{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339484026],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339486095],
[427.6759348388007, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2945172997218105, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945172997218105, 0.0006691020035684995],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006697593512614023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006694771379596545],
[427.6305536428744, 1024.381966196321, 0, 1, 0.2945088611840845, 0, 0.0009761983644764314, 0.01434969142216756, 0.7054911388159155, 1, 0.000669763480431831],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690612212292122],
[427.6759348388007, 1024.336585000395, 1, 0, 0.2945401151817645, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945401151817645, 0.0006691020035679697],
[427.4779082281543, 1024.534611611042, 0, 1, 0.2944037343944497, 0, 0.0009760529206793104, 0.01434755346160145, 0.7055962656055503, 1, 0.0006696011599769371],
[427.5634513496125, 1024.408906564051, 0, 1, 0.2944707927938639, 0, 0.0009761726919712942, 0.01434931404750668, 0.7055292072061361, 1, 0.0006694255948555629],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006696079077794827],
[427.4108059348924, 1024.601713904304, 0, 1, 0.2943575210923293, 0, 0.0009759889978999183, 0.01434661382454355, 0.7056424789076707, 1, 0.0006693948413279975],
[427.6759348388007, 1024.387551918559, 1, 0, 0.294529776927216, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945297769272159, 0.0006693188266378926],
[427.1777270142298, 1024.767690531704, 1, 0, 0.2942105962469595, 0.002340946020265445, 0, -0.03441088845173062, 1, 0.2942105962469594, 0.0006695664339486095],
[427.5232894240807, 1024.489230415115, 0, 1, 0.2944349883921297, 0, 0.0009760961563205576, 0.01434818900672518, 0.7055650116078702, 1, 0.0006694598700871706],
[427.336692195807, 1024.742929936651, 0, 1, 0.2942928787666891, 0, 0.00097585450046659, 0.01434463677076476, 0.7057071212333109, 1, 0.0006693495779035288],
[427.5634513496125, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2944936070494412, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7055063929505588, 1, 0.0006696011600038601],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006695664339486095],
[427.5299858609642, 1024.329888563512, 1, 1, 0.2944705569677922, 0.002339017222350357, 0.0009762479950696049, -0.02003211499088376, 0.9132870910790782, 0.5022282050146627, 0.001339844108963229],
[427.7160967643327, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2945677746715988, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7054322253284011, 1, 0.0006699675749728967],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690612212292122],
[427.4108059348924, 1024.601713904303, 0, 1, 0.2943575210923294, 0, 0.0009759889978999185, 0.01434661382454355, 0.7056424789076705, 1, 0.0006694436659773544],
[427.6840467810869, 1024.531390613604, 0, 1, 0.294504545102731, 0, 0.0009760559892665546, 0.01434759856849945, 0.7054954548972689, 1, 0.0006693948413000845],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693188266640565],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339484026],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006691229406144256],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690312816592966],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696614784411987],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339486095],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696079077525086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3032267071586, 1024.861938546757, 0, 1, 0.2942524975335318, 0, 0.0009757411826787018, 0.0143429710485632, 0.7057475024664682, 1, 0.0006694653828690369],
[426.9161965212521, 1025.133204974337, 0, 1, 0.2940094159892459, 0, 0.0009754829861598661, 0.01433917567202253, 0.7059905840107541, 1, 0.0006688557633787133],
[427.4161965212521, 1024.633204974337, 0, 1, 0.2943537568907917, 0, 0.0009759590018606184, 0.01434617289581072, 0.7056462431092083, 1, 0.0006693458958215555],
[427.3037130320639, 1024.745688463525, 1, 0, 0.2942762915586395, 0.00234025581688536, 0, -0.0344007427622036, 1, 0.2942762915586394, 0.000669008940705946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3438749575957, 1024.772628831255, 0, 1, 0.2942903505624883, 0, 0.0009758262192663089, 0.01434422104941975, 0.7057096494375117, 1, 0.0006694131318387538],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5299858609642, 1024.56807709969, 1, 0, 0.2944222547816652, 0.002339017222350357, 0, -0.0343825359611873, 1, 0.2944222547816652, 0.000669385280557275],
[427.5634513496125, 1024.489230415115, 0, 1, 0.29445450342062, 0, 0.0009760961563205574, 0.01434818900672518, 0.7055454965793799, 1, 0.0006690612212292122],
[427.8032267071586, 1024.209293132037, 0, 1, 0.2946277810018718, 0, 0.0009763629433023349, 0.01435211065933521, 0.7053722189981282, 1, 0.0006694517092860545],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696079077525086],
[427.5299858609642, 1024.685451533727, 1, 0, 0.2943984582810683, 0.002339017222350357, 0, -0.03438253596118729, 1, 0.2943984582810684, 0.0006694356177823323],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693495779322376],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339486095],
[427.6759348388008, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2945172997218105, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378653, 1, 0.2945172997218105, 0.0006691020035679697],
[427.5634513496125, 1024.432933114486, 0, 1, 0.2944659201113765, 0, 0.0009761497972930209, 0.01434897750569265, 0.7055340798886236, 1, 0.0006692636836147075],
[427.2111925028782, 1024.648681921597, 1, 0, 0.2942509811232484, 0.002340762642807545, 0, -0.0344081928828479, 1, 0.2942509811232483, 0.0006696011599769371],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693892593885932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.0232894240807, 1022.989230415115, 0, 1, 0.2954680373359269, 0, 0.0009775273974235424, 0.01436922762851141, 0.7045319626640731, 1, 0.000669784679327726],
[428.0634513496125, 1023.949068489583, 0, 1, 0.2948069975298965, 0, 0.0009766110744893685, 0.01435575807987566, 0.7051930024701035, 1, 0.0006692565876488555],
[428.5628823912158, 1023.864522444185, 1.5, 5.5, 0.2950666456474522, 0.003500069795196863, 0.005371804452087388, 0.02751368546387703, 0.4990988599764028, 0.7867668037241436, 0.005069325825548727],
[427.6864844916607, 1024.326035347535, 0, 0, 0.2945473807202607, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002076424608122859],
[427.6249679206366, 1024.387551918559, 1, 0, 0.2945050143011124, 0.002338497690774668, 0, -0.034374899072962, 1, 0.2945050143011123, 0.0004615021810016039],
[427.6759348388008, 1024.336585000395, 1, 0, 0.2945401151817644, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378653, 1, 0.2945401151817644, 0.0006693317014644363],
[428.4538816777202, 1023.558638161476, 1, 0, 0.2950758866219484, 0.002333973486444435, 0, -0.03430839523682364, 1, 0.2950758866219484, 0.0006690540067986103],
[428.3683385562619, 1023.644181282934, 0, 1, 0.2950169731344341, 0, 0.0009769019531246682, 0.01436003386931533, 0.7049830268655659, 1, 0.0006693245472295944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.9779082281543, 1024.034611611042, 0, 1, 0.2947480840423821, 0, 0.000976529492911153, 0.01435455886615464, 0.7052519159576178, 1, 0.000669358451648971],
[426.9875020760181, 1022.05457026051, 0, 1.75, 0.2946688092965556, 0, 0.001712237341254631, 0.02516914428728259, 0.5428600800302907, 1, 0.0006701444816917322],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.6759348388008, 1024.387551918559, 3, 0, 0.294529776927216, 0.007014657023268698, 0, -0.1031124076613596, 1, 0.02554980708942001, 0.002009704801808872],
[427.336692195807, 1024.742929936651, 0, 1, 0.294292878766689, 0, 0.0009758545004665898, 0.01434463677076476, 0.705707121233311, 1, 0.0006695263528466634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[426.9305185755165, 1025.082001263679, 1, 0, 0.2940267475261145, 0.00234230151392449, 0, -0.03443081361903249, 1, 0.2940267475261145, 0.0006696220538147361],
[427.3032267071587, 1024.709293132037, 0, 1, 0.2942834313539395, 0, 0.0009758865335782084, 0.01434510764357478, 0.7057165686460605, 1, 0.0006697600707198364],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006694553129662487],
[427.5019347785885, 1024.510585060607, 1, 0, 0.2944202814628158, 0.002339170699935941, 0, -0.03438479201495002, 1, 0.2944202814628158, 0.0006694609572864018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006697022539856553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006694718490930932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3279347183762, 1024.68458512082, 1, 0, 0.2943004477438672, 0.002340123167138686, 0, -0.03439879286861509, 1, 0.2943004477438672, 0.0006699577925832804],
[427.5019347785885, 1024.510585060607, 1, 0, 0.2944202814628158, 0.002339170699935941, 0, -0.03438479201495002, 1, 0.2944202814628158, 0.0006696127553796474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.276967800212, 1024.430261209544, 1, 0, 0.2943272302168446, 0.002340402304267391, 0, -0.03440289606301405, 1, 0.2943272302168447, 0.0006701192566460906],
[427.3384843712361, 1024.52139005324, 0, 1, 0.294338656160351, 0, 0.0009760655167463459, 0.01434773861830901, 0.7056613438396491, 1, 0.00066997499080442],
[427.1022862792164, 1024.910233559979, 1, 0, 0.2941450438227049, 0.002341359510649526, 0, -0.03441696658055517, 1, 0.2941450438227049, 0.0006707009916197473],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006698193124775239],
[426.9240274926944, 1025.088492346502, 0, 1, 0.2940222771219454, 0, 0.000975525535079345, 0.01433980112263492, 0.7059777228780546, 1, 0.0006698862149491076],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 0, 1, 0.2943077132823634, 0, 0.0009759201125295506, 0.01434560123955647, 0.7056922867176365, 1, 0.0006697285570939499],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006699067551880097],
[427.3144578208019, 1024.698062018394, 0, 1, 0.2942911662139974, 0, 0.0009758972296973558, 0.01434526487187465, 0.7057088337860027, 1, 0.0006699248485490004],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006696516651654557],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339486095],
[427.2260008820479, 1024.786518957148, 1, 0, 0.2942302459825631, 0.00234068150799672, 0, -0.03440700023641322, 1, 0.2942302459825632, 0.0006697144630094812],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006697144630094812],
