{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016496736573883],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.000800804435602235],
[355.5909295026443, 835.005954893615, 1, 0, 0.2986661011488881, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986661011488881, 0.0008014131638034591],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986613127850838, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013386872149162, 1, 0.0008009975644450466],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010847343216811],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008011196163805473],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010133205490193],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008015961484813707],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008012001065012936],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008011196436979784],
[355.7502930771969, 834.8273456803566, 1, 0, 0.2988047830702127, 0.002810960438992534, 0, -0.02353661163457875, 1, 0.2988047830702127, 0.0008015893350476628],
[355.5909295026443, 834.7890114929073, 1, 1, 0.2987205322069293, 0.002812220214387003, 0.001197907478695287, -0.01351689315497734, 0.9107660436380091, 0.5082071080518675, 0.001605467151014983],
[355.4315659280917, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2985770408081578, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985770408081578, 0.000800938973470131],
[355.4134924506214, 835.1893703437305, 0, 1, 0.2985155701847246, 0, 0.00119733324621749, 0.01002545863772128, 0.7014844298152754, 1, 0.0008010133125556819],
[355.5909295026443, 834.9483750674599, 0, 1, 0.2986805459825166, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008008043932571725],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008012001065012936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7651645122199, 834.4937470962285, 1, 0, 0.2988972912048682, 0.0028108429372816, 0, -0.02353562777436561, 1, 0.2988972912048682, 0.0008006421018884614],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008012559285760754],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008018148636554351],
[355.2264324485783, 835.3512063089753, 0, 1, 0.2983647776379208, 0, 0.001197101282008714, 0.01002351636510181, 0.7016352223620792, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 835.005954893615, 1, 0, 0.2986661011488881, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986661011488881, 0.0008010133460205318],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008043932902646],
[355.7779895046875, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.0008016644609456317],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008043932902646],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000801647481748092],
[356.052595315195, 834.5250434423587, 0, 1, 0.2990586953126042, 0, 0.001198286387997499, 0.01003343944299965, 0.7009413046873958, 1, 0.0008009389733952831],
[355.3932317406424, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2985544526593887, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7014455473406113, 1, 0.0008021478414927318],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008007592605180423],
[355.8789940620441, 835.6219763206109, 0, 1, 0.2986812456793486, 0, 0.001196713380377063, 0.01002026840403841, 0.7013187543206514, 1, 0.0008009975645180347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7157946886195, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008011326408192489],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000801119616345783],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008016496635079015],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016269233860066],
[355.9184557774407, 834.6591829801127, 0, 1, 0.2989460277020365, 0, 0.001198093809295365, 0.0100318269513906, 0.7010539722979635, 1, 0.0008014131894375949],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008009389567357225],
[355.5718409539007, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986548960594989, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013451039405012, 1, 0.0008008043932902646],
[355.7157946886196, 834.9522028413487, 0, 1, 0.2987531330535038, 0, 0.00119767334776409, 0.01002830636119246, 0.7012468669464962, 1, 0.0008010133125572557],
[355.552595315195, 835.0250434423587, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758041, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008016644609456317],
[355.316791220993, 835.3512063089753, 0, 1, 0.2984180241327515, 0, 0.001197101282008714, 0.01002351636510181, 0.7015819758672486, 1, 0.0008009098210749764],
[355.545785329125, 835.0318534284285, 0, 1, 0.2986330111996397, 0, 0.001197559106151764, 0.01002734979829512, 0.7013669888003603, 1, 0.0008019447257548158],
[355.9650495067306, 834.414891488821, 0, 1, 0.299034818420265, 0, 0.001198444574995217, 0.01003476396748575, 0.700965181579735, 1, 0.0008016564964472921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7779895046874, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.0008019178462950879],
[355.4315659280917, 835.1460728294619, 1, 1, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0.001197395321050862, -0.01353173928660021, 0.9108756148038025, 0.5079497649600375, 0.0016025974522955],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.000801029292771138],
[355.5909295026443, 834.7890114929074, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008017559855695803],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800759260593753],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389567357225],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010403821140139],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008015961484813707],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008010133205178633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008008043932918393],
[355.5718409539007, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986548960594989, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013451039405012, 1, 0.0008016201517677173],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008010404074297495],
[355.7502930771969, 834.8273456803566, 1, 0, 0.2988047830702127, 0.002810960438992534, 0, -0.02353661163457875, 1, 0.2988047830702127, 0.0008015808843936475],
[356.1840227886501, 834.3936159689034, 0, 1, 0.2991690849832789, 0, 0.001198475133152587, 0.01003501983571937, 0.7008309150167211, 1, 0.0008015996029091544],
[355.7886272646463, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008004778123456119],
[355.7886272646463, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008018994391839353],
[356.052595315195, 834.8606719076986, 0, 1, 0.2989744132630908, 0, 0.001197804656093034, 0.01002940582637876, 0.7010255867369093, 1, 0.0008062729793125111],
[356.052595315195, 834.5250434423585, 0, 1, 0.2990586953126042, 0, 0.001198286387997499, 0.01003343944299965, 0.7009413046873958, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010133125572557],
[355.5706687926653, 835.0009915667956, 0, 1, 0.2986554112041524, 0, 0.001197603368259001, 0.01002772041184546, 0.7013445887958476, 1, 0.0008008043932902646],
[355.4038695006012, 835.1737692569524, 1, 0, 0.2985138120614197, 0.002813700372494983, 0, -0.02355955352655886, 1, 0.2985138120614197, 0.0008010595943021229],
[355.7886272646463, 834.7890114929074, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561303, 1, 0.0008011584573318856],
[355.4134924506214, 835.1893703437305, 0, 1, 0.2985155701847246, 0, 0.00119733324621749, 0.01002545863772128, 0.7014844298152754, 1, 0.0008014131813788322],
[355.4820140016884, 835.0956247558651, 1, 0, 0.2985794478490773, 0.002813081845528338, 0, -0.02355437450347568, 1, 0.2985794478490773, 0.0008004403023939725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.6161535394427, 834.9614852181109, 0, 1, 0.298692115459645, 0, 0.001197660033071798, 0.01002819487519032, 0.7013078845403551, 1, 0.0008011326407644088],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.000801228034304901],
[355.3932317406424, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985112014778451, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.701488798522155, 1, 0.000800939000845633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008008044203906146],
[355.565705465846, 835.0119332917076, 0, 1, 0.2986497426886853, 0, 0.001197587675253803, 0.01002758901185719, 0.7013502573113146, 1, 0.0008017099918472157],
[355.4184557774407, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.7014739365100596, 1, 0.0008012001339562654],
[355.3932317406424, 835.1844070169112, 0, 1, 0.2985048771044606, 0, 0.001197340361719363, 0.01002551821693195, 0.7014951228955395, 1, 0.0008024536749056461],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008347327921179],
[355.0011964616712, 835.1810467718785, 1, 1, 0.2982746537178921, 0.002816891914638852, 0.001197345179066474, -0.01356071825503131, 0.9110322309494714, 0.5075815383852559, 0.001602996519157696],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.2960629821577, 835.0838780133938, 1, 0, 0.2984728243026446, 0.002814554125949372, 0, -0.02356670213783382, 1, 0.2984728243026447, 0.0008012571989831784],
[355.7886272646462, 834.7890114929072, 0, 1, 0.2988369810438698, 0, 0.001197907478695288, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008016719816541876],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389734368767],
[355.7157946886196, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008010404074297495],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800759245267409],
[355.4184557774407, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.7014739365100596, 1, 0.0008012001339229804],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008007141588385201],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010404074297495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.9939991533084, 834.9081905437727, 0, 3, 0.2989279910920807, 0, 0.003593209449827185, 0.03008650501413388, 0.3445782676531045, 1, 0.00240673456452531],
[355.7779895046875, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.000801228034304901],
[355.5909295026443, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008011298931410318],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008008117276500732],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800795987780146],
[355.7157946886196, 834.9522028413487, 0, 1, 0.2987531330535038, 0, 0.00119767334776409, 0.01002830636119246, 0.7012468669464962, 1, 0.0008008209927579942],
[355.7157946886196, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008014287249824377],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 1, 0, 0.2990678873019417, 0.002809673405394531, 0, -0.02352583510085859, 1, 0.2990678873019417, 0.0008019235845979642],
[356.0381176230787, 834.4986700890365, 0, 1, 0.2990567963105837, 0, 0.001198324258435673, 0.01003375653810471, 0.7009432036894163, 1, 0.0008016434106864937],
[356.0381176230787, 834.1273630489006, 0, 1, 0.2991500958522642, 0, 0.001198857685647432, 0.01003822300762321, 0.7008499041477358, 1, 0.0008015766745043013],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 0, 1, 0.2990678873019417, 0, 0.001198808093019651, 0.0100378077607902, 0.7009321126980583, 1, 0.0008018186964310978],
[355.9132524371035, 833.9641717004591, 0, 1, 0.2991175773379125, 0, 0.001199092279900937, 0.01004018730201877, 0.7008824226620876, 1, 0.0008015759525872929],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851851, 0.002810932027186807, 0, -0.02353637373808332, 1, 0.2989339767851851, 0.0008016537276923178],
[356.0381176230787, 834.4986700890366, 0, 1, 0.2990567963105837, 0, 0.001198324258435673, 0.01003375653810471, 0.7009432036894163, 1, 0.0008022813007959305],
[355.7155546751015, 834.3595672244629, 0, 1, 0.2989017652157272, 0, 0.001198524040811982, 0.0100354293472049, 0.7010982347842728, 1, 0.000803214413214813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7358153850806, 834.3645305512824, 0, 1, 0.2989124543991205, 0, 0.001198516911234564, 0.01003536965013749, 0.7010875456008796, 1, 0.0008022846888441586],
[355.9132524371035, 834.462635618432, 0, 1, 0.2989923233563504, 0, 0.001198376005486316, 0.01003418982425749, 0.7010076766436496, 1, 0.0008023041089592359],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851852, 0.002810932027186806, 0, -0.02353637373808331, 1, 0.2989339767851852, 0.0008017952853352564],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 1, 0, 0.2990678873019417, 0.002809673405394531, 0, -0.02352583510085859, 1, 0.2990678873019417, 0.0008024650602661321],
[355.9323409858471, 834.1427809137176, 0, 1, 0.2990839270866513, 0, 0.001198835526580477, 0.01003803746628799, 0.7009160729133487, 1, 0.0008024650602948573],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851851, 0.002810932027186807, 0, -0.02353637373808332, 1, 0.2989339767851851, 0.0008017952916618763],
[355.7069467963546, 834.5290747597898, 1, 1, 0.2988541267061423, 0.002811302981306432, 0.001198280599495996, -0.01350608882000572, 0.9106862109507092, 0.5083944643629935, 0.001320209641712826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5006411556058, 834.8962800571184, 0, 0, 0.2986404238961214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000293523317685389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5457853291251, 834.9414946560138, 0, 1, 0.2986556776428249, 0, 0.001197688708011797, 0.01002843497495019, 0.7013443223571751, 1, 0.0008017364457615545],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008012946599177646],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016487406858965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008009390008440561],
[355.552595315195, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986435586613868, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013564413386133, 1, 0.0008010133205162903],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008007592605511508],
[355.7634032278478, 834.8142355297056, 0, 1, 0.29881579465839, 0, 0.001197871283741922, 0.01002996371010926, 0.70118420534161, 1, 0.0008010595669936822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[354.4382797920347, 833.1591788441991, 1, 0.75, 0.2984498469700756, 0.002821365684842919, 0.0009001881261638841, -0.0160863203382197, 0.9381402264964968, 0.4622223283857517, 0.0008018318961767742],
[355.5909295026443, 834.9483750674599, 0, 1, 0.2986805459825166, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008007026228094178],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010133205178633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389567373008],
[355.5909295026443, 834.7890114929072, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695288, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008010133205178633],
[353.431887686878, 831.1852708912935, 0.75, 1.75, 0.2983511467207534, 0.002122049611619822, 0.00210542710667075, -0.0001391828351452665, 0.7411643713871723, 0.5876181435211442, 0.00080206584642975],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 0, 0.2986709290741651, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001891041253976044],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0006119301442446551],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008012699060866951],
