{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[158.1294394616074, 362.4141930931027, 1, 0, 0.3037774925524379, 0.006323933123425713, 0, -0.08038661878113311, 1, 0.3037774925524379, 0.00186076842849592],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860885770556215],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001868040768727473],
[158.2065610771264, 362.3822339012575, 0, 1, 0.303899282126684, 0, 0.002759517179510742, 0.03507757770359721, 0.696100717873316, 1, 0.001860886111080483],
[158.4164007551286, 362.284820284325, 0, 1, 0.3042366607838727, 0, 0.002760259177337845, 0.03508700960227477, 0.6957633392161273, 1, 0.001860768427898998],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001861010778603459],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860885771559637],
[158.0461241673347, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3036486038173385, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6963513961826615, 1, 0.001860960239983779],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.0018609801463556],
[158.0461241673347, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3036486038173385, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6963513961826615, 1, 0.001860862165005896],
[158.1069689928313, 362.4946599623272, 0, 1, 0.3037004884332578, 0, 0.002758661327877013, 0.03506669855328506, 0.6962995115667423, 1, 0.001861314309073234],
[158.2342799244348, 362.1517641455318, 0, 1, 0.3040709521855663, 0, 0.002761273308607015, 0.03509990072274326, 0.6959290478144338, 1, 0.001864857598224506],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001861011592858104],
[158.2743432712358, 362.2692892834743, 0, 1, 0.3040558627034994, 0, 0.002760377513583559, 0.03508851383239336, 0.6959441372965005, 1, 0.00186076842849592],
[158.1387788830169, 362.4048536716931, 0, 1, 0.3037954342211577, 0, 0.002759344942178705, 0.03507538831030666, 0.6962045657788423, 1, 0.001861282852718036],
[158.0212516457619, 362.3370714775837, 0, 0, 0.30367776323298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000535867748295149],
[158.1139063614441, 362.2444167619014, 1, 1, 0.3038558226807969, 0.006324554386215891, 0.002760567047351587, -0.04530359286830548, 0.9076716390229762, 0.5153832843845698, 0.003746573695734135],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.001324547942061181],
[158.0461241673347, 362.4975083873754, 0, 1, 0.3036174381611013, 0, 0.002758639650927948, 0.0350664230069428, 0.6963825618388988, 1, 0.001861154270157308],
[158.1387788830169, 362.3822339012575, 0, 1, 0.3038086359609775, 0, 0.002759517179510742, 0.03507757770359721, 0.6961913640390225, 1, 0.001860862164386559],
[158.2065610771264, 362.176634567792, 0, 1, 0.3040193503578814, 0, 0.002761083693853863, 0.03509749043652116, 0.6959806496421186, 1, 0.001860885771100849],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 0, 1, 0.3039256484623286, 0, 0.002759861131299853, 0.03508194984365795, 0.6960743515376714, 1, 0.001860990974267888],
[158.1139063614441, 362.429726193266, 1, 0, 0.303747652402272, 0.00632455438621589, 0, -0.08039451595747925, 1, 0.303747652402272, 0.001860980145748018],
[158.2836826926453, 362.2599498620647, 1, 0, 0.3040738043722194, 0.006317770619109212, 0, -0.08030828416317319, 1, 0.3040738043722193, 0.001861282852770206],
[158.1139063614441, 362.4297261932659, 1, 0, 0.3037476524022721, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3037476524022721, 0.001860862164400724],
[158.1139063614441, 362.4297261932659, 1, 0, 0.3037476524022721, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3037476524022721, 0.001860917235944689],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[158.2065610771264, 361.9048536716931, 1, 1, 0.3041782137266301, 0.006320850369236557, 0.002763157194092687, -0.04522358466302159, 0.9074756142940765, 0.5158320417473368, 0.003742194821506221],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860376878847317],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.001860476767041874],
[158.3179050634336, 362.2257274912765, 1, 0, 0.3041395478923548, 0.006316404954950156, 0, -0.08029092453554992, 1, 0.3041395478923548, 0.002092551731005137],
[157.885687257543, 362.6579452971671, 0, 0, 0.3033092278598739, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008809766124333913],
[158.0461241673347, 362.4975083873754, 0, 1, 0.3036174381611013, 0, 0.002758639650927948, 0.0350664230069428, 0.6963825618388988, 1, 0.000978809934358394],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001859528193080434],
[158.2559638453369, 362.4452571941167, 0, 1, 0.3039285437614632, 0, 0.002759037344678026, 0.03507147828745498, 0.6960714562385368, 1, 0.001860666760551596],
[158.2992157928086, 362.2444167619014, 1, 0, 0.3041036445223851, 0.006317150688281736, 0, -0.0803004039180589, 1, 0.3041036445223851, 0.001860308621873043],
[157.2065610771263, 357.4530642784804, 1, 0, 0.3054573417693366, 0.006361057662913922, 0, -0.0808585270295314, 1, 0.3054573417693367, 0.002057071627664128],
[157.2065610771263, 357.4530642784804, 0, 0, 0.3054573417693366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000899384796175998],
[158.2065610771264, 362.3950678780321, 0, 1, 0.3038917903400439, 0, 0.002759419453072029, 0.03507633545485417, 0.696108209659956, 1, 0.0009821604460514167],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001870232575367032],
[158.1139063614441, 362.429726193266, 1, 0, 0.303747652402272, 0.00632455438621589, 0, -0.08039451595747925, 1, 0.303747652402272, 0.001860862164686011],
[158.2065610771264, 362.4946599623271, 1, 0, 0.3038336663803196, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3038336663803196, 0.001860799467459045],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 0, 1, 0.3039256484623286, 0, 0.002759861131299853, 0.03508194984365795, 0.6960743515376714, 1, 0.001860990780826612],