[426.9862255245018, 1024.873648899974, 1, 0, 0.2940960302341582, 0.002341995924509319, 0, -0.03442632158752622, 1, 0.2940960302341582, 0.0006697602035577343],
[427.4460635989699, 1024.453972751038, 0, 1, 0.2944046097509195, 0, 0.0009761297496993741, 0.01434868281478447, 0.7055953902490805, 1, 0.0006695155635216658],
[427.3625109216703, 1024.650008917526, 0, 1, 0.2943242603507296, 0, 0.0009759429964348834, 0.01434593762301296, 0.7056757396492704, 1, 0.0006695398122272926],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 0, 1, 0.2943077132823634, 0, 0.0009759201125295506, 0.01434560123955647, 0.7056922867176365, 1, 0.0006695386919316829],
[427.185838956516, 1024.82668088268, 0, 1, 0.2942025864927288, 0, 0.0009757747516279566, 0.01434346449751856, 0.7057974135072712, 1, 0.0006697608288768228],
[427.4911297859563, 1024.610859777589, 0, 2, 0.2943947001370381, 0, 0.001951960572069418, 0.02869297152782729, 0.4978788391947003, 1, 0.001339784337728598],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.00066963627541137],
[426.1316646536582, 1023.214766360758, 0.375, 1.375, 0.2940164308097156, 0.0008800097038195557, 0.001343803906281013, 0.00681757307827665, 0.6923452456652595, 0.4562609316728524, 0.000676066397566504],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006838318896164132],
[427.59870901369, 1024.59730928436, 0, 2, 0.2944497186508118, 0, 0.001951986387117217, 0.02869335099780332, 0.4978011995119186, 1, 0.001340562240242593],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695750178286915],
[427.7562586898645, 1024.256261149331, 1, 0, 0.2945954341614332, 0.002337779938189118, 0, -0.03436434842209544, 1, 0.2945954341614332, 0.0006693519399823407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.7160967643327, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2945677746715988, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7054322253284011, 1, 0.0006694136373435589]
],
"NAMES": [
["epi_isl_418370_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_417406_New_South_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_413559_California_20200227_null_1"],
["epi_isl_413561_California_20200227_null_3"],
["Node181"],
["epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1"],
["epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_414482_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_418672_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1"],
["epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1"],
["epi_isl_418815_Hong_Kong_20200209_null_13"],
["epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1"],
["epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_416518_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1"],
["epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1"],
["epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_1"],
["epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_417305_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_418743_England_20200317_null_3"],
["Node122"],
["epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1"],
["epi_isl_414522_England_20200228_null_1"],
["Node127"],
["epi_isl_418832_British_Columbia_null_3"],
["Node126"],
["epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_3"],
["Node125"],
["epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_2"],
["epi_isl_416578_unknown_20200215_null_3"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_418716_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1"],
["epi_isl_418104_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2"],
["epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_418844_British_Columbia_null_1951"],
["epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2"],
["epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1"],
["epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1"],
["Node29"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_417768_Reykjavik_20200310_null_1"],
["Node25"],
["epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1"],
["epi_isl_418750_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1"],
["epi_isl_418383_Ontario_20200101_null_13"],
["Node34"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_418769_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1"],
["epi_isl_418724_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_408430_Ile_de_France_20200129_null_3"],
["epi_isl_417025_Li_ge_20200315_null_2"],
["Node53"],
["epi_isl_418303_Derbyshire_20200325_null_18"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_414619_USA_20200307_null_1"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1"],
["Node114"],
["epi_isl_413616_USA_20200217_null_1"],
["epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1"],
["Node111"],
["epi_isl_418248_Castilla_y_Leon_20200301_null_27"],
["epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1"],
["Node104"],
["epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2"],
["epi_isl_418066_Washington_20200314_null_3"],
["epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1"],
["epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1"],
["epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_418812_MB_20200312_null_10"],
["epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_415600_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1"],
["epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2"],
["epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1"],
["epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_12"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_418855_British_Columbia_null_531"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1"],
["Node63"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1"],
["Node108"]
],
"RESOLVED": [
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339484026],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339486095],
[427.6759348388007, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2945172997218105, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945172997218105, 0.0006691020035684995],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006697593512614023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006694771379596545],
[427.6305536428744, 1024.381966196321, 0, 1, 0.2945088611840845, 0, 0.0009761983644764314, 0.01434969142216756, 0.7054911388159155, 1, 0.000669763480431831],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690612212292122],
[427.6759348388007, 1024.336585000395, 1, 0, 0.2945401151817645, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945401151817645, 0.0006691020035679697],
[427.4779082281543, 1024.534611611042, 0, 1, 0.2944037343944497, 0, 0.0009760529206793104, 0.01434755346160145, 0.7055962656055503, 1, 0.0006696011599769371],
[427.5634513496125, 1024.408906564051, 0, 1, 0.2944707927938639, 0, 0.0009761726919712942, 0.01434931404750668, 0.7055292072061361, 1, 0.0006694255948555629],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006696079077794827],
[427.4108059348924, 1024.601713904304, 0, 1, 0.2943575210923293, 0, 0.0009759889978999183, 0.01434661382454355, 0.7056424789076707, 1, 0.0006693948413279975],
[427.6759348388007, 1024.387551918559, 1, 0, 0.294529776927216, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378654, 1, 0.2945297769272159, 0.0006693188266378926],
[427.1777270142298, 1024.767690531704, 1, 0, 0.2942105962469595, 0.002340946020265445, 0, -0.03441088845173062, 1, 0.2942105962469594, 0.0006695664339486095],
[427.5232894240807, 1024.489230415115, 0, 1, 0.2944349883921297, 0, 0.0009760961563205576, 0.01434818900672518, 0.7055650116078702, 1, 0.0006694598700871706],
[427.336692195807, 1024.742929936651, 0, 1, 0.2942928787666891, 0, 0.00097585450046659, 0.01434463677076476, 0.7057071212333109, 1, 0.0006693495779035288],
[427.5634513496125, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2944936070494412, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7055063929505588, 1, 0.0006696011600038601],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006695664339486095],
[427.5299858609642, 1024.329888563512, 1, 1, 0.2944705569677922, 0.002339017222350357, 0.0009762479950696049, -0.02003211499088376, 0.9132870910790782, 0.5022282050146627, 0.001339844108963229],
[427.7160967643327, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2945677746715988, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7054322253284011, 1, 0.0006699675749728967],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690612212292122],
[427.4108059348924, 1024.601713904303, 0, 1, 0.2943575210923294, 0, 0.0009759889978999185, 0.01434661382454355, 0.7056424789076705, 1, 0.0006694436659773544],
[427.6840467810869, 1024.531390613604, 0, 1, 0.294504545102731, 0, 0.0009760559892665546, 0.01434759856849945, 0.7054954548972689, 1, 0.0006693948413000845],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693188266640565],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339484026],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006691229406144256],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006690312816592966],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696614784411987],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339486095],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696079077525086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3032267071586, 1024.861938546757, 0, 1, 0.2942524975335318, 0, 0.0009757411826787018, 0.0143429710485632, 0.7057475024664682, 1, 0.0006694653828690369],
[426.9161965212521, 1025.133204974337, 0, 1, 0.2940094159892459, 0, 0.0009754829861598661, 0.01433917567202253, 0.7059905840107541, 1, 0.0006688557633787133],
[427.4161965212521, 1024.633204974337, 0, 1, 0.2943537568907917, 0, 0.0009759590018606184, 0.01434617289581072, 0.7056462431092083, 1, 0.0006693458958215555],
[427.3037130320639, 1024.745688463525, 1, 0, 0.2942762915586395, 0.00234025581688536, 0, -0.0344007427622036, 1, 0.2942762915586394, 0.000669008940705946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3438749575957, 1024.772628831255, 0, 1, 0.2942903505624883, 0, 0.0009758262192663089, 0.01434422104941975, 0.7057096494375117, 1, 0.0006694131318387538],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5299858609642, 1024.56807709969, 1, 0, 0.2944222547816652, 0.002339017222350357, 0, -0.0343825359611873, 1, 0.2944222547816652, 0.000669385280557275],
[427.5634513496125, 1024.489230415115, 0, 1, 0.29445450342062, 0, 0.0009760961563205574, 0.01434818900672518, 0.7055454965793799, 1, 0.0006690612212292122],
[427.8032267071586, 1024.209293132037, 0, 1, 0.2946277810018718, 0, 0.0009763629433023349, 0.01435211065933521, 0.7053722189981282, 1, 0.0006694517092860545],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006696079077525086],