[355.4184557774407, 835.1591829801127, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.01002582101434541, 0.7014739365100595, 1, 0.000801029292771138],
[355.552595315195, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986483469721167, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013516530278833, 1, 0.0008021192079678942],
[356.5164483602545, 834.1116384708959, 0, 1, 0.2994356107532462, 0, 0.001198880286376549, 0.01003841224706483, 0.7005643892467539, 1, 0.0008012458512356905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 0, 1, 0.2994678073626436, 0, 0.001198935387170917, 0.01003887361463864, 0.7005321926373564, 1, 0.0008015120554356938],
[356.5547825477038, 834.2837116670026, 0, 1, 0.2994148948660182, 0, 0.001198633014183959, 0.01003634179830138, 0.7005851051339818, 1, 0.0008021902684822413],
[356.7418425497469, 833.8862442814034, 1, 0, 0.2996249177181879, 0.002803147488538724, 0, -0.02347119257780347, 1, 0.299624917718188, 0.0008021902359760841],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 1, 0, 0.2994678073626436, 0.002804618109045302, 0, -0.02348350631343811, 1, 0.2994678073626436, 0.0008021753631830167],
[356.5547825477038, 834.1116384708959, 0, 1, 0.2994581658250476, 0, 0.001198880286376549, 0.01003841224706483, 0.7005418341749523, 1, 0.0008021753704950616],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 0, 0, 0.2994678073626436, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001884938415586908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[356.072856025174, 834.5300067691779, 1, 0, 0.2990693766597108, 0.002808414017184452, 0, -0.02351529004629766, 1, 0.2990693766597108, 0.0006127989312666532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[354.1943356112772, 833.3633147750542, 0.25, 1.5, 0.2982544346340172, 0.0007058272108404668, 0.001799935242415714, 0.009161137762112921, 0.6380858383558191, 0.4619601605382743, 0.0008015271022524182],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008007368651868498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.9245280867725, 834.3343835216759, 1, 0, 0.2990311810442959, 0.002809584395251921, 0, -0.02352508980500558, 1, 0.2990311810442958, 0.0008003833249463985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008007026206959339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.4315659280917, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2985770408081578, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985770408081578, 0.0008012208412871659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008007026206792522],
[354.2255673247018, 830.4421567754327, 1.6875, 1.5625, 0.2990083718147796, 0.004763913606645871, 0.00188152779486426, -0.02413466745808726, 0.8962751661106889, 0.3844187546305748, 0.0008049743792066935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008014642203624829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.0909295026443, 835.1318351508635, 0, 1, 0.2983398906893003, 0, 0.001197415734749656, 0.0100261493271095, 0.7016601093106997, 1, 0.0008007763902395931],
[354.3998229988975, 833.1979436126417, 0, 1.75, 0.2984173875722865, 0, 0.002100341237536209, 0.01758648585808559, 0.5378212157910649, 1, 0.0008025721637819973],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.00080188223993611],
[355.5909295026443, 834.8258095983294, 0, 1, 0.2987112981720953, 0, 0.001197854676391885, 0.01002982465416856, 0.7012887018279047, 1, 0.0008064643515011081],
[354.4301645429193, 830.5794379997094, 1, 2.333333333333333, 0.2990947615803555, 0.002821430284551602, 0.002809283768151927, -0.0001017046825869473, 0.7409359983367854, 0.6941341297131142, 0.00160418652449081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
],
"NAMES": [
["epi_isl_416714_Washington_20200314_null_3"],
["epi_isl_412983_Hubei_20200208_null_1"],
["epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1"],
["Node278"],
["epi_isl_416652_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_418026_Portugal_20200317_null_1"],
["epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_417592_Reykjavik_20200317_null_2"],
["epi_isl_416024_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2"],
["epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_418242_Blida_20200308_null_2"],
["epi_isl_418634_Li_ge_20200319_null_1"],
["epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10"],
["epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1"],
["epi_isl_418265_Athens_20200318_null_27"],
["Node26"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_417656_Reykjavik_20200314_null_3"],
["epi_isl_418355_Ontario_20200308_null_3"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_417285_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_413607_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_418677_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_417497_Minnesota_20200313_null_2"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_1"],
["Node44"],
["epi_isl_417102_Washington_20200304_null_1"],
["epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_414527_Hong_Kong_20200209_null_1"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_417513_Wisconsin_20200326_null_2"],
["epi_isl_418727_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_418666_Li_ge_20200322_null_5"],
["epi_isl_417253_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4"],
["Node10"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1"],
["epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_7"],
["epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1"],
["epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_418738_England_20200317_null_5"],
["epi_isl_418754_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_417419_Friuli_Venezia_Giulia_20200301_null_1"],
["epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["Node80"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1"],
["epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1"],
["epi_isl_413557_California_20200228_null_1"],
["epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1"],
["epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_418165_Wales_20200316_null_47"],
["Node260"],
["epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_417377_Washington_20200315_null_4"],
["epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1"],
["epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_415600_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1"],
["epi_isl_418808_Queensland_20200319_null_9"],
["Node242"],
["epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_417281_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_416489_Wisconsin_20200315_null_3"],
["epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_2"],
["epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_416651_USA_20200311_null_3"],
["epi_isl_417257_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2"],
["epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_25"],
["epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1"],
["epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_417279_England_20200307_null_1"],
["epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4"],
["epi_isl_418770_England_20200318_null_5"],
["epi_isl_418516_Tipperary_20200306_null_3"],
["epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_417870_Reykjavik_20200310_null_16"],
["epi_isl_418665_Li_ge_20200322_null_343"],
["epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2"],
["epi_isl_417297_England_20200306_null_2"],
["epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3"],
["epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["Node198"],
["epi_isl_417236_England_20200301_null_1"],
["Node197"],
["epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1"],
["Node196"],
["epi_isl_418352_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_414617_USA_20200308_null_1"],
["epi_isl_417460_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_417924_Antioquia_20200311_null_1"],
["epi_isl_418376_Ontario_20200312_null_14"],
["epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1"],
["Node164"],
["epi_isl_417964_Utah_20200313_null_2"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_418840_British_Columbia_null_2"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["Node156"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_418828_British_Columbia_null_51"],
["epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1"],
["epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_418832_British_Columbia_null_4"],
["Node134"],
["epi_isl_415137_England_20200302_null_1"],
["Node133"],
["epi_isl_416328_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["Node148"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_418391_Finland_20200313_null_16"],
["Node120"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_418641_Li_ge_20200319_null_1"],
["Node117"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3"],
["Node114"],
["epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_417201_Wisconsin_20200321_null_18"],
["Node110"],
["epi_isl_417259_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["Node126"],
["epi_isl_414485_USA_20200224_null_1"],
["epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4"],
["epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1"],
["epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1954"]
],
"RESOLVED": [
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016496736573883],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.000800804435602235],
[355.5909295026443, 835.005954893615, 1, 0, 0.2986661011488881, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986661011488881, 0.0008014131638034591],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986613127850838, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013386872149162, 1, 0.0008009975644450466],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010847343216811],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008011196163805473],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010133205490193],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008015961484813707],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008012001065012936],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008011196436979784],
[355.7502930771969, 834.8273456803566, 1, 0, 0.2988047830702127, 0.002810960438992534, 0, -0.02353661163457875, 1, 0.2988047830702127, 0.0008015893350476628],
[355.5909295026443, 834.7890114929073, 1, 1, 0.2987205322069293, 0.002812220214387003, 0.001197907478695287, -0.01351689315497734, 0.9107660436380091, 0.5082071080518675, 0.001605467151014983],
[355.4315659280917, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2985770408081578, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985770408081578, 0.000800938973470131],
[355.4134924506214, 835.1893703437305, 0, 1, 0.2985155701847246, 0, 0.00119733324621749, 0.01002545863772128, 0.7014844298152754, 1, 0.0008010133125556819],
[355.5909295026443, 834.9483750674599, 0, 1, 0.2986805459825166, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008008043932571725],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008012001065012936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7651645122199, 834.4937470962285, 1, 0, 0.2988972912048682, 0.0028108429372816, 0, -0.02353562777436561, 1, 0.2988972912048682, 0.0008006421018884614],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008012559285760754],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008018148636554351],
[355.2264324485783, 835.3512063089753, 0, 1, 0.2983647776379208, 0, 0.001197101282008714, 0.01002351636510181, 0.7016352223620792, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 835.005954893615, 1, 0, 0.2986661011488881, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986661011488881, 0.0008010133460205318],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008043932902646],
[355.7779895046875, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.0008016644609456317],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008043932902646],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000801647481748092],
[356.052595315195, 834.5250434423587, 0, 1, 0.2990586953126042, 0, 0.001198286387997499, 0.01003343944299965, 0.7009413046873958, 1, 0.0008009389733952831],
[355.3932317406424, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2985544526593887, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7014455473406113, 1, 0.0008021478414927318],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008007592605180423],
[355.8789940620441, 835.6219763206109, 0, 1, 0.2986812456793486, 0, 0.001196713380377063, 0.01002026840403841, 0.7013187543206514, 1, 0.0008009975645180347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7157946886195, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008011326408192489],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000801119616345783],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008016496635079015],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016269233860066],
[355.9184557774407, 834.6591829801127, 0, 1, 0.2989460277020365, 0, 0.001198093809295365, 0.0100318269513906, 0.7010539722979635, 1, 0.0008014131894375949],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008009389567357225],
[355.5718409539007, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986548960594989, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013451039405012, 1, 0.0008008043932902646],
[355.7157946886196, 834.9522028413487, 0, 1, 0.2987531330535038, 0, 0.00119767334776409, 0.01002830636119246, 0.7012468669464962, 1, 0.0008010133125572557],
[355.552595315195, 835.0250434423587, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758041, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008016644609456317],
[355.316791220993, 835.3512063089753, 0, 1, 0.2984180241327515, 0, 0.001197101282008714, 0.01002351636510181, 0.7015819758672486, 1, 0.0008009098210749764],
[355.545785329125, 835.0318534284285, 0, 1, 0.2986330111996397, 0, 0.001197559106151764, 0.01002734979829512, 0.7013669888003603, 1, 0.0008019447257548158],
[355.9650495067306, 834.414891488821, 0, 1, 0.299034818420265, 0, 0.001198444574995217, 0.01003476396748575, 0.700965181579735, 1, 0.0008016564964472921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7779895046874, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.0008019178462950879],
[355.4315659280917, 835.1460728294619, 1, 1, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0.001197395321050862, -0.01353173928660021, 0.9108756148038025, 0.5079497649600375, 0.0016025974522955],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.000801029292771138],
[355.5909295026443, 834.7890114929074, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008017559855695803],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800759260593753],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389567357225],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010403821140139],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008015961484813707],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008010133205178633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008008043932918393],