[158.0995513318425, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3037200754064088, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6962799245935911, 1, 0.001861377205808129]
],
"NAMES": [
["epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_418647_Li_ge_20200322_null_3"],
["epi_isl_418962_Utah_20200313_null_3"],
["epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_6"],
["epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1"],
["epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_8"],
["epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1"],
["epi_isl_418739_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_418895_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1"],
["epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_418970_New_York_20200316_null_5"],
["epi_isl_419210_Ramat_Gan_20200301_null_20"],
["epi_isl_415580_British_Columbia_20200228_null_1"],
["epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_418902_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_418963_Utah_20200314_null_3"],
["Node50"],
["epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_418227_Hauts_de_France_20200312_null_3"],
["epi_isl_416829_Selangor_20200220_null_1"],
["epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1"],
["epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_1"],
["epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1"],
["epi_isl_416402_Shanghai_20200211_null_1"],
["epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_2585"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_417830_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_413747_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2"],
["Node19"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_417619_Reykjavik_20200318_null_2"],
["epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_69"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["Node29"],
["epi_isl_417973_Utah_20200319_null_1"],
["epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1"],
["epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_418141_Wales_20200313_null_7"]
],
"RESOLVED": [
[158.1294394616074, 362.4141930931027, 1, 0, 0.3037774925524379, 0.006323933123425713, 0, -0.08038661878113311, 1, 0.3037774925524379, 0.00186076842849592],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860885770556215],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001868040768727473],
[158.2065610771264, 362.3822339012575, 0, 1, 0.303899282126684, 0, 0.002759517179510742, 0.03507757770359721, 0.696100717873316, 1, 0.001860886111080483],
[158.4164007551286, 362.284820284325, 0, 1, 0.3042366607838727, 0, 0.002760259177337845, 0.03508700960227477, 0.6957633392161273, 1, 0.001860768427898998],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001861010778603459],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860885771559637],
[158.0461241673347, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3036486038173385, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6963513961826615, 1, 0.001860960239983779],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.0018609801463556],
[158.0461241673347, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3036486038173385, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6963513961826615, 1, 0.001860862165005896],
[158.1069689928313, 362.4946599623272, 0, 1, 0.3037004884332578, 0, 0.002758661327877013, 0.03506669855328506, 0.6962995115667423, 1, 0.001861314309073234],
[158.2342799244348, 362.1517641455318, 0, 1, 0.3040709521855663, 0, 0.002761273308607015, 0.03509990072274326, 0.6959290478144338, 1, 0.001864857598224506],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001861011592858104],
[158.2743432712358, 362.2692892834743, 0, 1, 0.3040558627034994, 0, 0.002760377513583559, 0.03508851383239336, 0.6959441372965005, 1, 0.00186076842849592],
[158.1387788830169, 362.4048536716931, 0, 1, 0.3037954342211577, 0, 0.002759344942178705, 0.03507538831030666, 0.6962045657788423, 1, 0.001861282852718036],
[158.0212516457619, 362.3370714775837, 0, 0, 0.30367776323298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000535867748295149],
[158.1139063614441, 362.2444167619014, 1, 1, 0.3038558226807969, 0.006324554386215891, 0.002760567047351587, -0.04530359286830548, 0.9076716390229762, 0.5153832843845698, 0.003746573695734135],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.001324547942061181],
[158.0461241673347, 362.4975083873754, 0, 1, 0.3036174381611013, 0, 0.002758639650927948, 0.0350664230069428, 0.6963825618388988, 1, 0.001861154270157308],
[158.1387788830169, 362.3822339012575, 0, 1, 0.3038086359609775, 0, 0.002759517179510742, 0.03507757770359721, 0.6961913640390225, 1, 0.001860862164386559],
[158.2065610771264, 362.176634567792, 0, 1, 0.3040193503578814, 0, 0.002761083693853863, 0.03509749043652116, 0.6959806496421186, 1, 0.001860885771100849],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 0, 1, 0.3039256484623286, 0, 0.002759861131299853, 0.03508194984365795, 0.6960743515376714, 1, 0.001860990974267888],
[158.1139063614441, 362.429726193266, 1, 0, 0.303747652402272, 0.00632455438621589, 0, -0.08039451595747925, 1, 0.303747652402272, 0.001860980145748018],
[158.2836826926453, 362.2599498620647, 1, 0, 0.3040738043722194, 0.006317770619109212, 0, -0.08030828416317319, 1, 0.3040738043722193, 0.001861282852770206],
[158.1139063614441, 362.4297261932659, 1, 0, 0.3037476524022721, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3037476524022721, 0.001860862164400724],