[427.5299858609642, 1024.685451533727, 1, 0, 0.2943984582810683, 0.002339017222350357, 0, -0.03438253596118729, 1, 0.2943984582810684, 0.0006694356177823323],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693495779322376],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006695664339486095],
[427.6759348388008, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2945172997218105, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378653, 1, 0.2945172997218105, 0.0006691020035679697],
[427.5634513496125, 1024.432933114486, 0, 1, 0.2944659201113765, 0, 0.0009761497972930209, 0.01434897750569265, 0.7055340798886236, 1, 0.0006692636836147075],
[427.2111925028782, 1024.648681921597, 1, 0, 0.2942509811232484, 0.002340762642807545, 0, -0.0344081928828479, 1, 0.2942509811232483, 0.0006696011599769371],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 1, 0, 0.2944626478819641, 0.002338834146940016, 0, -0.03437984483227233, 1, 0.2944626478819641, 0.0006693892593885932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[429.0232894240807, 1022.989230415115, 0, 1, 0.2954680373359269, 0, 0.0009775273974235424, 0.01436922762851141, 0.7045319626640731, 1, 0.000669784679327726],
[428.0634513496125, 1023.949068489583, 0, 1, 0.2948069975298965, 0, 0.0009766110744893685, 0.01435575807987566, 0.7051930024701035, 1, 0.0006692565876488555],
[428.5628823912158, 1023.864522444185, 1.5, 5.5, 0.2950666456474522, 0.003500069795196863, 0.005371804452087388, 0.02751368546387703, 0.4990988599764028, 0.7867668037241436, 0.005069325825548727],
[427.6864844916607, 1024.326035347535, 0, 0, 0.2945473807202607, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002076424608122859],
[427.6249679206366, 1024.387551918559, 1, 0, 0.2945050143011124, 0.002338497690774668, 0, -0.034374899072962, 1, 0.2945050143011123, 0.0004615021810016039],
[427.6759348388008, 1024.336585000395, 1, 0, 0.2945401151817644, 0.002338219007756233, 0, -0.03437080255378653, 1, 0.2945401151817644, 0.0006693317014644363],
[428.4538816777202, 1023.558638161476, 1, 0, 0.2950758866219484, 0.002333973486444435, 0, -0.03430839523682364, 1, 0.2950758866219484, 0.0006690540067986103],
[428.3683385562619, 1023.644181282934, 0, 1, 0.2950169731344341, 0, 0.0009769019531246682, 0.01436003386931533, 0.7049830268655659, 1, 0.0006693245472295944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.9779082281543, 1024.034611611042, 0, 1, 0.2947480840423821, 0, 0.000976529492911153, 0.01435455886615464, 0.7052519159576178, 1, 0.000669358451648971],
[426.9877590605983, 1022.05431327593, 0, 1, 0.2946689866444637, 0, 0.0009784215838733266, 0.01438237178045349, 0.7053310133555363, 1, 0.0006701444816917322],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.6759348388008, 1024.387551918559, 3, 0, 0.294529776927216, 0.007014657023268698, 0, -0.1031124076613596, 1, 0.02554980708942001, 0.002009704801808872],
[427.336692195807, 1024.742929936651, 0, 1, 0.294292878766689, 0, 0.0009758545004665898, 0.01434463677076476, 0.705707121233311, 1, 0.0006695263528466634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[426.9305185755165, 1025.082001263679, 1, 0, 0.2940267475261145, 0.00234230151392449, 0, -0.03443081361903249, 1, 0.2940267475261145, 0.0006696220538147361],
[427.3032267071587, 1024.709293132037, 0, 1, 0.2942834313539395, 0, 0.0009758865335782084, 0.01434510764357478, 0.7057165686460605, 1, 0.0006697600707198364],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006694553129662487],
[427.5019347785885, 1024.510585060607, 1, 0, 0.2944202814628158, 0.002339170699935941, 0, -0.03438479201495002, 1, 0.2944202814628158, 0.0006694609572864018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006697022539856553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.5634513496125, 1024.449068489583, 0, 1, 0.2944626478819641, 0, 0.0009761344226456955, 0.01434875150506319, 0.7055373521180359, 1, 0.0006694718490930932],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3279347183762, 1024.68458512082, 1, 0, 0.2943004477438672, 0.002340123167138686, 0, -0.03439879286861509, 1, 0.2943004477438672, 0.0006699577925832804],
[427.5019347785885, 1024.510585060607, 1, 0, 0.2944202814628158, 0.002339170699935941, 0, -0.03438479201495002, 1, 0.2944202814628158, 0.0006696127553796474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.276967800212, 1024.430261209544, 1, 0, 0.2943272302168446, 0.002340402304267391, 0, -0.03440289606301405, 1, 0.2943272302168447, 0.0006701192566460906],
[427.3384843712361, 1024.52139005324, 0, 1, 0.294338656160351, 0, 0.0009760655167463459, 0.01434773861830901, 0.7056613438396491, 1, 0.00066997499080442],
[427.1022862792164, 1024.910233559979, 1, 0, 0.2941450438227049, 0.002341359510649526, 0, -0.03441696658055517, 1, 0.2941450438227049, 0.0006707009916197473],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006698193124775239],
[426.9240274926944, 1025.088492346502, 0, 1, 0.2940222771219454, 0, 0.000975525535079345, 0.01433980112263492, 0.7059777228780546, 1, 0.0006698862149491076],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 0, 1, 0.2943077132823634, 0, 0.0009759201125295506, 0.01434560123955647, 0.7056922867176365, 1, 0.0006697285570939499],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006699067551880097],
[427.3144578208019, 1024.698062018394, 0, 1, 0.2942911662139974, 0, 0.0009758972296973558, 0.01434526487187465, 0.7057088337860027, 1, 0.0006699248485490004],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006696516651654557],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695664339486095],
[427.2260008820479, 1024.786518957148, 1, 0, 0.2942302459825631, 0.00234068150799672, 0, -0.03440700023641322, 1, 0.2942302459825632, 0.0006697144630094812],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006697144630094812],
[426.9862255245018, 1024.873648899974, 1, 0, 0.2940960302341582, 0.002341995924509319, 0, -0.03442632158752622, 1, 0.2940960302341582, 0.0006697602035577343],
[427.4460635989699, 1024.453972751038, 0, 1, 0.2944046097509195, 0, 0.0009761297496993741, 0.01434868281478447, 0.7055953902490805, 1, 0.0006695155635216658],
[427.3625109216703, 1024.650008917526, 0, 1, 0.2943242603507296, 0, 0.0009759429964348834, 0.01434593762301296, 0.7056757396492704, 1, 0.0006695398122272926],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 0, 1, 0.2943077132823634, 0, 0.0009759201125295506, 0.01434560123955647, 0.7056922867176365, 1, 0.0006695386919316829],
[427.185838956516, 1024.82668088268, 0, 1, 0.2942025864927288, 0, 0.0009757747516279566, 0.01434346449751856, 0.7057974135072712, 1, 0.0006697608288768228],
[427.4911297859563, 1024.610859777589, 0, 2, 0.2943947001370381, 0, 0.001951960572069418, 0.02869297152782729, 0.4978788391947003, 1, 0.001339784337728598],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.00066963627541137],
[426.1316646536582, 1023.214766360758, 0.375, 1.375, 0.2940164308097156, 0.0008800097038195557, 0.001343803906281013, 0.00681757307827665, 0.6923452456652595, 0.4562609316728524, 0.000676066397566504],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.3384843712361, 1024.67403546796, 1, 0, 0.2943077132823634, 0.002340065396804476, 0, -0.03439794366982576, 1, 0.2943077132823635, 0.0006838318896164132],
[427.59870901369, 1024.59730928436, 0, 2, 0.2944497186508118, 0, 0.001951986387117217, 0.02869335099780332, 0.4978011995119186, 1, 0.001340562240242593],
[427.4509678604243, 1024.561551978772, 1, 0, 0.2943851805821638, 0.002339449609870881, 0, -0.03438889186969943, 1, 0.2943851805821638, 0.0006695750178286915],
[427.7562586898645, 1024.256261149331, 1, 0, 0.2945954341614332, 0.002337779938189118, 0, -0.03436434842209544, 1, 0.2945954341614332, 0.0006693519399823407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[427.7160967643327, 1024.296423074863, 0, 1, 0.2945677746715988, 0, 0.000976279890735216, 0.01435088982271701, 0.7054322253284011, 1, 0.0006694136373435589]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.9064181069792107, 2.335132118573244, 1, 0, 0.2796248843636938, 1.103243627085812, 0, -17.52295776155067, 1, 0.2796248843636937, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7518407104665411, 2.489709515085913, 1, 0, 0.2319386275554024, 1.330068970832224, 0, -21.12565332229142, 1, 0.2319386275554024, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0, 2.261481977333097, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.240679013616808, 1.855860909363574, 0, 0, 0.4006662418299035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.4900341241096788, 2.313004469587194, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.4900341241096788, 1.757790625436318, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.8956551920792019, 2.345895033473253, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9254831149465572, 0, -14.69956511335049, 1, 0.3333333333333333, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9254831149465572, 0, -14.69956511335049, 1, 0.3333333333333333, 0.06295989764391134],
[0.9937254760064576, 2.247824749545996, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.8956551920792019, 2.345895033473253, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.9937254760064576, 2.247824749545996, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.161033483701636, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5181625762236401, 2.723387649328814, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.04352586473925325, 3.1980243608132, 1, 3, 0.01342748429320887, 22.97484509476414, 0.9380791581078368, -350.0127344757113, 0.9989374859889584, 0.05263780441754573, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9521833670971149, 2.047816632902885, 0, 1, 0.3173944556990383, 0, 0.4883249720373882, 7.178164722938648, 0.6826055443009618, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958162707865987, 2.304183729213401, 1, 0, 0.2319387569288663, 1.437160989163894, 0, -21.12564153858186, 1, 0.2319387569288662, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 1, 0.3065587163120689, 0, 0.4806943877938237, 7.065998452997466, 0.6934412836879311, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8620167561568947, 2.137983243843106, 4, 0, 0.2873389187189648, 4.64028102868103, 0, -68.21011312534182, 1, 0.006816756996604889, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 1.626805543452661, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702978, 2, 1, 0, 0.258109467109098, 1.437162575244322, 0, -21.12566485327439, 1, 0.258109467109098, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9950840555773875, 2.004915944422613, 0, 1, 0.3316946851924625, 0, 0.4987740273011723, 7.33176129116164, 0.6683053148075375, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.145995772126367, 1.72046004509087, 0, 1, 0.3997953728234692, 0, 0.5812398857232299, 8.54397354666502, 0.6002046271765309, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080165113097613, 0, 1, 0.3065749380061159, 0, 0.4807310697134428, 7.066537661263388, 0.6934250619938841, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 1, 0.3065587163120689, 0, 0.4806943877938237, 7.065998452997466, 0.6934412836879311, 1, 0.06802922346946007],