[355.5718409539007, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986548960594989, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013451039405012, 1, 0.0008016201517677173],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.0008010404074297495],
[355.7502930771969, 834.8273456803566, 1, 0, 0.2988047830702127, 0.002810960438992534, 0, -0.02353661163457875, 1, 0.2988047830702127, 0.0008015808843936475],
[356.1840227886501, 834.3936159689034, 0, 1, 0.2991690849832789, 0, 0.001198475133152587, 0.01003501983571937, 0.7008309150167211, 1, 0.0008015996029091544],
[355.7886272646463, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008004778123456119],
[355.7886272646463, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008018994391839353],
[356.052595315195, 834.8606719076986, 0, 1, 0.2989744132630908, 0, 0.001197804656093034, 0.01002940582637876, 0.7010255867369093, 1, 0.0008062729793125111],
[356.052595315195, 834.5250434423585, 0, 1, 0.2990586953126042, 0, 0.001198286387997499, 0.01003343944299965, 0.7009413046873958, 1, 0.0008009389733952831],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010133125572557],
[355.5706687926653, 835.0009915667956, 0, 1, 0.2986554112041524, 0, 0.001197603368259001, 0.01002772041184546, 0.7013445887958476, 1, 0.0008008043932902646],
[355.4038695006012, 835.1737692569524, 1, 0, 0.2985138120614197, 0.002813700372494983, 0, -0.02355955352655886, 1, 0.2985138120614197, 0.0008010595943021229],
[355.7886272646463, 834.7890114929074, 0, 1, 0.2988369810438697, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7011630189561303, 1, 0.0008011584573318856],
[355.4134924506214, 835.1893703437305, 0, 1, 0.2985155701847246, 0, 0.00119733324621749, 0.01002545863772128, 0.7014844298152754, 1, 0.0008014131813788322],
[355.4820140016884, 835.0956247558651, 1, 0, 0.2985794478490773, 0.002813081845528338, 0, -0.02355437450347568, 1, 0.2985794478490773, 0.0008004403023939725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.6161535394427, 834.9614852181109, 0, 1, 0.298692115459645, 0, 0.001197660033071798, 0.01002819487519032, 0.7013078845403551, 1, 0.0008011326407644088],
[355.552595315195, 835.0250434423585, 0, 1, 0.2986387311005081, 0, 0.001197568872758042, 0.01002743157561783, 0.7013612688994919, 1, 0.000801228034304901],
[355.3932317406424, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985112014778451, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.701488798522155, 1, 0.000800939000845633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008008044203906146],
[355.565705465846, 835.0119332917076, 0, 1, 0.2986497426886853, 0, 0.001197587675253803, 0.01002758901185719, 0.7013502573113146, 1, 0.0008017099918472157],
[355.4184557774407, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.7014739365100596, 1, 0.0008012001339562654],
[355.3932317406424, 835.1844070169112, 0, 1, 0.2985048771044606, 0, 0.001197340361719363, 0.01002551821693195, 0.7014951228955395, 1, 0.0008024536749056461],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008008347327921179],
[355.0011964616712, 835.1810467718785, 1, 1, 0.2982746537178921, 0.002816891914638852, 0.001197345179066474, -0.01356071825503131, 0.9110322309494714, 0.5075815383852559, 0.001602996519157696],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.2960629821577, 835.0838780133938, 1, 0, 0.2984728243026446, 0.002814554125949372, 0, -0.02356670213783382, 1, 0.2984728243026447, 0.0008012571989831784],
[355.7886272646462, 834.7890114929072, 0, 1, 0.2988369810438698, 0, 0.001197907478695288, 0.01003026677611783, 0.7011630189561302, 1, 0.0008016719816541876],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389734368767],
[355.7157946886196, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008010404074297495],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800759245267409],
[355.4184557774407, 835.1591829801129, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.0100258210143454, 0.7014739365100596, 1, 0.0008012001339229804],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008007141588385201],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008010404074297495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.9939991533084, 834.9081905437727, 0, 3, 0.2989279910920807, 0, 0.003593209449827185, 0.03008650501413388, 0.3445782676531045, 1, 0.00240673456452531],
[355.7779895046875, 834.7996492528661, 1, 0, 0.2988280460869107, 0.002810741612746184, 0, -0.02353477936817459, 1, 0.2988280460869106, 0.000801228034304901],
[355.5909295026443, 834.7890114929073, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695287, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008011298931410318],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008008117276500732],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.000800795987780146],
[355.7157946886196, 834.9522028413487, 0, 1, 0.2987531330535038, 0, 0.00119767334776409, 0.01002830636119246, 0.7012468669464962, 1, 0.0008008209927579942],
[355.7157946886196, 835.3235098814847, 0, 1, 0.2986599966295925, 0, 0.001197140973731099, 0.01002384871010458, 0.7013400033704076, 1, 0.0008014287249824377],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 1, 0, 0.2990678873019417, 0.002809673405394531, 0, -0.02352583510085859, 1, 0.2990678873019417, 0.0008019235845979642],
[356.0381176230787, 834.4986700890365, 0, 1, 0.2990567963105837, 0, 0.001198324258435673, 0.01003375653810471, 0.7009432036894163, 1, 0.0008016434106864937],
[356.0381176230787, 834.1273630489006, 0, 1, 0.2991500958522642, 0, 0.001198857685647432, 0.01003822300762321, 0.7008499041477358, 1, 0.0008015766745043013],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 0, 1, 0.2990678873019417, 0, 0.001198808093019651, 0.0100378077607902, 0.7009321126980583, 1, 0.0008018186964310978],
[355.9132524371035, 833.9641717004591, 0, 1, 0.2991175773379125, 0, 0.001199092279900937, 0.01004018730201877, 0.7008824226620876, 1, 0.0008015759525872929],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851851, 0.002810932027186807, 0, -0.02353637373808332, 1, 0.2989339767851851, 0.0008016537276923178],
[356.0381176230787, 834.4986700890366, 0, 1, 0.2990567963105837, 0, 0.001198324258435673, 0.01003375653810471, 0.7009432036894163, 1, 0.0008022813007959305],
[355.7155546751015, 834.3595672244629, 0, 1, 0.2989017652157272, 0, 0.001198524040811982, 0.0100354293472049, 0.7010982347842728, 1, 0.000803214413214813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7358153850806, 834.3645305512824, 0, 1, 0.2989124543991205, 0, 0.001198516911234564, 0.01003536965013749, 0.7010875456008796, 1, 0.0008022846888441586],
[355.9132524371035, 834.462635618432, 0, 1, 0.2989923233563504, 0, 0.001198376005486316, 0.01003418982425749, 0.7010076766436496, 1, 0.0008023041089592359],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851852, 0.002810932027186806, 0, -0.02353637373808331, 1, 0.2989339767851852, 0.0008017952853352564],
[355.9132524371035, 834.1618694624611, 1, 0, 0.2990678873019417, 0.002809673405394531, 0, -0.02352583510085859, 1, 0.2990678873019417, 0.0008024650602661321],
[355.9323409858471, 834.1427809137176, 0, 1, 0.2990839270866513, 0, 0.001198835526580477, 0.01003803746628799, 0.7009160729133487, 1, 0.0008024650602948573],
[355.7538888625509, 834.3212330370137, 1, 0, 0.2989339767851851, 0.002810932027186807, 0, -0.02353637373808332, 1, 0.2989339767851851, 0.0008017952916618763],
[355.7069467963546, 834.5290747597898, 1, 1, 0.2988541267061423, 0.002811302981306432, 0.001198280599495996, -0.01350608882000572, 0.9106862109507092, 0.5083944643629935, 0.001320209641712826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5006411556058, 834.8962800571184, 0, 0, 0.2986404238961214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000293523317685389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5457853291251, 834.9414946560138, 0, 1, 0.2986556776428249, 0, 0.001197688708011797, 0.01002843497495019, 0.7013443223571751, 1, 0.0008017364457615545],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008012946599177646],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008016487406858965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 834.94837506746, 0, 1, 0.2986805459825165, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008009390008440561],
[355.552595315195, 835.0057978036529, 0, 1, 0.2986435586613868, 0, 0.001197596474935069, 0.01002766269296546, 0.7013564413386133, 1, 0.0008010133205162903],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008007592605511508],
[355.7634032278478, 834.8142355297056, 0, 1, 0.29881579465839, 0, 0.001197871283741922, 0.01002996371010926, 0.70118420534161, 1, 0.0008010595669936822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[354.4382797920347, 833.1592431868289, 1, 1, 0.2984498308004157, 0.002821365684842919, 0.00120025074219306, -0.01357384909829514, 0.9109276984952031, 0.5078273600960348, 0.0008018318961767742],
[355.5909295026443, 834.9483750674599, 0, 1, 0.2986805459825166, 0, 0.001197678838430226, 0.01002835233539923, 0.7013194540174834, 1, 0.0008007026228094178],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008010133205178633],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008009389567373008],
[355.5909295026443, 834.7890114929072, 0, 1, 0.2987205322069293, 0, 0.001197907478695288, 0.01003026677611783, 0.7012794677930707, 1, 0.0008010133205178633],
[353.4318874231309, 831.1860462714932, 0, 2, 0.2983509512816814, 0, 0.002406200162973781, 0.02014749050373399, 0.4923113875673214, 1, 0.00080206584642975],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 0, 0.2986709290741651, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001891041253976044],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0006119301442446551],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.0008012699060866951],
[355.4184557774407, 835.1591829801127, 0, 1, 0.2985260634899404, 0, 0.001197376524594608, 0.01002582101434541, 0.7014739365100595, 1, 0.000801029292771138],
[355.552595315195, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986483469721167, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013516530278833, 1, 0.0008021192079678942],
[356.5164483602545, 834.1116384708959, 0, 1, 0.2994356107532462, 0, 0.001198880286376549, 0.01003841224706483, 0.7005643892467539, 1, 0.0008012458512356905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 0, 1, 0.2994678073626436, 0, 0.001198935387170917, 0.01003887361463864, 0.7005321926373564, 1, 0.0008015120554356938],
[356.5547825477038, 834.2837116670026, 0, 1, 0.2994148948660182, 0, 0.001198633014183959, 0.01003634179830138, 0.7005851051339818, 1, 0.0008021902684822413],
[356.7418425497469, 833.8862442814034, 1, 0, 0.2996249177181879, 0.002803147488538724, 0, -0.02347119257780347, 1, 0.299624917718188, 0.0008021902359760841],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 1, 0, 0.2994678073626436, 0.002804618109045302, 0, -0.02348350631343811, 1, 0.2994678073626436, 0.0008021753631830167],
[356.5547825477038, 834.1116384708959, 0, 1, 0.2994581658250476, 0, 0.001198880286376549, 0.01003841224706483, 0.7005418341749523, 1, 0.0008021753704950616],
[356.5547825477038, 834.0733042834465, 0, 0, 0.2994678073626436, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001884938415586908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[356.072856025174, 834.5300067691779, 1, 0, 0.2990693766597108, 0.002808414017184452, 0, -0.02351529004629766, 1, 0.2990693766597108, 0.0006127989312666532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[354.1942979474915, 833.3632254740569, 0, 1, 0.2982544348058185, 0, 0.00119995695686134, 0.01004742737751897, 0.7017455651941815, 1, 0.0008015271022524182],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008007368651868498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.9245280867725, 834.3343835216759, 1, 0, 0.2990311810442959, 0.002809584395251921, 0, -0.02352508980500558, 1, 0.2990311810442958, 0.0008003833249463985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.7577287947084, 834.6605463882926, 0, 1, 0.2988510309454199, 0, 0.001198091852223227, 0.01003181056451933, 0.70114896905458, 1, 0.0008007026206959339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.4315659280917, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2985770408081578, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985770408081578, 0.0008012208412871659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.4315659280917, 835.1460728294618, 1, 0, 0.2985370750781176, 0.002813481119463409, 0, -0.02355771768661523, 1, 0.2985370750781176, 0.0008007026206792522],
[354.224448644422, 830.443739216482, 1, 0, 0.2990073104638923, 0.002823068830587189, 0, -0.02363799709220722, 1, 0.2990073104638923, 0.0008049743792066935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 0, 1, 0.2986709290741651, 0, 0.001197623853069875, 0.01002789193437252, 0.7013290709258349, 1, 0.0008014642203624829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[355.0909295026443, 835.1318351508635, 0, 1, 0.2983398906893003, 0, 0.001197415734749656, 0.0100261493271095, 0.7016601093106997, 1, 0.0008007763902395931],
[354.3999518029619, 833.1978471415503, 0, 1, 0.2984174879053649, 0, 0.001200195131841372, 0.01004942165389807, 0.7015825120946351, 1, 0.0008025721637819973],
[355.5909295026443, 834.9867092549092, 1, 0, 0.2986709290741651, 0.002812220214387003, 0, -0.02354715993109517, 1, 0.2986709290741651, 0.00080188223993611],
[355.5909295026443, 834.8258095983294, 0, 1, 0.2987112981720953, 0, 0.001197854676391885, 0.01002982465416856, 0.7012887018279047, 1, 0.0008064643515011081],
[354.4301645429193, 830.5846470991128, 1, 1, 0.2990934468167518, 0.002821430284551602, 0.001203971206899363, -0.01354323796857457, 0.9105431100712748, 0.5087300037047786, 0.00160418652449081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.392737907054512, 0, 1, 0.2017135177532795, 0, 0.4179312732295914, 3.499403951581561, 0.7982864822467205, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 1, 0.2015348253320487, 0, 0.4174675914600195, 3.495521471564745, 0.7984651746679513, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6056740864090249, 2.394325913590975, 1, 0, 0.2018913621363417, 1.651052971291689, 0, -13.82452489702685, 1, 0.2018913621363416, 0.119429273959843],
[0.3565501411990807, 1.726315069496603, 0, 2, 0.171182532296457, 0, 1.158537068545201, 9.700612170971988, 0.6869383947705134, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6112359151510298, 2.388764084848969, 0, 1, 0.2037453050503433, 0, 0.4186265216990758, 3.505225375813933, 0.7962546949496567, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923588727818015, 0, 1, 0.3420453740585931, 0, 0.519861644819644, 4.352882903687774, 0.6579546259414069, 1, 0.119429273959843],
