197, 0.684192591241455, 1, 0.0005240764590147409],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005241600894678584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 1, 0, 0.3157989194099932, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3157989194099932, 0.0005236274835562581],
[586.7757099250659, 1271.503861971458, 0, 1, 0.3157628802463852, 0, 0.0007864702813009999, 0.007807543151193439, 0.6842371197536148, 1, 0.0005239054243196032],
[586.8537571635354, 1271.460888940871, 0, 1, 0.3157989194099932, 0, 0.0007864968625444717, 0.00780780703173712, 0.6842010805900068, 1, 0.0005240099279720744],
[586.8537571635354, 1271.373735502612, 1, 0, 0.3158137308158806, 0.001704002041042289, 0, -0.01691617570488667, 1, 0.3158137308158806, 0.000524176558916512],
[586.896730194122, 1271.417915910284, 0, 1, 0.3158220441432975, 0, 0.0007865234455847981, 0.007808070930118753, 0.6841779558567025, 1, 0.0005236013481185212]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[0.9251218159096414, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[0.8673731303896688, 2.055616669609093, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9053538941470822, 2.11284609984825, 1, 0, 0.2999648452548775, 1.10454045259515, 0, -11.03164968194422, 1, 0.2999648452548775, 0.1001246852864608],
[0.9051111738132915, 2.113088820182041, 1, 0, 0.2998844263514671, 1.104836653144978, 0, -11.03460799885659, 1, 0.2998844263514671, 0.1001246852864608],
[0.9056467834699465, 2.112553210525386, 1, 1, 0.3000618863136036, 1.104183240367225, 0.473360857855648, -6.300368192986262, 0.9099628643819221, 0.5100866370091292, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.098600796435877, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005805105809731, 2.0123948881856, 0, 1, 0.3332466727886711, 0, 0.4969203638266107, 4.963015488187568, 0.6667533272113289, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005805211702617, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3332755780236655, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6667244219763344, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9054053419510231, 2.012358152834976, 1, 0, 0.3103079956853834, 1.104477689346452, 0, -11.03102283104807, 1, 0.3103079956853834, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7176935931500726, 2.176897826742065, 1, 0, 0.2479429698498921, 1.3933522739291, 0, -13.91617132121477, 1, 0.2479429698498921, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.911618982372416, 1.106581011622916, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.000754462876084, 2.015058242683193, 0, 1, 0.3318357473033114, 0, 0.4962635713538627, 4.956455742497792, 0.6681642526966887, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 1.911618982372416, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.679727541656411, 1.267898469657894, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7181493238994048, 2.124820926508738, 0, 2, 0.2526052897656266, 0, 0.9412557900990606, 9.400836441144257, 0.558598852886323, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 1.395248531662073, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.911618982372416, 1.106581011622916, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.919824359634386, 2.098375634360946, 1, 0, 0.3047592477186283, 1.087164075973681, 0, -10.85810230377514, 1, 0.3047592477186283, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005841697889233, 2.012358296106098, 0, 1, 0.333258796597423, 0, 0.4969293996675416, 4.963105734073536, 0.666741203402577, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9957612727139447, 2.022438721281386, 0, 0, 0.329918916803061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9939699178213703, 0, -9.927321269251257, 1, 0.3333333333333333, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3103666492059411, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6896333507940589, 1, 0.1001246852864608],
[1.005658194375945, 2.012358234228513, 0, 1, 0.3332182637723297, 0, 0.4969294149475202, 4.96310588668304, 0.6667817362276702, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8491722421756873, 2.169027751819645, 1, 0, 0.2813505545905188, 1.177617390598959, 0, -11.76150903475749, 1, 0.2813505545905188, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0, 1.356795340439366, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7176936294719083, 2.125142026636295, 1, 0, 0.252456953651137, 1.393352203412782, 0, -13.91617061692973, 1, 0.252456953651137, 0.1001246852864608],
[1.679432503338915, 1.267968349109342, 1, 0, 0.5698011866773721, 0.5954392320095503, 0, -5.946977314395292, 1, 0.5698011866773721, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 1.281945349510045, 0, 0, 0.3932043833440066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.004200706738881, 2.01399928725645, 0, 1, 0.3327150979844693, 0, 0.4965245054094532, 4.959061833641489, 0.6672849020155307, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.679727541656411, 1.267898469657894, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 1.987939835642741, 19.85464253850251, 0.1975308641975309, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.999740139229161, 0, 1, 0.3333622092535551, 0, 0.5000649736347591, 4.964305648771915, 0.6666377907464449, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142773108692613, 2.085722689130741, 0, 1, 0.3047591036230869, 0, 0.4794501230730566, 4.759655404328289, 0.695240896376913, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9893293686346745, 2.010350575694031, 0, 1, 0.3298116422404108, 0, 0.497425678929045, 4.938104522304057, 0.6701883577595893, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8261460726854689, 2.051309992119331, 0, 1, 0.2871098825071071, 0, 0.4874933597758378, 4.839503199121432, 0.7128901174928929, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.099908237185519, 1, 0, 0, 0.5237887150058103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.00144815948895, 1.898497517600113, 0, 1, 0.3453334203467542, 0, 0.5267323189677371, 5.229040953290456, 0.6546665796532458, 1, 0.1007321081767934],
[1.002341920540172, 1.997398169908929, 0, 2, 0.3341429224923644, 0, 1.001302609630002, 9.940252693536708, 0.4433656476670094, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8997993715014391, 2.000447260428667, 1, 0, 0.310249260044007, 1.1113588558429, 0, -11.03281640737997, 1, 0.310249260044007, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1.001448703712691, 1.898496918476812, 0, 1, 0.3453336145512211, 0, 0.5267324851927137, 5.229042603459201, 0.6546663854487789, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.844051663771557, 2.155948336228445, 1, 0, 0.2813505545905188, 1.184761600411525, 0, -11.76150903475749, 1, 0.2813505545905188, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.155688519844165, 0, 1, 0.2813399116647295, 0, 0.4638889110344616, 4.605174253082216, 0.7186600883352705, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.999546482346183, 1, 0, 0.3333837318026227, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333837318026227, 0.1007321081767934],
[0.8440516637872334, 2.155948336212769, 1, 0, 0.2813505545957443, 1.18476160038952, 0, -11.76150903453905, 1, 0.2813505545957442, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764019038407, 2.00022359809616, 0, 1, 0.3332588006346134, 0, 0.4999441067247749, 4.963105764125681, 0.6667411993653866, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7135594894370477, 2.112586899275349, 0, 1, 0.2524849711561291, 0, 0.4733533093209165, 4.699130375492006, 0.747515028843871, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8999456221895026, 2, 1, 0, 0.3103318956408672, 1.111178248266903, 0, -11.03102345794939, 1, 0.3103318956408672, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.7161606653460397, 1.386088756886457, 0, 1, 0.3406639848593743, 0, 0.7214545208823997, 7.162110809953325, 0.6593360151406257, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.91427728639868, 2.085722713601322, 0, 1, 0.3047590954662265, 0, 0.4794501174479449, 4.759655348485999, 0.6952409045337735, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.099128404878163, 0, 1, 0.3001085990652494, 0, 0.4763881988715415, 4.729258699077754, 0.6998914009347506, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9573338404271003, 2.0426661595729, 0, 3, 0.3191112801423668, 0, 1.468668771908998, 14.57994673685733, 0.3156664441273302, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -4.963660634625629, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.155688383144679, 0, 1, 0.2813399244861389, 0, 0.4638889404512253, 4.605174545111881, 0.7186600755138611, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939974987007, 2.0004060025013, 0, 1, 0.3331979991662335, 0, 0.4998985199752469, 4.962653209817495, 0.6668020008337665, 1, 0.1007321081767934],
[0.9984405064397698, 2.001559493560231, 0, 2, 0.3328135021465898, 0, 0.9992208607512049, 9.919586503614989, 0.4451378229178984, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987818404520526, 2.000670722097795, 0, 3, 0.3329880435258439, 0, 1.499497127070647, 14.88598972274959, 0.2967569211975518, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997401382664999, 2, 1, 1, 0.333275581278928, 1.000259929279173, 0.4999999999999999, -4.966241036087268, 0.8889273869231926, 0.5554785494810488, 0.1007321081767934],
[0.999776453943407, 2.000223546056594, 0, 1, 0.3332588179811355, 0, 0.4999441197317583, 4.963105893250184, 0.6667411820188645, 1, 0.1007321081767934],
[0.9124207196638788, 2.087579280336123, 1, 0, 0.3041402398879594, 1.095985632996568, 0, -10.88020148524063, 1, 0.3041402398879594, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9994801789589297, 2.000519821041071, 0, 2, 0.3331600596529765, 0, 0.99974015701539, 9.924741724463477, 0.4446755060420219, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8467479378575794, 2.15284638373591, 0, 2, 0.2822874852649265, 0, 0.929002652074659, 9.222507787131592, 0.5151112538073432, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.9006115573271719, 2.09938844267283, 0, 3, 0.3002038524423904, 0, 1.428987575153343, 14.18601874831556, 0.3427004241684332, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8996051713749548, 2.10007515889519, 0, 1, 0.2999003468126013, 0, 0.4761734339670401, 4.727126658873408, 0.7000996531873986, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900351562727405, 2.099648437272597, 0, 1, 0.3001171875758015, 0, 0.4762702089779282, 4.728087375497329, 0.6998828124241985, 1, 0.1007321081767934],
[0.8443437953856098, 2.155656204614392, 1, 0, 0.2814479317952031, 1.184351688808588, 0, -11.75743971058315, 1, 0.2814479317952031, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.005243886510038, 2.010487773020077, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1002066359503172],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112753769008344, 0, 1, 0.2523414152795621, 0, 0.4733159228817121, 4.69875922829891, 0.747658584720438, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8465399442025624, 2.15346005579744, 2, 1, 0.2821799814008539, 2.362558333716896, 0.4643689569759369, -18.84393577278732, 0.9775312660666697, 0.1939391578434977, 0.1007321081767934],
[0.8716606062871567, 2.033578533647563, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09968251501991982],
[0.8999455892821974, 2.100054410717805, 1, 0, 0.2999818630940655, 1.111178288898117, 0, -11.0310238613085, 1, 0.2999818630940656, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939975410287, 2.000406002458972, 0, 1, 0.3331979991803428, 0, 0.4998985199858246, 4.962653209922504, 0.6668020008196571, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995526858052034, 2.000447314194797, 1, 1, 0.3331842286017344, 1.000447514374329, 0.4998881964569566, -4.969213163283031, 0.8889882698110674, 0.5553567270145359, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8999456221280575, 2.100054377871944, 1, 0, 0.2999818740426857, 1.111178248342771, 0, -11.03102345870255, 1, 0.2999818740426856, 0.1007321081767934],