[0.9519468991316473, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3173156330438824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.09565070878195, 0, 0, 0.1779082927395821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6953698081973637, 2.304630191802636, 0, 1, 0.2317899360657879, 0, 0.4339090946377908, 6.378274989903168, 0.7682100639342121, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.519790177901554, 2.074374711108446, 1, 0, 0.20036898198091, 1.923853205609044, 0, -28.27980546437822, 1, 0.20036898198091, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4547049441122762, 2.141456615709621, 0, 1, 0.1751450877130582, 0, 0.4669718698310528, 6.864283406684593, 0.8248549122869417, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9996047757702087, 2.000395224229792, 0, 1, 0.3332015919234028, 0, 0.4999012134639684, 7.348330437556529, 0.6667984080765972, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702969, 2.304184497129703, 1, 0, 0.2319385009567656, 1.437162575244324, 0, -21.12566485327442, 1, 0.2319385009567656, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984978881014167, 2.001502111898584, 0, 1, 0.3328326293671389, 0, 0.4996247538562029, 7.344266601550968, 0.6671673706328611, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984971764445749, 2.001502823555426, 0, 1, 0.3328323921481916, 0, 0.4996245762090018, 7.344263990214369, 0.6671676078518084, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6992150272431704, 2.30078497275683, 0, 1, 0.2330716757477234, 0, 0.4346342712773316, 6.388934771134779, 0.7669283242522765, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.09565070878195, 0, 0, 0.1779082927395821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5272339117133206, 2.47276608828668, 0, 0, 0.1757446372377735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9174620402513396, 2.082537959748661, 2, 0, 0.3058206800837798, 2.179926702419316, 0, -32.04397450454416, 0.9999999999999999, 0.09352628836690569, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.593835574798766, 2.002326106651216, 1, 0, 0.2287359755140916, 1.683967822808311, 0, -24.75359466015784, 1, 0.2287359755140916, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984979976552006, 2.0015020023448, 1, 1, 0.3328326658850668, 1.001504261749474, 0.4996247812035561, -7.377410103339247, 0.8892224165198395, 0.5548877482899732, 0.06802922346946007],
[0.9185690487093805, 2.08143095129062, 1, 0, 0.3061896829031268, 1.088649787846687, 0, -16.00267844208757, 1, 0.3061896829031268, 0.06802922346946007],
[0.6958158613782175, 2.170481000095286, 1, 0, 0.2427577794647945, 1.437161834769444, 0, -21.1256539686157, 1, 0.2427577794647946, 0.06802922346946007],
[0.9842969045545152, 1.998905835153502, 0.5, 1.5, 0.3299463665184398, 0.5079768083049047, 0.7504105364146935, 3.563670372022151, 0.6700536334815601, 0.5510281282581591, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8248325852654877, 2.175167414734513, 0, 1, 0.2749441950884958, 0, 0.4597347281069183, 6.757900570676132, 0.7250558049115042, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.145996361363382, 1.720459281487554, 0, 1, 0.3997956027059222, 0, 0.5812401436989394, 8.543977338795759, 0.6002043972940778, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9484068811272194, 2.051593118872781, 3, 0, 0.3161356270424064, 3.163199318455366, 0, -46.49765434814056, 0.9999999999999998, 0.03159514296250521, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9923151791636422, 2.00728961684139, 0, 2, 0.3308153062314205, 0, 0.9963684279636437, 14.64618258373825, 0.4478081543741475, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5272339117133206, 2.47276608828668, 0, 0, 0.1757446372377735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.300780269737212, 0, 1, 0.231918417476009, 0, 0.4346351597122384, 6.388947830741541, 0.7680815825239911, 1, 0.06802922346946007],
[0.9894903131687788, 2.005889671948153, 0, 1, 0.3303388278232591, 0, 0.4985319053110152, 7.328202203201951, 0.6696611721767409, 1, 0.06802922346946007],
[0.5228088300380899, 2.026360186354994, 0, 1, 0.2050899044653508, 0, 0.4934956809424857, 7.25417189517131, 0.7949100955346492, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.302284458806513, 0, 1, 0.2318020177796203, 0, 0.4343511924318824, 6.384773635213887, 0.7681979822203797, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6929922156190852, 2.303009155572502, 0, 1, 0.231305707094341, 0, 0.4342145134683197, 6.382764513889372, 0.768694292905659, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.212195753007523, 1.490086557124446, 1, 0, 0.4485822034442892, 0.8249492687290367, 0, -12.12639549089335, 1, 0.4485822034442892, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9991580122418685, 2.000841987758132, 0, 1, 0.3330526707472895, 0, 0.4997895916410983, 7.346689645303179, 0.6669473292527105, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.6980321337925846, 2.16926893350337, 1, 0, 0.2434457064011324, 1.432598803964436, 0, -21.05857940018328, 1, 0.2434457064011324, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.001058750395876, 1.917510382425637, 0, 1, 0.3429964153112615, 0, 0.5215095621724912, 7.665963766389443, 0.6570035846887385, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185688039494901, 2.08143119605051, 1, 0, 0.3061896013164967, 1.088650077925994, 0, -16.00268270612725, 1, 0.3061896013164966, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.212597623798374, 1.483613707388804, 0, 1, 0.4497413128459968, 0, 0.6740299007886791, 9.907946414988363, 0.5502586871540032, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.7017633174537661, 2.328698984727921, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.8373306308671287, 2.19313167131456, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.4581233781882592, 1.643324290804494, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.04455113087015879, 2.110279685692821, 0, 2, 0.02067500173457663, 0, 0.9477416730869891, 14.07285117591693, 0.9590774522275716, 1, 0.06734539157984365],
[0, 3.030462302181687, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06734539157984365],
[1.010154100727229, 2.020308201454458, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.494973984305999, 7.349782556675249, 0.6666666666666666, 1, 0.06734539157984365],
[0, 3.061192982685736, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06666932518227714],
[0.9384353911556526, 2.122757591530084, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.020397660895245, 2.040795321790491, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.020397660895245, 2.040795321790491, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.211421091976652, 1.485128722515508, 0.375, 1.375, 0.4492485491890675, 0.3095537980010896, 0.9258456719300586, 9.059222529647675, 0.5405883974406573, 0.6478948418834984, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9519468991316473, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3173156330438824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6977154070775229, 2.169842045258956, 0, 2, 0.2433134884565351, 0, 0.9217260788037287, 13.54897251204864, 0.5725744767518182, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185689801341275, 2.081431019865873, 1, 0, 0.3061896600447092, 1.088649869119227, 0, -16.00267963675858, 1, 0.3061896600447092, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185690487093807, 2.08143095129062, 1, 0, 0.3061896829031269, 1.088649787846687, 0, -16.00267844208757, 1, 0.3061896829031269, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6962124580164737, 2.303787541983526, 0, 1, 0.2320708193388246, 0, 0.4340678043336475, 6.380607953411534, 0.7679291806611754, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.00039498888232, 0, 1, 0.3149499123583892, 0, 0.4999012722775963, 7.348331302091283, 0.6850500876416108, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.915879720657919, 1.083459836066122, 1, 0, 0.6387671967192985, 0.5219534343505641, 0, -7.67248849437303, 1, 0.6387671967192985, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5269419368420891, 2.082343736326057, 0, 1, 0.2019487334256835, 0, 0.4802281115049385, 7.059144394328187, 0.7980512665743165, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.04134118779249127, 2.958658812207509, 0, 2, 0.01378039593083042, 0, 0.6759819657974567, 9.936640921690383, 0.9726291074503495, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.916208095872221, 1.082289081975458, 1, 0, 0.6390561612092879, 0.5218639886524535, 0, -7.671173681509545, 1, 0.6390561612092879, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.916208919408129, 1.08228861530491, 1, 0, 0.6390563598017143, 0.5218637643691149, 0, -7.671170384642005, 1, 0.6390563598017143, 0.06802922346946007],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702969, 2, 1, 0, 0.2581094671090978, 1.437162575244324, 0, -21.12566485327442, 1, 0.2581094671090978, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.7002406704723984, 2.299759329527602, 1, 0, 0.2334135568241328, 1.428080433153614, 0, -20.99216131424333, 1, 0.2334135568241328, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.303788364153207, 0, 1, 0.2316857567889483, 0, 0.4340676494247186, 6.380605676317647, 0.7683142432110517, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9995066234816358, 2.000493376518365, 0, 1.75, 0.3331688744938786, 0, 0.8747842010082931, 12.85894732285169, 0.4920709881819801, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9501297492866021, 2.049870250713398, 1, 0, 0.3167099164288673, 1.052487832057509, 0, -15.47111341833845, 1, 0.3167099164288674, 0.06802922346946007],
[0.9997633960474649, 2.000236603952535, 0, 1, 0.333254465349155, 0, 0.4999408560087172, 7.348913165724324, 0.6667455346508451, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 1.626805543452661, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007]
],