[0.9975133428028941, 2.002486657197104, 0, 2, 0.3325044476009649, 0, 0.9987582153478195, 8.362758829829634, 0.445550312472493, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3557116044016597, 1.724053272370589, 0, 1, 0.1710345281692211, 0, 0.5800284805729876, 4.856669234780887, 0.828965471830779, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9996139010866454, 2.000353765940482, 1, 1.75, 0.333208224899714, 1.000386248043304, 0.8748452547728345, -1.051174382192777, 0.7789242185340577, 0.6719249951532412, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9966474869866954, 2.000973072909507, 0, 1, 0.3324795340412284, 0, 0.4997568500739264, 4.184542311141949, 0.6675204659587717, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.961508722588565, 0, 0, 0.3461637591371446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.333598584128189, 1.271005891867956, 0, 0, 0.5120157768361918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222617285885479, 2.077738271411451, 1, 0, 0.3074205761961828, 1.084290900296193, 0, -9.078937385659533, 1, 0.3074205761961828, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.670886857842966, 0, 1, 0.3037626109242763, 0, 0.5984845684231138, 5.011204946488654, 0.6962373890757236, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9211931572860804, 2.078806842713918, 1, 0, 0.3070643857620269, 1.08554866272139, 0, -9.089468827269236, 1, 0.307064385762027, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.392742477993087, 0, 2, 0.20171321014121, 0, 0.8358609496820988, 6.998794533098723, 0.6372617988630519, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.003116728903979871, 2.28940090749741, 0, 1, 0.001359522323619835, 0, 0.4367954938452086, 3.657357022802274, 0.9986404776763802, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2321290935219298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.99974283227178, 0, 1, 0.3333619099750209, 0, 0.5000643002000231, 4.187116639159719, 0.6666380900249791, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9986716548599927, 2.001328345140005, 0, 1, 0.3328905516199978, 0, 0.4996681341312057, 4.183799478670653, 0.6671094483800022, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2321290935219298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222632673774758, 2.077736732622523, 1, 0, 0.3074210891258254, 1.084289091165448, 0, -9.078922237524701, 1, 0.3074210891258253, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.2710058918679568, 2.728994108132043, 0, 0, 0.09033529728931892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.008122645545769679, 2.2886694855795, 0, 2, 0.003536517491371822, 0, 0.8738701733044656, 7.317051710439908, 0.9929394719732231, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.04359358401247, 0, 0, 0.1479586762050789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.00115129090545, 1.950938245110065, 1.25, 1.5, 0.3391331051078894, 1.248562541301314, 0.7688608308129073, -4.016617489022852, 0.8225864070217592, 0.5669409001536332, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222616797443564, 2.077481308506006, 1, 1, 0.3074468990699357, 1.084290957721665, 0.4813521045439091, -5.048501369777136, 0.9054764042522807, 0.5203702023921521, 0.119429273959843],
[0.6548832245885007, 2.345116775411499, 0, 1, 0.218294408196167, 0, 0.4264179978093115, 3.570464624550013, 0.781705591803833, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9998720063080964, 2.000127993691902, 0, 1, 0.3332906687693656, 0, 0.4999680036246917, 4.186310332865302, 0.6667093312306344, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742892225999, 0, 1, 0.3333619033122989, 0, 0.5000642852076135, 4.187116513625926, 0.6666380966877011, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742887099255, 0, 1, 0.3333619038820348, 0, 0.5000642864896291, 4.187116524360444, 0.6666380961179652, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999356385970444, 2.000064361402953, 0, 1.75, 0.3333118795323484, 0, 0.8749718427923265, 7.326276161458771, 0.4918863309347943, 1, 0.119429273959843],
[0.9986721611226473, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3330381273652681, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6669618726347319, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9986741621822085, 2.001156675650418, 0, 1, 0.3329101593287671, 0, 0.4997109982280517, 4.18415838646122, 0.6670898406712329, 1, 0.119429273959843],
[0.9994853548490135, 2.000257182411277, 0, 2, 0.3331903796523345, 0, 0.9998714253279335, 8.372079911196071, 0.4446350697881977, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.001118985372137, 1.921401018183943, 0, 2, 0.3425533389519968, 0, 1.040907119894392, 8.71567820335563, 0.432236112123168, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6059306770921744, 2.394069322907825, 0, 1, 0.2019768923640582, 0, 0.4176988487473725, 3.497457825020521, 0.7980231076359419, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9192860544300379, 2.080107519669381, 1, 1, 0.3064906394306914, 1.087800685304647, 0.4807443800592304, -5.082977440267563, 0.9060634879413658, 0.5190447668027488, 0.119429273959843],
[0.6051117927409195, 2.39488820725908, 0, 1, 0.2017039309136399, 0, 0.4175560249405076, 3.496261938935566, 0.7982960690863601, 1, 0.119429273959843],
[1.003353979815556, 1.916773181970833, 0, 1, 0.3435994133905297, 0, 0.5217101373318446, 4.368360620757561, 0.6564005866094702, 1, 0.119429273959843],
[0.8171409100914058, 2.002747503952146, 0, 2, 0.2897777465313511, 0, 0.9986281326294384, 8.36166962687237, 0.5044156493220857, 1, 0.119429273959843],
[0.6056740976853759, 2.394325902314623, 1, 0, 0.2018913658951254, 1.651052940552629, 0, -13.82452463964388, 1, 0.2018913658951254, 0.119429273959843],
[1.003355475420262, 1.91677025743373, 0, 1, 0.3436000936985785, 0, 0.5217109333378591, 4.368367285840486, 0.6563999063014215, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.003096109770208, 1.996646806310782, 0, 2, 0.3343940256989428, 0, 1.001679412542378, 8.387218471069195, 0.4430313130252596, 1, 0.119429273959843],
[0.9997426832241502, 2.000257316775848, 0, 1, 0.333247561074717, 0, 0.4999356790814637, 4.186039674406482, 0.666752438925283, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 1, 0.2015348253320487, 0, 0.4174675914600195, 3.495521471564745, 0.7984651746679513, 1, 0.119429273959843],
[0.4723932248430607, 2.507567178736508, 1, 1, 0.1585233227514082, 2.116880487293656, 0.3987929051232325, -14.38581618396269, 0.9748703561438529, 0.2919170016466693, 0.119429273959843],
[1.003831715732497, 1.362601610936244, 0, 1, 0.4241960694263904, 0, 0.7338902229191553, 6.144977680814832, 0.5758039305736096, 1, 0.119429273959843],
[0.9988429472343786, 2.001157052765619, 0, 1, 0.3329476490781265, 0, 0.4997109040582247, 4.184157597962522, 0.6670523509218735, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394068333786888, 0, 1, 0.2016240231423886, 0, 0.4176990213216765, 3.497459270012174, 0.7983759768576114, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9986714587189219, 2.001328541281076, 0, 1, 0.3328904862396409, 0, 0.4996680851610137, 4.183799068635571, 0.6671095137603591, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222635366539079, 2.077736463346091, 1, 0, 0.3074211788846361, 1.084288774581862, 0, -9.07891958672079, 1, 0.3074211788846362, 0.119429273959843],
[0.3561349214653531, 1.720533453433273, 1, 0, 0.1714934005689464, 2.807924580620735, 0, -23.51119191735917, 1, 0.1714934005689464, 0.119429273959843],
[0.9986749256125744, 2.001325074387423, 0, 1, 0.3328916418708584, 0, 0.4996689507355948, 4.183806316226991, 0.6671083581291416, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.04359358401247, 0, 0, 0.1479586762050789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9997428922260008, 2.000128027085034, 0, 1, 0.3332619699702301, 0, 0.4999679952774772, 4.186310262972769, 0.6667380300297698, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9998718759242722, 2.000128124075726, 0, 1, 0.3332906253080909, 0, 0.4999679710329095, 4.186310059969209, 0.6667093746919091, 1, 0.119429273959843],
[0.9988416970161026, 2.001158302983895, 0, 1, 0.3329472323387011, 0, 0.4997105918651793, 4.184154983921299, 0.667052767661299, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.3586413754254988, 2.039826312632722, 1, 0, 0.149529375447143, 2.788300705164264, 0, -23.34687813727985, 1, 0.1495293754471431, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.961508722588565, 0, 0, 0.3461637591371446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9211933334196661, 2.078806666580332, 2, 0, 0.3070644444732222, 2.171096910325625, 0, -18.17893417869756, 1, 0.09428857305964855, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3573866119590617, 1.728571293870703, 0, 1, 0.1713297334333783, 0, 0.5785124417753983, 4.843975204688239, 0.8286702665666217, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.913437870454679, 1.079928710640319, 1, 0, 0.6392260415210247, 0.5226195297171451, 0, -4.37597510550781, 1, 0.6392260415210247, 0.119429273959843],
[0.96195116163145, 2.038048838368548, 0, 1, 0.3206503872104835, 0, 0.4906653762038877, 4.108417977730229, 0.6793496127895164, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222624951214262, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3155987857562757, 1.084289999094389, 0, -9.0789298397558, 1, 0.3155987857562756, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.961637867710972, 1, 0, 0.3376510041630755, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3376510041630755, 0.119429273959843],
[1.000064625150043, 1.999160258397275, 1.75, 0, 0.3334410269253373, 1.74988691329567, 0, -14.65207695965776, 1, 0.1854330157962358, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.999742823307566, 2.000257176692432, 0, 1, 0.3332476077691889, 0, 0.4999357140933105, 4.186039967566154, 0.6667523922308111, 1, 0.119429273959843],
[0.002197818573338108, 2.997802181426661, 0, 1, 0.0007326061911127029, 0, 0.3335777144321437, 2.793098403531333, 0.9992673938088873, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9998641466616639, 1.961733569903387, 1, 1, 0.3376097101470406, 1.000135871796973, 0.5097532179404204, -4.10605069927361, 0.8860196836144312, 0.5612391039085124, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.400488180310837, 0, 1, 0.4165819303765581, 0, 0.714036729519596, 5.978741273765796, 0.5834180696234419, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9582879139041791, 1.991433274815666, 0, 1, 0.324874065240067, 0, 0.5021508943565098, 4.204588018556937, 0.675125934759933, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9975555415635575, 2.00244445843644, 0, 1, 0.3325185138545194, 0, 0.4993896314012252, 4.181467531730457, 0.6674814861454806, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9582866190983887, 1.991434753688023, 0, 1, 0.3248736060088133, 0, 0.5021505214509576, 4.204584896160394, 0.6751263939911867, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6059315271568686, 2.394068472843131, 0, 1, 0.2019771757189563, 0, 0.4176989970601915, 3.497459066866964, 0.7980228242810438, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742959287085, 0, 1, 0.33336189585979, 0, 0.5000642684380313, 4.187116373211591, 0.6666381041402101, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394068498476634, 0, 1, 0.2016240120690206, 0, 0.4176989925878513, 3.497459029419359, 0.7983759879309793, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9997428835316934, 2.000257116468304, 0, 1, 0.3332476278438981, 0, 0.4999357291454715, 4.186040093600254, 0.6667523721561019, 1, 0.119429273959843],
[0.6562093993588386, 2.343790600641161, 0, 1, 0.2187364664529463, 0, 0.4266592756735362, 3.572484881864027, 0.7812635335470537, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222628712391182, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3155988738439723, 1.084289556898715, 0, -9.078926137182222, 1, 0.3155988738439723, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9225188313136572, 2.077481168686341, 1, 1, 0.3075062771045526, 1.08398871226944, 0.4813521369401064, -5.045970350049727, 0.9054398895412981, 0.5204524437504033, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.99942127880455, 0, 1.75, 0.3333976480951551, 0, 0.8752532638075761, 7.328632543658198, 0.4917755953339475, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3561305607100615, 2.042337127348159, 1, 0, 0.1484825342793681, 2.807958963157154, 0, -23.51147980771703, 1, 0.1484825342793681, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.087683797336877, 0, 0.6666666666666666, 0.2588134435664841, 0, 0.3193331612369125, 2.673826530539617, 0.819002113234968, 1, 0.119429273959843],
[0.355711576073544, 2.464176916270434, 0, 1, 0.1261438447085067, 0, 0.4058150181495547, 3.397952651759453, 0.8738561552914933, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.356549436031744, 2.461340824510041, 0, 2.666666666666667, 0.1265306321627982, 0, 1.083420321197288, 9.07164789063005, 0.6971514648100553, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.605931407344402, 2.394068592655597, 0, 1, 0.2019771357814674, 0, 0.4176989761562177, 3.49745889183472, 0.7980228642185326, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.668387080503564, 0, 1, 0.3040793477431625, 0, 0.5993812896813928, 5.018713333909484, 0.6959206522568375, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7277394223721914, 1.348928952526436, 1, 0, 0.3504360306963869, 1.374118220420612, 0, -11.50570689128234, 1, 0.350436030696387, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[1.333598584128189, 1.271005891867956, 0, 0, 0.5120157768361918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.003096109770208, 1.996903890229789, 3, 1, 0.334365369923403, 2.990740339614364, 0.5007752275373289, -20.84886753070493, 0.9875007151449022, 0.112030607164594, 0.119429273959843],
[0.3561297371977431, 1.720538637700883, 1, 0, 0.1714909041339485, 2.807965456265013, 0, -23.51153417552522, 1, 0.1714909041339485, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 1.721794270852876, 0, 0, 0.1708862658743352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 1.721794270852876, 0, 0, 0.1708862658743352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9988431939545411, 2.001156806045457, 1, 1, 0.3329477313181806, 1.001158145795517, 0.4997109656669678, -4.198695709204058, 0.8891458082100767, 0.5550412708464378, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9987715617648296, 2.001228438235168, 1, 1, 0.3329238539216102, 1.001229949151736, 0.4996930789579796, -4.199446698155373, 0.8891617074899825, 0.5550094153332027, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6056853305027202, 2.393723397883952, 0.4375, 1.0625, 0.2019349096275076, 0.7223222653203009, 0.443869162552051, -2.331531403781934, 0.8313332415253296, 0.2870526305737814, 0.119429273959843],
[0.9595164058151961, 1.99016303143208, 0.25, 0.5, 0.325295146889129, 0.2605479161011346, 0.251235698836296, -0.07797265239986145, 0.8296331519320852, 0.2555502721018722, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394069563160674, 0, 1, 0.2016239404820909, 0, 0.4176988068299027, 3.497457474038987, 0.798376059517909, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.9222631866226449, 2.077736813377354, 1, 0, 0.3074210622075484, 1.084289186107525, 0, -9.078923032489564, 1, 0.3074210622075484, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.356967851359717, 1.722801822210043, 1, 1, 0.1716381654642602, 2.801372717993864, 0.5804498155900374, -18.59613500749064, 0.9705403401560633, 0.3138166710845837, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843]