[0.8440516636859597, 2.155948336314042, 1, 0, 0.2813505545619864, 1.184761600531674, 0, -11.76150903595025, 1, 0.2813505545619863, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9993292455895294, 2.000670754410471, 1, 0, 0.3331097485298431, 1.000671204623932, 0, -9.933984533190443, 1, 0.3331097485298431, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142772925096442, 2.085722707490357, 0, 1, 0.3047590975032146, 0, 0.479450118852687, 4.759655362431324, 0.6952409024967854, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939976668963, 2.000406002333104, 0, 1, 0.3331979992222987, 0, 0.4998985200172788, 4.962653210234759, 0.6668020007777014, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7138193199525025, 2.163636980667135, 0, 1, 0.2480730358263954, 0, 0.4621847421426771, 4.588256420996408, 0.7519269641736046, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997401382920992, 2.000259861707901, 0, 1, 0.333246712764033, 0, 0.4999350430129415, 4.963015785746419, 0.6667532872359669, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9996804454643062, 1.826146477708594, 0, 1, 0.3537656313153968, 0, 0.547601198593213, 5.436213025861887, 0.6462343686846033, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987815471449963, 2.001218452855004, 0, 2, 0.3329271823816654, 0, 0.999391144503357, 9.921276965129536, 0.444986144005264, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900351624522384, 0, 1, 0.3447857809877364, 0, 0.5262184045814839, 5.223939160073231, 0.6552142190122636, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.099908237185519, 1, 0, 0, 0.5237887150058103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142777727017505, 2.085722227298251, 0, 1, 0.30475925756725, 0, 0.4794502292356322, 4.759656458238284, 0.69524074243275, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997400996416436, 2.000259900358357, 1, 1, 0.3332466998805478, 1.000259967924113, 0.4999350333528382, -4.966886364506163, 0.8889466370187241, 0.5554400367798197, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997763927091139, 2.000223607290887, 0, 1, 0.3332587975697046, 0, 0.4999441044266071, 4.963105741311031, 0.6667412024302954, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995941079724636, 2.000405892027537, 0, 1, 0.3331980359908212, 0, 0.4998985475824795, 4.962653483883362, 0.6668019640091789, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257404636582067, 2.051715695056076, 0, 1, 0.2869689121613473, 0, 0.4873969636288564, 4.838546243601229, 0.7130310878386528, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544287, 2.001854706045572, 0, 1, 0.3327150979848095, 0, 0.4995367530820367, 4.959061833644018, 0.6672849020151905, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.826146492941041, 1, 0, 0.3538386996207497, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3538386996207497, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8767100363990097, 2.000426759357623, 0, 1, 0.3047161461672703, 0, 0.4998933329211813, 4.962601716265344, 0.6952838538327297, 1, 0.1007321081767934],
[0.9992200822493887, 2.000779917750612, 0, 1, 0.3330733607497962, 0, 0.4998050965666707, 4.96172576562649, 0.6669266392502038, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.002601120809675336, 2.997398879190325, 0, 1, 0.0008670402698917785, 0, 0.333622597560364, 3.311978708663855, 0.9991329597301082, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.667452602334925, 1.262581303390221, 0, 1, 0.569089865846536, 0, 0.7920282023144564, 7.862718418683143, 0.430910134153464, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9994798949368309, 2.00052010506317, 0, 2, 0.3331599649789436, 0, 0.9997400150781524, 9.924740315406918, 0.4446756323068837, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544654, 2.001854706045535, 0, 1, 0.3327150979848217, 0, 0.4995367530820459, 4.959061833644109, 0.6672849020151783, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.999552796406541, 2.00044720359346, 0, 2, 0.3331842654688469, 0, 0.9997764481898566, 9.925101998611645, 0.4446432238183212, 1, 0.1007321081767934],
[1.0052257578631, 1.895098259932171, 0, 1, 0.3465908469865512, 0, 0.5276771242646763, 5.238420339010061, 0.6534091530134488, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764539667052, 2.000223546033295, 0, 1, 0.3332588179889017, 0, 0.4999441197375817, 4.963105893307994, 0.6667411820110983, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9988825465109313, 2.001117453489069, 1, 0, 0.3329608488369771, 1.001118703588297, 0, -9.938426999177347, 1, 0.3329608488369771, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -19.85464253850252, 1, 0.1111111111111109, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.002576645237652475, 1.350336180785654, 0, 1, 0.001904516823324201, 0, 0.7405563253279485, 7.351740559506699, 0.9980954831766758, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8254002663100236, 2.00029285717151, 1, 0, 0.2921054163493341, 1.211533410899574, 0, -12.02728139843187, 1, 0.2921054163493342, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8447179311493945, 2.155282068850607, 0, 1, 0.2815726437164647, 0, 0.4639763929058674, 4.606042713724897, 0.7184273562835353, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939976671278, 2.000406002332873, 0, 1, 0.3331979992223758, 0, 0.4998985200173366, 4.962653210235334, 0.6668020007776242, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995933777947791, 2.000406622205221, 0, 1, 0.3331977925982597, 0, 0.4998983651121957, 4.962651672442233, 0.6668022074017403, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7139297104280234, 2.163577522937768, 1, 1, 0.2481070080901055, 1.400698115505612, 0.4621974435388713, -9.316797682022029, 0.9384429125365762, 0.4346569287167874, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7135598060385259, 2.112586877755839, 0, 1, 0.2524850568196643, 0, 0.4733533141426502, 4.699130423358906, 0.7475149431803357, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140185484421665, 2.085981451557835, 0, 0.75, 0.304672849480722, 0, 0.3595429860797138, 3.569298732919253, 0.7614508761893359, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9133164730351896, 2.086683526964812, 0, 1, 0.304438824345063, 0, 0.4792293546566456, 4.757463765332473, 0.6955611756549369, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8440516638333978, 2.085722514913134, 1, 0, 0.2880944442600403, 1.184761600324721, 0, -11.76150903389577, 1, 0.2880944442600403, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7160896121850481, 2.109603511296485, 0, 1, 0.2534208708774273, 0, 0.4740227225851726, 4.705775856028175, 0.7465791291225727, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142774850162562, 2.085722514983746, 0, 1, 0.3047591616720852, 0, 0.4794501631046512, 4.75965580173479, 0.6952408383279147, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257405016080487, 2.051715913120779, 0, 1, 0.2869688998176769, 0, 0.4873969118263269, 4.838545729340877, 0.7130311001823231, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8441085844353403, 2.155845787961451, 0, 0.75, 0.2813738076159292, 0, 0.3478913028882245, 3.453628730549804, 0.780507861383798, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.825740480432774, 1.276508228228688, 0, 1, 0.392789148605798, 0, 0.7833870380824905, 7.776934805212056, 0.6072108513942021, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.051309827401162, 0, 1, 0.2869976630466096, 0, 0.487493398921077, 4.839503587728797, 0.7130023369533904, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939031133233, 2.000406096886678, 0, 1, 0.333197967704441, 0, 0.4998984963884809, 4.962652975664091, 0.666802032295559, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.667448677957625, 1.262585561170869, 0, 1, 0.5690884617285528, 0, 0.7920255313807345, 7.862691903465998, 0.4309115382714472, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -4.963660634625629, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544287, 2.001854706045572, 0, 1, 0.3327150979848095, 0, 0.4995367530820367, 4.959061833644018, 0.6672849020151905, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8996531827335574, 2, 1, 0, 0.3102623403690773, 1.111539445635643, 0, -11.03460918027047, 1, 0.3102623403690773, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8254001784488253, 2.051736617307808, 1, 0, 0.286882493618716, 1.211533539863415, 0, -12.02728267869735, 1, 0.286882493618716, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764539654288, 2.000223546034572, 1, 1, 0.3332588179884762, 1.000223596018575, 0.4999441197372626, -4.96643508545735, 0.8889385602329237, 0.5554561962098761, 0.1007321081767934],
[0.9997401204889527, 2.000259879511048, 0, 1, 0.3332467068296509, 0, 0.4999350385633113, 4.96301574157351, 0.6667532931703491, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1007321081767934],
[1, 1.999740138293583, 0, 1, 0.3333622093575263, 0, 0.5000649738687144, 4.964305651094465, 0.6666377906424737, 1, 0.1007321081767934],
[0.7133658416826955, 2.163770954073938, 1, 0, 0.2479429698076256, 1.40180527517436, 0, -13.91617132358704, 1, 0.2479429698076255, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9174082087271803, 2.082591791272821, 0, 1, 0.3058027362423932, 0, 0.4801709121252361, 4.766810908816635, 0.6941972637576068, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.099648188985628, 0, 1, 0.3000565973308277, 0, 0.4762702652976903, 4.728087934601702, 0.6999434026691723, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987083470213215, 1.827525600484274, 0, 1, 0.3533707278205935, 0, 0.5471879571673365, 5.432110645465447, 0.6466292721794065, 1, 0.1007321081767934],
[0.713365842093575, 2.112327281387958, 1, 0, 0.2524569409768878, 1.401805274366958, 0, -13.9161713155717, 1, 0.2524569409768878, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981443858223855, 2.001855614177615, 0, 1, 0.3327147952741284, 0, 0.4995365264696231, 4.959059583989785, 0.6672852047258716, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257404859122556, 2.00040593299186, 0, 1, 0.2921789474136481, 0, 0.4998985373455545, 4.962653382258119, 0.7078210525863519, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112753728916506, 0, 1, 0.2523414188596932, 0, 0.473315931863405, 4.698759317463062, 0.7476585811403067, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.995580980267481, 0, 1, 0.3338250598422174, 0, 0.5011072013053378, 4.974652177693454, 0.6661749401577826, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.011750452504607, 1.988249547495394, 1, 0, 0.3372501508348688, 0.9883860170504316, 0, -9.812025529295289, 1, 0.3372501508348688, 0.1007321081767934],
[0.0253266799530769, 2.974673320046923, 0, 2, 0.008442226651025635, 0, 0.6723427364348201, 6.674562347635985, 0.9831868178887759, 1, 0.1007321081767934],
[1.647802491518712, 1.282964861153547, 0, 1, 0.5622426802373972, 0, 0.7794445742659502, 7.737796700312861, 0.4377573197626028, 1, 0.1007321081767934],
[0.9986957252089539, 2.001304274791047, 0, 1, 0.3328985750696513, 0, 0.4996741438052485, 4.960425755492757, 0.6671014249303487, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764417599, 2.000223558240101, 1, 0, 0.3332588139199666, 1.000223608229562, 0, -9.929541099984576, 1, 0.3332588139199666, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.899945622190337, 2, 1, 0, 0.3103318956410657, 1.111178248265873, 0, -11.03102345793916, 1, 0.3103318956410657, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8459432938897796, 2.154056706110222, 0, 1, 0.2819810979632597, 0, 0.4642403318182797, 4.608662920103871, 0.7180189020367402, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981447090383788, 2.001855290961622, 1, 1, 0.3327149030127928, 1.001858739464149, 0.4995366071239019, -4.986713188396982, 0.8893007933131878, 0.5547305993387736, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939693094938, 2.000406030690507, 0, 1, 0.3331979897698312, 0, 0.4998985129308057, 4.962653139885064, 0.6668020102301688, 1, 0.1007321081767934]
],
"RESOLVED": [
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[0.9251218159096414, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.027808334804547, 2.055616669609093, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[0.8673731303896688, 2.055616669609093, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09800670491346927],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9053538941470822, 2.11284609984825, 1, 0, 0.2999648452548775, 1.10454045259515, 0, -11.03164968194422, 1, 0.2999648452548775, 0.1001246852864608],
[0.9051111738132915, 2.113088820182041, 1, 0, 0.2998844263514671, 1.104836653144978, 0, -11.03460799885659, 1, 0.2998844263514671, 0.1001246852864608],
[0.9056467834699465, 2.112553210525386, 1, 1, 0.3000618863136036, 1.104183240367225, 0.473360857855648, -6.300368192986262, 0.9099628643819221, 0.5100866370091292, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.098600796435877, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005805105809731, 2.0123948881856, 0, 1, 0.3332466727886711, 0, 0.4969203638266107, 4.963015488187568, 0.6667533272113289, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005805211702617, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3332755780236655, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6667244219763344, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9054053419510231, 2.012358152834976, 1, 0, 0.3103079956853834, 1.104477689346452, 0, -11.03102283104807, 1, 0.3103079956853834, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7176935931500726, 2.176897826742065, 1, 0, 0.2479429698498921, 1.3933522739291, 0, -13.91617132121477, 1, 0.2479429698498921, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.911618982372416, 1.106581011622916, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.000754462876084, 2.015058242683193, 0, 1, 0.3318357473033114, 0, 0.4962635713538627, 4.956455742497792, 0.6681642526966887, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 1.911618982372416, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.679727541656411, 1.267898469657894, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7181493238994048, 2.124820926508738, 0, 2, 0.2526052897656266, 0, 0.9412557900990606, 9.400836441144257, 0.558598852886323, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 1.395248531662073, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.911618982372416, 1.106581011622916, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.919824359634386, 2.098375634360946, 1, 0, 0.3047592477186283, 1.087164075973681, 0, -10.85810230377514, 1, 0.3047592477186283, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.005841697889233, 2.012358296106098, 0, 1, 0.333258796597423, 0, 0.4969293996675416, 4.963105734073536, 0.666741203402577, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9957612727139447, 2.022438721281386, 0, 0, 0.329918916803061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9939699178213703, 0, -9.927321269251257, 1, 0.3333333333333333, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3103666492059411, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6896333507940589, 1, 0.1001246852864608],