"RESOLVED": [
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.9064181069792107, 2.335132118573244, 1, 0, 0.2796248843636938, 1.103243627085812, 0, -17.52295776155067, 1, 0.2796248843636937, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7518407104665411, 2.489709515085913, 1, 0, 0.2319386275554024, 1.330068970832224, 0, -21.12565332229142, 1, 0.2319386275554024, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0, 2.261481977333097, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.240679013616808, 1.855860909363574, 0, 0, 0.4006662418299035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.4900341241096788, 2.313004469587194, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.4900341241096788, 1.757790625436318, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.8956551920792019, 2.345895033473253, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9254831149465572, 0, -14.69956511335049, 1, 0.3333333333333333, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9254831149465572, 0, -14.69956511335049, 1, 0.3333333333333333, 0.06295989764391134],
[0.9937254760064576, 2.247824749545996, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.8956551920792019, 2.345895033473253, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.9937254760064576, 2.247824749545996, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.161033483701636, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5181625762236401, 2.723387649328814, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.7506448895071295, 2.490905336045324, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.04352586473925325, 3.1980243608132, 1, 3, 0.01342748429320887, 22.97484509476414, 0.9380791581078368, -350.0127344757113, 0.9989374859889584, 0.05263780441754573, 0.06295989764391134],
[1.080516741850818, 2.161033483701636, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.5623541656271778, 2.240684428069696, 0, 0, 0.2006230548846992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9521833670971149, 2.047816632902885, 0, 1, 0.3173944556990383, 0, 0.4883249720373882, 7.178164722938648, 0.6826055443009618, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958162707865987, 2.304183729213401, 1, 0, 0.2319387569288663, 1.437160989163894, 0, -21.12564153858186, 1, 0.2319387569288662, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 1, 0.3065587163120689, 0, 0.4806943877938237, 7.065998452997466, 0.6934412836879311, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8620167561568947, 2.137983243843106, 4, 0, 0.2873389187189648, 4.64028102868103, 0, -68.21011312534182, 1, 0.006816756996604889, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 1.626805543452661, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702978, 2, 1, 0, 0.258109467109098, 1.437162575244322, 0, -21.12566485327439, 1, 0.258109467109098, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9950840555773875, 2.004915944422613, 0, 1, 0.3316946851924625, 0, 0.4987740273011723, 7.33176129116164, 0.6683053148075375, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.145995772126367, 1.72046004509087, 0, 1, 0.3997953728234692, 0, 0.5812398857232299, 8.54397354666502, 0.6002046271765309, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080165113097613, 0, 1, 0.3065749380061159, 0, 0.4807310697134428, 7.066537661263388, 0.6934250619938841, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 1, 0.3065587163120689, 0, 0.4806943877938237, 7.065998452997466, 0.6934412836879311, 1, 0.06802922346946007],
[0.9519468991316473, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3173156330438824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.073715604102187, 0, 0, 0.2006230548846991, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.09565070878195, 0, 0, 0.1779082927395821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6953698081973637, 2.304630191802636, 0, 1, 0.2317899360657879, 0, 0.4339090946377908, 6.378274989903168, 0.7682100639342121, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.519790177901554, 2.074374711108446, 1, 0, 0.20036898198091, 1.923853205609044, 0, -28.27980546437822, 1, 0.20036898198091, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4547049441122762, 2.141456615709621, 0, 1, 0.1751450877130582, 0, 0.4669718698310528, 6.864283406684593, 0.8248549122869417, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9996047757702087, 2.000395224229792, 0, 1, 0.3332015919234028, 0, 0.4999012134639684, 7.348330437556529, 0.6667984080765972, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702969, 2.304184497129703, 1, 0, 0.2319385009567656, 1.437162575244324, 0, -21.12566485327442, 1, 0.2319385009567656, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984978881014167, 2.001502111898584, 0, 1, 0.3328326293671389, 0, 0.4996247538562029, 7.344266601550968, 0.6671673706328611, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984971764445749, 2.001502823555426, 0, 1, 0.3328323921481916, 0, 0.4996245762090018, 7.344263990214369, 0.6671676078518084, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6992150272431704, 2.30078497275683, 0, 1, 0.2330716757477234, 0, 0.4346342712773316, 6.388934771134779, 0.7669283242522765, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.09565070878195, 0, 0, 0.1779082927395821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5272339117133206, 2.47276608828668, 0, 0, 0.1757446372377735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9174620402513396, 2.082537959748661, 2, 0, 0.3058206800837798, 2.179926702419316, 0, -32.04397450454416, 0.9999999999999999, 0.09352628836690569, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.593835574798766, 2.002326106651216, 1, 0, 0.2287359755140916, 1.683967822808311, 0, -24.75359466015784, 1, 0.2287359755140916, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9984979976552006, 2.0015020023448, 1, 1, 0.3328326658850668, 1.001504261749474, 0.4996247812035561, -7.377410103339247, 0.8892224165198395, 0.5548877482899732, 0.06802922346946007],
[0.9185690487093805, 2.08143095129062, 1, 0, 0.3061896829031268, 1.088649787846687, 0, -16.00267844208757, 1, 0.3061896829031268, 0.06802922346946007],
[0.6958158613782175, 2.170481000095286, 1, 0, 0.2427577794647945, 1.437161834769444, 0, -21.1256539686157, 1, 0.2427577794647946, 0.06802922346946007],
[0.9842969045545152, 1.998905835153502, 0.5, 1.5, 0.3299463665184398, 0.5079768083049047, 0.7504105364146935, 3.563670372022151, 0.6700536334815601, 0.5510281282581591, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8248325852654877, 2.175167414734513, 0, 1, 0.2749441950884958, 0, 0.4597347281069183, 6.757900570676132, 0.7250558049115042, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.145996361363382, 1.720459281487554, 0, 1, 0.3997956027059222, 0, 0.5812401436989394, 8.543977338795759, 0.6002043972940778, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9484068811272194, 2.051593118872781, 3, 0, 0.3161356270424064, 3.163199318455366, 0, -46.49765434814056, 0.9999999999999998, 0.03159514296250521, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9923151791636422, 2.00728961684139, 0, 2, 0.3308153062314205, 0, 0.9963684279636437, 14.64618258373825, 0.4478081543741475, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5272339117133206, 2.47276608828668, 0, 0, 0.1757446372377735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.300780269737212, 0, 1, 0.231918417476009, 0, 0.4346351597122384, 6.388947830741541, 0.7680815825239911, 1, 0.06802922346946007],
[0.9894903131687788, 2.005889671948153, 0, 1, 0.3303388278232591, 0, 0.4985319053110152, 7.328202203201951, 0.6696611721767409, 1, 0.06802922346946007],
[0.5228088300380899, 2.026360186354994, 0, 1, 0.2050899044653508, 0, 0.4934956809424857, 7.25417189517131, 0.7949100955346492, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.302284458806513, 0, 1, 0.2318020177796203, 0, 0.4343511924318824, 6.384773635213887, 0.7681979822203797, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6929922156190852, 2.303009155572502, 0, 1, 0.231305707094341, 0, 0.4342145134683197, 6.382764513889372, 0.768694292905659, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.212195753007523, 1.490086557124446, 1, 0, 0.4485822034442892, 0.8249492687290367, 0, -12.12639549089335, 1, 0.4485822034442892, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9991580122418685, 2.000841987758132, 0, 1, 0.3330526707472895, 0, 0.4997895916410983, 7.346689645303179, 0.6669473292527105, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.6980321337925846, 2.16926893350337, 1, 0, 0.2434457064011324, 1.432598803964436, 0, -21.05857940018328, 1, 0.2434457064011324, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.001058750395876, 1.917510382425637, 0, 1, 0.3429964153112615, 0, 0.5215095621724912, 7.665963766389443, 0.6570035846887385, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185688039494901, 2.08143119605051, 1, 0, 0.3061896013164967, 1.088650077925994, 0, -16.00268270612725, 1, 0.3061896013164966, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.212597623798374, 1.483613707388804, 0, 1, 0.4497413128459968, 0, 0.6740299007886791, 9.907946414988363, 0.5502586871540032, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[0.7017633174537661, 2.328698984727921, 0, 0, 0.2315697235199242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.8373306308671287, 2.19313167131456, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.4581233781882592, 1.643324290804494, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06734539157984365],
[0.04455113087015879, 2.110279685692821, 0, 2, 0.02067500173457663, 0, 0.9477416730869891, 14.07285117591693, 0.9590774522275716, 1, 0.06734539157984365],
[0, 3.030462302181687, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06734539157984365],
[1.010154100727229, 2.020308201454458, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.494973984305999, 7.349782556675249, 0.6666666666666666, 1, 0.06734539157984365],
[0, 3.061192982685736, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06666932518227714],
[0.9384353911556526, 2.122757591530084, 0, 0, 0.3065587163120688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.020397660895245, 2.040795321790491, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.020397660895245, 2.040795321790491, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06666932518227714],