[158.1139063614441, 362.4297261932659, 1, 0, 0.3037476524022721, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3037476524022721, 0.001860917235944689],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[158.2065610771264, 361.9048536716931, 1, 1, 0.3041782137266301, 0.006320850369236557, 0.002763157194092687, -0.04522358466302159, 0.9074756142940765, 0.5158320417473368, 0.003742194821506221],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001860376878847317],
[158.1139063614441, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3038017279128789, 0.006324554386215891, 0, -0.08039451595747926, 1, 0.3038017279128788, 0.001860476767041874],
[158.3179050634336, 362.2257274912765, 1, 0, 0.3041395478923548, 0.006316404954950156, 0, -0.08029092453554992, 1, 0.3041395478923548, 0.002092551731005137],
[157.885687257543, 362.6579452971671, 0, 0, 0.3033092278598739, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008809766124333913],
[158.0461241673347, 362.4975083873754, 0, 1, 0.3036174381611013, 0, 0.002758639650927948, 0.0350664230069428, 0.6963825618388988, 1, 0.000978809934358394],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001859528193080434],
[158.2559638453369, 362.4452571941167, 0, 1, 0.3039285437614632, 0, 0.002759037344678026, 0.03507147828745498, 0.6960714562385368, 1, 0.001860666760551596],
[158.2992157928086, 362.2444167619014, 1, 0, 0.3041036445223851, 0.006317150688281736, 0, -0.0803004039180589, 1, 0.3041036445223851, 0.001860308621873043],
[157.2065610771263, 357.4530642784804, 1, 0, 0.3054573417693366, 0.006361057662913922, 0, -0.0808585270295314, 1, 0.3054573417693367, 0.002057071627664128],
[157.2065610771263, 357.4530642784804, 0, 0, 0.3054573417693366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000899384796175998],
[158.2065610771264, 362.3950678780321, 0, 1, 0.3038917903400439, 0, 0.002759419453072029, 0.03507633545485417, 0.696108209659956, 1, 0.0009821604460514167],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 1, 0, 0.3039256484623286, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3039256484623286, 0.001870232575367032],
[158.1139063614441, 362.429726193266, 1, 0, 0.303747652402272, 0.00632455438621589, 0, -0.08039451595747925, 1, 0.303747652402272, 0.001860862164686011],
[158.2065610771264, 362.4946599623271, 1, 0, 0.3038336663803196, 0.006320850369236557, 0, -0.08034743237910086, 1, 0.3038336663803196, 0.001860799467459045],
[158.2065610771264, 362.3370714775837, 0, 1, 0.3039256484623286, 0, 0.002759861131299853, 0.03508194984365795, 0.6960743515376714, 1, 0.001860990780826612],
[158.0995513318425, 362.4440812228676, 0, 1, 0.3037200754064088, 0, 0.002759046296537805, 0.0350715920789397, 0.6962799245935911, 1, 0.001861377205808129]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622439263198508, 2.13775607368015, 1, 0, 0.2874146421066168, 1.159764620515342, 0, -14.74233749877311, 1, 0.2874146421066168, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962047719605834, 2.002531377513562, 0, 2, 0.3322082111609841, 0, 0.998735911186218, 12.69542251453526, 0.4459458732408128, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622438614577107, 2.13775613854229, 1, 0, 0.2874146204859035, 1.159764707758428, 0, -14.74233860776281, 1, 0.2874146204859035, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.259446824412235, 1.633698846572126, 0, 0, 0.4353209162757857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 1.555243744223243, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962043762569358, 2.003795623743064, 0, 1, 0.3320681254189786, 0, 0.4990528914979927, 6.343706322868197, 0.6679318745810214, 1, 0.07866897773923975],
[0.9983966574364874, 2.001068286990395, 1, 1, 0.3328582516997058, 1.001605917399232, 0.4997330708308806, -6.379552156275441, 0.8892053842754152, 0.554921887674827, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9983962949660581, 2.001603705033942, 0, 1, 0.332798764988686, 0, 0.4995993949676681, 6.350653196786998, 0.6672012350113139, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.688550555350911, 1, 0, 0.3719476273227376, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3719476273227376, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5821453167531342, 2.102677713759965, 1, 0, 0.2168281894698586, 1.717784153237571, 0, -21.83559774898088, 1, 0.2168281894698586, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.864435611781151, 0, 0, 0.3491089120268912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.317078743415223, 0, 1, 0.226662126817445, 0, 0.4315779094007246, 5.485998697367785, 0.7733378731825551, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.214019490567732, 0, 0, 0.2347362551521864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9974680553072526, 2.002531944692747, 0, 1, 0.3324893517690842, 0, 0.4993678141566087, 6.347709459398837, 0.6675106482309158, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.259446824412235, 1.633698846572126, 0, 0, 0.4353209162757857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7327397065819161, 1.952083323931183, 1, 0, 0.2729191824765752, 1.364741109315339, 0, -17.3478942848219, 1, 0.2729191824765751, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 1.555243744223243, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2, 0, 0, 0.2534879414716548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9096751526524435, 2.090324847347556, 0, 0, 0.3032250508841478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.954760459128707, 0, 0, 0.3384369101429216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6797832590326556, 2.316481086944475, 0, 1, 0.2268769309174445, 0, 0.4316892573118468, 5.487414095334329, 0.7731230690825555, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[1.073304794860765, 1.119600666502211, 0, 0, 0.4894441706546092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.6973610902138649, 2.383190552425135, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.69961095417352, 2.380940688465481, 1, 0, 0.2271057379756139, 1.429365841164311, 0, -18.65722853942074, 1, 0.227105737975614, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9738515525842654, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333333, 0.07661190611157563],