],
"RESOLVED": [
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.392737907054512, 0, 1, 0.2017135177532795, 0, 0.4179312732295914, 3.499403951581561, 0.7982864822467205, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 1, 0.2015348253320487, 0, 0.4174675914600195, 3.495521471564745, 0.7984651746679513, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6056740864090249, 2.394325913590975, 1, 0, 0.2018913621363417, 1.651052971291689, 0, -13.82452489702685, 1, 0.2018913621363416, 0.119429273959843],
[0.3565501411990807, 1.726315069496603, 0, 2, 0.171182532296457, 0, 1.158537068545201, 9.700612170971988, 0.6869383947705134, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6112359151510298, 2.388764084848969, 0, 1, 0.2037453050503433, 0, 0.4186265216990758, 3.505225375813933, 0.7962546949496567, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923588727818015, 0, 1, 0.3420453740585931, 0, 0.519861644819644, 4.352882903687774, 0.6579546259414069, 1, 0.119429273959843],
[0.9975133428028941, 2.002486657197104, 0, 2, 0.3325044476009649, 0, 0.9987582153478195, 8.362758829829634, 0.445550312472493, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3557116044016597, 1.724053272370589, 0, 1, 0.1710345281692211, 0, 0.5800284805729876, 4.856669234780887, 0.828965471830779, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9997427051509586, 2.000257294849039, 1, 1, 0.3332475683836531, 1.000257361066718, 0.4999356845617556, -4.189271691237034, 0.8889460581663824, 0.5554411949336886, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9966474869866954, 2.000973072909507, 0, 1, 0.3324795340412284, 0, 0.4997568500739264, 4.184542311141949, 0.6675204659587717, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.961508722588565, 0, 0, 0.3461637591371446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.333598584128189, 1.271005891867956, 0, 0, 0.5120157768361918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222617285885479, 2.077738271411451, 1, 0, 0.3074205761961828, 1.084290900296193, 0, -9.078937385659533, 1, 0.3074205761961828, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.670886857842966, 0, 1, 0.3037626109242763, 0, 0.5984845684231138, 5.011204946488654, 0.6962373890757236, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9211931572860804, 2.078806842713918, 1, 0, 0.3070643857620269, 1.08554866272139, 0, -9.089468827269236, 1, 0.307064385762027, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.038177097487194, 0, 0, 0.5000756451843822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.392742477993087, 0, 2, 0.20171321014121, 0, 0.8358609496820988, 6.998794533098723, 0.6372617988630519, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.003116728903979871, 2.28940090749741, 0, 1, 0.001359522323619835, 0, 0.4367954938452086, 3.657357022802274, 0.9986404776763802, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2321290935219298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.99974283227178, 0, 1, 0.3333619099750209, 0, 0.5000643002000231, 4.187116639159719, 0.6666380900249791, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9986716548599927, 2.001328345140005, 0, 1, 0.3328905516199978, 0, 0.4996681341312057, 4.183799478670653, 0.6671094483800022, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2321290935219298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222632673774758, 2.077736732622523, 1, 0, 0.3074210891258254, 1.084289091165448, 0, -9.078922237524701, 1, 0.3074210891258253, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.2710058918679568, 2.728994108132043, 0, 0, 0.09033529728931892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.008122645545769679, 2.2886694855795, 0, 2, 0.003536517491371822, 0, 0.8738701733044656, 7.317051710439908, 0.9929394719732231, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.04359358401247, 0, 0, 0.1479586762050789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.001113627119811, 1.950848944112793, 1, 1, 0.3391349324262577, 0.9988876116660056, 0.5125973505113078, -4.071784454774534, 0.8849874976082376, 0.5632573624607531, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222616797443564, 2.077481308506006, 1, 1, 0.3074468990699357, 1.084290957721665, 0.4813521045439091, -5.048501369777136, 0.9054764042522807, 0.5203702023921521, 0.119429273959843],
[0.6548832245885007, 2.345116775411499, 0, 1, 0.218294408196167, 0, 0.4264179978093115, 3.570464624550013, 0.781705591803833, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9998720063080964, 2.000127993691902, 0, 1, 0.3332906687693656, 0, 0.4999680036246917, 4.186310332865302, 0.6667093312306344, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742892225999, 0, 1, 0.3333619033122989, 0, 0.5000642852076135, 4.187116513625926, 0.6666380966877011, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742887099255, 0, 1, 0.3333619038820348, 0, 0.5000642864896291, 4.187116524360444, 0.6666380961179652, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9986721611226473, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3330381273652681, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6669618726347319, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9986741621822085, 2.001156675650418, 0, 1, 0.3329101593287671, 0, 0.4997109982280517, 4.18415838646122, 0.6670898406712329, 1, 0.119429273959843],
[0.9994853548490135, 2.000257182411277, 0, 2, 0.3331903796523345, 0, 0.9998714253279335, 8.372079911196071, 0.4446350697881977, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.001118985372137, 1.921401018183943, 0, 2, 0.3425533389519968, 0, 1.040907119894392, 8.71567820335563, 0.432236112123168, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6059306770921744, 2.394069322907825, 0, 1, 0.2019768923640582, 0, 0.4176988487473725, 3.497457825020521, 0.7980231076359419, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9192860544300379, 2.080107519669381, 1, 1, 0.3064906394306914, 1.087800685304647, 0.4807443800592304, -5.082977440267563, 0.9060634879413658, 0.5190447668027488, 0.119429273959843],
[0.6051117927409195, 2.39488820725908, 0, 1, 0.2017039309136399, 0, 0.4175560249405076, 3.496261938935566, 0.7982960690863601, 1, 0.119429273959843],
[1.003353979815556, 1.916773181970833, 0, 1, 0.3435994133905297, 0, 0.5217101373318446, 4.368360620757561, 0.6564005866094702, 1, 0.119429273959843],
[0.8171409100914058, 2.002747503952146, 0, 2, 0.2897777465313511, 0, 0.9986281326294384, 8.36166962687237, 0.5044156493220857, 1, 0.119429273959843],
[0.6056740976853759, 2.394325902314623, 1, 0, 0.2018913658951254, 1.651052940552629, 0, -13.82452463964388, 1, 0.2018913658951254, 0.119429273959843],
[1.003355475420262, 1.91677025743373, 0, 1, 0.3436000936985785, 0, 0.5217109333378591, 4.368367285840486, 0.6563999063014215, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.003096109770208, 1.996646806310782, 0, 2, 0.3343940256989428, 0, 1.001679412542378, 8.387218471069195, 0.4430313130252596, 1, 0.119429273959843],
[0.9997426832241502, 2.000257316775848, 0, 1, 0.333247561074717, 0, 0.4999356790814637, 4.186039674406482, 0.666752438925283, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 1, 0.2015348253320487, 0, 0.4174675914600195, 3.495521471564745, 0.7984651746679513, 1, 0.119429273959843],
[0.4723932248430607, 2.507567178736508, 1, 1, 0.1585233227514082, 2.116880487293656, 0.3987929051232325, -14.38581618396269, 0.9748703561438529, 0.2919170016466693, 0.119429273959843],
[1.003831715732497, 1.362601610936244, 0, 1, 0.4241960694263904, 0, 0.7338902229191553, 6.144977680814832, 0.5758039305736096, 1, 0.119429273959843],
[0.9988429472343786, 2.001157052765619, 0, 1, 0.3329476490781265, 0, 0.4997109040582247, 4.184157597962522, 0.6670523509218735, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394068333786888, 0, 1, 0.2016240231423886, 0, 0.4176990213216765, 3.497459270012174, 0.7983759768576114, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9986714587189219, 2.001328541281076, 0, 1, 0.3328904862396409, 0, 0.4996680851610137, 4.183799068635571, 0.6671095137603591, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222635366539079, 2.077736463346091, 1, 0, 0.3074211788846361, 1.084288774581862, 0, -9.07891958672079, 1, 0.3074211788846362, 0.119429273959843],
[0.3561349214653531, 1.720533453433273, 1, 0, 0.1714934005689464, 2.807924580620735, 0, -23.51119191735917, 1, 0.1714934005689464, 0.119429273959843],
[0.9986749256125744, 2.001325074387423, 0, 1, 0.3328916418708584, 0, 0.4996689507355948, 4.183806316226991, 0.6671083581291416, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.04359358401247, 0, 0, 0.1479586762050789, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9997428922260008, 2.000128027085034, 0, 1, 0.3332619699702301, 0, 0.4999679952774772, 4.186310262972769, 0.6667380300297698, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9998718759242722, 2.000128124075726, 0, 1, 0.3332906253080909, 0, 0.4999679710329095, 4.186310059969209, 0.6667093746919091, 1, 0.119429273959843],
[0.9988416970161026, 2.001158302983895, 0, 1, 0.3329472323387011, 0, 0.4997105918651793, 4.184154983921299, 0.667052767661299, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.3586413754254988, 2.039826312632722, 1, 0, 0.149529375447143, 2.788300705164264, 0, -23.34687813727985, 1, 0.1495293754471431, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.038491277411433, 1.961508722588565, 0, 0, 0.3461637591371446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9211933334196661, 2.078806666580332, 2, 0, 0.3070644444732222, 2.171096910325625, 0, -18.17893417869756, 1, 0.09428857305964855, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3573866119590617, 1.728571293870703, 0, 1, 0.1713297334333783, 0, 0.5785124417753983, 4.843975204688239, 0.8286702665666217, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.913437870454679, 1.079928710640319, 1, 0, 0.6392260415210247, 0.5226195297171451, 0, -4.37597510550781, 1, 0.6392260415210247, 0.119429273959843],
[0.96195116163145, 2.038048838368548, 0, 1, 0.3206503872104835, 0, 0.4906653762038877, 4.108417977730229, 0.6793496127895164, 1, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222624951214262, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3155987857562757, 1.084289999094389, 0, -9.0789298397558, 1, 0.3155987857562756, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.398467688058221, 0, 0, 0.4169328630020406, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.961637867710972, 1, 0, 0.3376510041630755, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3376510041630755, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.999742823307566, 2.000257176692432, 0, 1, 0.3332476077691889, 0, 0.4999357140933105, 4.186039967566154, 0.6667523922308111, 1, 0.119429273959843],
[0.002197818573338108, 2.997802181426661, 0, 1, 0.0007326061911127029, 0, 0.3335777144321437, 2.793098403531333, 0.9992673938088873, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.669473579926177, 0, 0, 0.3039416006151122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9998641466616639, 1.961733569903387, 1, 1, 0.3376097101470406, 1.000135871796973, 0.5097532179404204, -4.10605069927361, 0.8860196836144312, 0.5612391039085124, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.400488180310837, 0, 1, 0.4165819303765581, 0, 0.714036729519596, 5.978741273765796, 0.5834180696234419, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.2902517919085, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9582879139041791, 1.991433274815666, 0, 1, 0.324874065240067, 0, 0.5021508943565098, 4.204588018556937, 0.675125934759933, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3158490871077119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9975555415635575, 2.00244445843644, 0, 1, 0.3325185138545194, 0, 0.4993896314012252, 4.181467531730457, 0.6674814861454806, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.9618229025128052, 2.038177097487193, 0, 0, 0.3206076341709352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9582866190983887, 1.991434753688023, 0, 1, 0.3248736060088133, 0, 0.5021505214509576, 4.204584896160394, 0.6751263939911867, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6059315271568686, 2.394068472843131, 0, 1, 0.2019771757189563, 0, 0.4176989970601915, 3.497459066866964, 0.7980228242810438, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999742959287085, 0, 1, 0.33336189585979, 0, 0.5000642684380313, 4.187116373211591, 0.6666381041402101, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394068498476634, 0, 1, 0.2016240120690206, 0, 0.4176989925878513, 3.497459029419359, 0.7983759879309793, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9997428835316934, 2.000257116468304, 0, 1, 0.3332476278438981, 0, 0.4999357291454715, 4.186040093600254, 0.6667523721561019, 1, 0.119429273959843],
[0.6562093993588386, 2.343790600641161, 0, 1, 0.2187364664529463, 0, 0.4266592756735362, 3.572484881864027, 0.7812635335470537, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.923331625101371, 1.076668374898627, 0, 0, 0.6411105417004576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6550525495928775, 2.344947450407122, 0, 0, 0.2183508498642926, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9222628712391182, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3155988738439723, 1.084289556898715, 0, -9.078926137182222, 1, 0.3155988738439723, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9225188313136572, 2.077481168686341, 1, 1, 0.3075062771045526, 1.08398871226944, 0.4813521369401064, -5.045970350049727, 0.9054398895412981, 0.5204524437504033, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999485621434275, 0, 2, 0.3333904963084389, 0, 1.000257255446206, 8.375310527153783, 0.4443682304119095, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3561305607100615, 2.042337127348159, 1, 0, 0.1484825342793681, 2.807958963157154, 0, -23.51147980771703, 1, 0.1484825342793681, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.355711576073544, 2.464176916270434, 0, 1, 0.1261438447085067, 0, 0.4058150181495547, 3.397952651759453, 0.8738561552914933, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.356549436031744, 2.463945374211713, 0, 2, 0.1264137890758848, 0, 0.8117063068574959, 6.796543928839631, 0.7631528679167527, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.605931407344402, 2.394068592655597, 0, 1, 0.2019771357814674, 0, 0.4176989761562177, 3.49745889183472, 0.7980228642185326, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.668387080503564, 0, 1, 0.3040793477431625, 0, 0.5993812896813928, 5.018713333909484, 0.6959206522568375, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.7277394223721914, 1.348928952526436, 1, 0, 0.3504360306963869, 1.374118220420612, 0, -11.50570689128234, 1, 0.350436030696387, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[1.333598584128189, 1.271005891867956, 0, 0, 0.5120157768361918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[1.003096109770208, 1.996903890229789, 3, 1, 0.334365369923403, 2.990740339614364, 0.5007752275373289, -20.84886753070493, 0.9875007151449022, 0.112030607164594, 0.119429273959843],