[1.005658194375945, 2.012358234228513, 0, 1, 0.3332182637723297, 0, 0.4969294149475202, 4.96310588668304, 0.6667817362276702, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8491722421756873, 2.169027751819645, 1, 0, 0.2813505545905188, 1.177617390598959, 0, -11.76150903475749, 1, 0.2813505545905188, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0, 1.356795340439366, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4969849589106852, 4.963660634625628, 0.6666666666666667, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.012133329330221, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7176936294719083, 2.125142026636295, 1, 0, 0.252456953651137, 1.393352203412782, 0, -13.91617061692973, 1, 0.252456953651137, 0.1001246852864608],
[1.679432503338915, 1.267968349109342, 1, 0, 0.5698011866773721, 0.5954392320095503, 0, -5.946977314395292, 1, 0.5698011866773721, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 1.281945349510045, 0, 0, 0.3932043833440066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.004200706738881, 2.01399928725645, 0, 1, 0.3327150979844693, 0, 0.4965245054094532, 4.959061833641489, 0.6672849020155307, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.125436511482249, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9195991975594553, 2.098600796435877, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.679727541656411, 1.267898469657894, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8307023267779827, 2.063889093114155, 0, 0, 0.2869843118684216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.7173991446259548, 2.177192275266183, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8490252148784285, 2.169174779116904, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[1.00606666466511, 2.012133329330221, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 1.987939835642741, 19.85464253850251, 0.1975308641975309, 1, 0.1001246852864608],
[0.9055523177073053, 2.112647676288027, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1001246852864608],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.999740139229161, 0, 1, 0.3333622092535551, 0, 0.5000649736347591, 4.964305648771915, 0.6666377907464449, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142773108692613, 2.085722689130741, 0, 1, 0.3047591036230869, 0, 0.4794501230730566, 4.759655404328289, 0.695240896376913, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9893293686346745, 2.010350575694031, 0, 1, 0.3298116422404108, 0, 0.497425678929045, 4.938104522304057, 0.6701883577595893, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8261460726854689, 2.051309992119331, 0, 1, 0.2871098825071071, 0, 0.4874933597758378, 4.839503199121432, 0.7128901174928929, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.099908237185519, 1, 0, 0, 0.5237887150058103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.00144815948895, 1.898497517600113, 0, 1, 0.3453334203467542, 0, 0.5267323189677371, 5.229040953290456, 0.6546665796532458, 1, 0.1007321081767934],
[1.002341920540172, 1.997398169908929, 0, 2, 0.3341429224923644, 0, 1.001302609630002, 9.940252693536708, 0.4433656476670094, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8997993715014391, 2.000447260428667, 1, 0, 0.310249260044007, 1.1113588558429, 0, -11.03281640737997, 1, 0.310249260044007, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1.001448703712691, 1.898496918476812, 0, 1, 0.3453336145512211, 0, 0.5267324851927137, 5.229042603459201, 0.6546663854487789, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.844051663771557, 2.155948336228445, 1, 0, 0.2813505545905188, 1.184761600411525, 0, -11.76150903475749, 1, 0.2813505545905188, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.155688519844165, 0, 1, 0.2813399116647295, 0, 0.4638889110344616, 4.605174253082216, 0.7186600883352705, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.999546482346183, 1, 0, 0.3333837318026227, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333837318026227, 0.1007321081767934],
[0.8440516637872334, 2.155948336212769, 1, 0, 0.2813505545957443, 1.18476160038952, 0, -11.76150903453905, 1, 0.2813505545957442, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764019038407, 2.00022359809616, 0, 1, 0.3332588006346134, 0, 0.4999441067247749, 4.963105764125681, 0.6667411993653866, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7135594894370477, 2.112586899275349, 0, 1, 0.2524849711561291, 0, 0.4733533093209165, 4.699130375492006, 0.747515028843871, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8999456221895026, 2, 1, 0, 0.3103318956408672, 1.111178248266903, 0, -11.03102345794939, 1, 0.3103318956408672, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.7161606653460397, 1.386088756886457, 0, 1, 0.3406639848593743, 0, 0.7214545208823997, 7.162110809953325, 0.6593360151406257, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.91427728639868, 2.085722713601322, 0, 1, 0.3047590954662265, 0, 0.4794501174479449, 4.759655348485999, 0.6952409045337735, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.099128404878163, 0, 1, 0.3001085990652494, 0, 0.4763881988715415, 4.729258699077754, 0.6998914009347506, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9573338404271003, 2.0426661595729, 0, 3, 0.3191112801423668, 0, 1.468668771908998, 14.57994673685733, 0.3156664441273302, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -4.963660634625629, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.155688383144679, 0, 1, 0.2813399244861389, 0, 0.4638889404512253, 4.605174545111881, 0.7186600755138611, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 1, 0.2813018410203275, 0, 0.4638015683893815, 4.604307174584, 0.7186981589796725, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939974987007, 2.0004060025013, 0, 1, 0.3331979991662335, 0, 0.4998985199752469, 4.962653209817495, 0.6668020008337665, 1, 0.1007321081767934],
[0.9984405064397698, 2.001559493560231, 0, 2, 0.3328135021465898, 0, 0.9992208607512049, 9.919586503614989, 0.4451378229178984, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987818404520526, 2.000670722097795, 0, 3, 0.3329880435258439, 0, 1.499497127070647, 14.88598972274959, 0.2967569211975518, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997401382664999, 2, 1, 1, 0.333275581278928, 1.000259929279173, 0.4999999999999999, -4.966241036087268, 0.8889273869231926, 0.5554785494810488, 0.1007321081767934],
[0.999776453943407, 2.000223546056594, 0, 1, 0.3332588179811355, 0, 0.4999441197317583, 4.963105893250184, 0.6667411820188645, 1, 0.1007321081767934],
[0.9124207196638788, 2.087579280336123, 1, 0, 0.3041402398879594, 1.095985632996568, 0, -10.88020148524063, 1, 0.3041402398879594, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9994801789589297, 2.000519821041071, 0, 2, 0.3331600596529765, 0, 0.99974015701539, 9.924741724463477, 0.4446755060420219, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8467479378575794, 2.15284638373591, 0, 2, 0.2822874852649265, 0, 0.929002652074659, 9.222507787131592, 0.5151112538073432, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.9006115573271719, 2.09938844267283, 0, 3, 0.3002038524423904, 0, 1.428987575153343, 14.18601874831556, 0.3427004241684332, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8996051713749548, 2.10007515889519, 0, 1, 0.2999003468126013, 0, 0.4761734339670401, 4.727126658873408, 0.7000996531873986, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900351562727405, 2.099648437272597, 0, 1, 0.3001171875758015, 0, 0.4762702089779282, 4.728087375497329, 0.6998828124241985, 1, 0.1007321081767934],
[0.8443437953856098, 2.155656204614392, 1, 0, 0.2814479317952031, 1.184351688808588, 0, -11.75743971058315, 1, 0.2814479317952031, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.005243886510038, 2.010487773020077, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1002066359503172],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112753769008344, 0, 1, 0.2523414152795621, 0, 0.4733159228817121, 4.69875922829891, 0.747658584720438, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8465399442025624, 2.15346005579744, 2, 1, 0.2821799814008539, 2.362558333716896, 0.4643689569759369, -18.84393577278732, 0.9775312660666697, 0.1939391578434977, 0.1007321081767934],
[0.8716606062871567, 2.033578533647563, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09968251501991982],
[0.8999455892821974, 2.100054410717805, 1, 0, 0.2999818630940655, 1.111178288898117, 0, -11.0310238613085, 1, 0.2999818630940656, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939975410287, 2.000406002458972, 0, 1, 0.3331979991803428, 0, 0.4998985199858246, 4.962653209922504, 0.6668020008196571, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995526858052034, 2.000447314194797, 1, 1, 0.3331842286017344, 1.000447514374329, 0.4998881964569566, -4.969213163283031, 0.8889882698110674, 0.5553567270145359, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8999456221280575, 2.100054377871944, 1, 0, 0.2999818740426857, 1.111178248342771, 0, -11.03102345870255, 1, 0.2999818740426856, 0.1007321081767934],
[0.8440516636859597, 2.155948336314042, 1, 0, 0.2813505545619864, 1.184761600531674, 0, -11.76150903595025, 1, 0.2813505545619863, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9993292455895294, 2.000670754410471, 1, 0, 0.3331097485298431, 1.000671204623932, 0, -9.933984533190443, 1, 0.3331097485298431, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142772925096442, 2.085722707490357, 0, 1, 0.3047590975032146, 0, 0.479450118852687, 4.759655362431324, 0.6952409024967854, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939976668963, 2.000406002333104, 0, 1, 0.3331979992222987, 0, 0.4998985200172788, 4.962653210234759, 0.6668020007777014, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7138193199525025, 2.163636980667135, 0, 1, 0.2480730358263954, 0, 0.4621847421426771, 4.588256420996408, 0.7519269641736046, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997401382920992, 2.000259861707901, 0, 1, 0.333246712764033, 0, 0.4999350430129415, 4.963015785746419, 0.6667532872359669, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9996804454643062, 1.826146477708594, 0, 1, 0.3537656313153968, 0, 0.547601198593213, 5.436213025861887, 0.6462343686846033, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987815471449963, 2.001218452855004, 0, 2, 0.3329271823816654, 0, 0.999391144503357, 9.921276965129536, 0.444986144005264, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900351624522384, 0, 1, 0.3447857809877364, 0, 0.5262184045814839, 5.223939160073231, 0.6552142190122636, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.099908237185519, 1, 0, 0, 0.5237887150058103, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142777727017505, 2.085722227298251, 0, 1, 0.30475925756725, 0, 0.4794502292356322, 4.759656458238284, 0.69524074243275, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997400996416436, 2.000259900358357, 1, 1, 0.3332466998805478, 1.000259967924113, 0.4999350333528382, -4.966886364506163, 0.8889466370187241, 0.5554400367798197, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997763927091139, 2.000223607290887, 0, 1, 0.3332587975697046, 0, 0.4999441044266071, 4.963105741311031, 0.6667412024302954, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995941079724636, 2.000405892027537, 0, 1, 0.3331980359908212, 0, 0.4998985475824795, 4.962653483883362, 0.6668019640091789, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257404636582067, 2.051715695056076, 0, 1, 0.2869689121613473, 0, 0.4873969636288564, 4.838546243601229, 0.7130310878386528, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544287, 2.001854706045572, 0, 1, 0.3327150979848095, 0, 0.4995367530820367, 4.959061833644018, 0.6672849020151905, 1, 0.1007321081767934],
[0.2869268311710185, 2.713073168828983, 0, 0, 0.09564227705700612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.826146492941041, 1, 0, 0.3538386996207497, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3538386996207497, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8767100363990097, 2.000426759357623, 0, 1, 0.3047161461672703, 0, 0.4998933329211813, 4.962601716265344, 0.6952838538327297, 1, 0.1007321081767934],