[0, 2.995882296618517, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07581658471782131],
[0.9745864736569428, 1.949172947313886, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07768681729318834],
[0.5971024118128333, 2.168856602441316, 0, 2, 0.2158753650128992, 0, 0.9221448747458698, 12.03657396805767, 0.6148514431936541, 1, 0.07661190611157563],
[1.914496728822359, 1.166054913816643, 0, 0, 0.6214785372603836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.7542873172859325, 2.002624681661451, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.038655998732607, 2.041895643906394, 2, 0, 0.33716558565557, 1.925565348335202, 0, -25.13402219141836, 1, 0.1136806321504635, 0.07661190611157563],
[0.7754681936445906, 2.058859679656239, 0, 0, 0.2735986196055321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07451935438057049],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.8074584623909487, 2.274520490143874, 0, 0, 0.2619935031440891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.5961786701719707, 1.597742828585829, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.8858063439398368, 2.054652635023215, 1, 0, 0.3012476454448669, 1.128914922365829, 0, -14.74232973793308, 1, 0.3012476454448669, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.6976841980531383, 2.384294754481683, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.5961786701719707, 2.162010686935407, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.012815786056132, 2.069163166478691, 0, 1, 0.3286251469118974, 0, 0.483287164685907, 6.311174206980318, 0.6713748530881026, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.046951481518447, 1, 0, 0.3341683428334722, 0.9734005475710996, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3341683428334722, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9734005475710996, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.6976841980531383, 2.384294754481683, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.2654361249664746, 2.734563875033525, 0, 0, 0.08847870832215819, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622437873631134, 2.001068300737755, 1, 1, 0.301135105371978, 1.159764807419684, 0.4997330673977092, -8.389987501931827, 0.9093176483126078, 0.5115878590565637, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962049719739411, 2.002531244106739, 0, 1, 0.3322082704813468, 0, 0.4993679888605513, 6.347711680146425, 0.6677917295186532, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.6848230305131, 0, 0, 0.3724640278465165, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6835388184162159, 2.316461181583783, 1, 1, 0.2278462728054054, 1.462974703202718, 0.4316929668194535, -13.10912847757605, 0.9480860759686849, 0.4037786215794955, 0.07866897773923975],
[0.8954326059724, 2.100012105686266, 1, 0, 0.2989314416277684, 1.116778631166825, 0, -14.90580348327236, 1, 0.2989314416277684, 0.07492240404350561],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.864435611781151, 1.135564388218849, 0, 0, 0.6214785372603836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.864435611781151, 0, 0, 0.3491089120268912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2, 0, 0, 0.2534879414716548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.862243787363829, 2.137756212636172, 1, 0, 0.2874145957879429, 1.159764807418721, 0, -14.74233987459374, 1, 0.2874145957879429, 0.07866897773923975],
[0, 1.839358712008788, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8660388735806249, 2.133961126419376, 0, 1, 0.288679624526875, 0, 0.4686120977648379, 5.956758448268181, 0.711320375473125, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 6.355745484037251, 0.6666666666666666, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.937195347445395, 0, 1, 0.2749364047677844, 0, 0.5162102011646441, 6.561801309732294, 0.7250635952322155, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5852840115004087, 2.103266481672534, 0, 1, 0.2176950044221319, 0, 0.4754509277420673, 6.043690173755929, 0.7823049955778681, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622439263195149, 2.137756073680486, 1, 0, 0.2874146421065049, 1.159764620515794, 0, -14.74233749877886, 1, 0.2874146421065049, 0.07866897773923975],
[0.9976436433153697, 1.688551586673705, 0, 1, 0.3713965508454229, 0, 0.5922235411059666, 7.528044193849592, 0.6286034491545771, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622439263198508, 2.13775607368015, 1, 0, 0.2874146421066168, 1.159764620515342, 0, -14.74233749877311, 1, 0.2874146421066168, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962047719605834, 2.002531377513562, 0, 2, 0.3322082111609841, 0, 0.998735911186218, 12.69542251453526, 0.4459458732408128, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622438614577107, 2.13775613854229, 1, 0, 0.2874146204859035, 1.159764707758428, 0, -14.74233860776281, 1, 0.2874146204859035, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.259446824412235, 1.633698846572126, 0, 0, 0.4353209162757857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 1.555243744223243, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962043762569358, 2.003795623743064, 0, 1, 0.3320681254189786, 0, 0.4990528914979927, 6.343706322868197, 0.6679318745810214, 1, 0.07866897773923975],