[0.3561297371977431, 1.720538637700883, 1, 0, 0.1714909041339485, 2.807965456265013, 0, -23.51153417552522, 1, 0.1714909041339485, 0.119429273959843],
[0.8192824551705922, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2905996359705004, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 1.721794270852876, 0, 0, 0.1708862658743352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 2.464408351124839, 0, 0, 0.1258739092973491, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.3548741040457504, 1.721794270852876, 0, 0, 0.1708862658743352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9988431939545411, 2.001156806045457, 1, 1, 0.3329477313181806, 1.001158145795517, 0.4997109656669678, -4.198695709204058, 0.8891458082100767, 0.5550412708464378, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -8.373156487045561, 1, 0.3333333333333333, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9987715617648296, 2.001228438235168, 1, 1, 0.3329238539216102, 1.001229949151736, 0.4996930789579796, -4.199446698155373, 0.8891617074899825, 0.5550094153332027, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 8.373156487045561, 0.4444444444444445, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.394069563160674, 0, 1, 0.2016239404820909, 0, 0.4176988068299027, 3.497457474038987, 0.798376059517909, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 4.186578243522781, 0.6666666666666667, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 2.090288347038549, 0, 0, 0.2585743428421159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9594785800418963, 1.99007334636137, 0, 0, 0.3252963853434853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.7289941081320429, 1.347674266766585, 0, 0, 0.3510402127482818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9233316251013716, 2.076668374898627, 0, 0, 0.307777208367124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.6046044759961459, 2.395395524003853, 0, 0, 0.2015348253320487, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -4.186578243522781, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.119429273959843],
[0.9222631866226449, 2.077736813377354, 1, 0, 0.3074210622075484, 1.084289186107525, 0, -9.078923032489564, 1, 0.3074210622075484, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.923331625101371, 0, 0, 0.342075456446144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843],
[0.356967851359717, 1.722801822210043, 1, 1, 0.1716381654642602, 2.801372717993864, 0.5804498155900374, -18.59613500749064, 0.9705403401560633, 0.3138166710845837, 0.119429273959843],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.119429273959843]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node10":{
"Global MG94xREV":0.0008019178462950879,
"Nucleotide GTR":0.0007967645336933488,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.0008014642203624829,
"Nucleotide GTR":0.0007963138228676291,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node114":{
"Global MG94xREV":0.0008007026206792522,
"Nucleotide GTR":0.0007955571174030062,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.0008012208412871659,
"Nucleotide GTR":0.0007960720078034661,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0008007026206959339,
"Nucleotide GTR":0.0007955571174195814,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node126":{
"Global MG94xREV":0.0008007763902395931,
"Nucleotide GTR":0.0007956304129028107,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node133":{
"Global MG94xREV":0.0006127989312666532,
"Nucleotide GTR":0.0006088609412725179,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node134":{
"Global MG94xREV":0.0001884938415586908,
"Nucleotide GTR":0.0001872825358201513,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node148":{
"Global MG94xREV":0.0008007368651868498,
"Nucleotide GTR":0.0007955911418473467,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0006119301442446551,
"Nucleotide GTR":0.0006079977372801647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node164":{
"Global MG94xREV":0.0008007026228094178,
"Nucleotide GTR":0.0007955571195194826,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node171":{
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node196":{
"Global MG94xREV":0.0008017364457615545,
"Nucleotide GTR":0.0007965842988822898,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.000293523317685389,
"Nucleotide GTR":0.0002916370678420654,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node198":{
"Global MG94xREV":0.001320209641712826,
"Nucleotide GTR":0.001311725664189433,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.0008012571989831784,
"Nucleotide GTR":0.0007961081318563764,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node26":{
"Global MG94xREV":0.0008012559285760754,
"Nucleotide GTR":0.0007961068696132087,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node260":{
"Global MG94xREV":0.0008011326407644088,
"Nucleotide GTR":0.0007959843740780036,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.0008010847343216811,
"Nucleotide GTR":0.0007959367754933395,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node44":{
"Global MG94xREV":0.0008011326408192489,
"Nucleotide GTR":0.0007959843741324904,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.0008018994391839353,
"Nucleotide GTR":0.0007967462448706209,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TNA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018148636554351,
"Nucleotide GTR":0.000796662212844348,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCT", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008003833249463985,
"Nucleotide GTR":0.0007952398735395948,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCT", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932902646,
"Nucleotide GTR":0.0007956582359992946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "I", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ATC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008044203906146,
"Nucleotide GTR":0.0007956582629254904,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008062729793125111,
"Nucleotide GTR":0.0008010916796021617,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "C", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGC", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016269233860066,
"Nucleotide GTR":0.0007964754803232743,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCC", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412983_Hubei_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800804435602235,
"Nucleotide GTR":0.0007956582780393583,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412983_Hubei_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019235845979642,
"Nucleotide GTR":0.0007967702351205429,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016719816541876,
"Nucleotide GTR":0.000796520249036431,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "V", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GTT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413557_California_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932902646,
"Nucleotide GTR":0.0007956582359992946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413557_California_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021902684822413,
"Nucleotide GTR":0.0007970352052314839,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "K", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "AAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932902646,
"Nucleotide GTR":0.0007956582359992946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "S", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "TCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012699060866951,
"Nucleotide GTR":0.0007961207573010584,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGT", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011584573318856,
"Nucleotide GTR":0.0007960100247421486,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "G", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "GGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080206584642975,
"Nucleotide GTR":0.0007969115827443527,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "DAGV", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "I", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GNC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ATT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGN", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009390008440561,
"Nucleotide GTR":0.0007957919785333011,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008209927579942,
"Nucleotide GTR":0.0007956747287949432,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017952853352564,
"Nucleotide GTR":0.0007966427603390582,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTT", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015120554356938,
"Nucleotide GTR":0.0007963613505414139,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "S", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "TCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025721637819973,
"Nucleotide GTR":0.0007974146463822651,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "SRGC", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "NGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414527_Hong_Kong_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014131894375949,
"Nucleotide GTR":0.0007962631198794621,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATT", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414527_Hong_Kong_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389734368767,
"Nucleotide GTR":0.0007957919513022458,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011298931410318,
"Nucleotide GTR":0.0007959816441114985,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016487406858965,
"Nucleotide GTR":0.000796497157420065,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024536749056461,
"Nucleotide GTR":0.0007972969189432888,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "H", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CAT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "MLV", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "NTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415137_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389567357225,
"Nucleotide GTR":0.0007957919347084182,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010133125572557,
"Nucleotide GTR":0.0007958658127019597,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "N", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAT", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022846888441586,
"Nucleotide GTR":0.0007971290188259582,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "F", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTT", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016434106864937,
"Nucleotide GTR":0.0007964918616724917,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012001339562654,
"Nucleotide GTR":0.0007960514335427415,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416024_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011196436979784,
"Nucleotide GTR":0.0007959714605337755,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416024_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416328_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416328_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801647481748092,
"Nucleotide GTR":0.0007964959065724917,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "A", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "GCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008049743792066935,
"Nucleotide GTR":0.0007998014246059099,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "EDAGV", "MLV", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAA", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GNN", "NTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009975644450466,
"Nucleotide GTR":0.0007958501657908245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "P", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "CCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000801228034304901,
"Nucleotide GTR":0.0007960791545971772,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAA", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800795987780146,
"Nucleotide GTR":0.0007956498845049602,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007141588385201,
"Nucleotide GTR":0.0007955685814153499,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "Y", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "TAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021192079678942,
"Nucleotide GTR":0.0007969646013687085,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "Y", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TAC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080188223993611,
"Nucleotide GTR":0.0007967291561492049,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACC", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416489_Wisconsin_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000800759245267409,
"Nucleotide GTR":0.0007956133781082478,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416489_Wisconsin_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010595669936822,
"Nucleotide GTR":0.0007959117698965048,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "V", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "GTT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389567373008,
"Nucleotide GTR":0.0007957919347099859,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014131638034591,
"Nucleotide GTR":0.0007962630944100568,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801228034304901,
"Nucleotide GTR":0.0007960791545971772,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "D", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GAC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014287249824377,
"Nucleotide GTR":0.00079627855558924,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416651_USA_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010404074297495,
"Nucleotide GTR":0.0007958927334564352,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416651_USA_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416652_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011196163805473,
"Nucleotide GTR":0.0007959714333918939,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCT", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416652_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801029292771138,
"Nucleotide GTR":0.0007958816902232345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "I", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ATT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017559855695803,
"Nucleotide GTR":0.0007966037131229152,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "Y", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "TAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416714_Washington_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016496736573883,