[0.9992200822493887, 2.000779917750612, 0, 1, 0.3330733607497962, 0, 0.4998050965666707, 4.96172576562649, 0.6669266392502038, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.002601120809675336, 2.997398879190325, 0, 1, 0.0008670402698917785, 0, 0.333622597560364, 3.311978708663855, 0.9991329597301082, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.667452602334925, 1.262581303390221, 0, 1, 0.569089865846536, 0, 0.7920282023144564, 7.862718418683143, 0.430910134153464, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9994798949368309, 2.00052010506317, 0, 2, 0.3331599649789436, 0, 0.9997400150781524, 9.924740315406918, 0.4446756323068837, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2, 0, 0, 0.3103666492059411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544654, 2.001854706045535, 0, 1, 0.3327150979848217, 0, 0.4995367530820459, 4.959061833644109, 0.6672849020151783, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.999552796406541, 2.00044720359346, 0, 2, 0.3331842654688469, 0, 0.9997764481898566, 9.925101998611645, 0.4446432238183212, 1, 0.1007321081767934],
[1.0052257578631, 1.895098259932171, 0, 1, 0.3465908469865512, 0, 0.5276771242646763, 5.238420339010061, 0.6534091530134488, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 1.274215113703988, 0, 0, 0.3932043833440068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764539667052, 2.000223546033295, 0, 1, 0.3332588179889017, 0, 0.4999441197375817, 4.963105893307994, 0.6667411820110983, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9988825465109313, 2.001117453489069, 1, 0, 0.3329608488369771, 1.001118703588297, 0, -9.938426999177347, 1, 0.3329608488369771, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2, 0, 0, 0.2967417574943423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -19.85464253850252, 1, 0.1111111111111109, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.002576645237652475, 1.350336180785654, 0, 1, 0.001904516823324201, 0, 0.7405563253279485, 7.351740559506699, 0.9980954831766758, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8254002663100236, 2.00029285717151, 1, 0, 0.2921054163493341, 1.211533410899574, 0, -12.02728139843187, 1, 0.2921054163493342, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8447179311493945, 2.155282068850607, 0, 1, 0.2815726437164647, 0, 0.4639763929058674, 4.606042713724897, 0.7184273562835353, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939976671278, 2.000406002332873, 0, 1, 0.3331979992223758, 0, 0.4998985200173366, 4.962653210235334, 0.6668020007776242, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995933777947791, 2.000406622205221, 0, 1, 0.3331977925982597, 0, 0.4998983651121957, 4.962651672442233, 0.6668022074017403, 1, 0.1007321081767934],
[0, 1.348613753036936, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7139297104280234, 2.163577522937768, 1, 1, 0.2481070080901055, 1.400698115505612, 0.4621974435388713, -9.316797682022029, 0.9384429125365762, 0.4346569287167874, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7135598060385259, 2.112586877755839, 0, 1, 0.2524850568196643, 0, 0.4733533141426502, 4.699130423358906, 0.7475149431803357, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9133164730351896, 2.086683526964812, 0, 1, 0.304438824345063, 0, 0.4792293546566456, 4.757463765332473, 0.6955611756549369, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8440516638333978, 2.085722514913134, 1, 0, 0.2880944442600403, 1.184761600324721, 0, -11.76150903389577, 1, 0.2880944442600403, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7160896121850481, 2.109603511296485, 0, 1, 0.2534208708774273, 0, 0.4740227225851726, 4.705775856028175, 0.7465791291225727, 1, 0.1007321081767934],
[0.9142774850162562, 2.085722514983746, 0, 1, 0.3047591616720852, 0, 0.4794501631046512, 4.75965580173479, 0.6952408383279147, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257405016080487, 2.051715913120779, 0, 1, 0.2869688998176769, 0, 0.4873969118263269, 4.838545729340877, 0.7130311001823231, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.825740480432774, 1.276508228228688, 0, 1, 0.392789148605798, 0, 0.7833870380824905, 7.776934805212056, 0.6072108513942021, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.051309827401162, 0, 1, 0.2869976630466096, 0, 0.487493398921077, 4.839503587728797, 0.7130023369533904, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939031133233, 2.000406096886678, 0, 1, 0.333197967704441, 0, 0.4998984963884809, 4.962652975664091, 0.666802032295559, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.667448677957625, 1.262585561170869, 0, 1, 0.5690884617285528, 0, 0.7920255313807345, 7.862691903465998, 0.4309115382714472, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -4.963660634625629, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981452939544287, 2.001854706045572, 0, 1, 0.3327150979848095, 0, 0.4995367530820367, 4.959061833644018, 0.6672849020151905, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.900091762814482, 0, 0, 0.3448166753970294, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.825693123481531, 0, 0, 0.3538954714119493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8996531827335574, 2, 1, 0, 0.3102623403690773, 1.111539445635643, 0, -11.03460918027047, 1, 0.3102623403690773, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8254001784488253, 2.051736617307808, 1, 0, 0.286882493618716, 1.211533539863415, 0, -12.02728267869735, 1, 0.286882493618716, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8771367957566326, 2, 0, 0, 0.3048644739625465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764539654288, 2.000223546034572, 1, 1, 0.3332588179884762, 1.000223596018575, 0.4999441197372626, -4.96643508545735, 0.8889385602329237, 0.5554561962098761, 0.1007321081767934],
[0.9997401204889527, 2.000259879511048, 0, 1, 0.3332467068296509, 0, 0.4999350385633113, 4.96301574157351, 0.6667532931703491, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.900091762814482, 1.099908237185519, 0, 0, 0.6333639209381604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1007321081767934],
[1, 1.999740138293583, 0, 1, 0.3333622093575263, 0, 0.5000649738687144, 4.964305651094465, 0.6666377906424737, 1, 0.1007321081767934],
[0.7133658416826955, 2.163770954073938, 1, 0, 0.2479429698076256, 1.40180527517436, 0, -13.91617132358704, 1, 0.2479429698076255, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9174082087271803, 2.082591791272821, 0, 1, 0.3058027362423932, 0, 0.4801709121252361, 4.766810908816635, 0.6941972637576068, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.099648188985628, 0, 1, 0.3000565973308277, 0, 0.4762702652976903, 4.728087934601702, 0.6999434026691723, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2, 0, 0, 0.2922090571761017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9987083470213215, 1.827525600484274, 0, 1, 0.3533707278205935, 0, 0.5471879571673365, 5.432110645465447, 0.6466292721794065, 1, 0.1007321081767934],
[0.713365842093575, 2.112327281387958, 1, 0, 0.2524569409768878, 1.401805274366958, 0, -13.9161713155717, 1, 0.2524569409768878, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981443858223855, 2.001855614177615, 0, 1, 0.3327147952741284, 0, 0.4995365264696231, 4.959059583989785, 0.6672852047258716, 1, 0.1007321081767934],
[0.8257404859122556, 2.00040593299186, 0, 1, 0.2921789474136481, 0, 0.4998985373455545, 4.962653382258119, 0.7078210525863519, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112753728916506, 0, 1, 0.2523414188596932, 0, 0.473315931863405, 4.698759317463062, 0.7476585811403067, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 1.995580980267481, 0, 1, 0.3338250598422174, 0, 0.5011072013053378, 4.974652177693454, 0.6661749401577826, 1, 0.1007321081767934],
[1.556978691889964, 1.286926831171019, 0, 0, 0.547479049238647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 1.386835068356538, 0, 0, 0.3395734900229281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.669598646542516, 1.260252937691699, 0, 0, 0.5698577550913402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9140539388267702, 2.085946061173232, 0, 0, 0.3046846462755899, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1.011750452504607, 1.988249547495394, 1, 0, 0.3372501508348688, 0.9883860170504316, 0, -9.812025529295289, 1, 0.3372501508348688, 0.1007321081767934],
[0.0253266799530769, 2.974673320046923, 0, 2, 0.008442226651025635, 0, 0.6723427364348201, 6.674562347635985, 0.9831868178887759, 1, 0.1007321081767934],
[1.647802491518712, 1.282964861153547, 0, 1, 0.5622426802373972, 0, 0.7794445742659502, 7.737796700312861, 0.4377573197626028, 1, 0.1007321081767934],
[0.9986957252089539, 2.001304274791047, 0, 1, 0.3328985750696513, 0, 0.4996741438052485, 4.960425755492757, 0.6671014249303487, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9997764417599, 2.000223558240101, 1, 0, 0.3332588139199666, 1.000223608229562, 0, -9.929541099984576, 1, 0.3332588139199666, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.112619954652552, 0, 0, 0.2523533652339449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8256931234815329, 2.0514436722751, 0, 0, 0.2869843118684217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.899945622190337, 2, 1, 0, 0.3103318956410657, 1.111178248265873, 0, -11.03102345793916, 1, 0.3103318956410657, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.085946061173232, 0, 0, 0.2880369529986133, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.927321269251259, 1, 0.3333333333333333, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.963660634625629, 0.6666666666666667, 1, 0.1007321081767934],
[0.8459432938897796, 2.154056706110222, 0, 1, 0.2819810979632597, 0, 0.4642403318182797, 4.608662920103871, 0.7180189020367402, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.8439055230609832, 2.156094476939019, 0, 0, 0.2813018410203275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.900091762814482, 2.09990823718552, 0, 0, 0.3000305876048271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9981447090383788, 2.001855290961622, 1, 1, 0.3327149030127928, 1.001858739464149, 0.4995366071239019, -4.986713188396982, 0.8893007933131878, 0.5547305993387736, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.7130731688289819, 2.164063626927651, 0, 0, 0.247841246158564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1007321081767934],
[0.9995939693094938, 2.000406030690507, 0, 1, 0.3331979897698312, 0, 0.4998985129308057, 4.962653139885064, 0.6668020102301688, 1, 0.1007321081767934]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node101":{
"Global MG94xREV":0.0005240189188934773,
"Nucleotide GTR":0.0005226456315537137,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.0005237053940018165,
"Nucleotide GTR":0.0005223329283113276,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node142":{
"Global MG94xREV":0.0005242657731207384,
"Nucleotide GTR":0.0005228918388543602,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node166":{
"Global MG94xREV":0.0005240949176020556,
"Nucleotide GTR":0.0005227214310937882,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":3.978847614081553e-05,
"Nucleotide GTR":3.968420316787014e-05,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node178":{
"Global MG94xREV":0.000523976714430793,
"Nucleotide GTR":0.0005226035376955372,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.0005240851602045857,
"Nucleotide GTR":0.0005227116992673611,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node187":{
"Global MG94xREV":0.0005235210278601389,
"Nucleotide GTR":0.0005221490453348166,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node198":{
"Global MG94xREV":0.0005238878645244062,
"Nucleotide GTR":0.0005225149206365674,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node203":{
"Global MG94xREV":0.0005239404613310476,
"Nucleotide GTR":0.0005225673796036643,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.0005241256896230962,
"Nucleotide GTR":0.0005227521224711243,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node217":{
"Global MG94xREV":0.0005239539006045378,
"Nucleotide GTR":0.0005225807836570828,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node23":{
"Global MG94xREV":0.0005238666651424648,
"Nucleotide GTR":0.0005224937768114801,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node238":{
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.0005240108819179513,
"Nucleotide GTR":0.0005226376156405504,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node261":{
"Global MG94xREV":0.0005241056740660272,
"Nucleotide GTR":0.0005227321593684799,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node271":{
"Global MG94xREV":0.0005239678126070371,
"Nucleotide GTR":0.0005225946592006373,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.0005247173128420806,
"Nucleotide GTR":0.0005233421952333461,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.0005238481336220079,
"Nucleotide GTR":0.0005224752938562586,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.000523993526735631,
"Nucleotide GTR":0.0005226203059406577,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node324":{
"Global MG94xREV":0.0005240429395258503,
"Nucleotide GTR":0.0005226695892356299,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node333":{
"Global MG94xREV":0.0005239835854659951,
"Nucleotide GTR":0.000522610390723936,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node341":{
"Global MG94xREV":0.0005238258124072264,
"Nucleotide GTR":0.0005224530311382994,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node346":{
"Global MG94xREV":0.0003404708463760047,
"Nucleotide GTR":0.0003395785803031039,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node35":{
"Global MG94xREV":0.0005239092276585341,