[0.9983966574364874, 2.001068286990395, 1, 1, 0.3328582516997058, 1.001605917399232, 0.4997330708308806, -6.379552156275441, 0.8892053842754152, 0.554921887674827, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9983962949660581, 2.001603705033942, 0, 1, 0.332798764988686, 0, 0.4995993949676681, 6.350653196786998, 0.6672012350113139, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.688550555350911, 1, 0, 0.3719476273227376, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3719476273227376, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5821453167531342, 2.102677713759965, 1, 0, 0.2168281894698586, 1.717784153237571, 0, -21.83559774898088, 1, 0.2168281894698586, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.864435611781151, 0, 0, 0.3491089120268912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.317078743415223, 0, 1, 0.226662126817445, 0, 0.4315779094007246, 5.485998697367785, 0.7733378731825551, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.214019490567732, 0, 0, 0.2347362551521864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9974680553072526, 2.002531944692747, 0, 1, 0.3324893517690842, 0, 0.4993678141566087, 6.347709459398837, 0.6675106482309158, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.259446824412235, 1.633698846572126, 0, 0, 0.4353209162757857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7327397065819161, 1.952083323931183, 1, 0, 0.2729191824765752, 1.364741109315339, 0, -17.3478942848219, 1, 0.2729191824765751, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 1.555243744223243, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2, 0, 0, 0.2534879414716548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9096751526524435, 2.090324847347556, 0, 0, 0.3032250508841478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.954760459128707, 0, 0, 0.3384369101429216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6797832590326556, 2.316481086944475, 0, 1, 0.2268769309174445, 0, 0.4316892573118468, 5.487414095334329, 0.7731230690825555, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[1.073304794860765, 1.119600666502211, 0, 0, 0.4894441706546092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.6973610902138649, 2.383190552425135, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.69961095417352, 2.380940688465481, 1, 0, 0.2271057379756139, 1.429365841164311, 0, -18.65722853942074, 1, 0.227105737975614, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9738515525842654, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333333, 0.07661190611157563],
[0, 2.995882296618517, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07581658471782131],
[0.9745864736569428, 1.949172947313886, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07768681729318834],
[0.5971024118128333, 2.168856602441316, 0, 2, 0.2158753650128992, 0, 0.9221448747458698, 12.03657396805767, 0.6148514431936541, 1, 0.07661190611157563],
[1.914496728822359, 1.166054913816643, 0, 0, 0.6214785372603836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.026850547546334, 2.053701095092667, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[0.7542873172859325, 2.002624681661451, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07661190611157563],
[1.038655998732607, 2.041895643906394, 2, 0, 0.33716558565557, 1.925565348335202, 0, -25.13402219141836, 1, 0.1136806321504635, 0.07661190611157563],
[0.7754681936445906, 2.058859679656239, 0, 0, 0.2735986196055321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07451935438057049],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.8074584623909487, 2.274520490143874, 0, 0, 0.2619935031440891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.5961786701719707, 1.597742828585829, 0, 0, 0.2717411131207419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.8858063439398368, 2.054652635023215, 1, 0, 0.3012476454448669, 1.128914922365829, 0, -14.74232973793308, 1, 0.3012476454448669, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.6976841980531383, 2.384294754481683, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.5961786701719707, 2.162010686935407, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.012815786056132, 2.069163166478691, 0, 1, 0.3286251469118974, 0, 0.483287164685907, 6.311174206980318, 0.6713748530881026, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.046951481518447, 1, 0, 0.3341683428334722, 0.9734005475710996, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3341683428334722, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9734005475710996, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.6976841980531383, 2.384294754481683, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[1.027326317511607, 2.054652635023215, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07657642600823461],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.2654361249664746, 2.734563875033525, 0, 0, 0.08847870832215819, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622437873631134, 2.001068300737755, 1, 1, 0.301135105371978, 1.159764807419684, 0.4997330673977092, -8.389987501931827, 0.9093176483126078, 0.5115878590565637, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9962049719739411, 2.002531244106739, 0, 1, 0.3322082704813468, 0, 0.4993679888605513, 6.347711680146425, 0.6677917295186532, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.6848230305131, 0, 0, 0.3724640278465165, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6835388184162159, 2.316461181583783, 1, 1, 0.2278462728054054, 1.462974703202718, 0.4316929668194535, -13.10912847757605, 0.9480860759686849, 0.4037786215794955, 0.07866897773923975],