[1.211421091976652, 1.485128722515508, 0.375, 1.375, 0.4492485491890675, 0.3095537980010896, 0.9258456719300586, 9.059222529647675, 0.5405883974406573, 0.6478948418834984, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4795507150921874, 2.520449284907813, 0, 0, 0.1598502383640625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9519468991316473, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3173156330438824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6977154070775229, 2.169842045258956, 0, 2, 0.2433134884565351, 0, 0.9217260788037287, 13.54897251204864, 0.5725744767518182, 1, 0.06802922346946007],
[0.8289137570835168, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2763045856945054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185689801341275, 2.081431019865873, 1, 0, 0.3061896600447092, 1.088649869119227, 0, -16.00267963675858, 1, 0.3061896600447092, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0, 2.092963384777734, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9185690487093807, 2.08143095129062, 1, 0, 0.3061896829031269, 1.088649787846687, 0, -16.00267844208757, 1, 0.3061896829031269, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6962124580164737, 2.303787541983526, 0, 1, 0.2320708193388246, 0, 0.4340678043336475, 6.380607953411534, 0.7679291806611754, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.00039498888232, 0, 1, 0.3149499123583892, 0, 0.4999012722775963, 7.348331302091283, 0.6850500876416108, 1, 0.06802922346946007],
[1.919676148936206, 1.080323851063794, 0, 0, 0.6398920496454019, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.6995651133505, 1, 0.3333333333333333, 0.06802922346946007],
[1.915879720657919, 1.083459836066122, 1, 0, 0.6387671967192985, 0.5219534343505641, 0, -7.67248849437303, 1, 0.6387671967192985, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.048053100868353, 0, 0, 0.3098922009131299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5269419368420891, 2.082343736326057, 0, 1, 0.2019487334256835, 0, 0.4802281115049385, 7.059144394328187, 0.7980512665743165, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.04134118779249127, 2.958658812207509, 0, 2, 0.01378039593083042, 0, 0.6759819657974567, 9.936640921690383, 0.9726291074503495, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.916208095872221, 1.082289081975458, 1, 0, 0.6390561612092879, 0.5218639886524535, 0, -7.671173681509545, 1, 0.6390561612092879, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.916208919408129, 1.08228861530491, 1, 0, 0.6390563598017143, 0.5218637643691149, 0, -7.671170384642005, 1, 0.6390563598017143, 0.06802922346946007],
[1.312999055134306, 1.598679318074459, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06295989764391134],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6958155028702969, 2, 1, 0, 0.2581094671090978, 1.437162575244324, 0, -21.12566485327442, 1, 0.2581094671090978, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.215158455467584, 1.479550715092188, 0, 0, 0.4509423386922156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2, 0, 0, 0.2578048785930618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.549169016393084, 0, 0, 0.3922846988839281, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.7002406704723984, 2.299759329527602, 1, 0, 0.2334135568241328, 1.428080433153614, 0, -20.99216131424333, 1, 0.2334135568241328, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5941648890099998, 2, 0, 0, 0.229038983422811, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 2.028719731485271, 0, 0, 0.204164291014417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.349782556675248, 0.6666666666666667, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.171086242916485, 0, 0, 0.2424140841641863, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.303788364153207, 0, 1, 0.2316857567889483, 0, 0.4340676494247186, 6.380605676317647, 0.7683142432110517, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 2.140646581398865, 0, 0, 0.1748224677361229, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2.080323851063794, 0, 0, 0.3065587163120689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.6947091705597724, 2.305290829440227, 0, 0, 0.2315697235199241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9196761489362066, 2, 0, 0, 0.3149925204106263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.5204492849078126, 1.559874566155981, 0, 0, 0.2501770503864943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9997636080617904, 2.00023639193821, 0, 1, 0.3332545360205968, 0, 0.4999409089997656, 7.34891394466969, 0.6667454639794033, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.9501297492866021, 2.049870250713398, 1, 0, 0.3167099164288673, 1.052487832057509, 0, -15.47111341833845, 1, 0.3167099164288674, 0.06802922346946007],
[0.9997633960474649, 2.000236603952535, 0, 1, 0.333254465349155, 0, 0.4999408560087172, 7.348913165724324, 0.6667455346508451, 1, 0.06802922346946007],
[1, 1.919676148936206, 0, 0, 0.342503739794687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[1.148227478170906, 1.71756793530535, 0, 0, 0.4006662418299034, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007],
[0.4535183076111333, 1.626805543452661, 0, 0, 0.2180037052304247, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06802922346946007]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node104":{
"Global MG94xREV":0.00066997499080442,
"Nucleotide GTR":0.0006674846057775016,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node108":{
"Global MG94xREV":0.0006694136373435589,
"Nucleotide GTR":0.0006669253389411759,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.0006696127553796474,
"Nucleotide GTR":0.0006671237168293745,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node114":{
"Global MG94xREV":0.0006694718490930932,
"Nucleotide GTR":0.0006669833343099926,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node122":{
"Global MG94xREV":0.0006694653828690369,
"Nucleotide GTR":0.0006669768921217405,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.000669385280557275,
"Nucleotide GTR":0.000666897087560791,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node126":{
"Global MG94xREV":0.0006694131318387538,
"Nucleotide GTR":0.0006669248353153988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node127":{
"Global MG94xREV":0.000669008940705946,
"Nucleotide GTR":0.000666522146614113,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.0006694771379596545,
"Nucleotide GTR":0.0006669886035171425,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node25":{
"Global MG94xREV":0.0004615021810016039,
"Nucleotide GTR":0.0004597867167869224,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node29":{
"Global MG94xREV":0.0006692565876488555,
"Nucleotide GTR":0.0006667688730208126,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node34":{
"Global MG94xREV":0.000669358451648971,
"Nucleotide GTR":0.0006668703583790628,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node53":{
"Global MG94xREV":0.0006697600707198364,
"Nucleotide GTR":0.0006672704845790982,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node63":{
"Global MG94xREV":0.0006695750178286915,
"Nucleotide GTR":0.0006670861195538524,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669763480431831,
"Nucleotide GTR":0.0006672738816167461,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "I", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "ATT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696011599769371,
"Nucleotide GTR":0.0006671121645282988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "RS", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGN", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695155635216658,
"Nucleotide GTR":0.0006670268862462942,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408430_Ile_de_France_20200129_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408430_Ile_de_France_20200129_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001339844108963229,
"Nucleotide GTR":0.00133486373245192,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAG", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694356177823323,
"Nucleotide GTR":0.0006669472376757722,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005069325825548727,
"Nucleotide GTR":0.005050482475713595,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "E", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "S", "M", "L", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "N", "E", "T", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "-", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTA", "TTC", "TGT", "GAA", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TCG", "ATG", "CTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAT", "GAA", "ACG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "---", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697593512614023,
"Nucleotide GTR":0.0006672697677949847,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413559_California_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413561_California_20200227_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413561_California_20200227_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006838318896164132,
"Nucleotide GTR":0.0006812899966768199,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000676066397566504,
"Nucleotide GTR":0.0006735533699806823,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "-", "-", "-", "-", "IM", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "AT-", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699067551880097,
"Nucleotide GTR":0.0006674166238018391,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCA", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693948413000845,
"Nucleotide GTR":0.0006669066127650632,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006691020035679697,
"Nucleotide GTR":0.0006666148635492562,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTC", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006688557633787133,
"Nucleotide GTR":0.0006663695386671219,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693458958215555,
"Nucleotide GTR":0.0006668578492233061,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "A", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "GCT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414522_England_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002009704801808872,
"Nucleotide GTR":0.00200223446513117,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCC", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGC", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697022539856553,
"Nucleotide GTR":0.0006672128827573115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699577925832804,