"Nucleotide GTR":0.0005225362277846979,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0005239079841106684,
"Nucleotide GTR":0.0005225349874957763,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.0005236274835562581,
"Nucleotide GTR":0.0005222552220443301,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node84":{
"Global MG94xREV":0.0005240764590147409,
"Nucleotide GTR":0.0005227030208805748,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0005241757871989212,
"Nucleotide GTR":0.0005228020887570962,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240450989276506,
"Nucleotide GTR":0.0005226717429783228,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "N", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AAC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001048539077747344,
"Nucleotide GTR":0.001045791189476901,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "S", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATT", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TCT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAT", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091993035499,
"Nucleotide GTR":0.0005226359374357482,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "I", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ATA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242601355951085,
"Nucleotide GTR":0.0005228862161028976,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCT", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240457989449013,
"Nucleotide GTR":0.0005226724411610499,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "S"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "AGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240094193359343,
"Nucleotide GTR":0.0005226361568914973,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAT", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005239062194633846,
"Nucleotide GTR":0.0005225332274730734,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "T", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "ACA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "F", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TTC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006074228903326382,
"Nucleotide GTR":0.0006058310276439059,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "N", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAC", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "I", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ATA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235582566453485,
"Nucleotide GTR":0.0005221861765551904,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACG", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240154546602313,
"Nucleotide GTR":0.0005226421763991245,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "C", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "TGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990048812,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371378619,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "F", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "TTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524009562146642,
"Nucleotide GTR":0.0005226362993279432,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "T", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ACT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091960232516,
"Nucleotide GTR":0.0005226359341640463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "I", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ATT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413693_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240099279720744,
"Nucleotide GTR":0.0005226366641946639,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "V", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413693_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005235583117554304,
"Nucleotide GTR":0.0005221862315208463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "V", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "GTT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "NHDY", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "NAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000523919703635543,
"Nucleotide GTR":0.0005225466763074946,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "D", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAT", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "YSCF", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TNC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "LF", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTN", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACN", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414525_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005238123483797843,
"Nucleotide GTR":0.0005224396023958028,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "L", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TTA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005248092407450837,
"Nucleotide GTR":0.0005234338822224799,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "S", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "AGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524009505934321,
"Nucleotide GTR":0.0005226362432629375,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "P", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CCC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "DAGV", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GNT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415473_Netherlands_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415473_Netherlands_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241600894678584,
"Nucleotide GTR":0.0005227864321648063,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245795608828151,
"Nucleotide GTR":0.0005232048042782631,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "F", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTT", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246071848955992,
"Nucleotide GTR":0.000523232355897273,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTA", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241283110036283,
"Nucleotide GTR":0.0005227547369818493,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCT", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241292958461817,
"Nucleotide GTR":0.0005227557192434428,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524005275656172,
"Nucleotide GTR":0.0005226320240710049,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGG", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244741330738605,
"Nucleotide GTR":0.0005230996527621481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "R", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "AGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524176558916512,
"Nucleotide GTR":0.0005228028584522608,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "K", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAA", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235584741855739,
"Nucleotide GTR":0.0005221863935253115,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005235583117654496,
"Nucleotide GTR":0.0005221862315308402,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "D", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "GAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000523836194740147,
"Nucleotide GTR":0.0005224633862624196,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGC", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002117980372991488,
"Nucleotide GTR":0.002112429818369839,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "N", "V", "T", "C", "A", "K", "G", "I", "K", "E", "S", "G", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "R", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "AAT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GGA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GGT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "AGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005239876699643361,
"Nucleotide GTR":0.0005226144645181025,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "R", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "AGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240071444641716,
"Nucleotide GTR":0.0005226338879814519,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "S", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "TCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524009505934321,
"Nucleotide GTR":0.0005226362432629375,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTC", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243852587268676,
"Nucleotide GTR":0.0005230110113266229,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "Y", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TAC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005238845899019168,
"Nucleotide GTR":0.0005225116545958241,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "T", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "ACC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240095590991551,
"Nucleotide GTR":0.0005226362962884433,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCC", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416453_Connecticut_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "-", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416453_Connecticut_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416458_Hawali_20200302_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416458_Hawali_20200302_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242746633061043,
"Nucleotide GTR":0.0005229007057413713,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005235583117554304,
"Nucleotide GTR":0.0005221862315208463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "G", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GGA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242126921002084,
"Nucleotide GTR":0.0005228388969423458,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242258642842941,
"Nucleotide GTR":0.0005228520346063155,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "D", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAC", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247319258702046,
"Nucleotide GTR":0.0005233567699653588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "NTSI", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCA", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ANT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240095059272798,
"Nucleotide GTR":0.000522636243255915,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAC", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005238668328015059,
"Nucleotide GTR":0.0005224939440311401,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "H", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CAT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241596258660735,
"Nucleotide GTR":0.0005227859697779753,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "I", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ATT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241312354055302,
"Nucleotide GTR":0.0005227576537198209,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "V", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GTA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240249047663563,
"Nucleotide GTR":0.0005226516017395196,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240450989276506,
"Nucleotide GTR":0.0005226717429783228,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "S", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "AGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524030833482854,
"Nucleotide GTR":0.0005226575149187314,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCT", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "I", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ATT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240451537312124,
"Nucleotide GTR":0.0005226717976382629,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAA", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240094193359343,
"Nucleotide GTR":0.0005226361568914973,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "V", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240096717619209,
"Nucleotide GTR":0.0005226364086559547,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "A", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GCA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "SL", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TNA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524030833493239,
"Nucleotide GTR":0.0005226575149290895,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "V", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GTT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417232_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235911216221629,
"Nucleotide GTR":0.0005222189554033272,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417232_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417285_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246146614082886,