[0.8954326059724, 2.100012105686266, 1, 0, 0.2989314416277684, 1.116778631166825, 0, -14.90580348327236, 1, 0.2989314416277684, 0.07492240404350561],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -12.7114909680745, 1, 0.3333333333333334, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.864435611781151, 1.135564388218849, 0, 0, 0.6214785372603836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.220495187414209, 0, 0, 0.20719700220471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 1.864435611781151, 0, 0, 0.3491089120268912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[1.413690055450154, 1.265436124966475, 0, 0, 0.5276683367075723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5803206439956061, 2.104502386517494, 0, 0, 0.2161485645050878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2, 0, 0, 0.2534879414716548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.401000513185324, 0, 0, 0.3439670932357993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.950259155479574, 0, 0, 0.2735986196055322, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.862243787363829, 2.137756212636172, 1, 0, 0.2874145957879429, 1.159764807418721, 0, -14.74233987459374, 1, 0.2874145957879429, 0.07866897773923975],
[0, 1.839358712008788, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8644356117811508, 2.13556438821885, 0, 0, 0.2881452039270502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 2.06625195637629, 0, 0, 0.2622678245373157, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8660388735806249, 2.133961126419376, 0, 1, 0.288679624526875, 0, 0.4686120977648379, 5.956758448268181, 0.711320375473125, 1, 0.07866897773923975],
[0.6791261804166282, 2.320873819583371, 0, 0, 0.2263753934722095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 6.355745484037251, 0.6666666666666666, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.7345638750335255, 1.937195347445395, 0, 1, 0.2749364047677844, 0, 0.5162102011646441, 6.561801309732294, 0.7250635952322155, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.5852840115004087, 2.103266481672534, 0, 1, 0.2176950044221319, 0, 0.4754509277420673, 6.043690173755929, 0.7823049955778681, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975],
[0.8622439263195149, 2.137756073680486, 1, 0, 0.2874146421065049, 1.159764620515794, 0, -14.74233749877886, 1, 0.2874146421065049, 0.07866897773923975],
[0.9976436433153697, 1.688551586673705, 0, 1, 0.3713965508454229, 0, 0.5922235411059666, 7.528044193849592, 0.6286034491545771, 1, 0.07866897773923975],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07866897773923975]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node19":{
"Global MG94xREV":0.000978809934358394,
"Nucleotide GTR":0.0009753836790250415,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node29":{
"Global MG94xREV":0.0009821604460514167,
"Nucleotide GTR":0.0009787224624875322,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "-", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "---", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node44":{
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.001324547942061181,
"Nucleotide GTR":0.001319911455148386,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002092551731005137,
"Nucleotide GTR":0.002085226900844549,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413747_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002057071627664128,
"Nucleotide GTR":0.002049870993109893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860862164400724,
"Nucleotide GTR":0.001854348347272795,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860768427898998,
"Nucleotide GTR":0.001854254938889102,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "G", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GGG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415580_British_Columbia_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00186076842849592,
"Nucleotide GTR":0.001854254939483933,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "G", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "GGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415580_British_Columbia_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860990780826612,
"Nucleotide GTR":0.001854476513485932,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "V", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GTT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416402_Shanghai_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860917235944689,
"Nucleotide GTR":0.001854403226042694,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416402_Shanghai_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860476767041874,
"Nucleotide GTR":0.001853964298970294,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAT", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001861282852770206,
"Nucleotide GTR":0.001854767563052227,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAA", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00186076842849592,
"Nucleotide GTR":0.001854254939483933,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAG", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860885771559637,
"Nucleotide GTR":0.001854371871796511,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200220_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860885771100849,
"Nucleotide GTR":0.001854371871339325,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "Y", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "TAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200220_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001861314309073234,
"Nucleotide GTR":0.001854798909244682,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "R", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "AGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860990974267888,
"Nucleotide GTR":0.001854476706250077,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "V", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GTT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860980145748018,