"Nucleotide GTR":0.000796498084396063,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCC", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416714_Washington_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010403821140139,
"Nucleotide GTR":0.000795892708303384,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "S", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "TCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016496635079015,
"Nucleotide GTR":0.0007964980743118,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "P", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "CCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417102_Washington_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801119616345783,
"Nucleotide GTR":0.0007959714333573532,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "L", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CTT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417102_Washington_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017099918472157,
"Nucleotide GTR":0.0007965580149670216,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "F", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "TTT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015893350476628,
"Nucleotide GTR":0.0007964381335364299,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAC", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00160418652449081,
"Nucleotide GTR":0.001593877644759066,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "KQE", "K", "D", "K", "KQE", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "F", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "NAA", "AAG", "GAC", "AAA", "NAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "TTC", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417201_Wisconsin_20200321_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417201_Wisconsin_20200321_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015996029091544,
"Nucleotide GTR":0.0007964483354142292,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KNTRSIM", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ANN", "NGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 19.5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015271022524182,
"Nucleotide GTR":0.0007963763006637571,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "MLV", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "NTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016564964472921,
"Nucleotide GTR":0.0007965048633411168,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "DAGV", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GNC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417257_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCN", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417259_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015766745043013,
"Nucleotide GTR":0.0007964255543526952,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417279_England_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010404074297495,
"Nucleotide GTR":0.0007958927334564352,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "H", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAT", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417281_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417285_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016644609456317,
"Nucleotide GTR":0.0007965127766577158,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAA", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417285_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008023041089592359,
"Nucleotide GTR":0.000797148314142811,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "V", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GTA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417297_England_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000800939000845633,
"Nucleotide GTR":0.0007957919785348681,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008021902359760841,
"Nucleotide GTR":0.0007970351729342193,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012001339229804,
"Nucleotide GTR":0.0007960514335096713,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417419_Friuli_Venezia_Giulia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016201517677173,
"Nucleotide GTR":0.0007964687522209958,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "I", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "ATC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417419_Friuli_Venezia_Giulia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417460_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCN", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417460_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417497_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021478414927318,
"Nucleotide GTR":0.0007969930508877847,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417497_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016644609456317,
"Nucleotide GTR":0.0007965127766577158,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "S", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "AGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417513_Wisconsin_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008021753631830167,
"Nucleotide GTR":0.0007970203957172174,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCC", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "ED", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAN", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0016025974522955,
"Nucleotide GTR":0.001592298784315251,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "S", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAT", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "TCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417592_Reykjavik_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012001065012936,
"Nucleotide GTR":0.0007960514062642023,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417592_Reykjavik_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012001065012936,
"Nucleotide GTR":0.0007960514062642023,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "S", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "TCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009975645180347,
"Nucleotide GTR":0.0007958501658633433,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "S", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TCC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022813007959305,
"Nucleotide GTR":0.0007971256525501257,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417656_Reykjavik_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008009389733952831,
"Nucleotide GTR":0.00079579195126092,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417656_Reykjavik_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00240673456452531,
"Nucleotide GTR":0.002391268322418704,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "Y", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TAT", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010404074297495,
"Nucleotide GTR":0.0007958927334564352,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "F", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801029292771138,
"Nucleotide GTR":0.0007958816902232345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010133205490193,
"Nucleotide GTR":0.0007958658206423676,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "S", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "TCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000800759260593753,
"Nucleotide GTR":0.0007956133933361007,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008024650602661321,
"Nucleotide GTR":0.0007973082311387716,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGC", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417870_Reykjavik_20200310_null_16":{
"Global MG94xREV":0.000803214413214813,
"Nucleotide GTR":0.0007980527685692388,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417870_Reykjavik_20200310_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008064643515011081,
"Nucleotide GTR":0.000801281821988086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "Q", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "CAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417924_Antioquia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010133205162903,
"Nucleotide GTR":0.0007958658206098508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417924_Antioquia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "ILVF", "QPRL", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "NTC", "CNA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010133205178633,
"Nucleotide GTR":0.0007958658206114125,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602996519157696,
"Nucleotide GTR":0.001592695286679975,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACC", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418026_Portugal_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389733952831,
"Nucleotide GTR":0.00079579195126092,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "V", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GTT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418026_Portugal_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001605467151014983,
"Nucleotide GTR":0.001595150041676131,
"amino-acid": [
["M", "S", "Y", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "TAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCA", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389567357225,
"Nucleotide GTR":0.0007957919347084182,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008347327921179,
"Nucleotide GTR":0.000795688380532377,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "D", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "GAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018318961767742,
"Nucleotide GTR":0.0007966791359107009,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "TPAS", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "NCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015961484813707,
"Nucleotide GTR":0.0007964449031854102,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "T", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "ACG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008004403023939725,
"Nucleotide GTR":0.0007952964848366962,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418165_Wales_20200316_null_47":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418165_Wales_20200316_null_47",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014131813788322,
"Nucleotide GTR":0.0007962631118724856,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "F", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTT", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007592605180423,
"Nucleotide GTR":0.0007956133932608763,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGT", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015808843936475,
"Nucleotide GTR":0.0007964297371883034,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAC", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389733952831,
"Nucleotide GTR":0.00079579195126092,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "L", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CTG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418242_Blida_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000800938973470131,
"Nucleotide GTR":0.0007957919513352875,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418242_Blida_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "KTRI", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "ANA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_27":{
"Global MG94xREV":0.0008006421018884614,
"Nucleotide GTR":0.0007954969875201924,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012458512356905,
"Nucleotide GTR":0.0007960968570321828,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "F", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TTC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010595943021229,
"Nucleotide GTR":0.0007959117970294562,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAG", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418352_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012946599177646,
"Nucleotide GTR":0.0007961453520581906,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418352_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418355_Ontario_20200308_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010133460205318,
"Nucleotide GTR":0.0007958658459501949,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418355_Ontario_20200308_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008024650602948573,
"Nucleotide GTR":0.0007973082311673126,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "T", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ACC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008015961484813707,
"Nucleotide GTR":0.0007964449031854102,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "H", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CAC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418376_Ontario_20200312_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0008007592605511508,
"Nucleotide GTR":0.0007956133932937732,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418376_Ontario_20200312_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017952916618763,
"Nucleotide GTR":0.0007966427666250225,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418391_Finland_20200313_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418391_Finland_20200313_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001891041253976044,
"Nucleotide GTR":0.0001878888978316453,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932902646,
"Nucleotide GTR":0.0007956582359992946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "V", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GTA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418516_Tipperary_20200306_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016537276923178,
"Nucleotide GTR":0.0007965021123788112,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418516_Tipperary_20200306_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008018186964310978,
"Nucleotide GTR":0.0007966660209896941,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010133125572557,
"Nucleotide GTR":0.0007958658127019597,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418634_Li_ge_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010133125556819,
"Nucleotide GTR":0.0007958658127003985,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418634_Li_ge_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418641_Li_ge_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418641_Li_ge_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418665_Li_ge_20200322_null_343":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418665_Li_ge_20200322_null_343",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418666_Li_ge_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008019447257548158,