"Nucleotide GTR":0.0005232398128163951,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATC", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417285_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241075344378398,
"Nucleotide GTR":0.0005227340148648482,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417363_Connecticut_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417363_Connecticut_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005240812501792626,
"Nucleotide GTR":0.0005227077994889742,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240378097191685,
"Nucleotide GTR":0.0005226644728725437,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATT", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524176558916512,
"Nucleotide GTR":0.0005228028584522608,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGA", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241284764429384,
"Nucleotide GTR":0.0005227549019875952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCT", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241279843988894,
"Nucleotide GTR":0.0005227544112330374,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "TPAS", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "NCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005241164601022798,
"Nucleotide GTR":0.0005227429171379536,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005239054243196032,
"Nucleotide GTR":0.0005225324344131113,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246839114002732,
"Nucleotide GTR":0.0005233088813261205,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "D", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "GAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001048413045778271,
"Nucleotide GTR":0.001045665487797636,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGT", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524009416375916,
"Nucleotide GTR":0.0005226361539392367,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCT", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241312354055302,
"Nucleotide GTR":0.0005227576537198209,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "I", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ATT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241752094997928,
"Nucleotide GTR":0.0005228015125719342,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "T", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "ACA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005235582566453485,
"Nucleotide GTR":0.0005221861765551904,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "A", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "GCT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005238848079896041,
"Nucleotide GTR":0.0005225118721119725,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "D", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAC", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417839_Reykjavik_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005241271928123775,
"Nucleotide GTR":0.0005227536217210231,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTT", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417839_Reykjavik_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002630060404328484,
"Nucleotide GTR":0.002623167850403704,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "F", "M", "F", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "T", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTA", "TTT", "ATG", "TTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "ACT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "DAGV", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GNC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "NHDY", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "NAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418037_Connecticut_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0004840998615362108,
"Nucleotide GTR":0.0004828311893813341,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418037_Connecticut_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241834287126242,
"Nucleotide GTR":0.0005228097102448165,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235468904484852,
"Nucleotide GTR":0.0005221748401455234,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "V", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GTC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241752063591096,
"Nucleotide GTR":0.0005228015094394812,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTA", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418204_New_York_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005240327655622489,
"Nucleotide GTR":0.0005226594419347596,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "V", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "GTG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418204_New_York_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243017095636647,
"Nucleotide GTR":0.0005229276811192704,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "EAGV", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GNG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418315_Derbyshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240092506362414,
"Nucleotide GTR":0.0005226359886339128,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "I", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ATT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418315_Derbyshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418320_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240188059860251,
"Nucleotide GTR":0.0005226455189421567,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "L", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CTA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418320_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000523558991661967,
"Nucleotide GTR":0.0005221869096455645,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAG", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005254722264761566,
"Nucleotide GTR":0.0005240951304782855,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "S", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "-", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "TCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "---", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "I", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ATA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240387844759482,
"Nucleotide GTR":0.0005226654450747957,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "C", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "TGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240095621367328,
"Nucleotide GTR":0.000522636299318061,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAC", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000523673530993973,
"Nucleotide GTR":0.0005223011488063189,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "N", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAT", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "ILVF", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "NTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418687_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "QPRL", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CNA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246707003553779,
"Nucleotide GTR":0.0005232957049031824,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATA", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241271931093644,
"Nucleotide GTR":0.0005227536220172316,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAT", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418710_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418722_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240092506438619,
"Nucleotide GTR":0.000522635988641514,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCT", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418722_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418729_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000524030833493239,
"Nucleotide GTR":0.0005226575149290895,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "S", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "TCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418729_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005239662917528574,
"Nucleotide GTR":0.0005225931423321336,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005248094041169225,
"Nucleotide GTR":0.0005234340451661719,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "K", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AAG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418741_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418746_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005238879800979891,
"Nucleotide GTR":0.0005225150359072677,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418746_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990048812,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371378619,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "I", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ATA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418751_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418765_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241646143896614,
"Nucleotide GTR":0.0005227909452282254,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "SRGC", "V", "Q", "T", "F", "F", "E", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "NGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "GAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418765_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00052422603598438,
"Nucleotide GTR":0.0005228522058564296,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005240091960232516,
"Nucleotide GTR":0.0005226359341640463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAT", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240093617552994,
"Nucleotide GTR":0.0005226360994617632,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "F", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "TTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990048812,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371378619,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "V", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GTT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005239508123006366,
"Nucleotide GTR":0.0005225777034466461,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "Y", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "TAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241310157556172,
"Nucleotide GTR":0.0005227574346455415,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "V", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GTT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "L", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CTT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001048787987104475,
"Nucleotide GTR":0.001046039446521574,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "D", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "T", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GAC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "ACC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005240450989276506,
"Nucleotide GTR":0.0005226717429783228,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "K", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "AAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "NHDY", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "NAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241319508702994,
"Nucleotide GTR":0.0005227583673095841,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCT", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001833582077066536,
"Nucleotide GTR":0.0001828776840152247,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "NTSI", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ANC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241899982938974,
"Nucleotide GTR":0.0005228162626093014,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240095059272798,
"Nucleotide GTR":0.000522636243255915,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACC", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "KN", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAN", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "ED", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAN", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235195434719665,
"Nucleotide GTR":0.0005221475648367548,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "T", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "ACG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "MLV", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "NTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240450986309658,
"Nucleotide GTR":0.0005226717426824159,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "K", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AAA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419698_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "L", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CTT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419698_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235582566453485,