"Nucleotide GTR":0.00185446591563468,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAT", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001861154270157308,
"Nucleotide GTR":0.001854639430533723,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "F", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "TTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001861282852718036,
"Nucleotide GTR":0.001854767563000239,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "D", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GAC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003742194821506221,
"Nucleotide GTR":0.00372909553173039,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "Q", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGA", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "CAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417619_Reykjavik_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001860666760551596,
"Nucleotide GTR":0.001854153627421099,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "D", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAT", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417619_Reykjavik_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860862165005896,
"Nucleotide GTR":0.00185434834787585,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001860862164686011,
"Nucleotide GTR":0.001854348347557084,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAT", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417830_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860376878847317,
"Nucleotide GTR":0.001853864760427336,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417830_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001861010778603459,
"Nucleotide GTR":0.001854496441261965,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCC", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860799467459045,
"Nucleotide GTR":0.001854285869797352,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGG", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417973_Utah_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001870232575367032,
"Nucleotide GTR":0.001863685957774559,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417973_Utah_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418141_Wales_20200313_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001861377205808129,
"Nucleotide GTR":0.001854861585813979,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418141_Wales_20200313_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418227_Hauts_de_France_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001860862164386559,
"Nucleotide GTR":0.001854348347258681,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "C", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "TGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418227_Hauts_de_France_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418647_Li_ge_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001860885770556215,
"Nucleotide GTR":0.001854371870796598,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCT", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418647_Li_ge_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859528193080434,
"Nucleotide GTR":0.001853019045425291,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTC", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418739_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860960239983779,
"Nucleotide GTR":0.001854446079549171,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "C", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "TGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418739_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000899384796175998,
"Nucleotide GTR":0.0008962365629527086,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "-", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "---", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001860886111080483,
"Nucleotide GTR":0.001854372210128886,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418895_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0018609801463556,
"Nucleotide GTR":0.001854465916240135,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418895_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418902_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000535867748295149,
"Nucleotide GTR":0.000533991980931007,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418902_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_2585":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_2585",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418962_Utah_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001868040768727473,
"Nucleotide GTR":0.001861501823399986,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418962_Utah_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418963_Utah_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003746573695734135,
"Nucleotide GTR":0.003733459078017037,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418963_Utah_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418970_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001864857598224506,
"Nucleotide GTR":0.001858329795361482,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418970_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008809766124333913,
"Nucleotide GTR":0.0008778928157626054,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419210_Ramat_Gan_20200301_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001861011592858104,
"Nucleotide GTR":0.001854497252666367,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419210_Ramat_Gan_20200301_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_69":{
"Global MG94xREV":0.001860308621873043,