"Nucleotide GTR":0.0006674674714844088,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340562240242593,
"Nucleotide GTR":0.001335579194343011,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "K", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "C", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAA", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGT", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693948413279975,
"Nucleotide GTR":0.0006669066127928725,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "F", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "TTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697602035577343,
"Nucleotide GTR":0.0006672706169232194,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693245472295944,
"Nucleotide GTR":0.0006668365799868657,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006691229406144256,
"Nucleotide GTR":0.0006666357227699617,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "D", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "GAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697285570939499,
"Nucleotide GTR":0.0006672390880934963,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "S", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "TCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006691020035684995,
"Nucleotide GTR":0.0006666148635497842,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694255948555629,
"Nucleotide GTR":0.0006669372520055377,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "S", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "TCA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696079077525086,
"Nucleotide GTR":0.0006671188872215019,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "V", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006692636836147075,
"Nucleotide GTR":0.0006667759426100277,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "C", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TGC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698862149491076,
"Nucleotide GTR":0.0006673961599137019,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "M", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATG", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699248485490004,
"Nucleotide GTR":0.0006674346499074305,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "I", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ATC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693495779322376,
"Nucleotide GTR":0.0006668615176470996,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCT", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696516651654557,
"Nucleotide GTR":0.0006671624819823993,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTG", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001339784337728598,
"Nucleotide GTR":0.001334804183394821,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "L", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "CTT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693317014644363,
"Nucleotide GTR":0.000666843707628476,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAC", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416518_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694436659773544,
"Nucleotide GTR":0.0006669552559545967,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416518_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416578_unknown_20200215_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006696079077525086,
"Nucleotide GTR":0.0006671188872215019,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416578_unknown_20200215_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694598700871706,
"Nucleotide GTR":0.0006669713998316081,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "D", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GAC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697144630094812,
"Nucleotide GTR":0.0006672250463985907,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693188266640565,
"Nucleotide GTR":0.0006668308806854204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCC", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417025_Li_ge_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006696220538147361,
"Nucleotide GTR":0.0006671329807009592,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417025_Li_ge_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006707009916197473,
"Nucleotide GTR":0.0006682079079524547,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATA", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697144630094812,
"Nucleotide GTR":0.0006672250463985907,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006690312816592966,
"Nucleotide GTR":0.0006665444045232057,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTC", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "ILVF", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "NTT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701444816917322,
"Nucleotide GTR":0.0006676534666449272,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "NTSI", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ANC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417305_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "LF", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTN", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417305_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695386919316829,
"Nucleotide GTR":0.0006670499286849733,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "N", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "AAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006690612212292122,
"Nucleotide GTR":0.000666574232803808,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACC", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006697608288768228,
"Nucleotide GTR":0.0006672712399179153,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006690612212292122,
"Nucleotide GTR":0.000666574232803808,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006690612212292122,
"Nucleotide GTR":0.000666574232803808,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGC", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006694517092860545,
"Nucleotide GTR":0.0006669632693652615,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417406_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417406_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669784679327726,
"Nucleotide GTR":0.0006672950017135593,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "L", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "CTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "L", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "MLV", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "NTG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695263528466634,
"Nucleotide GTR":0.0006670376354659531,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "F", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTT", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417768_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002076424608122859,
"Nucleotide GTR":0.0002068706265162948,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417768_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_12":{
"Global MG94xREV":0.00066963627541137,
"Nucleotide GTR":0.0006671471494340502,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTC", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693188266378926,
"Nucleotide GTR":0.000666830880659354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGC", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693519399823407,
"Nucleotide GTR":0.0006668638709171521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695398122272926,
"Nucleotide GTR":0.0006670510448162966,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418066_Washington_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006698193124775239,
"Nucleotide GTR":0.0006673295061273914,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418066_Washington_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "TPAS", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "NCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418104_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696011599769371,
"Nucleotide GTR":0.0006671121645282988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418104_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "YSCF", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TNT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696614784411987,
"Nucleotide GTR":0.0006671722587809072,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "R", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CGT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418248_Castilla_y_Leon_20200301_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418248_Castilla_y_Leon_20200301_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701192566460906,
"Nucleotide GTR":0.000667628335364092,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699675749728967,
"Nucleotide GTR":0.0006674772175115988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418303_Derbyshire_20200325_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0006694553129662487,
"Nucleotide GTR":0.0006669668596501036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418303_Derbyshire_20200325_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "S", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "TCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418370_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339484026,
"Nucleotide GTR":0.000667077567580973,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418370_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339484026,
"Nucleotide GTR":0.000667077567580973,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418383_Ontario_20200101_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418383_Ontario_20200101_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006693892593885932,
"Nucleotide GTR":0.0006669010516022707,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTC", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTT", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418672_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696079077794827,
"Nucleotide GTR":0.0006671188872483761,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418672_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418716_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006691020035679697,