"Nucleotide GTR":0.0005221861765551904,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAG", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241393191561543,
"Nucleotide GTR":0.0005227657162854996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "A", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "GCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419753_Victoria_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005238982384365814,
"Nucleotide GTR":0.0005225252673620093,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "H", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "CAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419753_Victoria_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005236013481185212,
"Nucleotide GTR":0.0005222291550992829,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "V", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "GTC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241404474789127,
"Nucleotide GTR":0.0005227668416512826,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "S", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AGT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "IM", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATN", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005235439871828074,
"Nucleotide GTR":0.0005221719444883842,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "T", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ACT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005240091960232516,
"Nucleotide GTR":0.0005226359341640463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "S", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "TCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "QPRL", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CNA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "NTSI", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ANT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000523623057986441,
"Nucleotide GTR":0.000522250808072527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAG", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524313527902877,
"Nucleotide GTR":0.0005229394684863654,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005236013481185212,
"Nucleotide GTR":0.0005222291550992829,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "V", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "GTT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "KTRI", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ANA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419937_Victoria_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005248758440315043,
"Nucleotide GTR":0.0005235003109628155,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419937_Victoria_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241272442633066,
"Nucleotide GTR":0.0005227536730371156,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "Y", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "TAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005238880908771223,
"Nucleotide GTR":0.000522515146396084,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "K", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "AAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241744550629877,
"Nucleotide GTR":0.0005228007601122682,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "I", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "KN", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAN", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005239490722748172,
"Nucleotide GTR":0.0005225759679808828,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005240073094369702,
"Nucleotide GTR":0.0005226340525219088,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420027_Virginia_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241527885564045,
"Nucleotide GTR":0.0005227791503867246,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "I", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ATT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420027_Virginia_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "L", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TTA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005239210704363576,
"Nucleotide GTR":0.0005225480395263576,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "K", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "AAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242908989786305,
"Nucleotide GTR":0.0005229168988653512,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCT", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091993035499,
"Nucleotide GTR":0.0005226359374357482,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "F", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TTT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_43":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_43",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240871373711231,
"Nucleotide GTR":0.0005227136712523713,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "F", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TTC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091960232516,
"Nucleotide GTR":0.0005226359341640463,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "S", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "TCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420237_South_Yorkshire_20200323_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420237_South_Yorkshire_20200323_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246839192010983,
"Nucleotide GTR":0.0005233088891065015,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "V", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "GTT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005241589718796915,
"Nucleotide GTR":0.0005227853175054832,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005240092506362414,
"Nucleotide GTR":0.0005226359886339128,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "C", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "TGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420295_Slovenia_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420295_Slovenia_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240933293374294,
"Nucleotide GTR":0.0005227198469914992,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "N", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAT", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420306_Fairbanks_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240097276663039,
"Nucleotide GTR":0.0005226364644138309,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGC", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420306_Fairbanks_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241903538906901,
"Nucleotide GTR":0.0005228166172741882,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990048812,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371378619,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTC", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005236220361376933,
"Nucleotide GTR":0.0005222497889017199,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "F", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTT", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420386_Watermaal_Bosvoorde_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420386_Watermaal_Bosvoorde_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241310190313335,
"Nucleotide GTR":0.0005227574379126732,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGT", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0005236435526104673,
"Nucleotide GTR":0.0005222712489866453,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "V", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GTC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "NTSI", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ANT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420458_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420463_England_20200312_null_103":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420463_England_20200312_null_103",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420477_England_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420477_England_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420479_England_20200319_null_56":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420479_England_20200319_null_56",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005235582566381513,
"Nucleotide GTR":0.0005221861765480127,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAG", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420485_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCN", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420488_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420489_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240094163862175,
"Nucleotide GTR":0.0005226361539495108,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420489_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420492_England_20200320_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420492_England_20200320_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240095059272798,
"Nucleotide GTR":0.000522636243255915,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAC", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420500_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420501_England_20200322_null_400":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420501_England_20200322_null_400",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420509_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242510290740338,
"Nucleotide GTR":0.000522877133447125,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "S", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "AGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420511_England_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005238590900155784,
"Nucleotide GTR":0.0005224862215365975,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "H", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAT", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420511_England_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420523_England_20200326_null_76":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420523_England_20200326_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420526_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "SRGC", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "NGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420526_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "RS", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGN", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420527_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_121":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_121",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420529_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "P", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "CCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420529_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420530_England_20200327_null_2507":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420530_England_20200327_null_2507",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420531_Australia_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240091990152466,
"Nucleotide GTR":0.0005226359371481996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCT", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420531_Australia_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":8924.639198137675,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03084730222978029],
[0.01739603463387795],
[0.0145867216652951],
[0.03910092827308292],
[0.01905488472127911],
[0.01074581602263778],
[0.009010457307519376],
[0.02415328495142458],
[0.01598234541836442],
[0.009013087509482621],
[0.007557549844706363],
[0.0202586448949106],
[0.02523922435695531],
[0.01423341392304755],
[0.01193483754269509],
[0.03199233093054134],
[0.01554654590687453],
[0.008767322633875885],
[0.007351473925048221],
[0.01970624114455086],
[0.009603356490071829],
[0.005415719042733158],
[0.004541126064439017],
[0.01217286848950546],
[0.008054845927701669],
[0.004542451644071924],
[0.003808883990211315],
[0.01021003232385551],
[0.01272016454458379],
[0.007173412485730423],
[0.006014966831344864],
[0.01612362201967266],
[0.03419125952112297],
[0.01928182666914535],
[0.01616797418151546],
[0.04333960798721408],
[0.02112050200686141],
[0.01191070070437296],
[0.009987222931539587],
[0.02677158695791965],
[0.01771488851391271],
[0.009990138256751767],
[0.008376815131493538],
[0.02245475406531506],
[0.02797524605789988],
[0.01577636662322643],
[0.01322861638677685],
[0.03546041340612818],
[0.015487380114272],
[0.03481086073528503],
[0.01696422483186889],
[0.009566808809205402],
[0.008021849821637434],
[0.02150323984309347],
[0.00802419144364724],
[0.006728352158461562],
[0.01803591109645854],
[0.02247003237417801],
[0.01267175516658928],
[0.01062537351275659],
[0.02848220300147923]
],