"Nucleotide GTR":0.001853796742381801,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_69",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":2191.561064276361,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01568447641108046],
[0.01533564946492853],
[0.01095016683481679],
[0.02433577951352608],
[0.006277555645460137],
[0.006137941130591301],
[0.004382695337159756],
[0.009740153644139715],
[0.01000349128672572],
[0.009781010967654262],
[0.006983969094620028],
[0.01552125502559039],
[0.01279153048293358],
[0.01250704342719617],
[0.008930447481295191],
[0.01984713147665573],
[0.02158578938324425],
[0.02110571565980669],
[0.01507018715911721],
[0.03349216112084784],
[0.008639497452957296],
[0.008447352721197333],
[0.006031692483660035],
[0.01340490428958829],
[0.01376732320243934],
[0.01346113425589594],
[0.009611700255996617],
[0.02136115565256128],
[0.01760436725187003],
[0.01721284142043911],
[0.01229054470018376],
[0.02731465104018322],
[0.03538337435143733],
[0.03459643865170031],
[0.02470301476262832],
[0.05490027043891706],
[0.01416184357026895],
[0.01384688038533226],
[0.009887135899128164],
[0.02197328706412143],
[0.02256736327962476],
[0.02206545909046282],
[0.0157554760807464],
[0.03501515527713814],
[0.02885703671215391],
[0.02821524850530095],
[0.02014663148929118],
[0.04477411068338801],
[0.01241750437824034],
[0.01970504407708239],
[0.005083030548554072],
[0.004969982591008196],
[0.003548733861068885],
[0.007886747854887945],
[0.007919830639858044],
[0.0056550240671756],
[0.01256779197234682],
[0.01035749324731731],
[0.01012713983005573],
[0.007231116683531034],
[0.01607051873287147]
],
"Log Likelihood":-1036.296925580803,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.4656455843108773, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":59
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":2331.931821588897,
"Equilibrium frequencies": [
[0.250408719346049],
[0.2143505903723887],
[0.2700272479564033],
[0.2652134423251589]
],
"Log Likelihood":-1078.61873140029,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1136192837043533,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2760815016506941,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2103695856164106,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.049842168408731,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.512790971129767
},
"display order":0,
"estimated parameters":87
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-02/sequences.leader.compressed.fas",
"number of sequences":41,
"number of sites":180,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418647_Li_ge_20200322_null_3,epi_isl_418962_Utah_20200313_null_3,epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_6,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_8,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_418739_England_20200318_null_1,epi_isl_418895_Washington_20200324_null_1,epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1,epi_isl_418970_New_York_20200316_null_5,epi_isl_419210_Ramat_Gan_20200301_null_20,epi_isl_415580_British_Columbia_20200228_null_1,epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2,(epi_isl_418902_Washington_20200324_null_1,epi_isl_418963_Utah_20200314_null_3)Node50,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_418227_Hauts_de_France_20200312_null_3,epi_isl_416829_Selangor_20200220_null_1,epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1,epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_1,epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1,epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1,epi_isl_416402_Shanghai_20200211_null_1,epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_2585,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_417830_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,(epi_isl_413747_China_20200201_null_1,epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2)Node19,epi_isl_418669_England_20200311_null_1,epi_isl_417619_Reykjavik_20200318_null_2,epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_69,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_418768_England_20200318_null_1)Node29,epi_isl_417973_Utah_20200319_null_1,epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_418141_Wales_20200313_null_7)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node19":"test",
"Node29":"test",
"Node50":"test",
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_415580_British_Columbia_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416402_Shanghai_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_416829_Selangor_20200220_null_1":"test",
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417619_Reykjavik_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_417830_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_8":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417973_Utah_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_418141_Wales_20200313_null_7":"test",
"epi_isl_418227_Hauts_de_France_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_418647_Li_ge_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418739_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418844_British_Columbia_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_418895_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418902_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_2585":"test",
"epi_isl_418962_Utah_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_418963_Utah_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_418970_New_York_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_419210_Ramat_Gan_20200301_null_20":"test",
"epi_isl_419259_Ghent_20200324_null_69":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":1
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":2
}
}
}