"Nucleotide GTR":0.0007967912404193505,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "K", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AAA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418666_Li_ge_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008004778123456119,
"Nucleotide GTR":0.0007953337537405681,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009389733952831,
"Nucleotide GTR":0.00079579195126092,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "L", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CTA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418677_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418727_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009098210749764,
"Nucleotide GTR":0.0007957629862802773,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418727_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008010133205178633,
"Nucleotide GTR":0.0007958658206114125,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "S", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "TCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932918393,
"Nucleotide GTR":0.00079565823600086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418754_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418770_England_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008015759525872929,
"Nucleotide GTR":0.0007964248370748944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418770_England_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008008043932571725,
"Nucleotide GTR":0.0007956582359664161,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1954":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1954",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418808_Queensland_20200319_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418808_Queensland_20200319_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_25":{
"Global MG94xREV":0.0008008117276500732,
"Nucleotide GTR":0.0007956655232267836,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418828_British_Columbia_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418828_British_Columbia_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418832_British_Columbia_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008021753704950616,
"Nucleotide GTR":0.0007970204029822719,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "P", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "CCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418832_British_Columbia_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418840_British_Columbia_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010133205178633,
"Nucleotide GTR":0.0007958658206114125,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418840_British_Columbia_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6275.339233890544,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03560368579866047],
[0.02373649009534862],
[0.01704050537073055],
[0.03332989068140615],
[0.02770492960165312],
[0.01847049743110338],
[0.01326003168162],
[0.02593558094465302],
[0.0227845208607927],
[0.01519012825800798],
[0.01090504371635781],
[0.02132940937106601],
[0.01613926771939585],
[0.01075982892709475],
[0.00772451705723036],
[0.01510854892404564],
[0.02727062943837293],
[0.0181809554555224],
[0.01305216853209283],
[0.02552901694319252],
[0.02122058016845314],
[0.01414747040052214],
[0.01015651616451881],
[0.01986534824541027],
[0.01745179498660031],
[0.01163487289456639],
[0.008352714038647079],
[0.01633725290092253],
[0.01236186589981921],
[0.008241486826684843],
[0.005916590867849012],
[0.01157238723510694],
[0.03339372830011914],
[0.02226314167372984],
[0.01598278362709027],
[0.03126106999094529],
[0.02598525604689895],
[0.01732401460540698],
[0.01243696783897722],
[0.02432573268591408],
[0.0213702621514072],
[0.01424726133020097],
[0.01022815640561223],
[0.02000547093262438],
[0.01513748672629465],
[0.01009195524809071],
[0.007245048316556356],
[0.01417074570963716],
[0.01468373365844859],
[0.02061834903412612],
[0.01713866732876657],
[0.01142611497015425],
[0.008202846028767023],
[0.016044122839503],
[0.009396831489503626],
[0.006746016652905004],
[0.01319467895373985],
[0.009983982791139155],
[0.006656184698802217],
[0.004778497185257406],
[0.009346365341934008]
],
"Log Likelihood":-2951.118239373223,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.087091997240227, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":186
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6632.487333101353,
"Equilibrium frequencies": [
[0.316861338096066],
[0.2504412376782732],
[0.2222283688167454],
[0.2104690554089154]
],
"Log Likelihood":-3008.744687664244,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1099009233003857,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2617505157311369,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1554217079213703,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.968969189645451,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.551911751159902
},
"display order":0,
"estimated parameters":307
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-03-31/sequences.N.compressed.fas",
"number of sequences":151,
"number of sites":419,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_416714_Washington_20200314_null_3,epi_isl_412983_Hubei_20200208_null_1,epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1,(epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5,epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1)Node278,epi_isl_416652_Washington_20200311_null_1,epi_isl_418026_Portugal_20200317_null_1,epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_417592_Reykjavik_20200317_null_2,epi_isl_416024_Wales_20200311_null_1,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2,epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1,epi_isl_418242_Blida_20200308_null_2,epi_isl_418634_Li_ge_20200319_null_1,epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10,epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1,(epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1,epi_isl_418265_Athens_20200318_null_27)Node26,epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_417656_Reykjavik_20200314_null_3,epi_isl_418355_Ontario_20200308_null_3,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_417285_England_20200306_null_1,epi_isl_413607_USA_20200218_null_1,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_418677_England_20200315_null_1,epi_isl_417497_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,(epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_1)Node44,epi_isl_417102_Washington_20200304_null_1,epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_414527_Hong_Kong_20200209_null_1,epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1,epi_isl_417513_Wisconsin_20200326_null_2,epi_isl_418727_England_20200313_null_1,epi_isl_418666_Li_ge_20200322_null_5,(epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4)Node10,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1,epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1,epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_7,epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1,epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2,epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1,epi_isl_418738_England_20200317_null_5,epi_isl_418754_England_20200317_null_2,epi_isl_417419_Friuli_Venezia_Giulia_20200301_null_1,epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1,(epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_418669_England_20200311_null_1)Node80,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1,epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1,epi_isl_413557_California_20200228_null_1,epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2,epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1,(epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1,epi_isl_418165_Wales_20200316_null_47)Node260,epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1,epi_isl_417377_Washington_20200315_null_4,epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1,epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2,epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,(epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1,epi_isl_418808_Queensland_20200319_null_9)Node242,epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_417281_England_20200306_null_1,epi_isl_416489_Wisconsin_20200315_null_3,epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_2,epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_416651_USA_20200311_null_3,epi_isl_417257_England_20200303_null_1,epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2,epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_25,epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,(((epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1,epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_417279_England_20200307_null_1,epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4,epi_isl_418770_England_20200318_null_5,epi_isl_418516_Tipperary_20200306_null_3,epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_417870_Reykjavik_20200310_null_16,epi_isl_418665_Li_ge_20200322_null_343,epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2,epi_isl_417297_England_20200306_null_2,epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3,epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1)Node198,epi_isl_417236_England_20200301_null_1)Node197,epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1)Node196,epi_isl_418352_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_414617_USA_20200308_null_1,epi_isl_417460_Duesseldorf_20200311_null_1,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_417924_Antioquia_20200311_null_1,epi_isl_418376_Ontario_20200312_null_14,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,(epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1)Node164,epi_isl_417964_Utah_20200313_null_2,epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_418840_British_Columbia_null_2,(epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1)Node156,epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1,epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1,((epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_418828_British_Columbia_null_51,epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1,epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10,epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_418832_British_Columbia_null_4)Node134,epi_isl_415137_England_20200302_null_1)Node133,(epi_isl_416328_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_417238_England_20200303_null_1)Node148,(epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_418391_Finland_20200313_null_16)Node120,(epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_418641_Li_ge_20200319_null_1)Node117,(epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3)Node114,(epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_417201_Wisconsin_20200321_null_18)Node110,epi_isl_417259_England_20200304_null_1,(epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1)Node126,epi_isl_414485_USA_20200224_null_1,epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1,epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4,epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1,epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1954)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node10":"test",
"Node110":"test",
"Node114":"test",
"Node117":"test",
"Node120":"test",
"Node126":"test",
"Node133":"test",
"Node134":"test",
"Node148":"test",
"Node156":"test",
"Node164":"test",
"Node196":"test",
"Node197":"test",
"Node198":"test",
"Node242":"test",
"Node26":"test",
"Node260":"test",
"Node278":"test",
"Node44":"test",
"Node80":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_412983_Hubei_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_413557_California_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_414527_Hong_Kong_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416024_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416328_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":"test",
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5":"test",
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416489_Wisconsin_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416651_USA_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_416652_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416714_Washington_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417102_Washington_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417201_Wisconsin_20200321_null_18":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417285_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_4":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":"test",
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417419_Friuli_Venezia_Giulia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417460_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417497_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417592_Reykjavik_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417656_Reykjavik_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417837_Reykjavik_20200316_null_7":"test",
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_417870_Reykjavik_20200310_null_16":"test",
"epi_isl_417871_Reykjavik_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_417924_Antioquia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418026_Portugal_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418165_Wales_20200316_null_47":"test",
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418242_Blida_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_27":"test",
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418352_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418355_Ontario_20200308_null_3":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418376_Ontario_20200312_null_14":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418391_Finland_20200313_null_16":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418516_Tipperary_20200306_null_3":"test",
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418634_Li_ge_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_418641_Li_ge_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_418665_Li_ge_20200322_null_343":"test",
"epi_isl_418666_Li_ge_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418727_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418770_England_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":"test",
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1954":"test",
"epi_isl_418808_Queensland_20200319_null_9":"test",
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_25":"test",
"epi_isl_418828_British_Columbia_null_51":"test",
"epi_isl_418832_British_Columbia_null_4":"test",
"epi_isl_418840_British_Columbia_null_2":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":6
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":11
}
}
}