"Log Likelihood":-4208.839049287942,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.276157132225685, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":253
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":9457.248743325259,
"Equilibrium frequencies": [
[0.298375350140056],
[0.1840896358543417],
[0.2141699346405229],
[0.3033650793650793]
],
"Log Likelihood":-4303.173453388298,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2676747331281714,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1216411896666472,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.371866404908173,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.2076314836589146
},
"display order":0,
"estimated parameters":425
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-06/sequences.nsp2.compressed.fas",
"number of sequences":210,
"number of sites":638,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1,epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,(epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1,epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4)Node23,epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1,epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2,epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1,(epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2,epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2)Node35,epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2,epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1,epi_isl_419698_New_York_20200318_null_4,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3,epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9,epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1,epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1,epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_417363_Connecticut_20200314_null_1)Node390,epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1,epi_isl_418722_England_20200317_null_1,epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1,epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1,epi_isl_418710_England_20200316_null_2,epi_isl_418751_England_20200318_null_1,epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4,epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1,epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_417839_Reykjavik_20200316_null_5,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1,epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1,epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5,epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12,epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5,epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1,epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1,epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1,epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4,epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2,epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1,epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1,epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1,epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_418746_England_20200318_null_1,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,(epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1,epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1)Node346,epi_isl_414525_England_20200302_null_1,epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1,(epi_isl_420477_England_20200318_null_6,epi_isl_420526_England_20200327_null_1)Node261,epi_isl_418687_England_20200317_null_1,epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1,epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1,epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1,(epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420479_England_20200319_null_56)Node271,epi_isl_418730_England_20200318_null_3,(epi_isl_420458_England_20200311_null_1,epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1,epi_isl_417285_England_20200306_null_1,epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1,epi_isl_420463_England_20200312_null_103,epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1,epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1,epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5,epi_isl_418741_England_20200318_null_2)Node276,(epi_isl_419937_Victoria_20200321_null_4,epi_isl_420386_Watermaal_Bosvoorde_20200323_null_5)Node295,epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1,(epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5,epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1,epi_isl_416453_Connecticut_20200307_null_1)Node303,epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1,epi_isl_414483_USA_20200217_null_1,epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1,epi_isl_420530_England_20200327_null_2507,epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,(epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_420523_England_20200326_null_76,epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1,epi_isl_420488_England_20200320_null_1)Node324,(epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1,epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1)Node333,epi_isl_420527_England_20200327_null_2,(epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2)Node341,epi_isl_417232_England_20200304_null_1,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_420511_England_20200323_null_7,epi_isl_420306_Fairbanks_20200301_null_1,epi_isl_420531_Australia_20200314_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1,epi_isl_420489_England_20200320_null_2,epi_isl_420500_England_20200322_null_1,epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,(epi_isl_420509_England_20200323_null_1,epi_isl_420510_England_20200323_null_1)Node245,epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1,epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2,epi_isl_418315_Derbyshire_20200325_null_1,epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2,epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1,epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2,epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_6,epi_isl_420485_England_20200318_null_1,epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3,epi_isl_418729_England_20200318_null_3,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1,epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,(epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1)Node217,epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_2,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1)Node181,(epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1,(epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1,epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1)Node166,epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1,epi_isl_420501_England_20200322_null_400,epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1,epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1,epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4,epi_isl_420529_England_20200327_null_1,epi_isl_420027_Virginia_20200328_null_3,epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,(epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6)Node142,epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3,epi_isl_418204_New_York_20200317_null_3,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1,epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2,epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1,(epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_418037_Connecticut_20200316_null_6)Node173,epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1)Node121,(epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1)Node178,((epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2,epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_416458_Hawali_20200302_null_12,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1)Node204,epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1)Node203,(epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_43,epi_isl_419753_Victoria_20200310_null_2,epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8)Node187,(epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7,epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_420295_Slovenia_20200324_null_6)Node198,epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3,(epi_isl_420237_South_Yorkshire_20200323_null_27,epi_isl_416675_USA_20200311_null_1,epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1)Node101,((epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5,epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3,epi_isl_420528_England_20200327_null_121,epi_isl_418320_South_Yorkshire_20200325_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1,epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1,epi_isl_418765_England_20200318_null_1)Node85,epi_isl_420492_England_20200320_null_17)Node84,(epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1,epi_isl_415473_Netherlands_20200309_null_3)Node80,epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_413693_China_20200101_null_1,epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1,epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node101":"test",
"Node121":"test",
"Node142":"test",
"Node166":"test",
"Node173":"test",
"Node178":"test",
"Node181":"test",
"Node187":"test",
"Node198":"test",
"Node203":"test",
"Node204":"test",
"Node217":"test",
"Node23":"test",
"Node245":"test",
"Node261":"test",
"Node271":"test",
"Node276":"test",
"Node295":"test",
"Node303":"test",
"Node324":"test",
"Node333":"test",
"Node341":"test",
"Node346":"test",
"Node35":"test",
"Node390":"test",
"Node80":"test",
"Node84":"test",
"Node85":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413693_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2":"test",
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_415473_Netherlands_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":"test",
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":"test",
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416453_Connecticut_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_416458_Hawali_20200302_null_12":"test",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":"test",
"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417232_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417285_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417363_Connecticut_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7":"test",
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9":"test",
"epi_isl_417839_Reykjavik_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418037_Connecticut_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418204_New_York_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418315_Derbyshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_418320_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418722_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418729_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_418746_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418765_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":"test",
"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1":"test",
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":"test",
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":"test",
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419698_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419753_Victoria_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419842_Victoria_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419937_Victoria_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8":"test",
"epi_isl_420027_Virginia_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_43":"test",
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420237_South_Yorkshire_20200323_null_27":"test",
"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_6":"test",
"epi_isl_420295_Slovenia_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420306_Fairbanks_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":"test",
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420386_Watermaal_Bosvoorde_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":"test",
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_420463_England_20200312_null_103":"test",
"epi_isl_420477_England_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_420479_England_20200319_null_56":"test",
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420489_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420492_England_20200320_null_17":"test",
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420501_England_20200322_null_400":"test",
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420511_England_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_420523_England_20200326_null_76":"test",
"epi_isl_420526_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_121":"test",
"epi_isl_420529_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420530_England_20200327_null_2507":"test",
"epi_isl_420531_Australia_20200314_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":6
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":10
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":16
}
}
}