"Nucleotide GTR":0.0006666148635492562,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418716_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418724_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "QH", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAN", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418724_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418743_England_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418743_England_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006690540067986103,
"Nucleotide GTR":0.0006665670451901924,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATC", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418750_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694609572864018,
"Nucleotide GTR":0.0006669724829895772,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGN", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418769_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693495779035288,
"Nucleotide GTR":0.0006668615176184975,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "F", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTT", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418812_MB_20200312_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006695664339486095,
"Nucleotide GTR":0.0006670775675811795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418812_MB_20200312_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418815_Hong_Kong_20200209_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006696011600038601,
"Nucleotide GTR":0.000667112164555122,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418815_Hong_Kong_20200209_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418832_British_Columbia_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418832_British_Columbia_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418844_British_Columbia_null_1951":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418844_British_Columbia_null_1951",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418855_British_Columbia_null_531":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418855_British_Columbia_null_531",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5865.263064557331,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02253253305359616],
[0.01127484836530315],
[0.008611111808673322],
[0.03587686414844644],
[0.0191690856449519],
[0.009591843643777463],
[0.007325724958045544],
[0.0305214988433852],
[0.01421276738341255],
[0.007111796828085767],
[0.005431600999235989],
[0.02262992462388874],
[0.0268846102545636],
[0.01345254451683145],
[0.01027431688589953],
[0.04280635059949327],
[0.01064901292324541],
[0.005328562290984114],
[0.004069664103718611],
[0.01695562540854016],
[0.009059427108099226],
[0.004533163966846309],
[0.003462182417077066],
[0.01442464701358357],
[0.00671704078636137],
[0.003361078674538727],
[0.00256700785025789],
[0.01069504077498289],
[0.01270583122440251],
[0.006357754810323414],
[0.004855704994871883],
[0.0202305430839355],
[0.02287093776938891],
[0.01144417960949089],
[0.008740437740974957],
[0.03641568062268889],
[0.01945697644552266],
[0.009735898691404831],
[0.00743574631545381],
[0.03097988579513612],
[0.01442622174717946],
[0.007218605307126255],
[0.005513175467054321],
[0.02296979201440994],
[0.02728837661632834],
[0.01365458147792585],
[0.01042862165391951],
[0.04344923752544563],
[0.01322605776167159],
[0.04208566378553148],
[0.02248646063913135],
[0.01125179461073065],
[0.008593504613276855],
[0.03580350649483451],
[0.008342554382105535],
[0.006371586226855372],
[0.02654622754297055],
[0.03153722308329476],
[0.01578062294554748],
[0.01205237571201442],
[0.0502143574132264]
],
"Log Likelihood":-2805.298908281285,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.497926769957993, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":127
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6170.474977377678,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2659347356808694],
[0.1770747502536619],
[0.1873506118529918],
[0.3696399022124768]
],
"Log Likelihood":-2883.960904539191,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1498578476167576,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3952277868047985,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.31674648102853,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.072568496571715,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7151796574886067
},
"display order":0,
"estimated parameters":201
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-03-31/sequences.nsp4.compressed.fas",
"number of sequences":98,
"number of sites":500,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_418370_Ontario_20200311_null_2,epi_isl_417406_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1,(epi_isl_413559_California_20200227_null_1,epi_isl_413561_California_20200227_null_3)Node181,epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1,epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_418672_England_20200315_null_1,epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2,epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_418815_Hong_Kong_20200209_null_13,epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1,epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1,epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1,epi_isl_416518_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_1,epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,(epi_isl_417305_England_20200308_null_1,epi_isl_418743_England_20200317_null_3)Node122,(((epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1,epi_isl_414522_England_20200228_null_1)Node127,epi_isl_418832_British_Columbia_null_3)Node126,epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_3)Node125,epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_2,epi_isl_416578_unknown_20200215_null_3,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_418716_England_20200317_null_1,epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1,epi_isl_418104_Wales_20200315_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1,epi_isl_418844_British_Columbia_null_1951,epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2,(epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1,epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1)Node29,(epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_417768_Reykjavik_20200310_null_1)Node25,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1,(epi_isl_418750_England_20200318_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1,epi_isl_418383_Ontario_20200101_null_13)Node34,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_418769_England_20200318_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1,epi_isl_418724_England_20200318_null_3,(epi_isl_408430_Ile_de_France_20200129_null_3,epi_isl_417025_Li_ge_20200315_null_2)Node53,epi_isl_418303_Derbyshire_20200325_null_18,epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,(epi_isl_414619_USA_20200307_null_1,epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1)Node114,(epi_isl_413616_USA_20200217_null_1,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1)Node111,((epi_isl_418248_Castilla_y_Leon_20200301_null_27,epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1)Node104,epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2,epi_isl_418066_Washington_20200314_null_3,epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1,epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_418812_MB_20200312_null_10,epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1,epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1,epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1,epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1,epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1,epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2,epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1,epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_12,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_418855_British_Columbia_null_531,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1)Node63,(epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1)Node108)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node104":"test",
"Node108":"test",
"Node111":"test",
"Node114":"test",
"Node122":"test",
"Node125":"test",
"Node126":"test",
"Node127":"test",
"Node181":"test",
"Node25":"test",
"Node29":"test",
"Node34":"test",
"Node53":"test",
"Node63":"test",
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":"test",
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1":"test",
"epi_isl_408430_Ile_de_France_20200129_null_3":"test",
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413561_California_20200227_null_3":"test",
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_415577_British_Columbia_20200220_null_3":"test",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":"test",
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416518_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_416578_unknown_20200215_null_3":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417025_Li_ge_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":"test",
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417305_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_417406_New_South_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417768_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_12":"test",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418066_Washington_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418104_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418248_Castilla_y_Leon_20200301_null_27":"test",
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418303_Derbyshire_20200325_null_18":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418370_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_418383_Ontario_20200101_null_13":"test",
"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418672_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418716_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418724_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418743_England_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418812_MB_20200312_null_10":"test",
"epi_isl_418815_Hong_Kong_20200209_null_13":"test",
"epi_isl_418832_British_Columbia_null_3":"test",
"epi_isl_418844_British_Columbia_null_1951":"test",
"epi_isl_418855_British_Columbia_null_531":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":5
}
}
}